<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL807812.6	1	CATGATTCCAGGGCCTGTACTTCTAGCTGTGTGACCTTGAGAAAGTATTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	179653	CATGATTCCAGGGCCTGTACTTCTAGCTGTGTGACCTTGAGAAAGTATTT	179702

AL807812.6	51	GATTTCTTTTAGCCTTCGTGTCTTCATCTGTAAAGTAGAATGCACTGTTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	179703	GATTTCTTTTAGCCTTCGTGTCTTCATCTGTAAAGTAGAATGCACTGTTG	179752

AL807812.6	101	GCTATTTTCTCTCCCACCTTCCACCTCCAGCCTATACTCAAAGTCTATAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	179753	GCTATTTTCTCTCCCACCTTCCACCTCCAGCCTATACTCAAAGTCTATAA	179802

AL807812.6	151	TTCACAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	179803	TTCACAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC	179852

AL807812.6	201	CCCTCTTAAGTTTTCTCTGCCCTGGGAATCCAATTCCTACTGATAGTATC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	179853	CCCTCTTAAGTTTTCTCTGCCCTGGGAATCCAATTCCTACTGATAGTATC	179902

AL807812.6	251	AGTGGAATTTGCTAGAGTTCAGCTAATGTGAGGTCAGATTATAGAAGGGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	179903	AGTGGAATTTGCTAGAGTTCAGCTAATGTGAGGTCAGATTATAGAAGGGA	179952

AL807812.6	301	GAGTTTGGAGTATTCCTTGATTCTTATCCTACTTTTCCATACTACAGAGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	179953	GAGTTTGGAGTATTCCTTGATTCTTATCCTACTTTTCCATACTACAGAGC	180002

AL807812.6	351	TGTTAATAGCCACAGTCCTCCCCAAACCACCTTACTGTATCCCTTCCTTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	180003	TGTTAATAGCCACAGTCCTCCCCAAACCACCTTACTGTATCCCTTCCTTC	180052

AL807812.6	401	ACAGTGCTAGTAATGGAAGGGATTTGGGGGAAATCTCTTCCCATTGTTCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	180053	ACAGTGCTAGTAATGGAAGGGATTTGGGGGAAATCTCTTCCCATTGTTCC	180102

AL807812.6	451	CCTGTTCCTTCCTAGAGGTCAGAGAGCTCTATTAGCTCTCTATCCATCCC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	180103	CCTGTTCCTTCCTAGAGGTCAGAGAGCTCTATTAGCTCTCTATCCATCCC	180152

AL807812.6	501	TAGTAGTTCCTTTATCTCTGCCCACACTCTACAGCTAGTCTCCTTTGCTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	180153	TAGTAGTTCCTTTATCTCTGCCCACACTCTACAGCTAGTCTCCTTTGCTG	180202

AL807812.6	551	CATTGTCCTCATGCTTATATCTGCATATTCTTTCTGCATTCCATTGGGAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	180203	CATTGTCCTCATGCTTATATCTGCATATTCTTTCTGCATTCCATTGGGAC	180252

AL807812.6	601	CATGAATACAGCAGAGGTTTAATAATAATAGGTATTTCCAGTACTGTCAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	180253	CATGAATACAGCAGAGGTTTAATAATAATAGGTATTTCCAGTACTGTCAA	180302

AL807812.6	651	TTGAAGCCTAAGCAAATGATATGGGTAGGAGCACCTGGAACCAGGAACCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	180303	TTGAAGCCTAAGCAAATGATATGGGTAGGAGCACCTGGAACCAGGAACCA	180352

AL807812.6	701	GGATTAAAACATGAGAGCTCAATGAACATCAGCCATTGTCACCCTACCCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	180353	GGATTAAAACATGAGAGCTCAATGAACATCAGCCATTGTCACCCTACCCT	180402

AL807812.6	751	ACTCCCATTCTCTAGCCTCAGTTTTCTGGCATTCTTTCCATCCTCAGCCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	180403	ACTCCCATTCTCTAGCCTCAGTTTTCTGGCATTCTTTCCATCCTCAGCCT	180452

AL807812.6	801	AGAAAATGTCCACATATCCCTTACTTAGCCCAATTCCTGCTCTCATTACC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	180453	AGAAAATGTCCACATATCCCTTACTTAGCCCAATTCCTGCTCTCATTACC	180502

AL807812.6	851	ACCCAAGCTCAGCTTCTAGGACCCAGGCTTCTGACTTTTTGATCATAGAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	180503	ACCCAAGCTCAGCTTCTAGGACCCAGGCTTCTGACTTTTTGATCATAGAG	180552

AL807812.6	901	AATCAGGGAAAAAAATAAAATATTATTAGAAACAGTTAATTCATACTATT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	180553	AATCAGGGAAAAAAATAAAATATTATTAGAAACAGTTAATTCATACTATT	180602

AL807812.6	951	AAACAAAACCAATCTAAAGAAATTACTCCCATACAATTGCAAATACATTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	180603	AAACAAAACCAATCTAAAGAAATTACTCCCATACAATTGCAAATACATTG	180652

AL807812.6	1001	AGTGACCATATCATTAACTCTCATTCATGAATTATAGCTTTAGCATATGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	180653	AGTGACCATATCATTAACTCTCATTCATGAATTATAGCTTTAGCATATGT	180702

