<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
AL671560.7 1 AGTCTGCCCCTGCCCCTGAGTCCCCTGGACTCCTACACACACACACACAC 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 216428 AGTCTGCCCCTGCCCCTGAGTCCCCTGGACTCCTACACACACACACACAC 216477 AL671560.7 51 ACACACACACACACACACACACACACACACACAAACACACACACCCACCA 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 216478 ACACACACACACACACACACACACACACACACAAACACACACACCCACCA 216527 AL671560.7 101 AACCACACACACCACATACTACACACAAACACTACATATACCACATACTA 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 216528 AACCACACACACCACATACTACACACAAACACTACATATACCACATACTA 216577 AL671560.7 151 CATATAAACACACACACACCACACTACACATACCATACCACACACACATA 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 216578 CATATAAACACACACACACCACACTACACATACCATACCACACACACATA 216627 AL671560.7 201 CACATACCACACGTACACACAGGTATACACCATATATACATGCGCACCAC 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 216628 CACATACCACACGTACACACAGGTATACACCATATATACATGCGCACCAC 216677 AL671560.7 251 ATACAGATACAAACAGTACACCACACATACCACACACACATACACAAACC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 216678 ATACAGATACAAACAGTACACCACACATACCACACACACATACACAAACC 216727 AL671560.7 301 AACACATATCATACACTCATATACATACCACACACACATACACACACCAC 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 216728 AACACATATCATACACTCATATACATACCACACACACATACACACACCAC 216777 AL671560.7 351 ACATACCAGAGGCACACACAGGCATACACCATACACATACCGCACACACA 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 216778 ACATACCAGAGGCACACACAGGCATACACCATACACATACCGCACACACA 216827 AL671560.7 401 CACAGACCGTACACCACACACAAACACATATGCATACAACAACACACACC 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 216828 CACAGACCGTACACCACACACAAACACATATGCATACAACAACACACACC 216877 AL671560.7 451 ACCAACACACACACACATATACAAATACACTCACCACCCTCTTTGGGTCC 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 216878 ACCAACACACACACACATATACAAATACACTCACCACCCTCTTTGGGTCC 216927 AL671560.7 501 CCACCACTACTACCTTTTCTCTCCATCTGGAATCCTAAGATGTGAAGGCC 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 216928 CCACCACTACTACCTTTTCTCTCCATCTGGAATCCTAAGATGTGAAGGCC 216977 AL671560.7 551 AGTAATGGAGTGTCAGCGGAAGTAATTGATTCCTCACACACAGAGAATGC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 216978 AGTAATGGAGTGTCAGCGGAAGTAATTGATTCCTCACACACAGAGAATGC 217027 AL671560.7 601 CCCTGCCTTTAGTGTCAATGGAGCTGAACCAGATTCTGGGCGGGTGAGCG 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 217028 CCCTGCCTTTAGTGTCAATGGAGCTGAACCAGATTCTGGGCGGGTGAGCG 217077 AL671560.7 651 AGACGTGTAAACAGTTCATAGCTGAGCTGTCAGGGCCAAGCCAGACACAG 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 217078 AGACGTGTAAACAGTTCATAGCTGAGCTGTCAGGGCCAAGCCAGACACAG 217127 AL671560.7 701 TGGAGAGGGGGTGAGAGGGAGAACCATGGAACAAATAATTGTTTTATTGG 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 217128 TGGAGAGGGGGTGAGAGGGAGAACCATGGAACAAATAATTGTTTTATTGG 217177 AL671560.7 751 AAAAGAAAGCAATAAATAATATTTCAGCCCAGGAACTGGCTGTTTGAAAG 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 217178 AAAAGAAAGCAATAAATAATATTTCAGCCCAGGAACTGGCTGTTTGAAAG 217227 AL671560.7 801 GGATGGAGACAGCCTAGGACCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 217228 GGATGGAGACAGCCTAGGACCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 217277 AL671560.7 851 AACATGGCACAGGTTTGAATGGGAGAGTTTTTCTTTGTCTTGAGGTAGGA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 217278 AACATGGCACAGGTTTGAATGGGAGAGTTTTTCTTTGTCTTGAGGTAGGA 217327 AL671560.7 901 GGTTTCTTCCTGCCCCACCCCCTTTCTCCCATTATCATCATTAAAATAAT 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 217328 GGTTTCTTCCTGCCCCACCCCCTTTCTCCCATTATCATCATTAAAATAAT 217377 AL671560.7 951 TACTCTAACAATTACAGTTGATGAGACCTGGGGTTTATGGAACACCTTTC 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 217378 TACTCTAACAATTACAGTTGATGAGACCTGGGGTTTATGGAACACCTTTC 