<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
AL807812.6 1 CATGATTCCAGGGCCTGTACTTCTAGCTGTGTGACCTTGAGAAAGTATTT 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 179653 CATGATTCCAGGGCCTGTACTTCTAGCTGTGTGACCTTGAGAAAGTATTT 179702 AL807812.6 51 GATTTCTTTTAGCCTTCGTGTCTTCATCTGTAAAGTAGAATGCACTGTTG 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 179703 GATTTCTTTTAGCCTTCGTGTCTTCATCTGTAAAGTAGAATGCACTGTTG 179752 AL807812.6 101 GCTATTTTCTCTCCCACCTTCCACCTCCAGCCTATACTCAAAGTCTATAA 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 179753 GCTATTTTCTCTCCCACCTTCCACCTCCAGCCTATACTCAAAGTCTATAA 179802 AL807812.6 151 TTCACAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 179803 TTCACAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC 179852 AL807812.6 201 CCCTCTTAAGTTTTCTCTGCCCTGGGAATCCAATTCCTACTGATAGTATC 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 179853 CCCTCTTAAGTTTTCTCTGCCCTGGGAATCCAATTCCTACTGATAGTATC 179902 AL807812.6 251 AGTGGAATTTGCTAGAGTTCAGCTAATGTGAGGTCAGATTATAGAAGGGA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 179903 AGTGGAATTTGCTAGAGTTCAGCTAATGTGAGGTCAGATTATAGAAGGGA 179952 AL807812.6 301 GAGTTTGGAGTATTCCTTGATTCTTATCCTACTTTTCCATACTACAGAGC 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 179953 GAGTTTGGAGTATTCCTTGATTCTTATCCTACTTTTCCATACTACAGAGC 180002 AL807812.6 351 TGTTAATAGCCACAGTCCTCCCCAAACCACCTTACTGTATCCCTTCCTTC 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 180003 TGTTAATAGCCACAGTCCTCCCCAAACCACCTTACTGTATCCCTTCCTTC 180052 AL807812.6 401 ACAGTGCTAGTAATGGAAGGGATTTGGGGGAAATCTCTTCCCATTGTTCC 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 180053 ACAGTGCTAGTAATGGAAGGGATTTGGGGGAAATCTCTTCCCATTGTTCC 180102 AL807812.6 451 CCTGTTCCTTCCTAGAGGTCAGAGAGCTCTATTAGCTCTCTATCCATCCC 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 180103 CCTGTTCCTTCCTAGAGGTCAGAGAGCTCTATTAGCTCTCTATCCATCCC 180152 AL807812.6 501 TAGTAGTTCCTTTATCTCTGCCCACACTCTACAGCTAGTCTCCTTTGCTG 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 180153 TAGTAGTTCCTTTATCTCTGCCCACACTCTACAGCTAGTCTCCTTTGCTG 180202 AL807812.6 551 CATTGTCCTCATGCTTATATCTGCATATTCTTTCTGCATTCCATTGGGAC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 180203 CATTGTCCTCATGCTTATATCTGCATATTCTTTCTGCATTCCATTGGGAC 180252 AL807812.6 601 CATGAATACAGCAGAGGTTTAATAATAATAGGTATTTCCAGTACTGTCAA 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 180253 CATGAATACAGCAGAGGTTTAATAATAATAGGTATTTCCAGTACTGTCAA 180302 AL807812.6 651 TTGAAGCCTAAGCAAATGATATGGGTAGGAGCACCTGGAACCAGGAACCA 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 180303 TTGAAGCCTAAGCAAATGATATGGGTAGGAGCACCTGGAACCAGGAACCA 180352 AL807812.6 701 GGATTAAAACATGAGAGCTCAATGAACATCAGCCATTGTCACCCTACCCT 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 180353 GGATTAAAACATGAGAGCTCAATGAACATCAGCCATTGTCACCCTACCCT 180402 AL807812.6 751 ACTCCCATTCTCTAGCCTCAGTTTTCTGGCATTCTTTCCATCCTCAGCCT 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 180403 ACTCCCATTCTCTAGCCTCAGTTTTCTGGCATTCTTTCCATCCTCAGCCT 180452 AL807812.6 801 AGAAAATGTCCACATATCCCTTACTTAGCCCAATTCCTGCTCTCATTACC 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 180453 AGAAAATGTCCACATATCCCTTACTTAGCCCAATTCCTGCTCTCATTACC 180502 AL807812.6 851 ACCCAAGCTCAGCTTCTAGGACCCAGGCTTCTGACTTTTTGATCATAGAG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 180503 ACCCAAGCTCAGCTTCTAGGACCCAGGCTTCTGACTTTTTGATCATAGAG 180552 AL807812.6 901 AATCAGGGAAAAAAATAAAATATTATTAGAAACAGTTAATTCATACTATT 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 180553 AATCAGGGAAAAAAATAAAATATTATTAGAAACAGTTAATTCATACTATT 180602 AL807812.6 951 AAACAAAACCAATCTAAAGAAATTACTCCCATACAATTGCAAATACATTG 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 180603 AAACAAAACCAATCTAAAGAAATTACTCCCATACAATTGCAAATACATTG 180652 AL807812.6 