<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645825.6	1	GCACAATTTAAACACCTTGTTATTTAAAGAGTTTATGTCTAGGTATGTCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	191915	GCACAATTTAAACACCTTGTTATTTAAAGAGTTTATGTCTAGGTATGTCC	191964

AL645825.6	51	AGGCCTTAGATGGTTTCAAATTTTGTCAGGACAGCAGTAAATGGAAAGTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	191965	AGGCCTTAGATGGTTTCAAATTTTGTCAGGACAGCAGTAAATGGAAAGTG	192014

AL645825.6	101	AGTTGCAGAGCTGAGGGCCTGCCCAGGCTACTGGAGTGAGGAGGATGAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	192015	AGTTGCAGAGCTGAGGGCCTGCCCAGGCTACTGGAGTGAGGAGGATGAAA	192064

AL645825.6	151	ATGGTGGAACATGTCAGACACATTTGACACAGAAAACACACACACACATA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	192065	ATGGTGGAACATGTCAGACACATTTGACACAGAAAACACACACACACATA	192114

AL645825.6	201	CACACACACACACACACACACACACACACACACACGAACAAATATACACC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	192115	CACACACACACACACACACACACACACACACACACGAACAAATATACACC	192164

AL645825.6	251	TCCCAAGGGTTGAATTCAAAAGTAAAAGCAGGGATAAGAGTAAATACTGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	192165	TCCCAAGGGTTGAATTCAAAAGTAAAAGCAGGGATAAGAGTAAATACTGT	192214

AL645825.6	301	TACATAGGGAATTGGATTAACATAACTAAAATTTTTAAAAGATTTATTTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	192215	TACATAGGGAATTGGATTAACATAACTAAAATTTTTAAAAGATTTATTTA	192264

AL645825.6	351	TTTTATGTATAGGAGTACACTGTCACTGTCTTCAGACACACCATAAGAGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	192265	TTTTATGTATAGGAGTACACTGTCACTGTCTTCAGACACACCATAAGAGG	192314

AL645825.6	401	GCATCAGATCCCATTACAGGTGGTTGTCAGCAACCATGTGGTTGTTGGAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	192315	GCATCAGATCCCATTACAGGTGGTTGTCAGCAACCATGTGGTTGTTGGAA	192364

AL645825.6	451	ATTGAACTCAGGACCTCTGCAAGACCAATCAGTGCTTGTAAAACCCCTGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	192365	ATTGAACTCAGGACCTCTGCAAGACCAATCAGTGCTTGTAAAACCCCTGA	192414

AL645825.6	501	GCCATCTCTCCAGCCCTAAAATAACTAATTTTAAAGATAATCTTTTATAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	192415	GCCATCTCTCCAGCCCTAAAATAACTAATTTTAAAGATAATCTTTTATAT	192464

AL645825.6	551	ATCTGAGCCTTATGAATCTCTACCTAATTTTTACTTAATAGCATTTTAAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	192465	ATCTGAGCCTTATGAATCTCTACCTAATTTTTACTTAATAGCATTTTAAA	192514

AL645825.6	601	AAATAGAGCAAATAAACACGGATGCAGGGGATGTGGGTAGTACACACCCG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	192515	AAATAGAGCAAATAAACACGGATGCAGGGGATGTGGGTAGTACACACCCG	192564

AL645825.6	651	GAGTGAACACTCTGGTGCGTGATCACTCAGGCATGATAAAACAAATGTTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	192565	GAGTGAACACTCTGGTGCGTGATCACTCAGGCATGATAAAACAAATGTTG	192614

AL645825.6	701	TCATTAAATAATTTTTTATTTAGTATACCTTGGTTTTATAGGAGAAATTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	192615	TCATTAAATAATTTTTTATTTAGTATACCTTGGTTTTATAGGAGAAATTA	192664

AL645825.6	751	ATTTGCATCCATTGTGAAATAAAATAGGTTTCTACTTTTTGTGACACAGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	192665	ATTTGCATCCATTGTGAAATAAAATAGGTTTCTACTTTTTGTGACACAGT	192714

AL645825.6	801	CATTGCCTCCCCCCGCCCCCATTTGCCTAATCAACATGGCAAAACTCTCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	192715	CATTGCCTCCCCCCGCCCCCATTTGCCTAATCAACATGGCAAAACTCTCC	192764

AL645825.6	851	TCACTTCAGTTCAGTAGCTTGGGCAAGGTCTTAGCTGTGCATTTTTTCAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	192765	TCACTTCAGTTCAGTAGCTTGGGCAAGGTCTTAGCTGTGCATTTTTTCAT	192814

AL645825.6	901	TTTACATTTTCACAGACCAATGTCAGCTTTCTGATCTGTGGTTAGCACAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	192815	TTTACATTTTCACAGACCAATGTCAGCTTTCTGATCTGTGGTTAGCACAG	192864

AL645825.6	951	CGATTCTTCTATATTGCTATTGCTGTGGTAAAACGTATACAATAAAAGTA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	192865	CGATTCTTCTATATTGCTATTGCTGTGGTAAAACGTATACAATAAAAGTA	192914

AL645825.6	1001	TGCCAGTTAAACAATTTTAAATGTGTAATTCAGTAGAATTGAGCAGATTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	192915	TGCCAGTTAAACAATTTTAAATGTGTAATTCAGTAGAATTGAGCAGATTT	192964

