<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645667.14	1	GAATTCCCAGAGAGGCACCTATCCTTGCTGTGTGTGAACTTCCCTGGGGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	120518	GAATTCCCAGAGAGGCACCTATCCTTGCTGTGTGTGAACTTCCCTGGGGG	120567

AL645667.14	51	CCAAGAGGTTGCAAAGGGCTATTCACCAAAGCTGTCCAACAGCTTACCAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	120568	CCAAGAGGTTGCAAAGGGCTATTCACCAAAGCTGTCCAACAGCTTACCAC	120617

AL645667.14	101	CCTTCTACCTGAGAAGAAATGGAAATATCTCAACAGTCACTGAAGGAGTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	120618	CCTTCTACCTGAGAAGAAATGGAAATATCTCAACAGTCACTGAAGGAGTC	120667

AL645667.14	151	CCAGTGTCTGACAGGGGAGCCAAACACACAGTTCTCTAGTTAAAAGTTGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	120668	CCAGTGTCTGACAGGGGAGCCAAACACACAGTTCTCTAGTTAAAAGTTGA	120717

AL645667.14	201	AACTCTCAAAAAACAGAGGGGTGAAGTATGCAACAGCCCTTTTTGTGGGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	120718	AACTCTCAAAAAACAGAGGGGTGAAGTATGCAACAGCCCTTTTTGTGGGT	120767

AL645667.14	251	TGGGAGATATTCATGGATTTTTAAAACATCTAAATATGGTCCAGCTTATG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	120768	TGGGAGATATTCATGGATTTTTAAAACATCTAAATATGGTCCAGCTTATG	120817

AL645667.14	301	GCATCCTTGTGGAGAAGGGCTGTTTCTTCAGAGACCTCAAGAGTGTACAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	120818	GCATCCTTGTGGAGAAGGGCTGTTTCTTCAGAGACCTCAAGAGTGTACAC	120867

AL645667.14	351	AGAGTTTGCAATCTTTGTCACTAGTTAGTAATGGACAAGAATGAGGGGTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	120868	AGAGTTTGCAATCTTTGTCACTAGTTAGTAATGGACAAGAATGAGGGGTC	120917

AL645667.14	401	AGTGTGTCACCTGACACATTTCATTCCAGAATGTTTATTTCCTGTATTTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	120918	AGTGTGTCACCTGACACATTTCATTCCAGAATGTTTATTTCCTGTATTTT	120967

AL645667.14	451	TCTTGCATTTTAAAAATAAAAGACATATACCACAAACTTTTTGTGTATAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	120968	TCTTGCATTTTAAAAATAAAAGACATATACCACAAACTTTTTGTGTATAT	121017

AL645667.14	501	AGTTTTGATATACACTGACATTGCACAGAAAACCTTTGTATGAGAGGAAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	121018	AGTTTTGATATACACTGACATTGCACAGAAAACCTTTGTATGAGAGGAAT	121067

AL645667.14	551	TAAAGAGACTAGCACAACAAAATGATACATTCTTGACATAGGTGTGGAGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	121068	TAAAGAGACTAGCACAACAAAATGATACATTCTTGACATAGGTGTGGAGA	121117

AL645667.14	601	ACATGAACAGGATAAAAATATGAGCACCAAAACGCAGACACTAATGTATA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	121118	ACATGAACAGGATAAAAATATGAGCACCAAAACGCAGACACTAATGTATA	121167

AL645667.14	651	TGCGAGCAAGATTTTGCTGACAGGTCCCAGATATAGATGTCTTTTGTGAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	121168	TGCGAGCAAGATTTTGCTGACAGGTCCCAGATATAGATGTCTTTTGTGAG	121217

AL645667.14	701	GCTATGCCAGTGCCTGGCAAATACAGAAGTGGATGCTCACAGTCATCTAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	121218	GCTATGCCAGTGCCTGGCAAATACAGAAGTGGATGCTCACAGTCATCTAT	121267

AL645667.14	751	TGGATGGAACACAGAGCCCCCAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	121268	TGGATGGAACACAGAGCCCCCAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAGG	121317

AL645667.14	801	AGCTGAAGGGGTCTGCAACCCTATAGGAAGAACAACAATATGAACTAATC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	121318	AGCTGAAGGGGTCTGCAACCCTATAGGAAGAACAACAATATGAACTAATC	121367

AL645667.14	851	AGTACCCCCAGAGCTCATGTCTCTAGCTGTATATGTAGCAGAAGATGGCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	121368	AGTACCCCCAGAGCTCATGTCTCTAGCTGTATATGTAGCAGAAGATGGCC	121417

AL645667.14	901	TAGTTGGCCATCATTGGGAGGAGAGGCCCCTTGGTCTTACAAAGATTATA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	121418	TAGTTGGCCATCATTGGGAGGAGAGGCCCCTTGGTCTTACAAAGATTATA	121467

AL645667.14	951	TGCCCCAGTACAGGGGAATGCCAGGGCCAGGAAGCAGGAGTGGGTGGGTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	121468	TGCCCCAGTACAGGGGAATGCCAGGGCCAGGAAGCAGGAGTGGGTGGGTT	121517

AL645667.14	1001	GGTGAGCAGGGCAGGGGGAGTGTATAGGGGGACTTTCGGGATAGCATTTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	121518	GGTGAGCAGGGCAGGGGGAGTGTATAGGGGGACTTTCGGGATAGCATTTG	121567