217427 AL671560.7 1001 ATCTGAAAGTTCAAAGTGATTTATCTGTGTGTCATCCTCTGAGAACTGTG 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 217428 ATCTGAAAGTTCAAAGTGATTTATCTGTGTGTCATCCTCTGAGAACTGTG 217477 AL671560.7 1051 GGAGGGTAAGAAAGTATTATTATTGTTATTATTATTATTATTATTATTAT 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 217478 GGAGGGTAAGAAAGTATTATTATTGTTATTATTATTATTATTATTATTAT 217527 AL671560.7 1101 TATTATTATTTGGTCCTGCCAGATACATGACTCCATCCAACCCCAGGGCA 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 217528 TATTATTATTTGGTCCTGCCAGATACATGACTCCATCCAACCCCAGGGCA 217577 AL671560.7 1151 GGCTGTAGGTTAAATGCTGGGGTATAGACTTCTCTTCTGGGGCGTCTTCA 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 217578 GGCTGTAGGTTAAATGCTGGGGTATAGACTTCTCTTCTGGGGCGTCTTCA 217627 AL671560.7 1201 CTATTGTACCCTTCTCAGCAAGCCTCTTTTCCACACGTGGCTCTTAGACT 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 217628 CTATTGTACCCTTCTCAGCAAGCCTCTTTTCCACACGTGGCTCTTAGACT 217677 AL671560.7 1251 TCATCACCAGCACTAATGTCTTCTCCATGCTATGGGGTCCCCACATATGT 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 217678 TCATCACCAGCACTAATGTCTTCTCCATGCTATGGGGTCCCCACATATGT 217727 AL671560.7 1301 GTGGTGTGTGTGTGTGTGTGGTGTGGTATGTATGTGGTATGTGTATGTGT 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 217728 GTGGTGTGTGTGTGTGTGTGGTGTGGTATGTATGTGGTATGTGTATGTGT 217777 AL671560.7 1351 GTGGTCATCACAATATGGTGACCAGCCAGCCAGCTGATCCATACACACCA 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 217778 GTGGTCATCACAATATGGTGACCAGCCAGCCAGCTGATCCATACACACCA 217827 AL671560.7 1401 CAAGTGACCTGCTTACGGCTTCCAGAGAAATAAGTCCTTTAAGTACGGTT 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 217828 CAAGTGACCTGCTTACGGCTTCCAGAGAAATAAGTCCTTTAAGTACGGTT 217877 AL671560.7 1451 CAACCCAGACTGTTTCCGGCTACCTTGGAGACTTCCTGCAACCTGCCTCT 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 217878 CAACCCAGACTGTTTCCGGCTACCTTGGAGACTTCCTGCAACCTGCCTCT 217927 AL671560.7 1501 CTTCTTATAGAAGCGTGTGCACTTTCTAGACATATTCCCTCATGGTCCAC 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 217928 CTTCTTATAGAAGCGTGTGCACTTTCTAGACATATTCCCTCATGGTCCAC 217977 AL671560.7 1551 TAAGACTCAGCCTAACAGCACCCTATATTCCTGGGTGCTACTTCCGTGCC 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 217978 TAAGACTCAGCCTAACAGCACCCTATATTCCTGGGTGCTACTTCCGTGCC 218027 AL671560.7 1601 CAGCAAACGGGGTATTTTAACACATGCATTTCCACTGTGCAGCGAGGCCA 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 218028 CAGCAAACGGGGTATTTTAACACATGCATTTCCACTGTGCAGCGAGGCCA 218077 AL671560.7 1651 GGGCTGTGACTTGCATTCCTGACCGGGTCTGGCTTTGCTCTGAGAGCCAC 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 218078 GGGCTGTGACTTGCATTCCTGACCGGGTCTGGCTTTGCTCTGAGAGCCAC 218127 AL671560.7 1701 CACAGTGTTTCAGGATGTATATCGGGACACAGCATCCAAGTGGCACTTTG 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 218128 CACAGTGTTTCAGGATGTATATCGGGACACAGCATCCAAGTGGCACTTTG 218177 AL671560.7 1751 AGAGGAGGAAACAGTTCCAGCTGACTGGCCACCAAGGGCCACATTCAGAA 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 218178 AGAGGAGGAAACAGTTCCAGCTGACTGGCCACCAAGGGCCACATTCAGAA 218227 AL671560.7 1801 TCTCCACCCTGGCGTGGCTACAGCCCCTTCCTGCTTGGACCTTAGTGTGG 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 218228 TCTCCACCCTGGCGTGGCTACAGCCCCTTCCTGCTTGGACCTTAGTGTGG 218277 AL671560.7 1851 AACTGTTATTTCCACAGCCCGGTGCTTACCAGACAGTAGTGACAGTTTGC 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 218278 AACTGTTATTTCCACAGCCCGGTGCTTACCAGACAGTAGTGACAGTTTGC 218327 AL671560.7 1901 CCCTGGAGCTCTCTGTAACTTAAAACGCCAAGAGAACAGGATCCAAACTC 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 218328 CCCTGGAGCTCTCTGTAACTTAAAACGCCAAGAGAACAGGATCCAAACTC 218377 AL671560.7 1951 TGACTGCCACATCTGCCACCTGCTCCCAAAGTGCCTCTGTCCTGGAATTC 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645727.16 218378 TGACTGCCACATCTGCCACCTGCTCCCAAAGTGCCTCTGTCCTGGAATTC 218427
