<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645938.9	1	GGCTAATTATCAGAGAAGAGTGTGTGTATTTCAGCCAGTCATGACCCTTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	214047	GGCTAATTATCAGAGAAGAGTGTGTGTATTTCAGCCAGTCATGACCCTTT	214096

AL645938.9	51	CCTGGGTAACTATAGAAACCTTAGCAGCACTAGTTATTAAAAACGTTACA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	214097	CCTGGGTAACTATAGAAACCTTAGCAGCACTAGTTATTAAAAACGTTACA	214146

AL645938.9	101	CAGTTTGTTTTTTAAAGCATTTTAGTCTTTGATAGTTATGGGGAAATAAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	214147	CAGTTTGTTTTTTAAAGCATTTTAGTCTTTGATAGTTATGGGGAAATAAT	214196

AL645938.9	151	TGGTTATCATCTAGAAAGAATGGGAAGCTAGTACAAAACTAAGATTTTTA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	214197	TGGTTATCATCTAGAAAGAATGGGAAGCTAGTACAAAACTAAGATTTTTA	214246

AL645938.9	201	AATAATTTATGCATAGTAAAAATGTGTTCTGAATAATTTATAAATAACAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	214247	AATAATTTATGCATAGTAAAAATGTGTTCTGAATAATTTATAAATAACAG	214296

AL645938.9	251	AAATGTGTTCTATAAAATATTTCTGACTGCTACTAAAATGAACCCTTGCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	214297	AAATGTGTTCTATAAAATATTTCTGACTGCTACTAAAATGAACCCTTGCC	214346

AL645938.9	301	CCAGACCTCTAGCTTCATACATTACTGGGCTCTCCCACAATCTCATTCCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	214347	CCAGACCTCTAGCTTCATACATTACTGGGCTCTCCCACAATCTCATTCCA	214396

AL645938.9	351	CCCAAATATGGAAAATTCTTCTAATACAAGCCTGGAGAGACTCCTAATAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	214397	CCCAAATATGGAAAATTCTTCTAATACAAGCCTGGAGAGACTCCTAATAA	214446

AL645938.9	401	TCCATTTGGCACAGTGATATCAGAGTGGGGAATTTGCCCCTCTGGATACG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	214447	TCCATTTGGCACAGTGATATCAGAGTGGGGAATTTGCCCCTCTGGATACG	214496

AL645938.9	451	AAACAGCAGAGTGCCAGGTTTGTGCACACTGGTAGACACATACAGACAGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	214497	AAACAGCAGAGTGCCAGGTTTGTGCACACTGGTAGACACATACAGACAGT	214546

AL645938.9	501	GTTGACAGTGCAAGGTGCCATTGATGCATTCTCCAAGCCATGGCTCTATA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	214547	GTTGACAGTGCAAGGTGCCATTGATGCATTCTCCAAGCCATGGCTCTATA	214596

AL645938.9	551	AAGAGGGGATTAGGAGAGCATCTTTTTTTTTTTCTTCCTATGCTGAGCAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	214597	AAGAGGGGATTAGGAGAGCATCTTTTTTTTTTTCTTCCTATGCTGAGCAA	214646

AL645938.9	601	TCCATCTGAGTCAGAAGGAGGGATGATCTTTCATTGTACTTTTTAATGCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	214647	TCCATCTGAGTCAGAAGGAGGGATGATCTTTCATTGTACTTTTTAATGCA	214696

AL645938.9	651	AAGCTGTGCAAGGATTGCAACCGGAATGACAGTGCCCATCAATGTGGAAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	214697	AAGCTGTGCAAGGATTGCAACCGGAATGACAGTGCCCATCAATGTGGAAA	214746

AL645938.9	701	TGAAAATTGGCTGCGTTTTTCAGGATGCTCCATATCCTACGTCACTCAGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	214747	TGAAAATTGGCTGCGTTTTTCAGGATGCTCCATATCCTACGTCACTCAGG	214796

AL645938.9	751	AAGCAGGTGACATCCCCTTTGGAGGAGGCAGTGCTTCAAGTGAGCTTTCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	214797	AAGCAGGTGACATCCCCTTTGGAGGAGGCAGTGCTTCAAGTGAGCTTTCT	214846

AL645938.9	801	GCATTCATTGGCAGAGGCGGTGTTAATGGTATGTAACTGTAGTGATTTTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	214847	GCATTCATTGGCAGAGGCGGTGTTAATGGTATGTAACTGTAGTGATTTTT	214896

AL645938.9	851	TTTTCTGTTACGTGTGACCAGTTTATTTATAGATCACAATCCTCATGGAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	214897	TTTTCTGTTACGTGTGACCAGTTTATTTATAGATCACAATCCTCATGGAT	214946

AL645938.9	901	CTTTTTCTCTTCTCCTCATTTTCTTTGAAGAAGAATATGGTGACTAGAAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	214947	CTTTTTCTCTTCTCCTCATTTTCTTTGAAGAAGAATATGGTGACTAGAAT	214996

AL645938.9	951	TTGAGTCTTCTACTAATTTAATGCCTAACTCTTAGAAATTTATTCTAGTA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	214997	TTGAGTCTTCTACTAATTTAATGCCTAACTCTTAGAAATTTATTCTAGTA	215046

