<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645702.14	1	GAATTCTTTCTTTAGCTCTGAGCCCCATTTTTTTTGAGGATTTTTTTCCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	106016	GAATTCTTTCTTTAGCTCTGAGCCCCATTTTTTTTGAGGATTTTTTTCCC	106065

AL645702.14	51	ATTTTTTATTAGGTATTTAGCTCATTTACATTTCCAATGCTATACCAAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	106066	ATTTTTTATTAGGTATTTAGCTCATTTACATTTCCAATGCTATACCAAAA	106115

AL645702.14	101	GTCCCCCATACCTGCCCACCCCCACTCCCCTACCCACCCACTCCCCCTTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	106116	GTCCCCCATACCTGCCCACCCCCACTCCCCTACCCACCCACTCCCCCTTT	106165

AL645702.14	151	TTGGCCCTGGCGTTCCCCTGTACTGGGGCATACAAAGTTTGCGTGTCCAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	106166	TTGGCCCTGGCGTTCCCCTGTACTGGGGCATACAAAGTTTGCGTGTCCAA	106215

AL645702.14	201	TGGGCCTCTCTTTCCAGTGATGGCCAACTAGGCCATCTTTTGATACATAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	106216	TGGGCCTCTCTTTCCAGTGATGGCCAACTAGGCCATCTTTTGATACATAT	106265

AL645702.14	251	GCAGCTAGAGTCAAGAGCTCCGGGGTACTGGTTAGTTCATAATATTGTTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	106266	GCAGCTAGAGTCAAGAGCTCCGGGGTACTGGTTAGTTCATAATATTGTTC	106315

AL645702.14	301	CACCGATAGGGTTGCAGATCCCTTTAGCTCCTTGGGTTCTTTCTCTAGCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	106316	CACCGATAGGGTTGCAGATCCCTTTAGCTCCTTGGGTTCTTTCTCTAGCT	106365

AL645702.14	351	CCTCCATTGGGAGCCCTGTGATCCATCCAATAGTTGACTGTGAGCATCCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	106366	CCTCCATTGGGAGCCCTGTGATCCATCCAATAGTTGACTGTGAGCATCCA	106415

AL645702.14	401	CTTCTGTGTTTGCTAGGCCCCGGCATAGTCTCACAAGAGATAGCTACATC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	106416	CTTCTGTGTTTGCTAGGCCCCGGCATAGTCTCACAAGAGATAGCTACATC	106465

AL645702.14	451	TGGGTCCTTTCGATAAAATCTTGCTAGGGTATGCAATGGTGTCAGCGTTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	106466	TGGGTCCTTTCGATAAAATCTTGCTAGGGTATGCAATGGTGTCAGCGTTT	106515

AL645702.14	501	GGATGCTGATTATGGGGTGGATCCCTGGATATGGCAGTCTCTACATGGTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	106516	GGATGCTGATTATGGGGTGGATCCCTGGATATGGCAGTCTCTACATGGTC	106565

AL645702.14	551	CATTCTTTCATCTCAGCTCCAAACTTTGTCTCTGTAACTCCTTCCATGGG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	106566	CATTCTTTCATCTCAGCTCCAAACTTTGTCTCTGTAACTCCTTCCATGGG	106615

AL645702.14	601	TGTTTTGTTCCCAATTCTAAAGAGGGGCATAGTGTCCACACTTCAGTCTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	106616	TGTTTTGTTCCCAATTCTAAAGAGGGGCATAGTGTCCACACTTCAGTCTT	106665

AL645702.14	651	CATTCTTCTTGAGTTTCATGTGTTTAGCAAATTGTACCTTATATCTTGGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	106666	CATTCTTCTTGAGTTTCATGTGTTTAGCAAATTGTACCTTATATCTTGGG	106715

AL645702.14	701	AATCCTAGGTTTGGGGCTAATATCCACTTATCAGTGAGTACATATTGTGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	106716	AATCCTAGGTTTGGGGCTAATATCCACTTATCAGTGAGTACATATTGTGT	106765

AL645702.14	751	GAGTTCCTTTGTGAATGTGTTACCTCACTCAGGATGATGCCCTCCAGGTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	106766	GAGTTCCTTTGTGAATGTGTTACCTCACTCAGGATGATGCCCTCCAGGTC	106815

AL645702.14	801	CATCCATTTGGCTAGGAATTTCATAAATTCATTCTTTTTAATAGCTGAGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	106816	CATCCATTTGGCTAGGAATTTCATAAATTCATTCTTTTTAATAGCTGAGT	106865

AL645702.14	851	AGTACTCCATTGTGTAGATGTACCACATTTTCTGTATCCATTCCTCTGTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	106866	AGTACTCCATTGTGTAGATGTACCACATTTTCTGTATCCATTCCTCTGTT	106915

AL645702.14	901	GAGGGGCATCTGGGTTCTTTCCAGCTTCTGGCTATTATAAATAAGGCTGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	106916	GAGGGGCATCTGGGTTCTTTCCAGCTTCTGGCTATTATAAATAAGGCTGC	106965

AL645702.14	951	TATGAACATAGTGGAGCATGTGTCCTTCTTACCCGTTGGGGCATCTTCTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	106966	TATGAACATAGTGGAGCATGTGTCCTTCTTACCCGTTGGGGCATCTTCTG	107015

