<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645584.28	1	TTTCATAAGAAAAACTTCAACCTTCCAGATACAAGTGCTGGTCTCTAGCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	157400	TTTCATAAGAAAAACTTCAACCTTCCAGATACAAGTGCTGGTCTCTAGCT	157449

AL645584.28	51	TGGTCAAAGATTTGAAAGATATTTACAGTTTAATGACTCCTACATGGTTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	157450	TGGTCAAAGATTTGAAAGATATTTACAGTTTAATGACTCCTACATGGTTT	157499

AL645584.28	101	GCTTTTTGCTGGGCATAATCAAGTCTTTTTTTCTGACTCAGAAGATGAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	157500	GCTTTTTGCTGGGCATAATCAAGTCTTTTTTTCTGACTCAGAAGATGAAA	157549

AL645584.28	151	GAACATTGCTAACATTTTTTTTCCTTGAATGAATTCCTGGATTTGTACAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	157550	GAACATTGCTAACATTTTTTTTCCTTGAATGAATTCCTGGATTTGTACAT	157599

AL645584.28	201	CAGAAGAGAGACAACTACAAGCATGAAGACAAACTGTGGGGAGGCATAAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	157600	CAGAAGAGAGACAACTACAAGCATGAAGACAAACTGTGGGGAGGCATAAG	157649

AL645584.28	251	GATAAGCCTAACGGAATGACAAGACCAATACCTCAACAATGGGCCTATCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	157650	GATAAGCCTAACGGAATGACAAGACCAATACCTCAACAATGGGCCTATCT	157699

AL645584.28	301	AACCGTTTCAAAATAACTTCCCTTCAAGAATTGTCTAGAAACAGACCTTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	157700	AACCGTTTCAAAATAACTTCCCTTCAAGAATTGTCTAGAAACAGACCTTT	157749

AL645584.28	351	GAGTATAATGTTCAGTCTATATAAAATGTCATATAAAAAACATTAAATCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	157750	GAGTATAATGTTCAGTCTATATAAAATGTCATATAAAAAACATTAAATCC	157799

AL645584.28	401	CAGCACTTGGTAGGCAGAGGCAGGCGGATTTCTGTGTTCCAGGCCAGCCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	157800	CAGCACTTGGTAGGCAGAGGCAGGCGGATTTCTGTGTTCCAGGCCAGCCT	157849

AL645584.28	451	GGTCTGCAGAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTACACAGAAAAATCCTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	157850	GGTCTGCAGAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTACACAGAAAAATCCTG	157899

AL645584.28	501	TCTCGAAAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCAAACCAAACCAAAAAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	157900	TCTCGAAAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCAAACCAAACCAAAAAA	157949

AL645584.28	551	TTAAATCTTATTAGATTTTATAGATAATTTCTACTGTAGAAGGAAACAAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	157950	TTAAATCTTATTAGATTTTATAGATAATTTCTACTGTAGAAGGAAACAAT	157999

AL645584.28	601	AAATCTCCTATCTTCACCTCCAATTTGTTTAAGGTCGCCTGACTGTCACT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	158000	AAATCTCCTATCTTCACCTCCAATTTGTTTAAGGTCGCCTGACTGTCACT	158049

AL645584.28	651	CCAACTTCTTGTAGAGGCAGAAATACTTCAAAACCATTTACTTCCTTAGC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	158050	CCAACTTCTTGTAGAGGCAGAAATACTTCAAAACCATTTACTTCCTTAGC	158099

AL645584.28	701	TCTGACAATTCACTAAAAATGCATCGTATTGCTGAGGAGAAGGCATTGGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	158100	TCTGACAATTCACTAAAAATGCATCGTATTGCTGAGGAGAAGGCATTGGT	158149

AL645584.28	751	AAAGATAGTGTAAGTTATGATGTGATTAAAAATAAACTCTAAAATCTCAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	158150	AAAGATAGTGTAAGTTATGATGTGATTAAAAATAAACTCTAAAATCTCAA	158199

AL645584.28	801	TGGCTTAACTTCATGACTATTTCTGGCACATGACTTCCAACGTGCGGCCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	158200	TGGCTTAACTTCATGACTATTTCTGGCACATGACTTCCAACGTGCGGCCT	158249

AL645584.28	851	CCAAGGTCATTGTGACAGAAAAGAAGATGATAAAAAAATTCATGGAGTGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	158250	CCAAGGTCATTGTGACAGAAAAGAAGATGATAAAAAAATTCATGGAGTGA	158299

AL645584.28	901	TTTTGTGTCTATACCCAATAGAATGATTCCAAGCTAGTCACATGACCCCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	158300	TTTTGTGTCTATACCCAATAGAATGATTCCAAGCTAGTCACATGACCCCA	158349

AL645584.28	951	TTTAATTACTGAAAGGACTGGGAAACTCATGCATAGAGAGCACACAGCTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	158350	TTTAATTACTGAAAGGACTGGGAAACTCATGCATAGAGAGCACACAGCTC	158399

AL645584.28	1001	TGCCTTGTTTGGCTTCGTTGTTTTACACCCCTTTGCTGAGTTCTTCCCTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	158400	TGCCTTGTTTGGCTTCGTTGTTTTACACCCCTTTGCTGAGTTCTTCCCTG	158449

