<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL512647.14	1	GAATTCCTTACACAGACACCTTAAAAAACAAAACCAAAAAACCAAATGTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	148987	GAATTCCTTACACAGACACCTTAAAAAACAAAACCAAAAAACCAAATGTT	149036

AL512647.14	51	TGCCCTTGTCTGTGGCATAGAAAACCCAGGTTGTTTACACAAATTTTCTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	149037	TGCCCTTGTCTGTGGCATAGAAAACCCAGGTTGTTTACACAAATTTTCTG	149086

AL512647.14	101	TTGATCATCGAGTAATTAAAGTCCCCAAATTCTAAGGCACTTAAACCCTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	149087	TTGATCATCGAGTAATTAAAGTCCCCAAATTCTAAGGCACTTAAACCCTC	149136

AL512647.14	151	TAAGGTCATGGTTCTCTAACAAGATGAACAGGCAAAATCAAGTCAGGCCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	149137	TAAGGTCATGGTTCTCTAACAAGATGAACAGGCAAAATCAAGTCAGGCCA	149186

AL512647.14	201	TTCTCTTCTAACACCCATAGAGGCAGGGAAATGAGGAAGGGGAAGAAGAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	149187	TTCTCTTCTAACACCCATAGAGGCAGGGAAATGAGGAAGGGGAAGAAGAC	149236

AL512647.14	251	CCCCAAGAGAGACAAGACAGAAAGCTTGCAAAGAGAATGGACTCTGTCAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	149237	CCCCAAGAGAGACAAGACAGAAAGCTTGCAAAGAGAATGGACTCTGTCAG	149286

AL512647.14	301	AACTCTACATTGTCAGATGAAACCTTTCCAGTCAGGATAAACCCTTCACT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	149287	AACTCTACATTGTCAGATGAAACCTTTCCAGTCAGGATAAACCCTTCACT	149336

AL512647.14	351	GACAATAAGGAAAGGCTCTGTCTACGAATAAACACAAACAAGGCCAAGAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	149337	GACAATAAGGAAAGGCTCTGTCTACGAATAAACACAAACAAGGCCAAGAT	149386

AL512647.14	401	TCTGTTTAAATGGGTCAGGTTCTAGGGCTCAGAAGTACTCCAGGGTAAAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	149387	TCTGTTTAAATGGGTCAGGTTCTAGGGCTCAGAAGTACTCCAGGGTAAAG	149436

AL512647.14	451	GTCATTCACTGGCTAGCCTAGAAGCCTGAAAGGACTAGACGAGGGATATG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	149437	GTCATTCACTGGCTAGCCTAGAAGCCTGAAAGGACTAGACGAGGGATATG	149486

AL512647.14	501	CTGAGAAGCCTGGGAAATCCAGAGAGAGAAGAGCTACTTGCTCCTATCAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	149487	CTGAGAAGCCTGGGAAATCCAGAGAGAGAAGAGCTACTTGCTCCTATCAA	149536

AL512647.14	551	GTGTCAAAGAAAAAGAAGGGTTAAATGTCAATATACCAGCAAGTGATGGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	149537	GTGTCAAAGAAAAAGAAGGGTTAAATGTCAATATACCAGCAAGTGATGGA	149586

AL512647.14	601	GGCAACTAAGCCCAGGCATAGATAAGCATCTTGTGGATATTCTTTGAATC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	149587	GGCAACTAAGCCCAGGCATAGATAAGCATCTTGTGGATATTCTTTGAATC	149636

AL512647.14	651	TCTAGTTCTTCATCTGTCAAGTGTGCACAAAGATTACCTGAAATAGCAGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	149637	TCTAGTTCTTCATCTGTCAAGTGTGCACAAAGATTACCTGAAATAGCAGT	149686

AL512647.14	701	TTTTAAAGTTAAATGGTACAGAAGCTGTTAAAGTGGCTGATGCATAACAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	149687	TTTTAAAGTTAAATGGTACAGAAGCTGTTAAAGTGGCTGATGCATAACAT	149736

AL512647.14	751	GCAGGGTAAATTATTTACCTAACTTCTAAACCATATCAAAGTAGTTTGGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	149737	GCAGGGTAAATTATTTACCTAACTTCTAAACCATATCAAAGTAGTTTGGA	149786

AL512647.14	801	ATTCAAGAGGTGAACTCTACTTATGATCAGAGAAGACCAACTCTTCCTTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	149787	ATTCAAGAGGTGAACTCTACTTATGATCAGAGAAGACCAACTCTTCCTTA	149836

AL512647.14	851	TATGACAAGAGTGCCTTTCCCCTTCTTAGGGAGCACGGCTTTGAGGGTGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	149837	TATGACAAGAGTGCCTTTCCCCTTCTTAGGGAGCACGGCTTTGAGGGTGT	149886

AL512647.14	901	GCAGAGGTTCTGAGCCACAGAAATAGCAGCAGCATCTGAGTACAGTTCTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	149887	GCAGAGGTTCTGAGCCACAGAAATAGCAGCAGCATCTGAGTACAGTTCTA	149936

AL512647.14	951	AGCCTGTGCAAAAGCATCTCCAAAAATGTCCCATGCAGGCCATGATGGTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	149937	AGCCTGTGCAAAAGCATCTCCAAAAATGTCCCATGCAGGCCATGATGGTG	149986

