<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL606965.20	1	GAATTCACAGCCTGCAGGAAAAAGAATGTATCTGTAAATGATACAGCTGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	56319	GAATTCACAGCCTGCAGGAAAAAGAATGTATCTGTAAATGATACAGCTGA	56368

AL606965.20	51	CAAGGAGATAATGCCTAGAATTTATATAGAACTCAAAAACTCAACAGTGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	56369	CAAGGAGATAATGCCTAGAATTTATATAGAACTCAAAAACTCAACAGTGA	56418

AL606965.20	101	AATTATAAGACACTTAGGATGAACAAGACTTAGACAGACATTACTCAAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	56419	AATTATAAGACACTTAGGATGAACAAGACTTAGACAGACATTACTCAAAA	56468

AL606965.20	151	GAAGATGTACAAAGTTCATCAGGAATACGAAGAAACACTCAACAGTATTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	56469	GAAGATGTACAAAGTTCATCAGGAATACGAAGAAACACTCAACAGTATTG	56518

AL606965.20	201	ATCATCAGGCAAACATGAATCAAAATCACAGTGTAATAGCATCTCATTGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	56519	ATCATCAGGCAAACATGAATCAAAATCACAGTGTAATAGCATCTCATTGC	56568

AL606965.20	251	TGTTACAGTTGGTGATCATCAGAAAGGTGAAAGTCATTGAGCCCAGATGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	56569	TGTTACAGTTGGTGATCATCAGAAAGGTGAAAGTCATTGAGCCCAGATGT	56618

AL606965.20	301	AGAGGAAAGAGCTCTGAATACTGTTTCTGAAGATGGAAATTTCTATAGCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	56619	AGAGGAAAGAGCTCTGAATACTGTTTCTGAAGATGGAAATTTCTATAGCC	56668

AL606965.20	351	ACTATAGGACATATTCAACAAATTAAAAAAAAATCATGGTATGATCCAAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	56669	ACTATAGGACATATTCAACAAATTAAAAAAAAATCATGGTATGATCCAAT	56718

AL606965.20	401	GATAGGATACATGCAAATAGAACTGCCCACTAAAGAGACAACTGCACCCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	56719	GATAGGATACATGCAAATAGAACTGCCCACTAAAGAGACAACTGCACCCC	56768

AL606965.20	451	ATGTTAACTGTGGCATCAGTCACAACAGCCATGAAACGGAAACAAACGTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	56769	ATGTTAACTGTGGCATCAGTCACAACAGCCATGAAACGGAAACAAACGTG	56818

AL606965.20	501	ATTTTCATTATCCCCTTGAAAGTATTTGATCTTTTAGACAATTTCACTCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	56819	ATTTTCATTATCCCCTTGAAAGTATTTGATCTTTTAGACAATTTCACTCT	56868

AL606965.20	551	AGTAAAAAGTAAAATGTAATTGTTCTTTTGGTGTGATTTATGGAAAATAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	56869	AGTAAAAAGTAAAATGTAATTGTTCTTTTGGTGTGATTTATGGAAAATAT	56918

AL606965.20	601	GAGAAATATAACCATTTTCGAACTTGTTCATGGTTCTGAAAAATGTACCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	56919	GAGAAATATAACCATTTTCGAACTTGTTCATGGTTCTGAAAAATGTACCA	56968

AL606965.20	651	GCTCCCAGTAGAATTATCCCATCCTTAAGAAGTGGACAGCAACAGGTTTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	56969	GCTCCCAGTAGAATTATCCCATCCTTAAGAAGTGGACAGCAACAGGTTTG	57018

AL606965.20	701	TAGACACATGTCCCCTCTGGTAGTGGTGAACAGATCATAGCTCCACAGAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	57019	TAGACACATGTCCCCTCTGGTAGTGGTGAACAGATCATAGCTCCACAGAT	57068

AL606965.20	751	GTGGACGTGGCATCCATGAGGAGACAGAAGTGACCAATTTTAAAGCTCCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	57069	GTGGACGTGGCATCCATGAGGAGACAGAAGTGACCAATTTTAAAGCTCCA	57118

AL606965.20	801	TTCTTGTATTGTTTGTGTTACCTGCTCTATAAGTATGCCACACTTACTCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	57119	TTCTTGTATTGTTTGTGTTACCTGCTCTATAAGTATGCCACACTTACTCT	57168

AL606965.20	851	AAACTGTACTAAATATCAAGTTTCTGGTTCACAGAGTTAACTCATCTTGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	57169	AAACTGTACTAAATATCAAGTTTCTGGTTCACAGAGTTAACTCATCTTGA	57218

AL606965.20	901	GAGGAAAAGGTATCGCTTTCATTTGTTTGGTCCTGACCATTGTCTTTGTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	57219	GAGGAAAAGGTATCGCTTTCATTTGTTTGGTCCTGACCATTGTCTTTGTA	57268

AL606965.20	951	TGTCACTCACCAATACTCTACTTTAAGACATTTTATCATCCTGTTAGACA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	57269	TGTCACTCACCAATACTCTACTTTAAGACATTTTATCATCCTGTTAGACA	57318

