<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
AL662807.8 1 ACTAGTTTGCTGTAGATTGCTTTTATCATGTTTAGGTATGGGCCTTGAAT 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 102723 ACTAGTTTGCTGTAGATTGCTTTTATCATGTTTAGGTATGGGCCTTGAAT 102772 AL662807.8 51 TCCTGATCTTTCCAAGACTTTTATCATGAATGGGTGTTGGATTTTGTCAA 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 102773 TCCTGATCTTTCCAAGACTTTTATCATGAATGGGTGTTGGATTTTGTCAA 102822 AL662807.8 101 ATGCTTTCTCAACATCTAACGAGATAATCCTGTGGTTTTTGTCTTTGAGT 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 102823 ATGCTTTCTCAACATCTAACGAGATAATCCTGTGGTTTTTGTCTTTGAGT 102872 AL662807.8 151 TTGTTTATATACTGGATTACATTGATGGATTTTCGTATATTGATCCATCC 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 102873 TTGTTTATATACTGGATTACATTGATGGATTTTCGTATATTGATCCATCC 102922 AL662807.8 201 CTGCATTCCTTGGGATGAAACCTACTTGGTCAGGATGGTTGATTGTTTTG 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 102923 CTGCATTCCTTGGGATGAAACCTACTTGGTCAGGATGGTTGATTGTTTTG 102972 AL662807.8 251 ATGTGTTCTTGGATTCGGTTAGCGAGAACTTTATTGAGGATTTTTGCATT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 102973 ATGTGTTCTTGGATTCGGTTAGCGAGAACTTTATTGAGGATTTTTGCATT 103022 AL662807.8 301 GATATTCATAAGGGAAATTCGTTCTCTATCTTTGTTGGGTCTTTTTGTGG 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 103023 GATATTCATAAGGGAAATTCGTTCTCTATCTTTGTTGGGTCTTTTTGTGG 103072 AL662807.8 351 TTTAGGTATCAGAGTAATTGTGGATTCATAGAAAGAGTTGGGTAGAATAT 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 103073 TTTAGGTATCAGAGTAATTGTGGATTCATAGAAAGAGTTGGGTAGAATAT 103122 AL662807.8 401 CTTCTTCTATTTTGTGGAATAGTTTGTGAAAAACTGGGATTAGATCTTCT 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 103123 CTTCTTCTATTTTGTGGAATAGTTTGTGAAAAACTGGGATTAGATCTTCT 103172 AL662807.8 451 TTGAAGGTCTGATAGAACTCTGCACTAAACTCATCTGGTCCTGGGCTTTT 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 103173 TTGAAGGTCTGATAGAACTCTGCACTAAACTCATCTGGTCCTGGGCTTTT 103222 AL662807.8 501 TTTGTTTAGGAGACTATTAATGAGTGCTTCTATTTCTTTAGGGGATATAG 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 103223 TTTGTTTAGGAGACTATTAATGAGTGCTTCTATTTCTTTAGGGGATATAG 103272 AL662807.8 551 GACTATTTCAATCATTAACCTGATCTTGATTTAAATTTGGTACCTGGTAT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 103273 GACTATTTCAATCATTAACCTGATCTTGATTTAAATTTGGTACCTGGTAT 103322 AL662807.8 601 CTGTCTAGAAACTTGTCCATTTCATCAAGGTTCTCCAGTTTTGAGGAGTA 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 103323 CTGTCTAGAAACTTGTCCATTTCATCAAGGTTCTCCAGTTTTGAGGAGTA 103372 AL662807.8 651 TAGATTTTTGTAGAAGGACCTGATGGCGTTTTGGATATCTTCAGGATCTG 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 103373 TAGATTTTTGTAGAAGGACCTGATGGCGTTTTGGATATCTTCAGGATCTG 103422 AL662807.8 701 CTGTTATGTCTCCCTTTCATTTCTGATTTTCTTTTTTTTTTTAATTTTTT 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 103423 CTGTTATGTCTCCCTTTCATTTCTGATTTTCTTTTTTTTTTTAATTTTTT 103472 AL662807.8 751 ATTAGGTATTTAGCTCATTTACATTTCCAATGCTATAGCAAAAGTCCCCC 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 103473 ATTAGGTATTTAGCTCATTTACATTTCCAATGCTATAGCAAAAGTCCCCC 103522 AL662807.8 801 ATACCCACCCACCCCCACTCCCCTACCCACCCACTCCCCCTTTTTGGCCC 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 103523 ATACCCACCCACCCCCACTCCCCTACCCACCCACTCCCCCTTTTTGGCCC 103572 AL662807.8 851 TGGCTTTCCCCTGTACTGGGGCATATAAAGTTTGCATGTCCAATGGGCCT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 103573 TGGCTTTCCCCTGTACTGGGGCATATAAAGTTTGCATGTCCAATGGGCCT 103622 AL662807.8 901 CTCTTTCCAGTGATGGCTGACTAGGCCATCTTTTGATACATAGGCAGCTA 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 103623 CTCTTTCCAGTGATGGCTGACTAGGCCATCTTTTGATACATAGGCAGCTA 103672 AL662807.8 951 GAGTCAAGAGCTCCGGGGTACTGGCTAGTTCCTAATGTTGTTCCACCTAT 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 103673 GAGTCAAGAGCTCCGGGGTACTGGCTAGTTCCTAATGTTGTTCCACCTAT 