<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL606764.19	1	GAATTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCTTGTCTCAAAAAACC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	135943	GAATTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCTTGTCTCAAAAAACC	135992

AL606764.19	51	AATTATATATATATGTACATATGTACGCCTGGCTTTTTGGTCATCAACAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	135993	AATTATATATATATGTACATATGTACGCCTGGCTTTTTGGTCATCAACAG	136042

AL606764.19	101	GCATATATAAAGCCTACAACACCATTAAATAGCCCAGAAAAACAGAAGGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	136043	GCATATATAAAGCCTACAACACCATTAAATAGCCCAGAAAAACAGAAGGC	136092

AL606764.19	151	TGCTGCTAGGGGCCCTGAAATAACTTTTAGATAGGAAATGGAATATAAAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	136093	TGCTGCTAGGGGCCCTGAAATAACTTTTAGATAGGAAATGGAATATAAAA	136142

AL606764.19	201	AAGGCCAGAGGAAGTCATACTGTAAATGACATTATTTTTCTAAAGTGAAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	136143	AAGGCCAGAGGAAGTCATACTGTAAATGACATTATTTTTCTAAAGTGAAT	136192

AL606764.19	251	ATATGGCAGAATGGCAGAGAAACTAAGCTAGCTGGGCATGTGAGGCCATC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	136193	ATATGGCAGAATGGCAGAGAAACTAAGCTAGCTGGGCATGTGAGGCCATC	136242

AL606764.19	301	TTCCCTTCTGCTACCTTCTGTTTTATCCTAACACATTCTTCTCATAGTGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	136243	TTCCCTTCTGCTACCTTCTGTTTTATCCTAACACATTCTTCTCATAGTGC	136292

AL606764.19	351	AGGAAGTAAATGACTTTGCAGCAGCTACTCCAAACACACAGAACCCCCTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	136293	AGGAAGTAAATGACTTTGCAGCAGCTACTCCAAACACACAGAACCCCCTC	136342

AL606764.19	401	AATGTCTCAAGTGGCTTCAAGCCTGTCCTTTACCAGTCTTTCATTTAGGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	136343	AATGTCTCAAGTGGCTTCAAGCCTGTCCTTTACCAGTCTTTCATTTAGGA	136392

AL606764.19	451	TTAAGACTTCCATTCTAGTTGATTGAGTGTGCAAGTCTATCCTGCCCTGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	136393	TTAAGACTTCCATTCTAGTTGATTGAGTGTGCAAGTCTATCCTGCCCTGT	136442

AL606764.19	501	TCCCCCACTGTGCTGACTTGGTTTCTCCATTACAAGACTTCTGGACCCTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	136443	TCCCCCACTGTGCTGACTTGGTTTCTCCATTACAAGACTTCTGGACCCTC	136492

AL606764.19	551	TTCAAAGTGAGAACTACTTCAGTAATCTAAAGACTAACTCTCAGCAAGTA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	136493	TTCAAAGTGAGAACTACTTCAGTAATCTAAAGACTAACTCTCAGCAAGTA	136542

AL606764.19	601	CATTTTGTTTGTGTATGTTATATTGAACATTACATGAAAGTGGGAAGAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	136543	CATTTTGTTTGTGTATGTTATATTGAACATTACATGAAAGTGGGAAGAAA	136592

AL606764.19	651	ACAGAATAACAAGAATCTAATTCTTAAACTTAGATGGTTAATCTGAAGTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	136593	ACAGAATAACAAGAATCTAATTCTTAAACTTAGATGGTTAATCTGAAGTT	136642

AL606764.19	701	TGTTTGTACCTGGTATAGAGATGTACATTTGACCATAATAGTCTCTGTAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	136643	TGTTTGTACCTGGTATAGAGATGTACATTTGACCATAATAGTCTCTGTAT	136692

AL606764.19	751	ATGAAGGAATGAGTCTTATGTAGTACTTCTCTGTACTCCTAGTCAGCACC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	136693	ATGAAGGAATGAGTCTTATGTAGTACTTCTCTGTACTCCTAGTCAGCACC	136742

AL606764.19	801	AGCAATGAACCCTTGAGACTGTGAATAAAGTCTTCTGACTCAAAATCTAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	136743	AGCAATGAACCCTTGAGACTGTGAATAAAGTCTTCTGACTCAAAATCTAG	136792

AL606764.19	851	ATCTTTTTCAATGTTATCCATTTCCTTCTGAATAATACAACCCTGAGAGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	136793	ATCTTTTTCAATGTTATCCATTTCCTTCTGAATAATACAACCCTGAGAGG	136842

AL606764.19	901	ATCTGGGTCCTCTCAGAACACAAGTCAGATCTGATGAGATCCCTCCACTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	136843	ATCTGGGTCCTCTCAGAACACAAGTCAGATCTGATGAGATCCCTCCACTA	136892

AL606764.19	951	GGGAAGAACACAGGCACAGATTTTGGAAACAAAGGAACATAACTTGGGAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	136893	GGGAAGAACACAGGCACAGATTTTGGAAACAAAGGAACATAACTTGGGAA	136942

AL606764.19	1001	GTGATGGACAGGTAAGCTGTTGTGAGGAGTGAAAGTGAAAACCCTGGGAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	136943	GTGATGGACAGGTAAGCTGTTGTGAGGAGTGAAAGTGAAAACCCTGGGAG	136992

