<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1998 bps / non-identical: 50 bps

Full alignment

AL607131.15	1	GAATTCTCTGAACAGAACTGCAATAGCACAAGCACTAGCCGCAAGAGCCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	52153	GAATTCTCTGAACAGAACTGCAATAGCACAAGCACTAGCCGCAAGAGCCA	52202

AL607131.15	51	GGTGGGGCTACATAACATTAAAAAGTTTCTGCACAGCAAAAGAACCCGTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	52203	GGTGGGGCTACATAACATTAAAAAGTTTCTGCACAGCAAAAGAACCCGTC	52252

AL607131.15	101	AGCAGAGCTAGCAGCCTGCAGAGCGAGGGGTAGAAAATCTTCAGCAGCCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	52253	AGCAGAGCTAGCAGCCTGCAGAGCGAGGGGTAGAAAATCTTCAGCAGCCA	52302

AL607131.15	151	GACTTCAGACAGAAGCTAATGTCCAGAATCTACAAAGAACCCCAGAAATG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	52303	GACTTCAGACAGAAGCTAATGTCCAGAATCTACAAAGAACCCCAGAAATG	52352

AL607131.15	201	AAACAGGCAAGATTCAAAAGTGCCCATCAACCAAGGAGCTAGGGAAAGGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	52353	AAACAGGCAAGATTCAAAAGTGCCCATCAACCAAGGAGCTAGGGAAAGGA	52402

AL607131.15	251	ACGGTCTGGTTCTCAGAAGAACAAACAAACGGCCAGTGAGTACTTACAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	52403	ACGGTCTGGTTCTCAGAAGAACAAACAAACGGCCAGTGAGTACTTACAAA	52452

AL607131.15	301	TGCTTTCAACATCCCCAGTCCCTGGGGAAACGCAAACTAAAACTATTTTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	52453	TGCTTTCAACATCCCCAGTCCCTGGGGAAACGCAAACTAAAACTATTTTG	52502

AL607131.15	351	AGATATCACTTCACCCCAGTCAGAAAGACTATCACCAAGAAATCTGACAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	52503	AGATATCACTTCACCCCAGTCAGAAAGACTATCACCAAGAAATCTGACAA	52552

AL607131.15	401	CACTTGTTAGTGCAGCTGTGGGAAAGAGGAATCCTTATATACTGATGGGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	52553	CACTTGTTAGTGCAGCTGTGGGAAAGAGGAATCCTTATATACTGATGGGT	52602

AL607131.15	451	GTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	52603	GTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	52652

AL607131.15	501	GTG--CAAATTAATATTCAGGAGATCAGTGTAGAATGGAGGGTCCTCAGA	548
			|||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	52653	GTGTGCAAATTAATATTCAGGAGATCAGTGTAGAATGGAGGGTCCTCAGA	52702

AL607131.15	549	AAAGTAAAAATAGATCTACCATATGACCCAGTTATCCCGCTCTTGGGCAC	598
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	52703	AAAGTAAAAATAGATCTACCATATGACCCAGTTATCCCGCTCTTGGGCAC	52752

AL607131.15	599	ACTCAAAGGACTGCATCTTACAGCAGAAATACTTGCACACCTATGACTGC	648
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	52753	ACTCAAAGGACTGCATCTTACAGCAGAAATACTTGCACACCTATGACTGC	52802

AL607131.15	649	TGCATTTACAATAGAAAGAGTGTCAGACCAGCCTAGATGTCCACCAACAG	698
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	52803	TGCATTTACAATAGAAAGAGTGTCAGACCAGCCTAGATGTCCACCAACAG	52852

AL607131.15	699	GAATGCATAGTGAAAGCATTGGTACAGACTTTACTCAGATGTGGGAAAAA	748
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	52853	GAATGCATAGTGAAAGCATTGGTACAGACTTTACTCAGATGTGGGAAAAA	52902

AL607131.15	749	TGAAATCATGGGGTTTTCAGGAAAATGGCTGGATGTGGAAAGGCATAATA	798
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	52903	TGAAATCATGGGGTTTTCAGGAAAATGGCTGGATGTGGAAAGGCATAATA	52952

AL607131.15	799	TTAAACAAAGTGTCTCAAATTGAGAGAGGTCCTGTGTCTCCCTCGTACGT	848
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	52953	TTAAACAAAGTGTCTCAAATTGAGAGAGGTCCTGTGTCTCCCTCGTACGT	53002

AL607131.15	849	GGCCCCTAACCTGTAATGTATACACATAATCTATCTAAAGTCTAAAAATC	898
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	53003	GGCCCCTAACCTGTAATGTATACACATAATCTATCTAAAGTCTAAAAATC	53052

AL607131.15	899	TGGAAAGGAGACCAAGAGAGGGTGGCATGAGTTGGTGAGGACGGATGGAG	948
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	53053	TGGAAAGGAGACCAAGAGAGGGTGGCATGAGTTGGTGAGGACGGATGGAG	53102

AL607131.15	949	AGGACACAATGGGACATTGACTGTGGAAAGAGCTGGGGTGGGGGTGGGGC	998
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	53103	AGGACACAATGGGACATTGACTGTGGAAAGAGCTGGGGTGGGGGTGGGGC	53152

AL607131.15	999	CATGGGAAGGGAATAGAGAGTTGGGGAGAAAATACCTCCTAGTGGTATCT	1048
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	53153	CATGGGAAGGGAATAGAGAGTTGGGGAGAAAATACCTCCTAGTGGTATCT	53202

AL607131.15	1049	ACCATAGTATATGCTGATTTTTAAAAACAGCATTTAAAAGGGAGTATTGG	1098
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	53203	ACCATAGTATATGCTGATTTTTAAAAACAGCATTTAAAAGGGAGTATTGG	53252

