<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL589738.6	1	GAATTCACCATTTAATGATGGAAGAGCCACTTAACTTGGTTGTGTGTTGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	13604	GAATTCACCATTTAATGATGGAAGAGCCACTTAACTTGGTTGTGTGTTGC	13653

AL589738.6	51	TGTCCTGCTTGGTTATTTTAAACATAAGAACTCAGAGAAATTGAAGAAAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	13654	TGTCCTGCTTGGTTATTTTAAACATAAGAACTCAGAGAAATTGAAGAAAG	13703

AL589738.6	101	CTTAACATGAACCCACACCACAGCTCTCTGGACAATTTGCCCCGCAGACA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	13704	CTTAACATGAACCCACACCACAGCTCTCTGGACAATTTGCCCCGCAGACA	13753

AL589738.6	151	AAGACATAGCAAAGACCCCTAGATCCATATGGGGCCCCTAGGCCCAGGAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	13754	AAGACATAGCAAAGACCCCTAGATCCATATGGGGCCCCTAGGCCCAGGAC	13803

AL589738.6	201	ATTATGACCCTTTTCCCTATGTCAAGTGGGGAGCAATGGTGTCTGTGTTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	13804	ATTATGACCCTTTTCCCTATGTCAAGTGGGGAGCAATGGTGTCTGTGTTG	13853

AL589738.6	251	AGGAACGCTGACACAACTCATGATCCAGCTTTCAGGTGCTTCACACAGTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	13854	AGGAACGCTGACACAACTCATGATCCAGCTTTCAGGTGCTTCACACAGTG	13903

AL589738.6	301	CTTGCAGAACAAGCACCTCCAGCGCCAGTTTCTATTAGGCATATGTCGAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	13904	CTTGCAGAACAAGCACCTCCAGCGCCAGTTTCTATTAGGCATATGTCGAA	13953

AL589738.6	351	GCAACTTTTACTAACATCTTCTATTTTTTAATGCCATACAGGAAAGAACT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	13954	GCAACTTTTACTAACATCTTCTATTTTTTAATGCCATACAGGAAAGAACT	14003

AL589738.6	401	TCACATTTTTTTCTGCTTTCATATACTAACCAACAGAAGGAAAATTCCAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	14004	TCACATTTTTTTCTGCTTTCATATACTAACCAACAGAAGGAAAATTCCAC	14053

AL589738.6	451	CTGGAAATATGTGTCCAAATGCCAAGAAACAGAAGTACCTGAGTGCTTAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	14054	CTGGAAATATGTGTCCAAATGCCAAGAAACAGAAGTACCTGAGTGCTTAA	14103

AL589738.6	501	TGACCCAGCATAAATCACCAGGCAGGGTTATGAAAGCCACGGGTTTATCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	14104	TGACCCAGCATAAATCACCAGGCAGGGTTATGAAAGCCACGGGTTTATCA	14153

AL589738.6	551	GAGGGAGCGGCAGATGAAGGGCCTGGATGGTTGGTGCATGTCTGGAACAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	14154	GAGGGAGCGGCAGATGAAGGGCCTGGATGGTTGGTGCATGTCTGGAACAG	14203

AL589738.6	601	GGAACAAGTCATGATTTTCATGTCCTACCTTGCCAAGCTAAGGCTGGTAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	14204	GGAACAAGTCATGATTTTCATGTCCTACCTTGCCAAGCTAAGGCTGGTAA	14253

AL589738.6	651	GTGGGCCAGCCTAAATATTTCCCAGTGTCAAGCAGTAAGGAGGAAAGGCG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	14254	GTGGGCCAGCCTAAATATTTCCCAGTGTCAAGCAGTAAGGAGGAAAGGCG	14303

AL589738.6	701	AAGCTCACAGTGGGAGCAGAGCACTTTCCTGCACAGAGAATTAACCTGGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	14304	AAGCTCACAGTGGGAGCAGAGCACTTTCCTGCACAGAGAATTAACCTGGT	14353

AL589738.6	751	CTCCAGCCTGCTCTTGAGCAGGAGGTTTTCCTGGAAGGGACTCCTTAGAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	14354	CTCCAGCCTGCTCTTGAGCAGGAGGTTTTCCTGGAAGGGACTCCTTAGAC	14403

AL589738.6	801	CTTCTGACTAACTTGTGTGTGTACCTGGGCAGGCTCTGGGCAGACACGCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	14404	CTTCTGACTAACTTGTGTGTGTACCTGGGCAGGCTCTGGGCAGACACGCA	14453

AL589738.6	851	TGTTTGCAGAACACGTATTCCTAGCACAAAAAGAGGAGCACGTGTCAAAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	14454	TGTTTGCAGAACACGTATTCCTAGCACAAAAAGAGGAGCACGTGTCAAAG	14503

AL589738.6	901	TCAGCAACAGGCCTCACATACGTTGATGGTAGTGATTGGCTCACTTTTAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	14504	TCAGCAACAGGCCTCACATACGTTGATGGTAGTGATTGGCTCACTTTTAA	14553

AL589738.6	951	TAATCTGAGAGAGTGCATCTCTTAGCGAGGCAGTTAGCTACAAAGAACAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	14554	TAATCTGAGAGAGTGCATCTCTTAGCGAGGCAGTTAGCTACAAAGAACAG	14603

