<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645534.20	1	GAATATGTTGAGTTGGAGCACAGTCTTAGTCACTTTTACTTTCTGTTCCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	205630	GAATATGTTGAGTTGGAGCACAGTCTTAGTCACTTTTACTTTCTGTTCCC	205679

AL645534.20	51	ATGTGAAAACTTCCTGTTCTGAAAGATGCTTGTGGGGCACAGTCTCAAGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	205680	ATGTGAAAACTTCCTGTTCTGAAAGATGCTTGTGGGGCACAGTCTCAAGG	205729

AL645534.20	101	GAGAAATGATTTGAAGGGTGTACACCATCTATAGATGTTTTAAGGCTCTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	205730	GAGAAATGATTTGAAGGGTGTACACCATCTATAGATGTTTTAAGGCTCTC	205779

AL645534.20	151	CTAAGGAGCTTGAAATGAGATTGATAACAATGAAGAAGTAATAACTGGCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	205780	CTAAGGAGCTTGAAATGAGATTGATAACAATGAAGAAGTAATAACTGGCT	205829

AL645534.20	201	TTGTTCTACTCTCTCAAATGTTTCCCAAACATTTTCAACTCTGAAAACCC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	205830	TTGTTCTACTCTCTCAAATGTTTCCCAAACATTTTCAACTCTGAAAACCC	205879

AL645534.20	251	AGTATGGTCTTCCAATGGCGGTGGCACAAGTATTATCACAGAGCCTGGCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	205880	AGTATGGTCTTCCAATGGCGGTGGCACAAGTATTATCACAGAGCCTGGCT	205929

AL645534.20	301	CAAAACCTTGGAATCCAGTGGGAACCTTCGAGCAGGAAGCCAAGTATGTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	205930	CAAAACCTTGGAATCCAGTGGGAACCTTCGAGCAGGAAGCCAAGTATGTA	205979

AL645534.20	351	CACTGACTTCTTACTCCAGTCCCCTTGTCGTTCTGTGTGTATTACGCATG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	205980	CACTGACTTCTTACTCCAGTCCCCTTGTCGTTCTGTGTGTATTACGCATG	206029

AL645534.20	401	CCCAGTCACCGAGAATACTTTATTTCCATGCCACCGTGGTTTAATCATAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	206030	CCCAGTCACCGAGAATACTTTATTTCCATGCCACCGTGGTTTAATCATAG	206079

AL645534.20	451	TGCATCTCATGCTTCAAAAAATAATCTTGAACATTTTGAGATCATTATTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	206080	TGCATCTCATGCTTCAAAAAATAATCTTGAACATTTTGAGATCATTATTA	206129

AL645534.20	501	GGCTATCTGAGGGGAATACATTTCTCTTTCAAAATTCATAAGCTTATCCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	206130	GGCTATCTGAGGGGAATACATTTCTCTTTCAAAATTCATAAGCTTATCCT	206179

AL645534.20	551	CCGTCAGCTCTATCTTACATAGAGAACGTTGGGACGAGGTGGGGTGGTAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	206180	CCGTCAGCTCTATCTTACATAGAGAACGTTGGGACGAGGTGGGGTGGTAG	206229

AL645534.20	601	TGGTATGCATATATTCTCCAGAGATTTAATCATTTGAGCATAGACACAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	206230	TGGTATGCATATATTCTCCAGAGATTTAATCATTTGAGCATAGACACAAA	206279

AL645534.20	651	ATGACAGATACAGCTCTGTGGAGAGATGATCAGATATATAGTGCATTGGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	206280	ATGACAGATACAGCTCTGTGGAGAGATGATCAGATATATAGTGCATTGGG	206329

AL645534.20	701	AATGAGATCTACAGCATACAAGGAGCTCATATTTAAATGCTAACCACACT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	206330	AATGAGATCTACAGCATACAAGGAGCTCATATTTAAATGCTAACCACACT	206379

AL645534.20	751	CACCCACAAGGTCATATCTAGAAGGTGAGCTCCTGTCTCCCCTAAGCAAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	206380	CACCCACAAGGTCATATCTAGAAGGTGAGCTCCTGTCTCCCCTAAGCAAA	206429

AL645534.20	801	GCCTGCCTCTGGCCCTTTAAGCTTCAAATGCGTGGGCACAGGACACAATT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	206430	GCCTGCCTCTGGCCCTTTAAGCTTCAAATGCGTGGGCACAGGACACAATT	206479

AL645534.20	851	GTCCTCTGGTGCAGGTAGGTCCAAGAGGAGCTCATCCATGGCCCCTGACC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	206480	GTCCTCTGGTGCAGGTAGGTCCAAGAGGAGCTCATCCATGGCCCCTGACC	206529

AL645534.20	901	CATGTGGCATCAAAGTAAGGCAAGGGACTGTTGAGGCCACTGTTTCCATT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	206530	CATGTGGCATCAAAGTAAGGCAAGGGACTGTTGAGGCCACTGTTTCCATT	206579

AL645534.20	951	GAACAGATGAGAGAAGGAAGGATAGGACTAACTTTTCAAGTGGGCTGAGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	206580	GAACAGATGAGAGAAGGAAGGATAGGACTAACTTTTCAAGTGGGCTGAGG	206629