AL606965.20	1001	CTAGCACAGGGATGAGTACACAAAAATGAAAAAAATACAGCCAGAATATC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	57319	CTAGCACAGGGATGAGTACACAAAAATGAAAAAAATACAGCCAGAATATC	57368

AL606965.20	1051	ATGAGAAGTCCTTTGATATGTGTCTTTCTATGAAGTCACAACAAGCAAAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	57369	ATGAGAAGTCCTTTGATATGTGTCTTTCTATGAAGTCACAACAAGCAAAG	57418

AL606965.20	1101	ATCAGTGAAGACCAGCGAAGCATTGCAAGGTGGACCAACACAGGGCATCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	57419	ATCAGTGAAGACCAGCGAAGCATTGCAAGGTGGACCAACACAGGGCATCA	57468

AL606965.20	1151	TCATCGAAGGGCTGCAAAGTATTTAAAGAGGAACCAACGCAAGGACATCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	57469	TCATCGAAGGGCTGCAAAGTATTTAAAGAGGAACCAACGCAAGGACATCT	57518

AL606965.20	1201	TTCACTGTCTGTTGGTTTCTACTTATATTCTTTCCGAACATCACACATCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	57519	TTCACTGTCTGTTGGTTTCTACTTATATTCTTTCCGAACATCACACATCC	57568

AL606965.20	1251	TCTCACATGTCTGCTTCAGCAAAACATCTTCTCATAGAGCTTCCAAAGAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	57569	TCTCACATGTCTGCTTCAGCAAAACATCTTCTCATAGAGCTTCCAAAGAA	57618

AL606965.20	1301	ACATCACATGACACAACTGAGTCTCCAGAGAAACCAGAAATTTCTACTTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	57619	ACATCACATGACACAACTGAGTCTCCAGAGAAACCAGAAATTTCTACTTC	57668

AL606965.20	1351	ATGCTTGTCTCAGTTTGACCATAGAAATGTCAAGACCTACCCCACATTAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	57669	ATGCTTGTCTCAGTTTGACCATAGAAATGTCAAGACCTACCCCACATTAT	57718

AL606965.20	1401	ATATGAAAATGGTTAGCACAGGGCCCTGTAGTTGGATAGGAGGTGCTCTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	57719	ATATGAAAATGGTTAGCACAGGGCCCTGTAGTTGGATAGGAGGTGCTCTG	57768

AL606965.20	1451	ATCATGGGGTAGTTCTCAGTGTGCTTGTGAATGATGTCCATGAGTGCTGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	57769	ATCATGGGGTAGTTCTCAGTGTGCTTGTGAATGATGTCCATGAGTGCTGG	57818

AL606965.20	1501	TTCATCTTTCACTTTTATTAACAATCTGATTATGACTCTAATAATAAGAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	57819	TTCATCTTTCACTTTTATTAACAATCTGATTATGACTCTAATAATAAGAA	57868

AL606965.20	1551	AAGTCAATTGAAGAAGGACGCAATTTTGGAAAAGTACAAAGGAGGTGAAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	57869	AAGTCAATTGAAGAAGGACGCAATTTTGGAAAAGTACAAAGGAGGTGAAA	57918

AL606965.20	1601	ATTACCCATAATTCTATTACCTAGGGTGGTTAGATAGGGTCCTCCACATT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	57919	ATTACCCATAATTCTATTACCTAGGGTGGTTAGATAGGGTCCTCCACATT	57968

AL606965.20	1651	CATAATCATTCACACAGCTACTTAAACTGTAGTGTTTGTGTAATATACAC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	57969	CATAATCATTCACACAGCTACTTAAACTGTAGTGTTTGTGTAATATACAC	58018

AL606965.20	1701	ATACATGTTTTTCTCTTTGCTTCTCAGTATTATATGCATTTGTTAGTATA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	58019	ATACATGTTTTTCTCTTTGCTTCTCAGTATTATATGCATTTGTTAGTATA	58068

AL606965.20	1751	ACACATTCTCAAAGATACAATGATTGAATAGCTGGATTTAATCAATTGGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	58069	ACACATTCTCAAAGATACAATGATTGAATAGCTGGATTTAATCAATTGGT	58118

AL606965.20	1801	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTAATTTATATGGTTAGCTGGCTTATCCACT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	58119	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTAATTTATATGGTTAGCTGGCTTATCCACT	58168

AL606965.20	1851	GGCTTTTTTGCCTTTGTTATTTATTATCAATAGTTTGTTATTGAGGATCC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	58169	GGCTTTTTTGCCTTTGTTATTTATTATCAATAGTTTGTTATTGAGGATCC	58218

AL606965.20	1901	TTATGTACATTTCTTATCACACTTTTAGCTATTTCCCTAGAGCAGATTCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	58219	TTATGTACATTTCTTATCACACTTTTAGCTATTTCCCTAGAGCAGATTCA	58268

AL606965.20	1951	CAGAGGCGGGGTTGTTAAATCAAAGGCATGGCATATCTGGAGGGCCCCTG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645748.9	58269	CAGAGGCGGGGTTGTTAAATCAAAGGCATGGCATATCTGGAGGGCCCCTG	58318

Overview

Query
AL606965.20 - 190594 bps
Hit
AL645748.9 - 58318 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link