AL645938.9	1001	GATTGAATGATATTAAACCAAATGTAAATAATGTACAAATGCAAATACTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	215047	GATTGAATGATATTAAACCAAATGTAAATAATGTACAAATGCAAATACTT	215096

AL645938.9	1051	TAAGCAGAATCATCATAATGCATAATGTAAATTTAAGGTCCAATTTCACT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	215097	TAAGCAGAATCATCATAATGCATAATGTAAATTTAAGGTCCAATTTCACT	215146

AL645938.9	1101	CTATTTTAAAATATTGCAATAATATAGCATTGTAATCATCTATACTTAAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	215147	CTATTTTAAAATATTGCAATAATATAGCATTGTAATCATCTATACTTAAT	215196

AL645938.9	1151	TTTTTCTTATCTTTTATCATATACAAGGTTAGTTCTTAAGGTATGTTTAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	215197	TTTTTCTTATCTTTTATCATATACAAGGTTAGTTCTTAAGGTATGTTTAT	215246

AL645938.9	1201	TTCCATAATTGATTACATCATAGAATGAAGTGAATTTTAATGTCATTTAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	215247	TTCCATAATTGATTACATCATAGAATGAAGTGAATTTTAATGTCATTTAC	215296

AL645938.9	1251	TTTTCTGATCAAAACATAAAGTTTTTAGCCATAGGGACTTTGGTTGCAAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	215297	TTTTCTGATCAAAACATAAAGTTTTTAGCCATAGGGACTTTGGTTGCAAG	215346

AL645938.9	1301	CCTAGTCAATATAAAACAATGCAGATAATCACTTTTCATTGCTGATCCTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	215347	CCTAGTCAATATAAAACAATGCAGATAATCACTTTTCATTGCTGATCCTT	215396

AL645938.9	1351	CTACTAAAGTTAAATTCAAACTAACATTTGACCCAAATACAAGTAGTTCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	215397	CTACTAAAGTTAAATTCAAACTAACATTTGACCCAAATACAAGTAGTTCC	215446

AL645938.9	1401	AGTAATTAGTGAATTCTTGATGTGAAGCACAGATGTTTTAATAAAGTTTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	215447	AGTAATTAGTGAATTCTTGATGTGAAGCACAGATGTTTTAATAAAGTTTT	215496

AL645938.9	1451	TGACCATATACTGAAGTCCAGTAAGATAGTTCAGTTGGTTTGCCTAACTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	215497	TGACCATATACTGAAGTCCAGTAAGATAGTTCAGTTGGTTTGCCTAACTC	215546

AL645938.9	1501	AAGTCTCAGATTTGCTCGTTAGTCATGGAAGTTTAGTCATATTTGTTAGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	215547	AAGTCTCAGATTTGCTCGTTAGTCATGGAAGTTTAGTCATATTTGTTAGT	215596

AL645938.9	1551	CACGGAAGACACTTAATAGACTGCTTGGTTGCTAATATGATGGCATTATG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	215597	CACGGAAGACACTTAATAGACTGCTTGGTTGCTAATATGATGGCATTATG	215646

AL645938.9	1601	AATTACACTACTTAAAATATTTTACTGCATGTTAATAGCTTTTGCAGTTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	215647	AATTACACTACTTAAAATATTTTACTGCATGTTAATAGCTTTTGCAGTTT	215696

AL645938.9	1651	TTTAATAATCAGATTCACTCTTAATACTTATTCCTTTTGAATACTGCAAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	215697	TTTAATAATCAGATTCACTCTTAATACTTATTCCTTTTGAATACTGCAAG	215746

AL645938.9	1701	TTTGCAGGCCAACAATGCTATTGAAAGTTTGCTTGATGCTAAGCAATAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	215747	TTTGCAGGCCAACAATGCTATTGAAAGTTTGCTTGATGCTAAGCAATAAA	215796

AL645938.9	1751	AATTAAATCTCGTACTACAACAGCTAAAGCCACAAATCTTGTGAACTAAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	215797	AATTAAATCTCGTACTACAACAGCTAAAGCCACAAATCTTGTGAACTAAG	215846

AL645938.9	1801	AGGTGTGAGTCTCAGTACGGAGAGTGTAATATCACTGGTTTCCTTACGCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	215847	AGGTGTGAGTCTCAGTACGGAGAGTGTAATATCACTGGTTTCCTTACGCT	215896

AL645938.9	1851	GGAATGCTGCTCAGCCTAATTATCCAAGGATCTTCTGGTTCTCTGGCATG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	215897	GGAATGCTGCTCAGCCTAATTATCCAAGGATCTTCTGGTTCTCTGGCATG	215946

AL645938.9	1901	TTACAGCTGTGCCAGCCCCTTTGTCTCTAACATAGCTCTCTTCTACACTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	215947	TTACAGCTGTGCCAGCCCCTTTGTCTCTAACATAGCTCTCTTCTACACTG	215996

AL645938.9	1951	CGCATGCATGAGAGAATGTTTTCTCATATTAGTAAATCACTTAAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645544.16	215997	CGCATGCATGAGAGAATGTTTTCTCATATTAGTAAATCACTTAAGAATTC	216046

Overview

Query
AL645938.9 - 138851 bps
Hit
AL645544.16 - 216046 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link