<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645696.30	1	AAAAGATATCAGGGGTAGCTTGTCACAGACATATATATGTATTTATATAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	203104	AAAAGATATCAGGGGTAGCTTGTCACAGACATATATATGTATTTATATAA	203153

AL645696.30	51	AAGCACAATGTGGCTAGATAACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	203154	AAGCACAATGTGGCTAGATAACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	203203

AL645696.30	101	GTGTGTGTGTGTGTATTCCATTGTCTGACATTCTTAGAACCAGAAGTATT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	203204	GTGTGTGTGTGTGTATTCCATTGTCTGACATTCTTAGAACCAGAAGTATT	203253

AL645696.30	151	TCAGATTTTCAGAGTTCTTCCAGAGTTTAGAACATCTGAATATGTATAAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	203254	TCAGATTTTCAGAGTTCTTCCAGAGTTTAGAACATCTGAATATGTATAAA	203303

AL645696.30	201	GTGGTATGCAAGCCTAAACATTAAAATCATTTGTGTTTTATAAATACCTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	203304	GTGGTATGCAAGCCTAAACATTAAAATCATTTGTGTTTTATAAATACCTT	203353

AL645696.30	251	GAATGTATAACCTGAAAGTAAATTTATAAAATTTTTAATGTACCCATATT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	203354	GAATGTATAACCTGAAAGTAAATTTATAAAATTTTTAATGTACCCATATT	203403

AL645696.30	301	TTGATTGTACAAGTCACATGACCTCAAGTATAAAATTTTCCTCTTGAATT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	203404	TTGATTGTACAAGTCACATGACCTCAAGTATAAAATTTTCCTCTTGAATT	203453

AL645696.30	351	TTCAGATTTAGGAATATTTTATATTTTAAAGTTTCAAAATTGGAATGTTA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	203454	TTCAGATTTAGGAATATTTTATATTTTAAAGTTTCAAAATTGGAATGTTA	203503

AL645696.30	401	AGCCATCAAATGTGTGTGTGCACACAGGCATAGATGGTGCTTACTGACTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	203504	AGCCATCAAATGTGTGTGTGCACACAGGCATAGATGGTGCTTACTGACTT	203553

AL645696.30	451	CCCTAAATTTGAAGTTAAAATCCATGCCTGCCAATCAGCCCTTTGTAATG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	203554	CCCTAAATTTGAAGTTAAAATCCATGCCTGCCAATCAGCCCTTTGTAATG	203603

AL645696.30	501	CTCTATCATATACCATAAAAATTAAATGTAGGAACTTTCAGAAAAGATGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	203604	CTCTATCATATACCATAAAAATTAAATGTAGGAACTTTCAGAAAAGATGT	203653

AL645696.30	551	GAAAGAACCAAGAAGCCAGAGACAATGAGGACACATGTACACCCCAGTCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	203654	GAAAGAACCAAGAAGCCAGAGACAATGAGGACACATGTACACCCCAGTCT	203703

AL645696.30	601	TGTCCCTAGAAAGTGCCAAAGCTTTGAGCCCCAAAGGAAGCTCAAACACT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	203704	TGTCCCTAGAAAGTGCCAAAGCTTTGAGCCCCAAAGGAAGCTCAAACACT	203753

AL645696.30	651	TCCCTGGAACTGTTTTGCTTCATCCTTACCAACAAATCATGAGGTGATAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	203754	TCCCTGGAACTGTTTTGCTTCATCCTTACCAACAAATCATGAGGTGATAT	203803

AL645696.30	701	TATTCTCAATGAAACTGAATTCCGGCGAGATTAAGCTGACTCAGAGTGCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	203804	TATTCTCAATGAAACTGAATTCCGGCGAGATTAAGCTGACTCAGAGTGCT	203853

AL645696.30	751	TATTAGAAAAAGTCAGCTTTGAACCCTGTCTGCCCAGCTGCACGATCCAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	203854	TATTAGAAAAAGTCAGCTTTGAACCCTGTCTGCCCAGCTGCACGATCCAG	203903

AL645696.30	801	TCAAAATTACTTCCATTATTACTATTAATGGTAGCATAAATATTACTTAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	203904	TCAAAATTACTTCCATTATTACTATTAATGGTAGCATAAATATTACTTAG	203953

AL645696.30	851	AGTTAATACTTTCCAGATGCCCTCAACATAGCAGTTCCTGTTGCAACCCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	203954	AGTTAATACTTTCCAGATGCCCTCAACATAGCAGTTCCTGTTGCAACCCC	204003

AL645696.30	901	CTCCCTCTTTAATAGAGAGAAGGCAAATTCAGTCCTATTTGGTCTGAGTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	204004	CTCCCTCTTTAATAGAGAGAAGGCAAATTCAGTCCTATTTGGTCTGAGTT	204053

AL645696.30	951	CTTGGGTGAAGTTCCACTCTAGGGCTTTAGAAGTGGAGCTCACGCCTCTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	204054	CTTGGGTGAAGTTCCACTCTAGGGCTTTAGAAGTGGAGCTCACGCCTCTG	204103

AL645696.30	1001	GCCACCTAGCACCATAGTTTTCTTCTCTTTGGAGTCTCCTGCCCCTTGTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	204104	GCCACCTAGCACCATAGTTTTCTTCTCTTTGGAGTCTCCTGCCCCTTGTC	204153

