<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645726.22	1	GAATTCGCACTTATGCTCCATTAATTGCCAGCATATCTTCCTCTCTCCTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	76439	GAATTCGCACTTATGCTCCATTAATTGCCAGCATATCTTCCTCTCTCCTT	76488

AL645726.22	51	TCCTCCCCTCCCCCACTAAATCCCTCTGGAAAACAGCAGAGCAGCAGGCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	76489	TCCTCCCCTCCCCCACTAAATCCCTCTGGAAAACAGCAGAGCAGCAGGCC	76538

AL645726.22	101	CAGACTGGTACCCAGCAGCAACACCAGGAGCAGAAGTAGCCAATTACCCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	76539	CAGACTGGTACCCAGCAGCAACACCAGGAGCAGAAGTAGCCAATTACCCT	76588

AL645726.22	151	CCAGAATACAAAGGGGGAGGGGGAGAAGAAATGATGCAGTTACCTAGCAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	76589	CCAGAATACAAAGGGGGAGGGGGAGAAGAAATGATGCAGTTACCTAGCAA	76638

AL645726.22	201	CCAGAAGGAGCAGAAACAGCTGTGTAGCAGGCCCAGGCTGGTACCCAGGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	76639	CCAGAAGGAGCAGAAACAGCTGTGTAGCAGGCCCAGGCTGGTACCCAGGC	76688

AL645726.22	251	AGAAACAGGATAGCCAATTAGCACACTGTATTTAATGCTGATGTGGTTTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	76689	AGAAACAGGATAGCCAATTAGCACACTGTATTTAATGCTGATGTGGTTTC	76738

AL645726.22	301	CTAGTAACAAGCTGTACAAGTCTGTGTGTTGAATTCTCTCCCCCACCCCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	76739	CTAGTAACAAGCTGTACAAGTCTGTGTGTTGAATTCTCTCCCCCACCCCA	76788

AL645726.22	351	CGTTTTCCTCAATCATGCACAGTATTACTATTTGCCCTAATTACTGTTTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	76789	CGTTTTCCTCAATCATGCACAGTATTACTATTTGCCCTAATTACTGTTTC	76838

AL645726.22	401	TCCTCTGCTTCAAGCAACCATTATTTTGTCCCCAGAGAAATTGGAAGAAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	76839	TCCTCTGCTTCAAGCAACCATTATTTTGTCCCCAGAGAAATTGGAAGAAC	76888

AL645726.22	451	TCAGGAAAAAAAAAAAAAAAACTTCTGTAATGACAGTATTTAGTTTCAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	76889	TCAGGAAAAAAAAAAAAAAAACTTCTGTAATGACAGTATTTAGTTTCAAA	76938

AL645726.22	501	ATCAGTTTAGCTATAAGCCTTGAAACGCTAAACAACAACAACAAAGAATG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	76939	ATCAGTTTAGCTATAAGCCTTGAAACGCTAAACAACAACAACAAAGAATG	76988

AL645726.22	551	AAGAAAAAGAAAAGCCAGCAATTCTCCCTCTGCCTAAATGTCTAAGGAAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	76989	AAGAAAAAGAAAAGCCAGCAATTCTCCCTCTGCCTAAATGTCTAAGGAAC	77038

AL645726.22	601	CCATGAACCCTTTTCTACATGCAAGTGTCTGCATACGAGCGGGATAAAGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	77039	CCATGAACCCTTTTCTACATGCAAGTGTCTGCATACGAGCGGGATAAAGG	77088

AL645726.22	651	TGTTTATGATATGTGCTAGCATTTGCCTTTCTCTGCATCTTCAAATAGGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	77089	TGTTTATGATATGTGCTAGCATTTGCCTTTCTCTGCATCTTCAAATAGGT	77138

AL645726.22	701	CAGATCCTCTCTGTACTTGAATTTATTCATATTGATTTTCTGATGCTCCC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	77139	CAGATCCTCTCTGTACTTGAATTTATTCATATTGATTTTCTGATGCTCCC	77188

AL645726.22	751	CTGAACACTAGGAACATAAAATGTCTTATTACCTGTATCATAGAAAGGAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	77189	CTGAACACTAGGAACATAAAATGTCTTATTACCTGTATCATAGAAAGGAG	77238

AL645726.22	801	ATGTAGCTTTTGTTGCTCTTTCTAAAATACCAATACTAGTTTCAACAGGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	77239	ATGTAGCTTTTGTTGCTCTTTCTAAAATACCAATACTAGTTTCAACAGGC	77288

AL645726.22	851	TCATGAGCAATTGCGAATTCAATATGAGCAATCATTATTTCCTTCCTACA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	77289	TCATGAGCAATTGCGAATTCAATATGAGCAATCATTATTTCCTTCCTACA	77338

AL645726.22	901	AGTCGAGTGGAGTGAGGGATGCTGTGTATCCCACTGTCGGGGAGCTCCTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	77339	AGTCGAGTGGAGTGAGGGATGCTGTGTATCCCACTGTCGGGGAGCTCCTG	77388

AL645726.22	951	CTTCCGTGTTATCCGTTCATAACCAAGCAATGAATCCCACTGAGGTGACA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	77389	CTTCCGTGTTATCCGTTCATAACCAAGCAATGAATCCCACTGAGGTGACA	77438