AL645825.6	1051	ACAATGCTGGTTACTTCTGCGGTTCTGACAACATTAAATCTTTCTGTCTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	192965	ACAATGCTGGTTACTTCTGCGGTTCTGACAACATTAAATCTTTCTGTCTA	193014

AL645825.6	1101	TGAACAGGGAGGTCCTTCTGTGTATTTCTCTTTTATTAGTGTTCTGTGGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	193015	TGAACAGGGAGGTCCTTCTGTGTATTTCTCTTTTATTAGTGTTCTGTGGG	193064

AL645825.6	1151	TTTTAGTATAGCAGTTTCCTACTGCTGTGACTAATTTCCAACTTTTTAAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	193065	TTTTAGTATAGCAGTTTCCTACTGCTGTGACTAATTTCCAACTTTTTAAT	193114

AL645825.6	1201	TCTTTTAGATGCTGTTATAAACAGAGTCATTTTCTTGATTTCCTTTTCAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	193115	TCTTTTAGATGCTGTTATAAACAGAGTCATTTTCTTGATTTCCTTTTCAG	193164

AL645825.6	1251	ATTGTTCATTGTCAATGTTCCTAAATGCAGCACATTTTGGTGTGTTAATT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	193165	ATTGTTCATTGTCAATGTTCCTAAATGCAGCACATTTTGGTGTGTTAATT	193214

AL645825.6	1301	TTTATATTCTATAACGGCTTAATTCATTCATTCTCTTAGAATTATTTTAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	193215	TTTATATTCTATAACGGCTTAATTCATTCATTCTCTTAGAATTATTTTAA	193264

AL645825.6	1351	AGCAAATTTTATATCTACTGTGTACTGGCTAGTTTTGTGTCAACTTGACA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	193265	AGCAAATTTTATATCTACTGTGTACTGGCTAGTTTTGTGTCAACTTGACA	193314

AL645825.6	1401	CAGCTGGGGTTATCACAGAGAAAGGAGCTTCAGTTGAGGAAATGCCTCCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	193315	CAGCTGGGGTTATCACAGAGAAAGGAGCTTCAGTTGAGGAAATGCCTCCA	193364

AL645825.6	1451	TGAGGTCCAACTGTAAGGCATTTTCTCAATTAGTGATCAAGGGGGAAAGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	193365	TGAGGTCCAACTGTAAGGCATTTTCTCAATTAGTGATCAAGGGGGAAAGG	193414

AL645825.6	1501	CCCCTTGTGGGTGGGACCATCTCTGGGCTGGTAGTCTTGGGTTCTATAAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	193415	CCCCTTGTGGGTGGGACCATCTCTGGGCTGGTAGTCTTGGGTTCTATAAG	193464

AL645825.6	1551	AGAGCAGGCTGAGCAAGCCAGAGGAGGCAAGCTAGTAAGGAATATCCCTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	193465	AGAGCAGGCTGAGCAAGCCAGAGGAGGCAAGCTAGTAAGGAATATCCCTC	193514

AL645825.6	1601	CATGGCCTCTGCATCAGTTCCTGCTTCCTGACCTGCCTGAGTTCCAGTCC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	193515	CATGGCCTCTGCATCAGTTCCTGCTTCCTGACCTGCCTGAGTTCCAGTCC	193564

AL645825.6	1651	TGACTTCCTTTGGTGATGAACAGCAGCATGGAAGTGAAAACCGAATAAAC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	193565	TGACTTCCTTTGGTGATGAACAGCAGCATGGAAGTGAAAACCGAATAAAC	193614

AL645825.6	1701	CCTTTCCTCCCCAACTTGCTTCTTGGTCATGATATTTGTGCAGGAATAGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	193615	CCTTTCCTCCCCAACTTGCTTCTTGGTCATGATATTTGTGCAGGAATAGA	193664

AL645825.6	1751	GACCCTGACTAAGACATACTGCACACTCATACACTTGTGTGTATATGTGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	193665	GACCCTGACTAAGACATACTGCACACTCATACACTTGTGTGTATATGTGT	193714

AL645825.6	1801	GTGCATGTGTGTGTATGTGTGTGTGCATGTGTGTGTATTGTGTATGTGTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	193715	GTGCATGTGTGTGTATGTGTGTGTGCATGTGTGTGTATTGTGTATGTGTG	193764

AL645825.6	1851	TATGTGTGTATGCATGTGTGTATATGTGTGTGCATGTGTGTGCATATGTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	193765	TATGTGTGTATGCATGTGTGTATATGTGTGTGCATGTGTGTGCATATGTG	193814

AL645825.6	1901	TGTATGTGTGTTTGTGTGTGTGTATGTATATAAGTGTGTGTATGTGTGTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	193815	TGTATGTGTGTTTGTGTGTGTGTATGTATATAAGTGTGTGTATGTGTGTG	193864

AL645825.6	1951	TACACATATGCTTTGGGACATTGACTAACTGTGGCATGCATGTGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645664.8	193865	TACACATATGCTTTGGGACATTGACTAACTGTGGCATGCATGTGGAATTC	193914

Overview

Query
AL645825.6 - 21891 bps
Hit
AL645664.8 - 193914 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link