AL606764.19	1051	ACCGCTGACAACCTGGTGCACCTCCGCACCTCTTGGGAGATGGACATGGA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	136993	ACCGCTGACAACCTGGTGCACCTCCGCACCTCTTGGGAGATGGACATGGA	137042

AL606764.19	1101	ACCACCTTGCTCTCCTCTCTAACTAGAGAAAGATGGGAGGCTTGGAGTAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	137043	ACCACCTTGCTCTCCTCTCTAACTAGAGAAAGATGGGAGGCTTGGAGTAG	137092

AL606764.19	1151	CCCTCCAAGTCAGGGTGCACACAAATCAGCTAGGACATGGCTGATGGGTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	137093	CCCTCCAAGTCAGGGTGCACACAAATCAGCTAGGACATGGCTGATGGGTT	137142

AL606764.19	1201	ACACAGCGTTTGCTGGGAGCTGGGAAGGGAACAAAGATCAGAACGGTCAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	137143	ACACAGCGTTTGCTGGGAGCTGGGAAGGGAACAAAGATCAGAACGGTCAC	137192

AL606764.19	1251	TGTGCATTAATAAGGCTCCTTCTGAGAGACCAAGAAAACAAAAGCATAGT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	137193	TGTGCATTAATAAGGCTCCTTCTGAGAGACCAAGAAAACAAAAGCATAGT	137242

AL606764.19	1301	TGGGACAGGTGGCTGGTACAGTCTGAGTTTCAAAGGCTCCTTCCTTCAGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	137243	TGGGACAGGTGGCTGGTACAGTCTGAGTTTCAAAGGCTCCTTCCTTCAGG	137292

AL606764.19	1351	TCCATCTCCTCTACCCCACTTTCTTCCTAGATTCACATGGAACAGCTATT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	137293	TCCATCTCCTCTACCCCACTTTCTTCCTAGATTCACATGGAACAGCTATT	137342

AL606764.19	1401	TCAATCCACTTCATGGCTTCCCTTAGCTCTTGACACTTGTTCTTACTGTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	137343	TCAATCCACTTCATGGCTTCCCTTAGCTCTTGACACTTGTTCTTACTGTG	137392

AL606764.19	1451	TTTTGTTTTGTTTTGTTTTTGTTTCCTATAAGCTAGAGTTATCTGGGAAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	137393	TTTTGTTTTGTTTTGTTTTTGTTTCCTATAAGCTAGAGTTATCTGGGAAA	137442

AL606764.19	1501	AGGAACCTCAATTGAGAAAATGCCTCTATCAGATTGCTTACAGGGATTTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	137443	AGGAACCTCAATTGAGAAAATGCCTCTATCAGATTGCTTACAGGGATTTG	137492

AL606764.19	1551	GTTTTGGCTTTGTCATATAACCTATGTTCAAATAAAAGAGGGGACTGGGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	137493	GTTTTGGCTTTGTCATATAACCTATGTTCAAATAAAAGAGGGGACTGGGA	137542

AL606764.19	1601	GGAAAAAAGAAGGCTGGAAGGGCAAATGCCAGGAAGGAAATGTCATGCCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	137543	GGAAAAAAGAAGGCTGGAAGGGCAAATGCCAGGAAGGAAATGTCATGCCT	137592

AL606764.19	1651	TCTGCTTCCCCACCTGTCCATCCAGGCAACTCTGCAGCAGCAGGAAACAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	137593	TCTGCTTCCCCACCTGTCCATCCAGGCAACTCTGCAGCAGCAGGAAACAG	137642

AL606764.19	1701	CCGAGGCACTTTTAACACTCAAGATGCAGGTGCTGTATTGCGTCTGTTTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	137643	CCGAGGCACTTTTAACACTCAAGATGCAGGTGCTGTATTGCGTCTGTTTA	137692

AL606764.19	1751	CGTAACCCCAAAATGTATACTGCAGTCACCACAGTGGCCATCTTAACATG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	137693	CGTAACCCCAAAATGTATACTGCAGTCACCACAGTGGCCATCTTAACATG	137742

AL606764.19	1801	GGATGATGTTTCTGGCTCAAGTGACTTAAGCTGACTACCACAGCCACTCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	137743	GGATGATGTTTCTGGCTCAAGTGACTTAAGCTGACTACCACAGCCACTCC	137792

AL606764.19	1851	CTTTAGCATGATACACTTCATTCTCTGTGCTTGCCATTTTACTTACTGAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	137793	CTTTAGCATGATACACTTCATTCTCTGTGCTTGCCATTTTACTTACTGAA	137842

AL606764.19	1901	GTCAAACTGAAGTCTTCATGGATGCTTCCAAACAAATCAGGAGAAGAAAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	137843	GTCAAACTGAAGTCTTCATGGATGCTTCCAAACAAATCAGGAGAAGAAAC	137892

AL606764.19	1951	ATCAACAGAAAGACTAAAGGCAGAAGAGGCAAAACAACAGTCATAATTAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645745.7	137893	ATCAACAGAAAGACTAAAGGCAGAAGAGGCAAAACAACAGTCATAATTAA	137942

Overview

Query
AL606764.19 - 127433 bps
Hit
AL645745.7 - 137942 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link