AL512647.14	1001	AGCTCTAAAGGTCAACGCACTTCAGTAGAGAGTTACGAACAATGGTGCTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	149987	AGCTCTAAAGGTCAACGCACTTCAGTAGAGAGTTACGAACAATGGTGCTG	150036

AL512647.14	1051	TCTGGAGGCACAAGAGCAGAATGGATTCTGTACAGGTGAGCAATGAGAGA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	150037	TCTGGAGGCACAAGAGCAGAATGGATTCTGTACAGGTGAGCAATGAGAGA	150086

AL512647.14	1101	CTGCCACAGATAAAAGCCTTGAGGGAACCAGGGAGAAGGTCACTAGACAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	150087	CTGCCACAGATAAAAGCCTTGAGGGAACCAGGGAGAAGGTCACTAGACAA	150136

AL512647.14	1151	GCAGATAAGCAAGACATTTGGTCCTGTTGCTTTATTGTCTAAGCCAGAGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	150137	GCAGATAAGCAAGACATTTGGTCCTGTTGCTTTATTGTCTAAGCCAGAGT	150186

AL512647.14	1201	CCCTACACCATTCCACTAACAAAATTCATGATATGAGATACATAAAAATA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	150187	CCCTACACCATTCCACTAACAAAATTCATGATATGAGATACATAAAAATA	150236

AL512647.14	1251	CCTTATAGTCTAGTTGAGGTGAGAAAACATGGCACCCATAAGTATAGTGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	150237	CCTTATAGTCTAGTTGAGGTGAGAAAACATGGCACCCATAAGTATAGTGC	150286

AL512647.14	1301	AACACAGAAAAAGTAAATGCACCGCCCTTTTCAGGGGAGGGGATACCACC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	150287	AACACAGAAAAAGTAAATGCACCGCCCTTTTCAGGGGAGGGGATACCACC	150336

AL512647.14	1351	AGCAAGGCAATCAGAACCAATCCCACAACTGTTAGAGCAGTTTGAGCTTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	150337	AGCAAGGCAATCAGAACCAATCCCACAACTGTTAGAGCAGTTTGAGCTTA	150386

AL512647.14	1401	GTGTGAATGGAGGACACAAGGTCAGCAAAGAGTCCCATCTTTGTAGGGAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	150387	GTGTGAATGGAGGACACAAGGTCAGCAAAGAGTCCCATCTTTGTAGGGAA	150436

AL512647.14	1451	AGTCTAGATAGAGGACCTTGACAGAACAGCACAAAGTGGGGCAATCAAGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	150437	AGTCTAGATAGAGGACCTTGACAGAACAGCACAAAGTGGGGCAATCAAGG	150486

AL512647.14	1501	CCAAGGTTGGAAATGGAGAGCATGTAGGTAACTTCCCAGCCTGAGGGGCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	150487	CCAAGGTTGGAAATGGAGAGCATGTAGGTAACTTCCCAGCCTGAGGGGCT	150536

AL512647.14	1551	AGGTTACAGCCACACAAAGCTAACTACAGATGCAGCGGACTGTGTAAGGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	150537	AGGTTACAGCCACACAAAGCTAACTACAGATGCAGCGGACTGTGTAAGGA	150586

AL512647.14	1601	ACAAGTCAAAACAAGACAAGCGATAGATTCAGATTCTAGAAGAAAAAAGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	150587	ACAAGTCAAAACAAGACAAGCGATAGATTCAGATTCTAGAAGAAAAAAGA	150636

AL512647.14	1651	CTCAATCAAGAGTGATTTCAATGCACAGGCTCAATGCTCAAGTCATGACT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	150637	CTCAATCAAGAGTGATTTCAATGCACAGGCTCAATGCTCAAGTCATGACT	150686

AL512647.14	1701	CATGAGTGGACAGGGAACACTAAGAAATGAACACATGTCATAAACAGGTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	150687	CATGAGTGGACAGGGAACACTAAGAAATGAACACATGTCATAAACAGGTG	150736

AL512647.14	1751	CTCGGGGATCATACTATGATACAGCTGAAGAAGCAGGATCAGGGCCAGTC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	150737	CTCGGGGATCATACTATGATACAGCTGAAGAAGCAGGATCAGGGCCAGTC	150786

AL512647.14	1801	TGGGTATGGCACAGTGAGTTCTTGACACAGGGGTCAGCCCCAGGGAAGCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	150787	TGGGTATGGCACAGTGAGTTCTTGACACAGGGGTCAGCCCCAGGGAAGCC	150836

AL512647.14	1851	AGTTCAAGCTGGTCTGCATACTGGCTAGATAGATCCAGTTCAGTCAGTTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	150837	AGTTCAAGCTGGTCTGCATACTGGCTAGATAGATCCAGTTCAGTCAGTTG	150886

AL512647.14	1901	ACCCTGAGGCCACCTGAGGATTGTGGGACAAGGGGAGTAAGAGAGTAAAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	150887	ACCCTGAGGCCACCTGAGGATTGTGGGACAAGGGGAGTAAGAGAGTAAAG	150936

AL512647.14	1951	GGAAGGGAGGATTCCAGATACACCTTCAAGGCAGCAGGCTACAAGTTCCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645587.9	150937	GGAAGGGAGGATTCCAGATACACCTTCAAGGCAGCAGGCTACAAGTTCCC	150986

Overview

Query
AL512647.14 - 199848 bps
Hit
AL645587.9 - 150986 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link