103722 AL662807.8 1001 AGGGTTGCAGATCCCTTTAGCTCCTTGGCTACTTTCTCTAGCTCCTCCAT 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 103723 AGGGTTGCAGATCCCTTTAGCTCCTTGGCTACTTTCTCTAGCTCCTCCAT 103772 AL662807.8 1051 TGGGAGCCCTGTGATCCATCCATTAGCTGACTGTGAGCATCCACTTCTGT 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 103773 TGGGAGCCCTGTGATCCATCCATTAGCTGACTGTGAGCATCCACTTCTGT 103822 AL662807.8 1101 GTTTGCTAAGCCCCGGCATAGTCTCACAAGAGACAGCTACATCTGGGTCC 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 103823 GTTTGCTAAGCCCCGGCATAGTCTCACAAGAGACAGCTACATCTGGGTCC 103872 AL662807.8 1151 TTTCAATAAAATCTTGCTAGTGTATGCAATGGTGTCAGCGTTTGGATGCT 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 103873 TTTCAATAAAATCTTGCTAGTGTATGCAATGGTGTCAGCGTTTGGATGCT 103922 AL662807.8 1201 GATTATGGGGTGGATCCCTGGATATGGCAGTCTCTACATGGTCCATCCTT 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 103923 GATTATGGGGTGGATCCCTGGATATGGCAGTCTCTACATGGTCCATCCTT 103972 AL662807.8 1251 TCATCTCAGCTCCAAACTTTGTCTCTGTAACTCCTTCCAAGGGTGTTTTG 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 103973 TCATCTCAGCTCCAAACTTTGTCTCTGTAACTCCTTCCAAGGGTGTTTTG 104022 AL662807.8 1301 TTCCCACTTCTAAGGAGGAGCATAGTGTCCACACTTCAGTCTTCATTTTT 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 104023 TTCCCACTTCTAAGGAGGAGCATAGTGTCCACACTTCAGTCTTCATTTTT 104072 AL662807.8 1351 CTTGAGTTTCATGTGTTTAGGAAATTGTATCTTATATCTTGGGTATCCTA 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 104073 CTTGAGTTTCATGTGTTTAGGAAATTGTATCTTATATCTTGGGTATCCTA 104122 AL662807.8 1401 GGTTTTGGGCTAATATCCACTTATCAGTGAGTACATATTGTGTGAGTTTC 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 104123 GGTTTTGGGCTAATATCCACTTATCAGTGAGTACATATTGTGTGAGTTTC 104172 AL662807.8 1451 TTTGTGAATGTGTTACCTCACTCAGGATGATGCCCTCCAGGTCCATCCAT 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 104173 TTTGTGAATGTGTTACCTCACTCAGGATGATGCCCTCCAGGTCCATCCAT 104222 AL662807.8 1501 TTGGCTAGGAATTTCATAAATTCATTCTTTTTAATAGCTGAGTAGTACTC 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 104223 TTGGCTAGGAATTTCATAAATTCATTCTTTTTAATAGCTGAGTAGTACTC 104272 AL662807.8 1551 CATTGTGTAGATGTACCACATTTTCTGTATCCATTCCTCTGTTGAGGGGC 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 104273 CATTGTGTAGATGTACCACATTTTCTGTATCCATTCCTCTGTTGAGGGGC 104322 AL662807.8 1601 ATCTGGGTTCTTTCCAGCTTCTGGCTATTATAAATAAGGCTGCTATGAAC 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 104323 ATCTGGGTTCTTTCCAGCTTCTGGCTATTATAAATAAGGCTGCTATGAAC 104372 AL662807.8 1651 ATAGTGGAGCATGTGTCCTTCTTACCAGTTGGGGCATGTTCTGGATAAAT 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 104373 ATAGTGGAGCATGTGTCCTTCTTACCAGTTGGGGCATGTTCTGGATAAAT 104422 AL662807.8 1701 GCCCAGGAGAGGTATTGCTGGATCCTCCGGTAGTACTATGTCCAATTTTC 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 104423 GCCCAGGAGAGGTATTGCTGGATCCTCCGGTAGTACTATGTCCAATTTTC 104472 AL662807.8 1751 TGAGGAACCTCCAGACTGATTTCCAGAGTGGTTGTACAAGCCTGCACTCC 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 104473 TGAGGAACCTCCAGACTGATTTCCAGAGTGGTTGTACAAGCCTGCACTCC 104522 AL662807.8 1801 CACCAACAATGGAGGAGTGTTCCTCTTTCTCCACATCCACGCCAGCATCT 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 104523 CACCAACAATGGAGGAGTGTTCCTCTTTCTCCACATCCACGCCAGCATCT 104572 AL662807.8 1851 GCTGTCACCTGAATTTTTGATCTTAGCCATTCTGACTGGTGTGAGGTGGA 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 104573 GCTGTCACCTGAATTTTTGATCTTAGCCATTCTGACTGGTGTGAGGTGGA 104622 AL662807.8 1901 ATCTCAGGGTTGTTTTGATTTGCATTTCCCTGATGATTAAGGATGTTGAA 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 104623 ATCTCAGGGTTGTTTTGATTTGCATTTCCCTGATGATTAAGGATGTTGAA 104672 AL662807.8 1951 CATTTTTTCAGGTGCTTCTCTGCCATTCGGAATTCCTCAGGTGAGAATTC 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645663.11 104673 CATTTTTTCAGGTGCTTCTCTGCCATTCGGAATTCCTCAGGTGAGAATTC 104722