1001 AGTGACCATATCATTAACTCTCATTCATGAATTATAGCTTTAGCATATGT 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 180653 AGTGACCATATCATTAACTCTCATTCATGAATTATAGCTTTAGCATATGT 180702 AL807812.6 1051 GTTCAGTGGGATAATTAGTGGAGAAATAGATGGAAAACTAATTGTTAACC 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 180703 GTTCAGTGGGATAATTAGTGGAGAAATAGATGGAAAACTAATTGTTAACC 180752 AL807812.6 1101 TCTTAACAGGAGATGCATACTCAATAAATCATAAGGGAAGAAACAGACAA 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 180753 TCTTAACAGGAGATGCATACTCAATAAATCATAAGGGAAGAAACAGACAA 180802 AL807812.6 1151 AGATAATAACATGGGCTAGCCAAGGGGATGAATTTCAGCTTGTCTGATTA 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 180803 AGATAATAACATGGGCTAGCCAAGGGGATGAATTTCAGCTTGTCTGATTA 180852 AL807812.6 1201 ATTGAGGAGGCTCACAAAATGCCAACAGAATTCACTTTTTGTAATAGTGA 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 180853 ATTGAGGAGGCTCACAAAATGCCAACAGAATTCACTTTTTGTAATAGTGA 180902 AL807812.6 1251 CTACATGTTTTCTGTTTTTTTGTTTTGTTTTTTTGTTTTTATTTTTGTTT 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 180903 CTACATGTTTTCTGTTTTTTTGTTTTGTTTTTTTGTTTTTATTTTTGTTT 180952 AL807812.6 1301 TTTTGAGAAATTGATAATTAAATATAAACTCCCATTTGAGAATGTAAAGT 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 180953 TTTTGAGAAATTGATAATTAAATATAAACTCCCATTTGAGAATGTAAAGT 181002 AL807812.6 1351 CTGTCTTTAAGAGTTATTATGTGGTAGAGGATAGGGCAATCAGTGAAGTG 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 181003 CTGTCTTTAAGAGTTATTATGTGGTAGAGGATAGGGCAATCAGTGAAGTG 181052 AL807812.6 1401 TTTACCTAATAAATATGATAACCTGAGTTTGAATCTAGGAAATCACATTT 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 181053 TTTACCTAATAAATATGATAACCTGAGTTTGAATCTAGGAAATCACATTT 181102 AL807812.6 1451 TAGAAGGTCAGGTATGATGTTGTGTGCTTGTAATCCCACTGTTGGAAAGG 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 181103 TAGAAGGTCAGGTATGATGTTGTGTGCTTGTAATCCCACTGTTGGAAAGG 181152 AL807812.6 1501 CAGGACAAGTGGGTCCCTTGGGTTATCCAGCCTAGTCTACTAGGAGAATT 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 181153 CAGGACAAGTGGGTCCCTTGGGTTATCCAGCCTAGTCTACTAGGAGAATT 181202 AL807812.6 1551 CTAGGCCAGTAAGAGATGCTGCTTTGTTGTTGTTGTGTTTGTCTGTTGTT 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 181203 CTAGGCCAGTAAGAGATGCTGCTTTGTTGTTGTTGTGTTTGTCTGTTGTT 181252 AL807812.6 1601 TTGTTTTTAAAGTGGACCAGTGTTTTTAGCACTAGAATATCATTATCTAG 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 181253 TTGTTTTTAAAGTGGACCAGTGTTTTTAGCACTAGAATATCATTATCTAG 181302 AL807812.6 1651 TTCTGGTGGGCAGCCAAGAGGAAGGTAAGGTTTCAAGAGATAGAGAAAGC 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 181303 TTCTGGTGGGCAGCCAAGAGGAAGGTAAGGTTTCAAGAGATAGAGAAAGC 181352 AL807812.6 1701 AAGCTGGAATTGAGCTGGCAGCTTCCTCCAGGCTGGCCAGCTTTCCTAGT 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 181353 AAGCTGGAATTGAGCTGGCAGCTTCCTCCAGGCTGGCCAGCTTTCCTAGT 181402 AL807812.6 1751 GTGAAAGGGGCTATGTAAGCTATAGTGGGGAGATAAGACATCAGTGATTT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 181403 GTGAAAGGGGCTATGTAAGCTATAGTGGGGAGATAAGACATCAGTGATTT 181452 AL807812.6 1801 CTACCCAGCTGTAAAACTCTAGGAACCACAATGCCAACCTGCCAGGCAAA 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 181453 CTACCCAGCTGTAAAACTCTAGGAACCACAATGCCAACCTGCCAGGCAAA 181502 AL807812.6 1851 ATGTACTACCCACTTAGGCAATAGTGGTACAACTATGGGGCAATCAAATA 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 181503 ATGTACTACCCACTTAGGCAATAGTGGTACAACTATGGGGCAATCAAATA 181552 AL807812.6 1901 TCCTTGGGTGGGATTAGAGATCCACTCTGTAGAAGGAATTCTACTATTGT 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 181553 TCCTTGGGTGGGATTAGAGATCCACTCTGTAGAAGGAATTCTACTATTGT 181602 AL807812.6 1951 AAACCTTGTTTAAAAGGTGGGATTAGAGATACACTCTGTAGAAGGAATTC 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL645584.28 181603 AAACCTTGTTTAAAAGGTGGGATTAGAGATACACTCTGTAGAAGGAATTC 181652