<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645546.5	1	ATGGTGTTTTGGATTTCTTCAGGATCTGTTGTTATGTCTCCCTTTTCATT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	75612	ATGGTGTTTTGGATTTCTTCAGGATCTGTTGTTATGTCTCCCTTTTCATT	75661

AL645546.5	51	TCTGATTTTGTTAATTAGGATGCTTTCCCTGTGCCCTCTAGTGAGTCTGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	75662	TCTGATTTTGTTAATTAGGATGCTTTCCCTGTGCCCTCTAGTGAGTCTGG	75711

AL645546.5	101	CTAAGGGTTTATCTATCTTGTTGATTTTCTCAAAGAAGCAGCTCCTCGTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	75712	CTAAGGGTTTATCTATCTTGTTGATTTTCTCAAAGAAGCAGCTCCTCGTT	75761

AL645546.5	151	TGTTTGATTCTTTGAATAGTTCTTCTTTTTTCCACTTTTTTGACTTTGCC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	75762	TGTTTGATTCTTTGAATAGTTCTTCTTTTTTCCACTTTTTTGACTTTGCC	75811

AL645546.5	201	CCTGAGTTTGATTATTTCCTGCTGTCTACTCCTCTTGGGTGAATTTGCTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	75812	CCTGAGTTTGATTATTTCCTGCTGTCTACTCCTCTTGGGTGAATTTGCTT	75861

AL645546.5	251	CCTTTTGTCATAGAGCTTTTAGGTTTGTTGTCAAGCTTCTAGTGTGTGTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	75862	CCTTTTGTCATAGAGCTTTTAGGTTTGTTGTCAAGCTTCTAGTGTGTGTT	75911

AL645546.5	301	CTCTCTAGTTTCTTTTTGGAGGCACTCAGAGCTATGAGTTTTCCTCTTAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	75912	CTCTCTAGTTTCTTTTTGGAGGCACTCAGAGCTATGAGTTTTCCTCTTAG	75961

AL645546.5	351	AAATGCTTTCATTGTGTCCCATAAGTTTGGGTATGAAGTGGCTTCATTTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	75962	AAATGCTTTCATTGTGTCCCATAAGTTTGGGTATGAAGTGGCTTCATTTT	76011

AL645546.5	401	CATTAAACTCTAAAAAGTCTTTAATTTCTTTTTTTATTCCTTCCCTGACC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	76012	CATTAAACTCTAAAAAGTCTTTAATTTCTTTTTTTATTCCTTCCCTGACC	76061

AL645546.5	451	AAGGTATCATTGAGTAGAGTGTTGTTCATTTCCCATGCTAATGTTGGCTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	76062	AAGGTATCATTGAGTAGAGTGTTGTTCATTTCCCATGCTAATGTTGGCTT	76111

AL645546.5	501	TCTATTATTTATGTTGTTATTGAAGATCAGCTTTAGTCCATGGTGGTCTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	76112	TCTATTATTTATGTTGTTATTGAAGATCAGCTTTAGTCCATGGTGGTCTG	76161

AL645546.5	551	ATAGGATGCATGGGACAAGTTCAATATTTTTGTATCTGTTGAGGCTTGTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	76162	ATAGGATGCATGGGACAAGTTCAATATTTTTGTATCTGTTGAGGCTTGTT	76211

AL645546.5	601	TTGTGATCAATTTTATGGTCAATTTTGGAGAAGGTACCATGAGGTGCTGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	76212	TTGTGATCAATTTTATGGTCAATTTTGGAGAAGGTACCATGAGGTGCTGA	76261

AL645546.5	651	GAAGAAGGTATATCCTTTTGTTTTAGGATAAAATTTTCTGTAGATATCTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	76262	GAAGAAGGTATATCCTTTTGTTTTAGGATAAAATTTTCTGTAGATATCTG	76311

AL645546.5	701	TTAAATCTACTTGTTTCATAACTTCTGTTAGTTTCACTATCTCCCTGTTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	76312	TTAAATCTACTTGTTTCATAACTTCTGTTAGTTTCACTATCTCCCTGTTT	76361

AL645546.5	751	AGTTTCTGTTTCCACAATCTGTCCATTGATGAAAGTGGTGTGTTGAAGTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	76362	AGTTTCTGTTTCCACAATCTGTCCATTGATGAAAGTGGTGTGTTGAAGTC	76411

AL645546.5	801	TCCCACTATTATTGTGTGAGCTGCAATGTGTGCTTTGAGCTTTACTAAAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	76412	TCCCACTATTATTGTGTGAGCTGCAATGTGTGCTTTGAGCTTTACTAAAG	76461

AL645546.5	851	TTTCTTTAATGAATGTGGCTGCCTTTGCATTTGGAGCATAGATATTCAGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	76462	TTTCTTTAATGAATGTGGCTGCCTTTGCATTTGGAGCATAGATATTCAGA	76511

AL645546.5	901	ATTGAGAGTTCCTCTTGGAAGATTTTACCTTTGATGAGTATGAAGTTCCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	76512	ATTGAGAGTTCCTCTTGGAAGATTTTACCTTTGATGAGTATGAAGTTCCC	76561

AL645546.5	951	CTCCTTGTTTTTTTTGATAACTTTGGGTTGGAAGTAGATTTTATTCGATA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	76562	CTCCTTGTTTTTTTTGATAACTTTGGGTTGGAAGTAGATTTTATTCGATA	76611

