<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL589701.9	1	GAATTCTTAGACATCTAAGTTTTCCTTTCACAAAATTTTATAAAATCATT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	73406	GAATTCTTAGACATCTAAGTTTTCCTTTCACAAAATTTTATAAAATCATT	73455

AL589701.9	51	ATTCATGGGCCTGATAAAACTTGACTGAATATTTCACTAAGATATAATAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	73456	ATTCATGGGCCTGATAAAACTTGACTGAATATTTCACTAAGATATAATAA	73505

AL589701.9	101	TTATGGTTTCAGGACATCACGAAGAAAATATTCCAACATGCCATATCTGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	73506	TTATGGTTTCAGGACATCACGAAGAAAATATTCCAACATGCCATATCTGT	73555

AL589701.9	151	TTAAGTATATGTATAAACCTATGTATGTAATTTCTTTGTCACTAAATATA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	73556	TTAAGTATATGTATAAACCTATGTATGTAATTTCTTTGTCACTAAATATA	73605

AL589701.9	201	TATTTGTTTTCTATTTCTCACTGTTATTATTGCTGCTGGTTTGAGGTTTC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	73606	TATTTGTTTTCTATTTCTCACTGTTATTATTGCTGCTGGTTTGAGGTTTC	73655

AL589701.9	251	TAAAAATAGCTCCTAGCTTCTTAGCATTTAAAATATGAATCTAATGTCTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	73656	TAAAAATAGCTCCTAGCTTCTTAGCATTTAAAATATGAATCTAATGTCTG	73705

AL589701.9	301	TAGTTATGACATTCTTGATAAGAAGGTCTGTACAATTCAGGGGAGGGAGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	73706	TAGTTATGACATTCTTGATAAGAAGGTCTGTACAATTCAGGGGAGGGAGA	73755

AL589701.9	351	AGAGGGGGGAAGAGGGAGGGAAGGAGAGAAGGGGAGAAGAGAAAGGTAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	73756	AGAGGGGGGAAGAGGGAGGGAAGGAGAGAAGGGGAGAAGAGAAAGGTAAA	73805

AL589701.9	401	GAAGGATGAGGATAAGTGGTGGGAAGAGGAAGCAGAAAAGGAGGGAGGGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	73806	GAAGGATGAGGATAAGTGGTGGGAAGAGGAAGCAGAAAAGGAGGGAGGGA	73855

AL589701.9	451	AGGAAGCTGGGCAGAAATTTAAAGACAAAAAAAAAAGTGAGAGGTTCAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	73856	AGGAAGCTGGGCAGAAATTTAAAGACAAAAAAAAAAGTGAGAGGTTCAAA	73905

AL589701.9	501	GAAGAAGTCACCTGTGTCTGAGTTGTTTGCTTCATCTAATTACTAACAAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	73906	GAAGAAGTCACCTGTGTCTGAGTTGTTTGCTTCATCTAATTACTAACAAA	73955

AL589701.9	551	GAGACGATGTGAGCTCTGGCTGCAAGGGAGTCTAAAGAATGGGGTTCGGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	73956	GAGACGATGTGAGCTCTGGCTGCAAGGGAGTCTAAAGAATGGGGTTCGGA	74005

AL589701.9	601	AGAAAATCTAAAGAAACTGCCTATTAGTCAGTCACCAAGGTGCTGTAATT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	74006	AGAAAATCTAAAGAAACTGCCTATTAGTCAGTCACCAAGGTGCTGTAATT	74055

AL589701.9	651	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCAAAACCCAGAAGAGGAAAAAAATTCTAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	74056	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCAAAACCCAGAAGAGGAAAAAAATTCTAT	74105

AL589701.9	701	TTTTTTTTTTTTTACCCCCGTACACAAAAGACCCGTTGAAATGGAAGCAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	74106	TTTTTTTTTTTTTACCCCCGTACACAAAAGACCCGTTGAAATGGAAGCAA	74155

AL589701.9	751	GTGGCATCCTCAGGAAAATAGAAGAGGTTTGATGCGGAAAATAGCCAACA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	74156	GTGGCATCCTCAGGAAAATAGAAGAGGTTTGATGCGGAAAATAGCCAACA	74205

AL589701.9	801	TCCTACACAGTAAGACTTTGTTATTGGCAAGCAGAAAGCAATAGTTCAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	74206	TCCTACACAGTAAGACTTTGTTATTGGCAAGCAGAAAGCAATAGTTCAAA	74255

AL589701.9	851	CTTTATCAAGCTTATCAGTTCCACCCAATTAAACCTGTTGCCCAGAGGGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	74256	CTTTATCAAGCTTATCAGTTCCACCCAATTAAACCTGTTGCCCAGAGGGT	74305

AL589701.9	901	ATGGTGAGCAAAACTCTCACCACTCACTTCTGAGCTTCAGCCTCAGTGAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	74306	ATGGTGAGCAAAACTCTCACCACTCACTTCTGAGCTTCAGCCTCAGTGAA	74355

AL589701.9	951	CCTCAATCTCCTTTCTGCGGTGTGCGTGTGGGGTGGTGCCGGCTCATCCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	74356	CCTCAATCTCCTTTCTGCGGTGTGCGTGTGGGGTGGTGCCGGCTCATCCT	74405

AL589701.9	1001	GACCTCCATCAGAAAGCGACCGCGTGGAAACACTCAACTCCGAGGAGCTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	74406	GACCTCCATCAGAAAGCGACCGCGTGGAAACACTCAACTCCGAGGAGCTT	74455

