<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
AL512647.14 1 GAATTCCTTACACAGACACCTTAAAAAACAAAACCAAAAAACCAAATGTT 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 148987 GAATTCCTTACACAGACACCTTAAAAAACAAAACCAAAAAACCAAATGTT 149036 AL512647.14 51 TGCCCTTGTCTGTGGCATAGAAAACCCAGGTTGTTTACACAAATTTTCTG 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 149037 TGCCCTTGTCTGTGGCATAGAAAACCCAGGTTGTTTACACAAATTTTCTG 149086 AL512647.14 101 TTGATCATCGAGTAATTAAAGTCCCCAAATTCTAAGGCACTTAAACCCTC 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 149087 TTGATCATCGAGTAATTAAAGTCCCCAAATTCTAAGGCACTTAAACCCTC 149136 AL512647.14 151 TAAGGTCATGGTTCTCTAACAAGATGAACAGGCAAAATCAAGTCAGGCCA 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 149137 TAAGGTCATGGTTCTCTAACAAGATGAACAGGCAAAATCAAGTCAGGCCA 149186 AL512647.14 201 TTCTCTTCTAACACCCATAGAGGCAGGGAAATGAGGAAGGGGAAGAAGAC 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 149187 TTCTCTTCTAACACCCATAGAGGCAGGGAAATGAGGAAGGGGAAGAAGAC 149236 AL512647.14 251 CCCCAAGAGAGACAAGACAGAAAGCTTGCAAAGAGAATGGACTCTGTCAG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 149237 CCCCAAGAGAGACAAGACAGAAAGCTTGCAAAGAGAATGGACTCTGTCAG 149286 AL512647.14 301 AACTCTACATTGTCAGATGAAACCTTTCCAGTCAGGATAAACCCTTCACT 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 149287 AACTCTACATTGTCAGATGAAACCTTTCCAGTCAGGATAAACCCTTCACT 149336 AL512647.14 351 GACAATAAGGAAAGGCTCTGTCTACGAATAAACACAAACAAGGCCAAGAT 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 149337 GACAATAAGGAAAGGCTCTGTCTACGAATAAACACAAACAAGGCCAAGAT 149386 AL512647.14 401 TCTGTTTAAATGGGTCAGGTTCTAGGGCTCAGAAGTACTCCAGGGTAAAG 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 149387 TCTGTTTAAATGGGTCAGGTTCTAGGGCTCAGAAGTACTCCAGGGTAAAG 149436 AL512647.14 451 GTCATTCACTGGCTAGCCTAGAAGCCTGAAAGGACTAGACGAGGGATATG 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 149437 GTCATTCACTGGCTAGCCTAGAAGCCTGAAAGGACTAGACGAGGGATATG 149486 AL512647.14 501 CTGAGAAGCCTGGGAAATCCAGAGAGAGAAGAGCTACTTGCTCCTATCAA 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 149487 CTGAGAAGCCTGGGAAATCCAGAGAGAGAAGAGCTACTTGCTCCTATCAA 149536 AL512647.14 551 GTGTCAAAGAAAAAGAAGGGTTAAATGTCAATATACCAGCAAGTGATGGA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 149537 GTGTCAAAGAAAAAGAAGGGTTAAATGTCAATATACCAGCAAGTGATGGA 149586 AL512647.14 601 GGCAACTAAGCCCAGGCATAGATAAGCATCTTGTGGATATTCTTTGAATC 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 149587 GGCAACTAAGCCCAGGCATAGATAAGCATCTTGTGGATATTCTTTGAATC 149636 AL512647.14 651 TCTAGTTCTTCATCTGTCAAGTGTGCACAAAGATTACCTGAAATAGCAGT 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 149637 TCTAGTTCTTCATCTGTCAAGTGTGCACAAAGATTACCTGAAATAGCAGT 149686 AL512647.14 701 TTTTAAAGTTAAATGGTACAGAAGCTGTTAAAGTGGCTGATGCATAACAT 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 149687 TTTTAAAGTTAAATGGTACAGAAGCTGTTAAAGTGGCTGATGCATAACAT 149736 AL512647.14 751 GCAGGGTAAATTATTTACCTAACTTCTAAACCATATCAAAGTAGTTTGGA 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 149737 GCAGGGTAAATTATTTACCTAACTTCTAAACCATATCAAAGTAGTTTGGA 149786 AL512647.14 801 ATTCAAGAGGTGAACTCTACTTATGATCAGAGAAGACCAACTCTTCCTTA 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 149787 ATTCAAGAGGTGAACTCTACTTATGATCAGAGAAGACCAACTCTTCCTTA 149836 AL512647.14 851 TATGACAAGAGTGCCTTTCCCCTTCTTAGGGAGCACGGCTTTGAGGGTGT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 149837 TATGACAAGAGTGCCTTTCCCCTTCTTAGGGAGCACGGCTTTGAGGGTGT 149886 AL512647.14 901 GCAGAGGTTCTGAGCCACAGAAATAGCAGCAGCATCTGAGTACAGTTCTA 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 149887 GCAGAGGTTCTGAGCCACAGAAATAGCAGCAGCATCTGAGTACAGTTCTA 149936 AL512647.14 951 AGCCTGTGCAAAAGCATCTCCAAAAATGTCCCATGCAGGCCATGATGGTG 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 149937 AGCCTGTGCAAAAGCATCTCCAAAAATGTCCCATGCAGGCCATGATGGTG 