AL645667.14	1051	AAATGTAAATGAAGAAAATATCCAATAAAAAATTGTTTAGAAAATATGAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	121568	AAATGTAAATGAAGAAAATATCCAATAAAAAATTGTTTAGAAAATATGAG	121617

AL645667.14	1101	TACCGGGTGAAGGAATTGTTATGAAACAAATAAATTCACAGAACTAATTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	121618	TACCGGGTGAAGGAATTGTTATGAAACAAATAAATTCACAGAACTAATTC	121667

AL645667.14	1151	TTGTGGGAACTTGGGATTCTATTCAGCCATGCTTTTATTCAATATGGATG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	121668	TTGTGGGAACTTGGGATTCTATTCAGCCATGCTTTTATTCAATATGGATG	121717

AL645667.14	1201	GGAATGATAATGATTCTTGCTAGTGTGGCTGGAGATATGGTTTAGCAATT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	121718	GGAATGATAATGATTCTTGCTAGTGTGGCTGGAGATATGGTTTAGCAATT	121767

AL645667.14	1251	ACGTGTAGGATCCTGAAAGGCAGCCTGGTTCCTGGTTTAGTACAGACTGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	121768	ACGTGTAGGATCCTGAAAGGCAGCCTGGTTCCTGGTTTAGTACAGACTGG	121817

AL645667.14	1301	TGACCCCGAGAGATGGTAGGCGTTTCGCCTGGTTCCTGGACACTAAGCTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	121818	TGACCCCGAGAGATGGTAGGCGTTTCGCCTGGTTCCTGGACACTAAGCTC	121867

AL645667.14	1351	CTGGCACGAGGCTGCAGCCCTCCATAGATTTGTGGCTATGAGTCATGAAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	121868	CTGGCACGAGGCTGCAGCCCTCCATAGATTTGTGGCTATGAGTCATGAAA	121917

AL645667.14	1401	GGTCAATGCCCCAAGTCCTTGCACAGGTAGAGGACATAACATGTGGTCAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	121918	GGTCAATGCCCCAAGTCCTTGCACAGGTAGAGGACATAACATGTGGTCAT	121967

AL645667.14	1451	GTAGCCTCAAGAAGGATCTCCATTCTAATGAGGTACCTAATAAGCCTGGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	121968	GTAGCCTCAAGAAGGATCTCCATTCTAATGAGGTACCTAATAAGCCTGGG	122017

AL645667.14	1501	GACTTAGCCAGTTAAGCTTTCCTTCCCAGACAGCCCTCCCTGTAAAAGGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	122018	GACTTAGCCAGTTAAGCTTTCCTTCCCAGACAGCCCTCCCTGTAAAAGGT	122067

AL645667.14	1551	ATTCAATCTCAAGTTCACCCTGAGAACTGGGGTACAGTTGTACTCATTCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	122068	ATTCAATCTCAAGTTCACCCTGAGAACTGGGGTACAGTTGTACTCATTCA	122117

AL645667.14	1601	TTTTACGCCATGACAATAAATGTCTTAAAACTTGGGGTCCGCCATGGGGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	122118	TTTTACGCCATGACAATAAATGTCTTAAAACTTGGGGTCCGCCATGGGGA	122167

AL645667.14	1651	CCAATAGAGAAGGCCTTCACCTAAAGAGCCACAGAAGACTGCTTTGTGCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	122168	CCAATAGAGAAGGCCTTCACCTAAAGAGCCACAGAAGACTGCTTTGTGCC	122217

AL645667.14	1701	GCCAGCCATGACCACCAAGCCAAGCCAGCCACCGACCAAGCTAAGCACTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	122218	GCCAGCCATGACCACCAAGCCAAGCCAGCCACCGACCAAGCTAAGCACTA	122267

AL645667.14	1751	CTCCCCATGGGACCCAGCTGGAGTGTTCCACTTTTCTCCTGGCCCTGGGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	122268	CTCCCCATGGGACCCAGCTGGAGTGTTCCACTTTTCTCCTGGCCCTGGGC	122317

AL645667.14	1801	TAGATCCAGTCAGCGGGCCCACACTCCATTCTCAGCTCTTCCGCTGCTCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	122318	TAGATCCAGTCAGCGGGCCCACACTCCATTCTCAGCTCTTCCGCTGCTCC	122367

AL645667.14	1851	CAGTGGTGCCTTGTTGCCCAAAAGTCTGAGAACCAGAAGGCCCTGGCCTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	122368	CAGTGGTGCCTTGTTGCCCAAAAGTCTGAGAACCAGAAGGCCCTGGCCTC	122417

AL645667.14	1901	CCTGTAGTCTCGATCGGGGAACCCCAGCCAGCTATGACTGTCCTCAGGAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	122418	CCTGTAGTCTCGATCGGGGAACCCCAGCCAGCTATGACTGTCCTCAGGAG	122467

AL645667.14	1951	CTCAGACTGAGGTCCTCCACCATGGGAGTGGTGTCCTGCGGTGTCCCATA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645546.5	122468	CTCAGACTGAGGTCCTCCACCATGGGAGTGGTGTCCTGCGGTGTCCCATA	122517

Overview

Query
AL645667.14 - 179902 bps
Hit
AL645546.5 - 122517 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link