AL607131.15	1099	GTCAGTGGGCTTGCATGAATGGCTTGTGTATCATTCCCTTAGGTCTCCGC	1148
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	53253	GTCAGTGGGCTTGCATGAATGGCTTGTGTATCATTCCCTTAGGTCTCCGC	53302

AL607131.15	1149	TGGGTCTCCATGCCTGGCCTTATCATGCTGGAGTTCTGCCCATCAGTGAG	1198
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	53303	TGGGTCTCCATGCCTGGCCTTATCATGCTGGAGTTCTGCCCATCAGTGAG	53352

AL607131.15	1199	GATAGAGCAGTGTTTTGTTTTTTTGTTTTTTTTTTTCTAGAGAAAATCCA	1248
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	53353	GATAGAGCAGTGTTTTGTTTTTTTGTTTTTTTTTTTCTAGAGAAAATCCA	53402

AL607131.15	1249	TTCTGGATACACACAAGCCTTTGGATTAATGGTCCCTTTTGTTCCTGGAC	1298
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	53403	TTCTGGATACACACAAGCCTTTGGATTAATGGTCCCTTTTGTTCCTGGAC	53452

AL607131.15	1299	AAAGAGGATTCACGCTGATAAGCACTTTGGATTTTTAAAATTCAGAGTAA	1348
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	53453	AAAGAGGATTCACGCTGATAAGCACTTTGGATTTTTAAAATTCAGAGTAA	53502

AL607131.15	1349	GCAGTTGACAGCTGCAATCAGCCCACTTGCCCTGCACTTTCTGCCTATTG	1398
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	53503	GCAGTTGACAGCTGCAATCAGCCCACTTGCCCTGCACTTTCTGCCTATTG	53552

AL607131.15	1399	TCTTTGCTGTTACCAACAAAATGACCCTTCAGCATTTCCAGCCGCAGCCA	1448
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	53553	TCTTTGCTGTTACCAACAAAATGACCCTTCAGCATTTCCAGCCGCAGCCA	53602

AL607131.15	1449	ATTGCAGCTGTCTCTGTGGGCTGCTCCGGAAAAGCCAGCAAGTGCCAGGA	1498
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	53603	ATTGCAGCTGTCTCTGTGGGCTGCTCCGGAAAAGCCAGCAAGTGCCAGGA	53652

AL607131.15	1499	CTGCGTTTCTGCCTACTCACCAGTGACCTTTTCCCCTTGCTGCTGCCAAG	1548
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	53653	CTGCGTTTCTGCCTACTCACCAGTGACCTTTTCCCCTTGCTGCTGCCAAG	53702

AL607131.15	1549	GACTTCCTGGACAGCACCTTAGGCCCCTGACTATTTATGACTCCTGTTGG	1598
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	53703	GACTTCCTGGACAGCACCTTAGGCCCCTGACTATTTATGACTCCTGTTGG	53752

AL607131.15	1599	CTCCTGCTGTATACAGCACAAAGCCCCTACCATGGCAGCCCCTCCTAACC	1648
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	53753	CTCCTGCTGTATACAGCACAAAGCCCCTACCATGGCAGCCCCTCCTAACC	53802

AL607131.15	1649	TGCCTCTTTTCACCCCTGCTTTCAGGCCTGCAGTTGTCCCTGCATGAGCT	1698
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	53803	TGCCTCTTTTCACCCCTGCTTTCAGGCCTGCAGTTGTCCCTGCATGAGCT	53852

AL607131.15	1699	ATCTCCAGCAGCAGAGGCCTTTCGTGATGGGGGACGGATGCACTCGCAAA	1748
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	53853	ATCTCCAGCAGCAGAGGCCTTTCGTGATGGGGGACGGATGCACTCGCAAA	53902

AL607131.15	1749	GCAGAGATTGAAGCAGCATCATGTTCCAGGGAAAGACTGAACACAGAGGG	1798
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	53903	GCAGAGATTGAAGCAGCATCATGTTCCAGGGAAAGACTGAACACAGAGGG	53952

AL607131.15	1799	CAAAAGAGAAAGCAGCAACTCTACTTCCTACGCAGAACATTGTGCATAAC	1848
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	53953	CAAAAGAGAAAGCAGCAACTCTACTTCCTACGCAGAACATTGTGCATAAC	54002

AL607131.15	1849	CATGTTCCCCGAGAAGTCCCCGTTTGGTGGCCTTTGAATCCTGCTCACTG	1898
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	54003	CATGTTCCCCGAGAAGTCCCCGTTTGGTGGCCTTTGAATCCTGCTCACTG	54052

AL607131.15	1899	ATACCCAATAACATCACCTGTTCTGGTTCTCTTGATGTCAATTGCCTCTT	1948
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	54053	ATACCCAATAACATCACCTGTTCTGGTTCTCTTGATGTCAATTGCCTCTT	54102

AL607131.15	1949	TGCATTTAACTGGCAGCTGTCCAGTGTCCCTTCTGTCTTCATACCTAGCA	1998
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	54103	TGCATTTAACTGGCAGCTGTCCAGTGTCCCTTCTGTCTTCATACCTAGCA	54152

Compact alignment

skip 500 bps 100% identity alignment

AL607131.15	501	GTG--CAAATTAATATTCAGGAGATCAGTGTAGAATGGAGGGTCCTCAGA	548
			|||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645749.6	52653	GTGTGCAAATTAATATTCAGGAGATCAGTGTAGAATGGAGGGTCCTCAGA	52702

skip 1450 bps 100% identity alignment

Overview

Query
AL607131.15 - 172871 bps
Hit
AL645749.6 - 54152 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1998 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link