AL645726.22	1001	TCGAGCTCCGTGAACAGACAAATACAGAAAAACTTTTAATATGACTTCTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	77439	TCGAGCTCCGTGAACAGACAAATACAGAAAAACTTTTAATATGACTTCTC	77488

AL645726.22	1051	TACAGTTATACTAAAATATATTTTGTGTTATACTCGATGTTGATATTCGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	77489	TACAGTTATACTAAAATATATTTTGTGTTATACTCGATGTTGATATTCGG	77538

AL645726.22	1101	TGGAACATATACCAGAGGGAGCCTTTCCCTTATATCCTATCCGCCATCAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	77539	TGGAACATATACCAGAGGGAGCCTTTCCCTTATATCCTATCCGCCATCAA	77588

AL645726.22	1151	ACATTGGACAGTTCTCCTTTTCTCAAGATGCCTGTCAGAATTCTAGGATC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	77589	ACATTGGACAGTTCTCCTTTTCTCAAGATGCCTGTCAGAATTCTAGGATC	77638

AL645726.22	1201	TTTCCCCTTTGACATGATGTAGATTTAAGAACAATGCATAGTCTTTCTTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	77639	TTTCCCCTTTGACATGATGTAGATTTAAGAACAATGCATAGTCTTTCTTT	77688

AL645726.22	1251	CAGACTCCCTTGATATGGAAACGAGGGCTCCAAAGGATGGTGTTAGAAAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	77689	CAGACTCCCTTGATATGGAAACGAGGGCTCCAAAGGATGGTGTTAGAAAG	77738

AL645726.22	1301	AAAAGCACACCTAACTAGACAATTTCCCATATGGAGGGGAGATCCACCTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	77739	AAAAGCACACCTAACTAGACAATTTCCCATATGGAGGGGAGATCCACCTT	77788

AL645726.22	1351	CTTGGATGAAATCCTTTATGATCTTTAGTGCATCTGGTGAAATAGGTGGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	77789	CTTGGATGAAATCCTTTATGATCTTTAGTGCATCTGGTGAAATAGGTGGA	77838

AL645726.22	1401	CTGTTTTGTCGCAGTACGCGTGGGAATTTTGAAACGTAAGTTCCTGAGGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	77839	CTGTTTTGTCGCAGTACGCGTGGGAATTTTGAAACGTAAGTTCCTGAGGA	77888

AL645726.22	1451	CAGAATGCACCTCTTCCCTGATTTCCATATATTTAGTGTTCATCATGGAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	77889	CAGAATGCACCTCTTCCCTGATTTCCATATATTTAGTGTTCATCATGGAC	77938

AL645726.22	1501	ACGTTGTGAAGGCAGAAACAACAAAAGAAACCAGAGTATCTGTTATGATG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	77939	ACGTTGTGAAGGCAGAAACAACAAAAGAAACCAGAGTATCTGTTATGATG	77988

AL645726.22	1551	CTAAGGGACTTGTTCATAACATAAAAGAGGTTCAAATTATAAACACATTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	77989	CTAAGGGACTTGTTCATAACATAAAAGAGGTTCAAATTATAAACACATTT	78038

AL645726.22	1601	TAATTTGTGAACACAAACAAAAGAGATCTTACCTGAGTGCAGATACAATC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	78039	TAATTTGTGAACACAAACAAAAGAGATCTTACCTGAGTGCAGATACAATC	78088

AL645726.22	1651	TTAGAGGAGAGAAAGGGGAAGACGAAGGTCAAAAGAGATGAGGGCCTTCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	78089	TTAGAGGAGAGAAAGGGGAAGACGAAGGTCAAAAGAGATGAGGGCCTTCC	78138

AL645726.22	1701	AAAGAGGTTTGGCCTAGGACAAGACTGTATCTAGGCTCTGTAAGGAACTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	78139	AAAGAGGTTTGGCCTAGGACAAGACTGTATCTAGGCTCTGTAAGGAACTT	78188

AL645726.22	1751	TCAATGTGTTATTTCTTAATCTCCATCTCCGTTTGCCTCATGAATCATAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	78189	TCAATGTGTTATTTCTTAATCTCCATCTCCGTTTGCCTCATGAATCATAA	78238

AL645726.22	1801	GCTCCAAAGGCAATAGCATTGAGTGCTTGGGAGCAACAGCATTGTACGGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	78239	GCTCCAAAGGCAATAGCATTGAGTGCTTGGGAGCAACAGCATTGTACGGA	78288

AL645726.22	1851	GGGAGGCTAACCCCAGCTTTGCCTCAGTGAATAACGAACACGTTAAAAGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	78289	GGGAGGCTAACCCCAGCTTTGCCTCAGTGAATAACGAACACGTTAAAAGC	78338

AL645726.22	1901	TGCTGCTGTTTGATTATTTTAATGGTCATGTCTCCACTAACATTTAGTAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	78339	TGCTGCTGTTTGATTATTTTAATGGTCATGTCTCCACTAACATTTAGTAT	78388

AL645726.22	1951	GATAATTGTCATGCCAATATATTATCTGTACACAAAACTAGAGGGAAGCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645646.8	78389	GATAATTGTCATGCCAATATATTATCTGTACACAAAACTAGAGGGAAGCT	78438

Overview

Query
AL645726.22 - 231347 bps
Hit
AL645646.8 - 78438 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link