<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662807.8	1	ACTAGTTTGCTGTAGATTGCTTTTATCATGTTTAGGTATGGGCCTTGAAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	102723	ACTAGTTTGCTGTAGATTGCTTTTATCATGTTTAGGTATGGGCCTTGAAT	102772

AL662807.8	51	TCCTGATCTTTCCAAGACTTTTATCATGAATGGGTGTTGGATTTTGTCAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	102773	TCCTGATCTTTCCAAGACTTTTATCATGAATGGGTGTTGGATTTTGTCAA	102822

AL662807.8	101	ATGCTTTCTCAACATCTAACGAGATAATCCTGTGGTTTTTGTCTTTGAGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	102823	ATGCTTTCTCAACATCTAACGAGATAATCCTGTGGTTTTTGTCTTTGAGT	102872

AL662807.8	151	TTGTTTATATACTGGATTACATTGATGGATTTTCGTATATTGATCCATCC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	102873	TTGTTTATATACTGGATTACATTGATGGATTTTCGTATATTGATCCATCC	102922

AL662807.8	201	CTGCATTCCTTGGGATGAAACCTACTTGGTCAGGATGGTTGATTGTTTTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	102923	CTGCATTCCTTGGGATGAAACCTACTTGGTCAGGATGGTTGATTGTTTTG	102972

AL662807.8	251	ATGTGTTCTTGGATTCGGTTAGCGAGAACTTTATTGAGGATTTTTGCATT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	102973	ATGTGTTCTTGGATTCGGTTAGCGAGAACTTTATTGAGGATTTTTGCATT	103022

AL662807.8	301	GATATTCATAAGGGAAATTCGTTCTCTATCTTTGTTGGGTCTTTTTGTGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	103023	GATATTCATAAGGGAAATTCGTTCTCTATCTTTGTTGGGTCTTTTTGTGG	103072

AL662807.8	351	TTTAGGTATCAGAGTAATTGTGGATTCATAGAAAGAGTTGGGTAGAATAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	103073	TTTAGGTATCAGAGTAATTGTGGATTCATAGAAAGAGTTGGGTAGAATAT	103122

AL662807.8	401	CTTCTTCTATTTTGTGGAATAGTTTGTGAAAAACTGGGATTAGATCTTCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	103123	CTTCTTCTATTTTGTGGAATAGTTTGTGAAAAACTGGGATTAGATCTTCT	103172

AL662807.8	451	TTGAAGGTCTGATAGAACTCTGCACTAAACTCATCTGGTCCTGGGCTTTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	103173	TTGAAGGTCTGATAGAACTCTGCACTAAACTCATCTGGTCCTGGGCTTTT	103222

AL662807.8	501	TTTGTTTAGGAGACTATTAATGAGTGCTTCTATTTCTTTAGGGGATATAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	103223	TTTGTTTAGGAGACTATTAATGAGTGCTTCTATTTCTTTAGGGGATATAG	103272

AL662807.8	551	GACTATTTCAATCATTAACCTGATCTTGATTTAAATTTGGTACCTGGTAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	103273	GACTATTTCAATCATTAACCTGATCTTGATTTAAATTTGGTACCTGGTAT	103322

AL662807.8	601	CTGTCTAGAAACTTGTCCATTTCATCAAGGTTCTCCAGTTTTGAGGAGTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	103323	CTGTCTAGAAACTTGTCCATTTCATCAAGGTTCTCCAGTTTTGAGGAGTA	103372

AL662807.8	651	TAGATTTTTGTAGAAGGACCTGATGGCGTTTTGGATATCTTCAGGATCTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	103373	TAGATTTTTGTAGAAGGACCTGATGGCGTTTTGGATATCTTCAGGATCTG	103422

AL662807.8	701	CTGTTATGTCTCCCTTTCATTTCTGATTTTCTTTTTTTTTTTAATTTTTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	103423	CTGTTATGTCTCCCTTTCATTTCTGATTTTCTTTTTTTTTTTAATTTTTT	103472

AL662807.8	751	ATTAGGTATTTAGCTCATTTACATTTCCAATGCTATAGCAAAAGTCCCCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	103473	ATTAGGTATTTAGCTCATTTACATTTCCAATGCTATAGCAAAAGTCCCCC	103522

AL662807.8	801	ATACCCACCCACCCCCACTCCCCTACCCACCCACTCCCCCTTTTTGGCCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	103523	ATACCCACCCACCCCCACTCCCCTACCCACCCACTCCCCCTTTTTGGCCC	103572

AL662807.8	851	TGGCTTTCCCCTGTACTGGGGCATATAAAGTTTGCATGTCCAATGGGCCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	103573	TGGCTTTCCCCTGTACTGGGGCATATAAAGTTTGCATGTCCAATGGGCCT	103622

AL662807.8	901	CTCTTTCCAGTGATGGCTGACTAGGCCATCTTTTGATACATAGGCAGCTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	103623	CTCTTTCCAGTGATGGCTGACTAGGCCATCTTTTGATACATAGGCAGCTA	103672

AL662807.8	951	GAGTCAAGAGCTCCGGGGTACTGGCTAGTTCCTAATGTTGTTCCACCTAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	103673	GAGTCAAGAGCTCCGGGGTACTGGCTAGTTCCTAATGTTGTTCCACCTAT	103722