149986 AL512647.14 1001 AGCTCTAAAGGTCAACGCACTTCAGTAGAGAGTTACGAACAATGGTGCTG 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 149987 AGCTCTAAAGGTCAACGCACTTCAGTAGAGAGTTACGAACAATGGTGCTG 150036 AL512647.14 1051 TCTGGAGGCACAAGAGCAGAATGGATTCTGTACAGGTGAGCAATGAGAGA 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 150037 TCTGGAGGCACAAGAGCAGAATGGATTCTGTACAGGTGAGCAATGAGAGA 150086 AL512647.14 1101 CTGCCACAGATAAAAGCCTTGAGGGAACCAGGGAGAAGGTCACTAGACAA 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 150087 CTGCCACAGATAAAAGCCTTGAGGGAACCAGGGAGAAGGTCACTAGACAA 150136 AL512647.14 1151 GCAGATAAGCAAGACATTTGGTCCTGTTGCTTTATTGTCTAAGCCAGAGT 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 150137 GCAGATAAGCAAGACATTTGGTCCTGTTGCTTTATTGTCTAAGCCAGAGT 150186 AL512647.14 1201 CCCTACACCATTCCACTAACAAAATTCATGATATGAGATACATAAAAATA 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 150187 CCCTACACCATTCCACTAACAAAATTCATGATATGAGATACATAAAAATA 150236 AL512647.14 1251 CCTTATAGTCTAGTTGAGGTGAGAAAACATGGCACCCATAAGTATAGTGC 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 150237 CCTTATAGTCTAGTTGAGGTGAGAAAACATGGCACCCATAAGTATAGTGC 150286 AL512647.14 1301 AACACAGAAAAAGTAAATGCACCGCCCTTTTCAGGGGAGGGGATACCACC 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 150287 AACACAGAAAAAGTAAATGCACCGCCCTTTTCAGGGGAGGGGATACCACC 150336 AL512647.14 1351 AGCAAGGCAATCAGAACCAATCCCACAACTGTTAGAGCAGTTTGAGCTTA 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 150337 AGCAAGGCAATCAGAACCAATCCCACAACTGTTAGAGCAGTTTGAGCTTA 150386 AL512647.14 1401 GTGTGAATGGAGGACACAAGGTCAGCAAAGAGTCCCATCTTTGTAGGGAA 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 150387 GTGTGAATGGAGGACACAAGGTCAGCAAAGAGTCCCATCTTTGTAGGGAA 150436 AL512647.14 1451 AGTCTAGATAGAGGACCTTGACAGAACAGCACAAAGTGGGGCAATCAAGG 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 150437 AGTCTAGATAGAGGACCTTGACAGAACAGCACAAAGTGGGGCAATCAAGG 150486 AL512647.14 1501 CCAAGGTTGGAAATGGAGAGCATGTAGGTAACTTCCCAGCCTGAGGGGCT 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 150487 CCAAGGTTGGAAATGGAGAGCATGTAGGTAACTTCCCAGCCTGAGGGGCT 150536 AL512647.14 1551 AGGTTACAGCCACACAAAGCTAACTACAGATGCAGCGGACTGTGTAAGGA 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 150537 AGGTTACAGCCACACAAAGCTAACTACAGATGCAGCGGACTGTGTAAGGA 150586 AL512647.14 1601 ACAAGTCAAAACAAGACAAGCGATAGATTCAGATTCTAGAAGAAAAAAGA 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 150587 ACAAGTCAAAACAAGACAAGCGATAGATTCAGATTCTAGAAGAAAAAAGA 150636 AL512647.14 1651 CTCAATCAAGAGTGATTTCAATGCACAGGCTCAATGCTCAAGTCATGACT 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 150637 CTCAATCAAGAGTGATTTCAATGCACAGGCTCAATGCTCAAGTCATGACT 150686 AL512647.14 1701 CATGAGTGGACAGGGAACACTAAGAAATGAACACATGTCATAAACAGGTG 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 150687 CATGAGTGGACAGGGAACACTAAGAAATGAACACATGTCATAAACAGGTG 150736 AL512647.14 1751 CTCGGGGATCATACTATGATACAGCTGAAGAAGCAGGATCAGGGCCAGTC 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 150737 CTCGGGGATCATACTATGATACAGCTGAAGAAGCAGGATCAGGGCCAGTC 150786 AL512647.14 1801 TGGGTATGGCACAGTGAGTTCTTGACACAGGGGTCAGCCCCAGGGAAGCC 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 150787 TGGGTATGGCACAGTGAGTTCTTGACACAGGGGTCAGCCCCAGGGAAGCC 150836 AL512647.14 1851 AGTTCAAGCTGGTCTGCATACTGGCTAGATAGATCCAGTTCAGTCAGTTG 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 150837 AGTTCAAGCTGGTCTGCATACTGGCTAGATAGATCCAGTTCAGTCAGTTG 150886 AL512647.14 1901 ACCCTGAGGCCACCTGAGGATTGTGGGACAAGGGGAGTAAGAGAGTAAAG 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 150887 ACCCTGAGGCCACCTGAGGATTGTGGGACAAGGGGAGTAAGAGAGTAAAG 150936 AL512647.14 1951 GGAAGGGAGGATTCCAGATACACCTTCAAGGCAGCAGGCTACAAGTTCCC 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645587.9 150937 GGAAGGGAGGATTCCAGATACACCTTCAAGGCAGCAGGCTACAAGTTCCC 150986