AL807812.6	1051	GTTCAGTGGGATAATTAGTGGAGAAATAGATGGAAAACTAATTGTTAACC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	180703	GTTCAGTGGGATAATTAGTGGAGAAATAGATGGAAAACTAATTGTTAACC	180752

AL807812.6	1101	TCTTAACAGGAGATGCATACTCAATAAATCATAAGGGAAGAAACAGACAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	180753	TCTTAACAGGAGATGCATACTCAATAAATCATAAGGGAAGAAACAGACAA	180802

AL807812.6	1151	AGATAATAACATGGGCTAGCCAAGGGGATGAATTTCAGCTTGTCTGATTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	180803	AGATAATAACATGGGCTAGCCAAGGGGATGAATTTCAGCTTGTCTGATTA	180852

AL807812.6	1201	ATTGAGGAGGCTCACAAAATGCCAACAGAATTCACTTTTTGTAATAGTGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	180853	ATTGAGGAGGCTCACAAAATGCCAACAGAATTCACTTTTTGTAATAGTGA	180902

AL807812.6	1251	CTACATGTTTTCTGTTTTTTTGTTTTGTTTTTTTGTTTTTATTTTTGTTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	180903	CTACATGTTTTCTGTTTTTTTGTTTTGTTTTTTTGTTTTTATTTTTGTTT	180952

AL807812.6	1301	TTTTGAGAAATTGATAATTAAATATAAACTCCCATTTGAGAATGTAAAGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	180953	TTTTGAGAAATTGATAATTAAATATAAACTCCCATTTGAGAATGTAAAGT	181002

AL807812.6	1351	CTGTCTTTAAGAGTTATTATGTGGTAGAGGATAGGGCAATCAGTGAAGTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	181003	CTGTCTTTAAGAGTTATTATGTGGTAGAGGATAGGGCAATCAGTGAAGTG	181052

AL807812.6	1401	TTTACCTAATAAATATGATAACCTGAGTTTGAATCTAGGAAATCACATTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	181053	TTTACCTAATAAATATGATAACCTGAGTTTGAATCTAGGAAATCACATTT	181102

AL807812.6	1451	TAGAAGGTCAGGTATGATGTTGTGTGCTTGTAATCCCACTGTTGGAAAGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	181103	TAGAAGGTCAGGTATGATGTTGTGTGCTTGTAATCCCACTGTTGGAAAGG	181152

AL807812.6	1501	CAGGACAAGTGGGTCCCTTGGGTTATCCAGCCTAGTCTACTAGGAGAATT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	181153	CAGGACAAGTGGGTCCCTTGGGTTATCCAGCCTAGTCTACTAGGAGAATT	181202

AL807812.6	1551	CTAGGCCAGTAAGAGATGCTGCTTTGTTGTTGTTGTGTTTGTCTGTTGTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	181203	CTAGGCCAGTAAGAGATGCTGCTTTGTTGTTGTTGTGTTTGTCTGTTGTT	181252

AL807812.6	1601	TTGTTTTTAAAGTGGACCAGTGTTTTTAGCACTAGAATATCATTATCTAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	181253	TTGTTTTTAAAGTGGACCAGTGTTTTTAGCACTAGAATATCATTATCTAG	181302

AL807812.6	1651	TTCTGGTGGGCAGCCAAGAGGAAGGTAAGGTTTCAAGAGATAGAGAAAGC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	181303	TTCTGGTGGGCAGCCAAGAGGAAGGTAAGGTTTCAAGAGATAGAGAAAGC	181352

AL807812.6	1701	AAGCTGGAATTGAGCTGGCAGCTTCCTCCAGGCTGGCCAGCTTTCCTAGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	181353	AAGCTGGAATTGAGCTGGCAGCTTCCTCCAGGCTGGCCAGCTTTCCTAGT	181402

AL807812.6	1751	GTGAAAGGGGCTATGTAAGCTATAGTGGGGAGATAAGACATCAGTGATTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	181403	GTGAAAGGGGCTATGTAAGCTATAGTGGGGAGATAAGACATCAGTGATTT	181452

AL807812.6	1801	CTACCCAGCTGTAAAACTCTAGGAACCACAATGCCAACCTGCCAGGCAAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	181453	CTACCCAGCTGTAAAACTCTAGGAACCACAATGCCAACCTGCCAGGCAAA	181502

AL807812.6	1851	ATGTACTACCCACTTAGGCAATAGTGGTACAACTATGGGGCAATCAAATA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	181503	ATGTACTACCCACTTAGGCAATAGTGGTACAACTATGGGGCAATCAAATA	181552

AL807812.6	1901	TCCTTGGGTGGGATTAGAGATCCACTCTGTAGAAGGAATTCTACTATTGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	181553	TCCTTGGGTGGGATTAGAGATCCACTCTGTAGAAGGAATTCTACTATTGT	181602

AL807812.6	1951	AAACCTTGTTTAAAAGGTGGGATTAGAGATACACTCTGTAGAAGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645584.28	181603	AAACCTTGTTTAAAAGGTGGGATTAGAGATACACTCTGTAGAAGGAATTC	181652

Overview

Query
AL807812.6 - 27551 bps
Hit
AL645584.28 - 181652 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link