<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645686.10	1	TGGAATCCATGAGGGTGACTCTAGCAAAGACTCCTAGTAATCAGACCCAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	177903	TGGAATCCATGAGGGTGACTCTAGCAAAGACTCCTAGTAATCAGACCCAT	177952

AL645686.10	51	GGAACCTGAACCAGCCATCTTCTATACCAGGCAATGCTCTCAGCAGTGAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	177953	GGAACCTGAACCAGCCATCTTCTATACCAGGCAATGCTCTCAGCAGTGAG	178002

AL645686.10	101	ACTGAGACATCAAACCAACCACAAAAACTCCAACCTACAACTAATCCTTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	178003	ACTGAGACATCAAACCAACCACAAAAACTCCAACCTACAACTAATCCTTC	178052

AL645686.10	151	CTGTAAGATATGCCTGTGTAATGATATGCCTATGTAAAGATTCAACAAAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	178053	CTGTAAGATATGCCTGTGTAATGATATGCCTATGTAAAGATTCAACAAAA	178102

AL645686.10	201	CTTGTGGGAGTGGCCAACCAATGACTAGTCAAACCCGAGTCCCACACATT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	178103	CTTGTGGGAGTGGCCAACCAATGACTAGTCAAACCCGAGTCCCACACATT	178152

AL645686.10	251	GAGTGGGAACATATGACTGACTCTTCCTGGATGTCCAGGAACCAGAAGAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	178153	GAGTGGGAACATATGACTGACTCTTCCTGGATGTCCAGGAACCAGAAGAT	178202

AL645686.10	301	AAATAACCCAGAGACCTAAGATAGAACCAAACTTGAGTGGCAATGTAACT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	178203	AAATAACCCAGAGACCTAAGATAGAACCAAACTTGAGTGGCAATGTAACT	178252

AL645686.10	351	ACCTACATACATATATACAAGTCAAGAACACTTTTTTAAAATTTAACTTA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	178253	ACCTACATACATATATACAAGTCAAGAACACTTTTTTAAAATTTAACTTA	178302

AL645686.10	401	TTTTCTATTAGATATTCTCTTCATTTACATTTCAAAGGCTATTGCCTTTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	178303	TTTTCTATTAGATATTCTCTTCATTTACATTTCAAAGGCTATTGCCTTTT	178352

AL645686.10	451	CTTGTTTCCTTTCCGAAAGTCCCCTATACCCCCTCCCACCCTGCTCCCCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	178353	CTTGTTTCCTTTCCGAAAGTCCCCTATACCCCCTCCCACCCTGCTCCCCA	178402

AL645686.10	501	ACCCACCCACTCCTGCTTTCTGACCCTGGCATTCTCCTGTACTGGGGCAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	178403	ACCCACCCACTCCTGCTTTCTGACCCTGGCATTCTCCTGTACTGGGGCAT	178452

AL645686.10	551	ATAATCTTAGCAAGACCAAGGGCCTCTCCTCCCCTAATGGCCAACTAGGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	178453	ATAATCTTAGCAAGACCAAGGGCCTCTCCTCCCCTAATGGCCAACTAGGC	178502

AL645686.10	601	CATCCTCTGGTACATATGCTTCTAGAGACAAAAACTTGGGGGGGGGGGGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	178503	CATCCTCTGGTACATATGCTTCTAGAGACAAAAACTTGGGGGGGGGGGGG	178552

AL645686.10	651	AGGTGCTGGTTAGTTCATATTGTTGTTCCTCCTACAGGGTTGCAGACCCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	178553	AGGTGCTGGTTAGTTCATATTGTTGTTCCTCCTACAGGGTTGCAGACCCC	178602

AL645686.10	701	TTTAGCTCCTTGGGTACTTTCTCTAGCTCTTTCATTGTGAGTCCTGTGTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	178603	TTTAGCTCCTTGGGTACTTTCTCTAGCTCTTTCATTGTGAGTCCTGTGTT	178652

AL645686.10	751	CCATCTAAAAGATGGCTGTGAGCATCCACTTCTATATTTTCCAGGCACTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	178653	CCATCTAAAAGATGGCTGTGAGCATCCACTTCTATATTTTCCAGGCACTG	178702

AL645686.10	801	GCAGATCCTCAAAAGAGATAGCTATATCAGGGCCCTGTCAGCACAATCTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	178703	GCAGATCCTCAAAAGAGATAGCTATATCAGGGCCCTGTCAGCACAATCTT	178752

AL645686.10	851	GTTGGCATATGCAATAGTGTCTGGGTTTGGTGGTTTATAGGATGGATACC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	178753	GTTGGCATATGCAATAGTGTCTGGGTTTGGTGGTTTATAGGATGGATACC	178802

AL645686.10	901	CAGGTGGAGCAGTCTCTGTATGGTACTTCCTTCTGTCTCATCTCCGAACT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	178803	CAGGTGGAGCAGTCTCTGTATGGTACTTCCTTCTGTCTCATCTCCGAACT	178852

AL645686.10	951	TTGTCTTTGTAACTCCTTCCATGGGTATTTTATTCCTCATTCTAAGAAGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	178853	TTGTCTTTGTAACTCCTTCCATGGGTATTTTATTCCTCATTCTAAGAAGG	178902