AL645696.30	1051	TGGCCGTTACTGGCATGTTCTAGTCTTTCTCCTCAATATCTACTCTGGGA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	204154	TGGCCGTTACTGGCATGTTCTAGTCTTTCTCCTCAATATCTACTCTGGGA	204203

AL645696.30	1101	TGTTGTCCAATCACTTTTCTCCTAGGCTCAGAGCAACTTCAAGTCACATG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	204204	TGTTGTCCAATCACTTTTCTCCTAGGCTCAGAGCAACTTCAAGTCACATG	204253

AL645696.30	1151	GTTTCTGGTTCACAGTTTTGCATGTTCCTGGGTTATTTCTCTTTGGCTGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	204254	GTTTCTGGTTCACAGTTTTGCATGTTCCTGGGTTATTTCTCTTTGGCTGT	204303

AL645696.30	1201	ACAAACTTCCCAAACGTTAGTCCATTTGGAACTAATTTGCCAGCCAGTAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	204304	ACAAACTTCCCAAACGTTAGTCCATTTGGAACTAATTTGCCAGCCAGTAG	204353

AL645696.30	1251	ACACCCTGCAGACTAATGGGGGGATTGTCCATTCTGGATTCAGCCTGCCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	204354	ACACCCTGCAGACTAATGGGGGGATTGTCCATTCTGGATTCAGCCTGCCT	204403

AL645696.30	1301	CATCATTCTTTTCTCTTTACAACATTAGCATCGTCAAAGTATTGGCAAGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	204404	CATCATTCTTTTCTCTTTACAACATTAGCATCGTCAAAGTATTGGCAAGG	204453

AL645696.30	1351	GCTCTCCTTCTGGGCTGGTAAAATAAGATTAAGTGTCTAAATCCACTGTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	204454	GCTCTCCTTCTGGGCTGGTAAAATAAGATTAAGTGTCTAAATCCACTGTA	204503

AL645696.30	1401	ACTTGGTGATGGAGATTATTATTATTTTTTTTTGGAGCTTCTCACTTATC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	204504	ACTTGGTGATGGAGATTATTATTATTTTTTTTTGGAGCTTCTCACTTATC	204553

AL645696.30	1451	TTTGACTCAGTGAAAGTCATACCTGTCCAGTTTATACCATTTCATCCAAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	204554	TTTGACTCAGTGAAAGTCATACCTGTCCAGTTTATACCATTTCATCCAAA	204603

AL645696.30	1501	AGACAAAAGACAAACCAGGTATAGTGAGCTCTCTTAAACCAAGCAGCAAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	204604	AGACAAAAGACAAACCAGGTATAGTGAGCTCTCTTAAACCAAGCAGCAAG	204653

AL645696.30	1551	CATAGCAGTGCAGGTAACCATGAGGGTTGGTGGGCTCCCAGCAATGGAGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	204654	CATAGCAGTGCAGGTAACCATGAGGGTTGGTGGGCTCCCAGCAATGGAGG	204703

AL645696.30	1601	CCTGGAGTAAGCAGGTTAAACTGCCACTGCTTCATTGCCATCATTTCAAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	204704	CCTGGAGTAAGCAGGTTAAACTGCCACTGCTTCATTGCCATCATTTCAAG	204753

AL645696.30	1651	GCAAAGACGTGTACATGGGTGTAAAACTTTTCCAGGGAGAAATCTGAGGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	204754	GCAAAGACGTGTACATGGGTGTAAAACTTTTCCAGGGAGAAATCTGAGGA	204803

AL645696.30	1701	AGAGACTAGGAATGATGAGGATTAATTCTCTGAATTTTCATGAAGGTAGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	204804	AGAGACTAGGAATGATGAGGATTAATTCTCTGAATTTTCATGAAGGTAGA	204853

AL645696.30	1751	GTAGTAATCACAAACAGTCAGGACATCCGTGCAGTCCCATTTAAGTAACA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	204854	GTAGTAATCACAAACAGTCAGGACATCCGTGCAGTCCCATTTAAGTAACA	204903

AL645696.30	1801	CCATTGTGCGATGGCACAATTAGAACTCCTTATGTCCTGCCTATCAGTTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	204904	CCATTGTGCGATGGCACAATTAGAACTCCTTATGTCCTGCCTATCAGTTA	204953

AL645696.30	1851	AATCGGTATTTATAGAGTGCTCAGGCTGCTGATAATAAGTCAAATCTGGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	204954	AATCGGTATTTATAGAGTGCTCAGGCTGCTGATAATAAGTCAAATCTGGC	205003

AL645696.30	1901	CCTATTCCCACCAGTGACTGAAATAATGGATAAAAAGCCCATTTAGTACA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	205004	CCTATTCCCACCAGTGACTGAAATAATGGATAAAAAGCCCATTTAGTACA	205053

AL645696.30	1951	TCTCTGTGAACATCATATTGTCACAGGCTTCTCCCGGGGACAGTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645702.14	205054	TCTCTGTGAACATCATATTGTCACAGGCTTCTCCCGGGGACAGTGAATTC	205103

Overview

Query
AL645696.30 - 159399 bps
Hit
AL645702.14 - 205103 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link