AL645702.14	1001	GATATATGCCCAGGAGAGGTATTGCTGGATCCTCCGGTAGTACTATGTCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	107016	GATATATGCCCAGGAGAGGTATTGCTGGATCCTCCGGTAGTACTATGTCC	107065

AL645702.14	1051	AATTTTCTGAGGAACCGCCAGACTGATTTCCAGAGTGGTTGTACAAGCCT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	107066	AATTTTCTGAGGAACCGCCAGACTGATTTCCAGAGTGGTTGTACAAGCCT	107115

AL645702.14	1101	GCAATCTCACCAACAATGGAGGAGTGTTCCTCTTTCTCCACATCCACGCC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	107116	GCAATCTCACCAACAATGGAGGAGTGTTCCTCTTTCTCCACATCCACGCC	107165

AL645702.14	1151	AGCATCTGCTGTCACCTGAATTTTTGATCTTAGCCATTCTGACTGGTGTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	107166	AGCATCTGCTGTCACCTGAATTTTTGATCTTAGCCATTCTGACTGGTGTG	107215

AL645702.14	1201	AGGTGGAATCTCAGGGTTGTTTTGATTTGCATTTCCCTGATGATTAAGGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	107216	AGGTGGAATCTCAGGGTTGTTTTGATTTGCATTTCCCTGATGATTAAGGA	107265

AL645702.14	1251	TGCTGAACATTTTTTCTGGTGCTTCTCAGCCATTCAGTATTCCTCAGTTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	107266	TGCTGAACATTTTTTCTGGTGCTTCTCAGCCATTCAGTATTCCTCAGTTG	107315

AL645702.14	1301	AGAATTCTTTCTTTAGCTCTGAGCCCCATTTTTTAATGGGGTTATTTGAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	107316	AGAATTCTTTCTTTAGCTCTGAGCCCCATTTTTTAATGGGGTTATTTGAT	107365

AL645702.14	1351	TTTCTGGAGTCCACCTTCTTGAGTTCTTTATATATTGGATATAGACCCCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	107366	TTTCTGGAGTCCACCTTCTTGAGTTCTTTATATATTGGATATAGACCCCT	107415

AL645702.14	1401	ATCTGATTTAGGATAGGTAAAGATCCTTTCCCAATCTGTTGGTGGCCTTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	107416	ATCTGATTTAGGATAGGTAAAGATCCTTTCCCAATCTGTTGGTGGCCTTT	107465

AL645702.14	1451	TTGTCTTATTGATGGTGTCTTTTGCCTTACAGAAGCTTTGCAATTTTATG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	107466	TTGTCTTATTGATGGTGTCTTTTGCCTTACAGAAGCTTTGCAATTTTATG	107515

AL645702.14	1501	AGGTCCCGTTTGTCGATTCTTGATCTTACAGCACAAGCCATTGCTGATAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	107516	AGGTCCCGTTTGTCGATTCTTGATCTTACAGCACAAGCCATTGCTGATAT	107565

AL645702.14	1551	AGCTGTCTCTTGTGAGGCTATGCTGGGGCCTAGGAAACACAGAAGTGGAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	107566	AGCTGTCTCTTGTGAGGCTATGCTGGGGCCTAGGAAACACAGAAGTGGAG	107615

AL645702.14	1601	GCTCACAGTCAGCTATTGGATGGATGACTGGGCTCCCAATGGAGGAGCTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	107616	GCTCACAGTCAGCTATTGGATGGATGACTGGGCTCCCAATGGAGGAGCTA	107665

AL645702.14	1651	GAGAAAGTACCCAAGCAGCTAAAGGGATCTGCCACCCTATAGGTGGAACA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	107666	GAGAAAGTACCCAAGCAGCTAAAGGGATCTGCCACCCTATAGGTGGAACA	107715

AL645702.14	1701	ACAATATGAACTAACCAGTACCCCCTGGAGCTTGTGTCTCTAGCTGCATA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	107716	ACAATATGAACTAACCAGTACCCCCTGGAGCTTGTGTCTCTAGCTGCATA	107765

AL645702.14	1751	AGTATCAGAAGATGGCCTAGTCGGCCATCACCGGGAAGAGAGGCCCATTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	107766	AGTATCAGAAGATGGCCTAGTCGGCCATCACCGGGAAGAGAGGCCCATTG	107815

AL645702.14	1801	ATTGGTCTTGCAAACTTTATATGCCTCAGTACAGGGGAACGCCAGGGCCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	107816	ATTGGTCTTGCAAACTTTATATGCCTCAGTACAGGGGAACGCCAGGGCCA	107865

AL645702.14	1851	AGAAGTGGAAGTGGATGGGTAGGTGAGTGTGGGGGGGTTATGGGGGACTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	107866	AGAAGTGGAAGTGGATGGGTAGGTGAGTGTGGGGGGGTTATGGGGGACTT	107915

AL645702.14	1901	TTGGGATAGCATTGGAAATGTAAATGAAGAAAATATCTAATAAAAATAAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	107916	TTGGGATAGCATTGGAAATGTAAATGAAGAAAATATCTAATAAAAATAAT	107965

AL645702.14	1951	AATAAAAAAAGAAAGAAAAAAAATTACTGCTTGATATAACTCCCTGTAAT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645744.16	107966	AATAAAAAAAGAAAGAAAAAAAATTACTGCTTGATATAACTCCCTGTAAT	108015

Overview

Query
AL645702.14 - 205103 bps
Hit
AL645744.16 - 108015 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link