AL589738.6	1001	CAAAAGCTACCTATGTGGCCTCAAAAGCTTAGGTGGACCTGAAGTCTCAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	14604	CAAAAGCTACCTATGTGGCCTCAAAAGCTTAGGTGGACCTGAAGTCTCAG	14653

AL589738.6	1051	TGCTTGGGGGGTAATGCAGGAAGGGCAGAAGTTTCCAGGCCAGCCTGGGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	14654	TGCTTGGGGGGTAATGCAGGAAGGGCAGAAGTTTCCAGGCCAGCCTGGGC	14703

AL589738.6	1101	TACATAGCAGGGCCCTATCTCCAAACAAAAGGGGAGGTTTATTTGTGGCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	14704	TACATAGCAGGGCCCTATCTCCAAACAAAAGGGGAGGTTTATTTGTGGCA	14753

AL589738.6	1151	AGGTAGGTTTAATGTAATAGTTGCTAGTGTTGCAATGGCTTAGTAATTCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	14754	AGGTAGGTTTAATGTAATAGTTGCTAGTGTTGCAATGGCTTAGTAATTCA	14803

AL589738.6	1201	CAGGCTATGCTGACATCTCTGAATTCCCTTCAGCTTTCCTCTTCTGGTTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	14804	CAGGCTATGCTGACATCTCTGAATTCCCTTCAGCTTTCCTCTTCTGGTTG	14853

AL589738.6	1251	TAAGACATTAACATACCTCCAAACACTCCACCAAAAATTCAAGCAGGCTA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	14854	TAAGACATTAACATACCTCCAAACACTCCACCAAAAATTCAAGCAGGCTA	14903

AL589738.6	1301	AGGAAGGAAAGGCTCCACCAGCCTTGTCTGCTCTTTCTTCAGGAAAAGAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	14904	AGGAAGGAAAGGCTCCACCAGCCTTGTCTGCTCTTTCTTCAGGAAAAGAA	14953

AL589738.6	1351	GTATCACCAGGGATCTATAGACGGGCTTATGCTTTTCTCTGATCCGCTTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	14954	GTATCACCAGGGATCTATAGACGGGCTTATGCTTTTCTCTGATCCGCTTG	15003

AL589738.6	1401	AACCATGGAATGCTTGTCACTGTGTCCCATGTCTGTCCTAGTCATAATGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	15004	AACCATGGAATGCTTGTCACTGTGTCCCATGTCTGTCCTAGTCATAATGG	15053

AL589738.6	1451	AAGCTAGGTGTGTGTGTGTCTGTCTGTGTGTGTCTGTGTGTGTATCTGTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	15054	AAGCTAGGTGTGTGTGTGTCTGTCTGTGTGTGTCTGTGTGTGTATCTGTG	15103

AL589738.6	1501	TGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	15104	TGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTG	15153

AL589738.6	1551	TGTGTCTGTGTATGTCTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	15154	TGTGTCTGTGTATGTCTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTG	15203

AL589738.6	1601	TCTGTGTGTGTCTGTGTGTACACATGTGTGAACATGCTGTCAGAATTGGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	15204	TCTGTGTGTGTCTGTGTGTACACATGTGTGAACATGCTGTCAGAATTGGG	15253

AL589738.6	1651	GGCCCTAGGCAGACAGTGACAGTGACAGAGTTCAAGAAAACATCAGTCAC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	15254	GGCCCTAGGCAGACAGTGACAGTGACAGAGTTCAAGAAAACATCAGTCAC	15303

AL589738.6	1701	AGAATAGATATTCATCACACACCATCATCAAAACTGATGGAGAAGGGAAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	15304	AGAATAGATATTCATCACACACCATCATCAAAACTGATGGAGAAGGGAAC	15353

AL589738.6	1751	TTGAACAGTAACTCTTGTAAAGTCACTAAGGACAACCTTATTCCCCAGGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	15354	TTGAACAGTAACTCTTGTAAAGTCACTAAGGACAACCTTATTCCCCAGGC	15403

AL589738.6	1801	ACCAAGGCTAGTTTAGTTCTTGGGAGGGCTCTTGCTATCACAGGTTCATG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	15404	ACCAAGGCTAGTTTAGTTCTTGGGAGGGCTCTTGCTATCACAGGTTCATG	15453

AL589738.6	1851	TTCATTAACAAGGAACAGATGATAATAAAGACAAGTTAACTCATGATTCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	15454	TTCATTAACAAGGAACAGATGATAATAAAGACAAGTTAACTCATGATTCT	15503

AL589738.6	1901	CCTGCCTTCGTCTCCCTAAGCGCTGATGTCACAGGTGTGCTCCCCTGACA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	15504	CCTGCCTTCGTCTCCCTAAGCGCTGATGTCACAGGTGTGCTCCCCTGACA	15553

AL589738.6	1951	CTGCCTGCTGCCATGAAATGCTGAGCCTCGGAGTGAGAACTAAACACAGT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645662.8	15554	CTGCCTGCTGCCATGAAATGCTGAGCCTCGGAGTGAGAACTAAACACAGT	15603

Overview

Query
AL589738.6 - 187709 bps
Hit
AL645662.8 - 15603 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link