AL589701.9	1051	CTGGAGGGAATTATGTAGTGATGACATTCCTGTCGTCTATGACAGAAACG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	74456	CTGGAGGGAATTATGTAGTGATGACATTCCTGTCGTCTATGACAGAAACG	74505

AL589701.9	1101	ATGCATGACATTTGTATGTGATCCTTTCTGGAAAAGGACCCTCTGAAGAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	74506	ATGCATGACATTTGTATGTGATCCTTTCTGGAAAAGGACCCTCTGAAGAA	74555

AL589701.9	1151	GCTGGGAGGATAATTTGAGAATTTCCATCTAGTGTACTGACACCATCACA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	74556	GCTGGGAGGATAATTTGAGAATTTCCATCTAGTGTACTGACACCATCACA	74605

AL589701.9	1201	CCATCTCCCACTCCATTTGTTGAAAATGGAGACCAACAGTTTCTGAGAAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	74606	CCATCTCCCACTCCATTTGTTGAAAATGGAGACCAACAGTTTCTGAGAAA	74655

AL589701.9	1251	ATCTCCCTTCTCAACCCAGAAGACTTTGGCCTGAAAATTATCTCTTCTTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	74656	ATCTCCCTTCTCAACCCAGAAGACTTTGGCCTGAAAATTATCTCTTCTTT	74705

AL589701.9	1301	GGTCTAGTGGATGGCAGTCAACAAAGGCTCTCGAAAGCTCAAATTAGAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	74706	GGTCTAGTGGATGGCAGTCAACAAAGGCTCTCGAAAGCTCAAATTAGAAA	74755

AL589701.9	1351	CAACAGAAATGGAAGATGAATGCAAATTCAGACACCCACGCCTCTGTGTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	74756	CAACAGAAATGGAAGATGAATGCAAATTCAGACACCCACGCCTCTGTGTT	74805

AL589701.9	1401	TCATTCACACTTCCCATCATCCTAAGCTGGTTTTCCCTCGAGAAGTCACT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	74806	TCATTCACACTTCCCATCATCCTAAGCTGGTTTTCCCTCGAGAAGTCACT	74855

AL589701.9	1451	TCTTATCCTCGTCTGGTTCTTATGAAGAGATGAGCATTCTCAGGCACTCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	74856	TCTTATCCTCGTCTGGTTCTTATGAAGAGATGAGCATTCTCAGGCACTCA	74905

AL589701.9	1501	AGACCTTGAAATTATAACTGGGTGTGTGTGGTGTGTGTGTGTCTGCCTGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	74906	AGACCTTGAAATTATAACTGGGTGTGTGTGGTGTGTGTGTGTCTGCCTGT	74955

AL589701.9	1551	CTGCCTGTCTATCTGTTTCTGCCTCTGTCTCTGTCTGTCTCTCTGTCTCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	74956	CTGCCTGTCTATCTGTTTCTGCCTCTGTCTCTGTCTGTCTCTCTGTCTCT	75005

AL589701.9	1601	TCTCTCGGTCTCTCTCTCATTCTCTCTGTCTCTGTCTCTATCTCTCTCTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	75006	TCTCTCGGTCTCTCTCTCATTCTCTCTGTCTCTGTCTCTATCTCTCTCTG	75055

AL589701.9	1651	TCTCTCTCCCCAGTGTTAAGTTAATTACTAAGAACTCACAAAGGTAGAGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	75056	TCTCTCTCCCCAGTGTTAAGTTAATTACTAAGAACTCACAAAGGTAGAGA	75105

AL589701.9	1701	AAAAGACACCAGAAAAGTGGGGCTTAGTAAAGCACAGATTTGGGAGAAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	75106	AAAAGACACCAGAAAAGTGGGGCTTAGTAAAGCACAGATTTGGGAGAAAA	75155

AL589701.9	1751	CTGTTCTGTATTCAAAACAGGTTGAGGATGCCACAGGACCTTTCTCCCTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	75156	CTGTTCTGTATTCAAAACAGGTTGAGGATGCCACAGGACCTTTCTCCCTT	75205

AL589701.9	1801	CAGGGTGGCCAGGGGTCCATGAGCCTGTGCTCTGGATTCTCCTGCAATGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	75206	CAGGGTGGCCAGGGGTCCATGAGCCTGTGCTCTGGATTCTCCTGCAATGC	75255

AL589701.9	1851	CCCCGCACTATGTGCAGCCCAAGTGTGGACTTTAGGAGCCAACAGGCACA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	75256	CCCCGCACTATGTGCAGCCCAAGTGTGGACTTTAGGAGCCAACAGGCACA	75305

AL589701.9	1901	AAAAGAGGCGACAACCTGCAATGACAAATTCTCAAGCTAAAGTTTTCAGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	75306	AAAAGAGGCGACAACCTGCAATGACAAATTCTCAAGCTAAAGTTTTCAGA	75355

AL589701.9	1951	GCTTCCTCATCTCCCTTAATTAGACAGGAAGTGGAGTGCTTCAGTGAATG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645746.10	75356	GCTTCCTCATCTCCCTTAATTAGACAGGAAGTGGAGTGCTTCAGTGAATG	75405

Overview

Query
AL589701.9 - 219200 bps
Hit
AL645746.10 - 75405 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link