AL645686.10	1001	AATGAAGTATCCACACTTTGGTCTTCCTTCTTCTTGAGTTTCATATGTTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	178903	AATGAAGTATCCACACTTTGGTCTTCCTTCTTCTTGAGTTTCATATGTTT	178952

AL645686.10	1051	TGCAAATTATATCATGGATATTTTAAGTTTCTGGGCTAATATCCACTTAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	178953	TGCAAATTATATCATGGATATTTTAAGTTTCTGGGCTAATATCCACTTAA	179002

AL645686.10	1101	CAGTGAGTGCATATCAGGTGTGTTCTTTTGTGATTAGGTTACTTCACTCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	179003	CAGTGAGTGCATATCAGGTGTGTTCTTTTGTGATTAGGTTACTTCACTCA	179052

AL645686.10	1151	GGATGATATCCTCCAGATCCATACATTTGCCTAAGAATTTCATTAATTCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	179053	GGATGATATCCTCCAGATCCATACATTTGCCTAAGAATTTCATTAATTCA	179102

AL645686.10	1201	TTGTTTTTACTGGCTGAGTAGTACTCCATTGTGTAAATATACCACATTTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	179103	TTGTTTTTACTGGCTGAGTAGTACTCCATTGTGTAAATATACCACATTTT	179152

AL645686.10	1251	CTGTATCCATTCCTCTGTTGAGGGTCATCTGGGTTCTTTCCAGCTTCCAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	179153	CTGTATCCATTCCTCTGTTGAGGGTCATCTGGGTTCTTTCCAGCTTCCAT	179202

AL645686.10	1301	ATATTATAAATAAGGCTGCTATGAACATAGTGGAGCATGTGTCCTTATTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	179203	ATATTATAAATAAGGCTGCTATGAACATAGTGGAGCATGTGTCCTTATTG	179252

AL645686.10	1351	CAAGTTGGAGCATCTTATGGGTATATGCCCAGGAGAGGTATTCCTGGATC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	179253	CAAGTTGGAGCATCTTATGGGTATATGCCCAGGAGAGGTATTCCTGGATC	179302

AL645686.10	1401	TTCCAATTTTCTGAGGAACCACCAGACTGATTTCCACAGTGGTTATACAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	179303	TTCCAATTTTCTGAGGAACCACCAGACTGATTTCCACAGTGGTTATACAA	179352

AL645686.10	1451	GCTTGCAATCCCACCAGCAATGGAGGAGTGTTCCTCTTTCTCTACATCCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	179353	GCTTGCAATCCCACCAGCAATGGAGGAGTGTTCCTCTTTCTCTACATCCT	179402

AL645686.10	1501	TGCCAGCATGTGCTGTCACCTGAATTTTTTATTTTATCCATTCTCAAGGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	179403	TGCCAGCATGTGCTGTCACCTGAATTTTTTATTTTATCCATTCTCAAGGG	179452

AL645686.10	1551	TATGAGGTGGAATCTCAGGATTGTTTTGATTTGCATTTCCCTGATGATTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	179453	TATGAGGTGGAATCTCAGGATTGTTTTGATTTGCATTTCCCTGATGATTA	179502

AL645686.10	1601	AGGATGTTGAACTTTTTTTTCAGGTGCTTGTCAGCAATTCAATATTCCTC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	179503	AGGATGTTGAACTTTTTTTTCAGGTGCTTGTCAGCAATTCAATATTCCTC	179552

AL645686.10	1651	ACTTGAGAATTCTTTGTTTAGCTCTGTACTCCATGTTTTAATAGGGTTAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	179553	ACTTGAGAATTCTTTGTTTAGCTCTGTACTCCATGTTTTAATAGGGTTAT	179602

AL645686.10	1701	TTGATTTTATGGAGTCTATCTTCTTGAGTTCTTTGTATATATTGGATATG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	179603	TTGATTTTATGGAGTCTATCTTCTTGAGTTCTTTGTATATATTGGATATG	179652

AL645686.10	1751	AATCCCCTATCATATTTAGGATTGATAAAGATCCTTTTCCAAACTGTTGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	179653	AATCCCCTATCATATTTAGGATTGATAAAGATCCTTTTCCAAACTGTTGG	179702

AL645686.10	1801	TGGTCTTTTTGTCTTATTGACAGTGTCTTTTGCCTTACATAAGCTTTGCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	179703	TGGTCTTTTTGTCTTATTGACAGTGTCTTTTGCCTTACATAAGCTTTGCA	179752

AL645686.10	1851	ATTTTATGAGGTCCCATTTGTCGATTCTTGATCTTACAGCACAAGCCATT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	179753	ATTTTATGAGGTCCCATTTGTCGATTCTTGATCTTACAGCACAAGCCATT	179802

AL645686.10	1901	GCTGTCTGTTCAGGAATTTTTCTCCTGTGCCTGTATCTTTGAGGCTTTTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	179803	GCTGTCTGTTCAGGAATTTTTCTCCTGTGCCTGTATCTTTGAGGCTTTTC	179852

AL645686.10	1951	CCCACTTTCTCCTCTGTAAGTTTCAGTGTCTCTGATTCTATATGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645667.14	179853	CCCACTTTCTCCTCTGTAAGTTTCAGTGTCTCTGATTCTATATGGAATTC	179902

Overview

Query
AL645686.10 - 137782 bps
Hit
AL645667.14 - 179902 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link