AL645584.28	1051	TATATAATCAGCCTTTCCCCTTCCACCAAGACAGCCAATCCCTGCTTTCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	158450	TATATAATCAGCCTTTCCCCTTCCACCAAGACAGCCAATCCCTGCTTTCA	158499

AL645584.28	1101	GCTTAAACTCCAGGGTTTCTGGGTGCTATGCATTAGTTAGTCACTATTAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	158500	GCTTAAACTCCAGGGTTTCTGGGTGCTATGCATTAGTTAGTCACTATTAG	158549

AL645584.28	1151	CTTAGTCACTGTCCTCTTGCTGTACAGAGACACATGACCACTGCAACTCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	158550	CTTAGTCACTGTCCTCTTGCTGTACAGAGACACATGACCACTGCAACTCT	158599

AL645584.28	1201	TACAAGAAAAAAAAAACATTTAATTGGGGGCTTGCATACAGTTTTAGAGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	158600	TACAAGAAAAAAAAAACATTTAATTGGGGGCTTGCATACAGTTTTAGAGG	158649

AL645584.28	1251	CTTAGTCCATTTTCATCAAGACAGGGAACATAGTAGCATTTAACTTCTGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	158650	CTTAGTCCATTTTCATCAAGACAGGGAACATAGTAGCATTTAACTTCTGG	158699

AL645584.28	1301	TAAAGTTGTTGAGAGCTAACTCCTGATCTGAAGGCAGCAGGGAGAGGCAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	158700	TAAAGTTGTTGAGAGCTAACTCCTGATCTGAAGGCAGCAGGGAGAGGCAT	158749

AL645584.28	1351	GAATAAGCCCGGTTAGGGCTTTTTGAATCCTCAGAGCCCACCCCAAAGGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	158750	GAATAAGCCCGGTTAGGGCTTTTTGAATCCTCAGAGCCCACCCCAAAGGA	158799

AL645584.28	1401	CAGACTTCCAACAAGGCCATATGTCCTAATCCTTCTTAAATATTGTCACT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	158800	CAGACTTCCAACAAGGCCATATGTCCTAATCCTTCTTAAATATTGTCACT	158849

AL645584.28	1451	CCCTGATGACTTAACATTCAAATATATGAGCCCATGGGGGTCACGCTCAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	158850	CCCTGATGACTTAACATTCAAATATATGAGCCCATGGGGGTCACGCTCAC	158899

AL645584.28	1501	TTAAGCCATTGTAACTATCAGATCTGAATTTGGTCCAGAAACAAGTATAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	158900	TTAAGCCATTGTAACTATCAGATCTGAATTTGGTCCAGAAACAAGTATAC	158949

AL645584.28	1551	TTTAATAAGGTTAACTATGCATCCCAATGGAAGTGTAGTTACAGAAAGAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	158950	TTTAATAAGGTTAACTATGCATCCCAATGGAAGTGTAGTTACAGAAAGAA	158999

AL645584.28	1601	ATGCAAAGTCATTACAGTACAGCCAAAGCTCCATTCATATCAGAGAAGGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	159000	ATGCAAAGTCATTACAGTACAGCCAAAGCTCCATTCATATCAGAGAAGGA	159049

AL645584.28	1651	AGGGAGATGCAAAGCAACCACAGACCTGGAGTTCCAAAATCCTACCTGAC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	159050	AGGGAGATGCAAAGCAACCACAGACCTGGAGTTCCAAAATCCTACCTGAC	159099

AL645584.28	1701	ACATTTGTGAGATGTCTTGAACTTGGGCTAGGAAATATCCTTGATCAGTC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	159100	ACATTTGTGAGATGTCTTGAACTTGGGCTAGGAAATATCCTTGATCAGTC	159149

AL645584.28	1751	CTGATTCTATCCAGTAAGAAGGTCTCGTCATCAGTTTCTGCCATGTCTGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	159150	CTGATTCTATCCAGTAAGAAGGTCTCGTCATCAGTTTCTGCCATGTCTGA	159199

AL645584.28	1801	AGTGGTGTGAGGAACTACCTCTTGCAGGCTGCTCAGCTTCAGTGCCTACT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	159200	AGTGGTGTGAGGAACTACCTCTTGCAGGCTGCTCAGCTTCAGTGCCTACT	159249

AL645584.28	1851	TCTGCTTAGGATGATCCCAGATGCAGAGATTGTTGTGCCTCTGATCATCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	159250	TCTGCTTAGGATGATCCCAGATGCAGAGATTGTTGTGCCTCTGATCATCT	159299

AL645584.28	1901	CCAGATTCATAGATGTAGAGCGGAACACTATCTCTTCAAACATCCATAGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	159300	CCAGATTCATAGATGTAGAGCGGAACACTATCTCTTCAAACATCCATAGA	159349

AL645584.28	1951	CCACTGATCTATTTGATCATACATCTAAATGAATCTTCTGAGTAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645696.30	159350	CCACTGATCTATTTGATCATACATCTAAATGAATCTTCTGAGTAGAATTC	159399

Overview

Query
AL645584.28 - 181652 bps
Hit
AL645696.30 - 159399 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link