AL645546.5	1001	TTAGAATGGCTACTCAAGCTTGTTTCTTCAGACCATTTGCTTGGAAAATT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	76612	TTAGAATGGCTACTCAAGCTTGTTTCTTCAGACCATTTGCTTGGAAAATT	76661

AL645546.5	1051	GTTTTCCAGCCTTTCACTCTGAGGTAGTGTCTGTCTTTTTCCCTGAGACG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	76662	GTTTTCCAGCCTTTCACTCTGAGGTAGTGTCTGTCTTTTTCCCTGAGACG	76711

AL645546.5	1101	GGTTTCCTGTAAGCAGCAAAATGTTGGATCCTGTTTGTGTAGCCAGTCTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	76712	GGTTTCCTGTAAGCAGCAAAATGTTGGATCCTGTTTGTGTAGCCAGTCTG	76761

AL645546.5	1151	TTAGTCTATATCTTTTTATTGGGGAATTGAGTAATGATGGTCTCTTCTTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	76762	TTAGTCTATATCTTTTTATTGGGGAATTGAGTAATGATGGTCTCTTCTTA	76811

AL645546.5	1201	ATTATCACATATTTCTTAGCACTAGCTAACTAGCATCAATTATCCCAGTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	76812	ATTATCACATATTTCTTAGCACTAGCTAACTAGCATCAATTATCCCAGTA	76861

AL645546.5	1251	ATACAAAGGTTTTACTTTGGTAGTTCTGGTATCTTGTTCATCACAATAGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	76862	ATACAAAGGTTTTACTTTGGTAGTTCTGGTATCTTGTTCATCACAATAGA	76911

AL645546.5	1301	GTCTTTATCCCTTCCTAACAAGTACAGCAGAATATTAAATGAAAATAGCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	76912	GTCTTTATCCCTTCCTAACAAGTACAGCAGAATATTAAATGAAAATAGCA	76961

AL645546.5	1351	AATGGCCCTTATAGTCTTTCATCTTCGTTTTGAAAAGTCACAAACCAGGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	76962	AATGGCCCTTATAGTCTTTCATCTTCGTTTTGAAAAGTCACAAACCAGGC	77011

AL645546.5	1401	ATCTTCTGTACTTCTCTCAACACTCTTATCTTCCAAGCTCCTATAGAACA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	77012	ATCTTCTGTACTTCTCTCAACACTCTTATCTTCCAAGCTCCTATAGAACA	77061

AL645546.5	1451	TCCTACAGATGTCTCAATACTCAATGGCTTTTCTAGTCCAAAGTTCCAAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	77062	TCCTACAGATGTCTCAATACTCAATGGCTTTTCTAGTCCAAAGTTCCAAA	77111

AL645546.5	1501	GTCCTTCCACAATCTTTTTCAAAATATAACCATGTCTGCCACAGCAATAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	77112	GTCCTTCCACAATCTTTTTCAAAATATAACCATGTCTGCCACAGCAATAC	77161

AL645546.5	1551	CTCACCTCACTGGTACCAAATTGTCTTAGTGATGCTGTTTCATTGGAACA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	77162	CTCACCTCACTGGTACCAAATTGTCTTAGTGATGCTGTTTCATTGGAACA	77211

AL645546.5	1601	CTAAGCCCTGACTAATACATCTAGTTTCAGAGCTTTTTTACTAAAGGCTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	77212	CTAAGCCCTGACTAATACATCTAGTTTCAGAGCTTTTTTACTAAAGGCTT	77261

AL645546.5	1651	TAAAGTATCTAACATAAAGAACCAGGCTAAACAAGAACTTTCAATGTCAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	77262	TAAAGTATCTAACATAAAGAACCAGGCTAAACAAGAACTTTCAATGTCAA	77311

AL645546.5	1701	TAATTGATATCTGACTCAAAAGAAAGTGATATAAGAACGTGGGATGGGGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	77312	TAATTGATATCTGACTCAAAAGAAAGTGATATAAGAACGTGGGATGGGGT	77361

AL645546.5	1751	GAAGAGCAATGTATTCAGTCTCAACCATGACAGCATTAAGAATAAAGAGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	77362	GAAGAGCAATGTATTCAGTCTCAACCATGACAGCATTAAGAATAAAGAGG	77411

AL645546.5	1801	AAATATATGACCATTGATAAAATGTGAGAAAGGACAGTCTGAAATTTGGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	77412	AAATATATGACCATTGATAAAATGTGAGAAAGGACAGTCTGAAATTTGGT	77461

AL645546.5	1851	AGCTTAAACTGGTGTTATTCTGGGCTTTTCTCTGTAAATTTAGAATTGAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	77462	AGCTTAAACTGGTGTTATTCTGGGCTTTTCTCTGTAAATTTAGAATTGAG	77511

AL645546.5	1901	TCCAAATTAAAATGAATTAGAAGTTATATTCAGAAAATAAATAAAACTAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	77512	TCCAAATTAAAATGAATTAGAAGTTATATTCAGAAAATAAATAAAACTAA	77561

AL645546.5	1951	GTTGTAAATTTAAATGAGTATAAGCAATAGAATTTAAAAATATGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645683.7	77562	GTTGTAAATTTAAATGAGTATAAGCAATAGAATTTAAAAATATGGAATTC	77611

Overview

Query
AL645546.5 - 122517 bps
Hit
AL645683.7 - 77611 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link