AL645534.20	1001	ACTGAGGGAACGTCAGATATTTAGAAGCCCATGGAAATATCTGGTTCGTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	206630	ACTGAGGGAACGTCAGATATTTAGAAGCCCATGGAAATATCTGGTTCGTT	206679

AL645534.20	1051	TTAAAATCAGGATAAAGTCCATATCTCATTTATTTTAAAATCAGGATAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	206680	TTAAAATCAGGATAAAGTCCATATCTCATTTATTTTAAAATCAGGATAAA	206729

AL645534.20	1101	ATCCAACCCAAATTTTAGTCCCCTTTGTATGAGCACCGTGGTCAAATATA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	206730	ATCCAACCCAAATTTTAGTCCCCTTTGTATGAGCACCGTGGTCAAATATA	206779

AL645534.20	1151	ATCTTGGTACATTTTTGTGGTAGAAGGCAAAGCATCACAATGGGACCTGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	206780	ATCTTGGTACATTTTTGTGGTAGAAGGCAAAGCATCACAATGGGACCTGG	206829

AL645534.20	1201	TGGAGAAAAAGAGCAGCACGTTCATCCATTGTTCATTTAATGAGAAAATA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	206830	TGGAGAAAAAGAGCAGCACGTTCATCCATTGTTCATTTAATGAGAAAATA	206879

AL645534.20	1251	AGCTGAAATCCTCACTCTCTCATTATATATCGTCCTGAGAGCGAGGAGAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	206880	AGCTGAAATCCTCACTCTCTCATTATATATCGTCCTGAGAGCGAGGAGAA	206929

AL645534.20	1301	AAAAACCCTCTCTTCCCACCCAGGCCTTCCCAGAGAAGAAAAGAAAAGTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	206930	AAAAACCCTCTCTTCCCACCCAGGCCTTCCCAGAGAAGAAAAGAAAAGTG	206979

AL645534.20	1351	CATTATCTCACATGCTGTCTTCTATGTGACTGATAGGTAGTACTGTGGAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	206980	CATTATCTCACATGCTGTCTTCTATGTGACTGATAGGTAGTACTGTGGAG	207029

AL645534.20	1401	AAGTGGAAGGACACCCGCATCCATACTCCTGAGTCCCTTTATGTCATTAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	207030	AAGTGGAAGGACACCCGCATCCATACTCCTGAGTCCCTTTATGTCATTAA	207079

AL645534.20	1451	GGACCAAGTACACACAGTCATGACAAGCACCCAGCAACAGTCTCCTAGTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	207080	GGACCAAGTACACACAGTCATGACAAGCACCCAGCAACAGTCTCCTAGTC	207129

AL645534.20	1501	TCCACAAACTTTCATTTACTAAAATCTTGCTCAGACTATGTGCTTTCTCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	207130	TCCACAAACTTTCATTTACTAAAATCTTGCTCAGACTATGTGCTTTCTCA	207179

AL645534.20	1551	AGGAAGTAGCCACCTCACTTTAAAGTTTCAGAAACTGACCCAGATAGCTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	207180	AGGAAGTAGCCACCTCACTTTAAAGTTTCAGAAACTGACCCAGATAGCTC	207229

AL645534.20	1601	AGACTCGGGAAGAAGAACATTGGGTTCCGTAACTTAGTTAAAAGTCCTGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	207230	AGACTCGGGAAGAAGAACATTGGGTTCCGTAACTTAGTTAAAAGTCCTGG	207279

AL645534.20	1651	AGGCCAGTGCTGGGGTCAGCTGAGCTGTTATTGGACTGAATGGTGAAGTA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	207280	AGGCCAGTGCTGGGGTCAGCTGAGCTGTTATTGGACTGAATGGTGAAGTA	207329

AL645534.20	1701	GACTGGGATGAGATTGTTGCACTTCTCTGGCTGATCCTAGCCCTGACTCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	207330	GACTGGGATGAGATTGTTGCACTTCTCTGGCTGATCCTAGCCCTGACTCC	207379

AL645534.20	1751	AGCAAATTGAATTTTATTCTTTAGCTGCCCTGTGTCTGAAGGACTTCAGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	207380	AGCAAATTGAATTTTATTCTTTAGCTGCCCTGTGTCTGAAGGACTTCAGT	207429

AL645534.20	1801	GACATTGTGCTGTATTCATACAGACTGTCTGGGAATGCCATCTATCTGTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	207430	GACATTGTGCTGTATTCATACAGACTGTCTGGGAATGCCATCTATCTGTT	207479

AL645534.20	1851	TGAGCCCTAAAGCCATGCTGGGAGATAGGTAGACATCACTTCCATTCTAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	207480	TGAGCCCTAAAGCCATGCTGGGAGATAGGTAGACATCACTTCCATTCTAA	207529

AL645534.20	1901	AGCAGACACCCTGCCCCTCCCCTTCCCCCCCCCCCCTCAAAAAAAGCTGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	207530	AGCAGACACCCTGCCCCTCCCCTTCCCCCCCCCCCCTCAAAAAAAGCTGA	207579

AL645534.20	1951	GTGTCTTCTCTATGGGACTCTCTCCTTGATTAAAAGATGGACTAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645637.18	207580	GTGTCTTCTCTATGGGACTCTCTCCTTGATTAAAAGATGGACTAGAATTC	207629

Overview

Query
AL645534.20 - 164167 bps
Hit
AL645637.18 - 207629 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link