AL662807.8	1001	AGGGTTGCAGATCCCTTTAGCTCCTTGGCTACTTTCTCTAGCTCCTCCAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	103723	AGGGTTGCAGATCCCTTTAGCTCCTTGGCTACTTTCTCTAGCTCCTCCAT	103772

AL662807.8	1051	TGGGAGCCCTGTGATCCATCCATTAGCTGACTGTGAGCATCCACTTCTGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	103773	TGGGAGCCCTGTGATCCATCCATTAGCTGACTGTGAGCATCCACTTCTGT	103822

AL662807.8	1101	GTTTGCTAAGCCCCGGCATAGTCTCACAAGAGACAGCTACATCTGGGTCC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	103823	GTTTGCTAAGCCCCGGCATAGTCTCACAAGAGACAGCTACATCTGGGTCC	103872

AL662807.8	1151	TTTCAATAAAATCTTGCTAGTGTATGCAATGGTGTCAGCGTTTGGATGCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	103873	TTTCAATAAAATCTTGCTAGTGTATGCAATGGTGTCAGCGTTTGGATGCT	103922

AL662807.8	1201	GATTATGGGGTGGATCCCTGGATATGGCAGTCTCTACATGGTCCATCCTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	103923	GATTATGGGGTGGATCCCTGGATATGGCAGTCTCTACATGGTCCATCCTT	103972

AL662807.8	1251	TCATCTCAGCTCCAAACTTTGTCTCTGTAACTCCTTCCAAGGGTGTTTTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	103973	TCATCTCAGCTCCAAACTTTGTCTCTGTAACTCCTTCCAAGGGTGTTTTG	104022

AL662807.8	1301	TTCCCACTTCTAAGGAGGAGCATAGTGTCCACACTTCAGTCTTCATTTTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	104023	TTCCCACTTCTAAGGAGGAGCATAGTGTCCACACTTCAGTCTTCATTTTT	104072

AL662807.8	1351	CTTGAGTTTCATGTGTTTAGGAAATTGTATCTTATATCTTGGGTATCCTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	104073	CTTGAGTTTCATGTGTTTAGGAAATTGTATCTTATATCTTGGGTATCCTA	104122

AL662807.8	1401	GGTTTTGGGCTAATATCCACTTATCAGTGAGTACATATTGTGTGAGTTTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	104123	GGTTTTGGGCTAATATCCACTTATCAGTGAGTACATATTGTGTGAGTTTC	104172

AL662807.8	1451	TTTGTGAATGTGTTACCTCACTCAGGATGATGCCCTCCAGGTCCATCCAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	104173	TTTGTGAATGTGTTACCTCACTCAGGATGATGCCCTCCAGGTCCATCCAT	104222

AL662807.8	1501	TTGGCTAGGAATTTCATAAATTCATTCTTTTTAATAGCTGAGTAGTACTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	104223	TTGGCTAGGAATTTCATAAATTCATTCTTTTTAATAGCTGAGTAGTACTC	104272

AL662807.8	1551	CATTGTGTAGATGTACCACATTTTCTGTATCCATTCCTCTGTTGAGGGGC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	104273	CATTGTGTAGATGTACCACATTTTCTGTATCCATTCCTCTGTTGAGGGGC	104322

AL662807.8	1601	ATCTGGGTTCTTTCCAGCTTCTGGCTATTATAAATAAGGCTGCTATGAAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	104323	ATCTGGGTTCTTTCCAGCTTCTGGCTATTATAAATAAGGCTGCTATGAAC	104372

AL662807.8	1651	ATAGTGGAGCATGTGTCCTTCTTACCAGTTGGGGCATGTTCTGGATAAAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	104373	ATAGTGGAGCATGTGTCCTTCTTACCAGTTGGGGCATGTTCTGGATAAAT	104422

AL662807.8	1701	GCCCAGGAGAGGTATTGCTGGATCCTCCGGTAGTACTATGTCCAATTTTC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	104423	GCCCAGGAGAGGTATTGCTGGATCCTCCGGTAGTACTATGTCCAATTTTC	104472

AL662807.8	1751	TGAGGAACCTCCAGACTGATTTCCAGAGTGGTTGTACAAGCCTGCACTCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	104473	TGAGGAACCTCCAGACTGATTTCCAGAGTGGTTGTACAAGCCTGCACTCC	104522

AL662807.8	1801	CACCAACAATGGAGGAGTGTTCCTCTTTCTCCACATCCACGCCAGCATCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	104523	CACCAACAATGGAGGAGTGTTCCTCTTTCTCCACATCCACGCCAGCATCT	104572

AL662807.8	1851	GCTGTCACCTGAATTTTTGATCTTAGCCATTCTGACTGGTGTGAGGTGGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	104573	GCTGTCACCTGAATTTTTGATCTTAGCCATTCTGACTGGTGTGAGGTGGA	104622

AL662807.8	1901	ATCTCAGGGTTGTTTTGATTTGCATTTCCCTGATGATTAAGGATGTTGAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	104623	ATCTCAGGGTTGTTTTGATTTGCATTTCCCTGATGATTAAGGATGTTGAA	104672

AL662807.8	1951	CATTTTTTCAGGTGCTTCTCTGCCATTCGGAATTCCTCAGGTGAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645663.11	104673	CATTTTTTCAGGTGCTTCTCTGCCATTCGGAATTCCTCAGGTGAGAATTC	104722

Overview

Query
AL662807.8 - 188325 bps
Hit
AL645663.11 - 104722 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link