<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL669819.13	1	GCCCCCACCAAGGACCAGGAGAGTGACCAGGAGCCCCCACCAAGCACCAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	68681	GCCCCCACCAAGGACCAGGAGAGTGACCAGGAGCCCCCACCAAGCACCAG	68730

AL669819.13	51	GAGAGTGACCAGGAGCCCCCACCAAGGACCAGGAGATGACCAGGAGCCCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	68731	GAGAGTGACCAGGAGCCCCCACCAAGGACCAGGAGATGACCAGGAGCCCC	68780

AL669819.13	101	CACCAAGGACCAGGAGAGTGACCAGGAGCCCCCACCAAGAACAGGAGAGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	68781	CACCAAGGACCAGGAGAGTGACCAGGAGCCCCCACCAAGAACAGGAGAGT	68830

AL669819.13	151	GACCAGGAGCCCCCACCAAGAACAGGAGATTGACCAGGAGCCCCCACCAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	68831	GACCAGGAGCCCCCACCAAGAACAGGAGATTGACCAGGAGCCCCCACCAA	68880

AL669819.13	201	GGACCAGGATAGTGACCAGGAGCCCCCACCAAGGACCAGGAGAGTGACCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	68881	GGACCAGGATAGTGACCAGGAGCCCCCACCAAGGACCAGGAGAGTGACCA	68930

AL669819.13	251	GGAGCCCCCACCAAGGACCAGGAGAGTGACCAGGAGCCCCCACCAAGGAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	68931	GGAGCCCCCACCAAGGACCAGGAGAGTGACCAGGAGCCCCCACCAAGGAC	68980

AL669819.13	301	CAGGAGAGTGACCAGGAGCCCCCACCAAGGACCAGGAGAGTGACCAGGAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	68981	CAGGAGAGTGACCAGGAGCCCCCACCAAGGACCAGGAGAGTGACCAGGAG	69030

AL669819.13	351	CCCCCACCAAGCACCAGGAGAGTGACCAGGAGCCCCCACCAAGGACCAGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	69031	CCCCCACCAAGCACCAGGAGAGTGACCAGGAGCCCCCACCAAGGACCAGG	69080

AL669819.13	401	AGAGTGACCAGGAGCCCCCACCAAGGACCAGGAGAGTGACCAGGAGCCCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	69081	AGAGTGACCAGGAGCCCCCACCAAGGACCAGGAGAGTGACCAGGAGCCCC	69130

AL669819.13	451	CACCAAGGACCAGGAGAGTGACCAGGAGCCCCCACCAAGGACCAGGAGAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	69131	CACCAAGGACCAGGAGAGTGACCAGGAGCCCCCACCAAGGACCAGGAGAG	69180

AL669819.13	501	TGACCAGGAGCCCCCAGCAAGAACACGACCAGTAGCCAGAAGCCACCTTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	69181	TGACCAGGAGCCCCCAGCAAGAACACGACCAGTAGCCAGAAGCCACCTTT	69230

AL669819.13	551	CAGGTCAGCCCAGCACAACTCTCATTTCTGGATCAGGGGTGCTTCTCACA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	69231	CAGGTCAGCCCAGCACAACTCTCATTTCTGGATCAGGGGTGCTTCTCACA	69280

AL669819.13	601	CCTCTACTCTGAACCCTGTGCCCACAGTTATCTACATTACTTCACATAAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	69281	CCTCTACTCTGAACCCTGTGCCCACAGTTATCTACATTACTTCACATAAG	69330

AL669819.13	651	GAACTAGAAAGGCCCTCCTGACTGGGATGCTATGATAGTGCCAGGGAAGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	69331	GAACTAGAAAGGCCCTCCTGACTGGGATGCTATGATAGTGCCAGGGAAGT	69380

AL669819.13	701	TTAGAGAAGCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAACTAAAAAAATAAAACAGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	69381	TTAGAGAAGCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAACTAAAAAAATAAAACAGA	69430

AL669819.13	751	CAGGAGCCAATCTGATGCAACTCACAGCAAGGTCTTTATTCTATTTAAGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	69431	CAGGAGCCAATCTGATGCAACTCACAGCAAGGTCTTTATTCTATTTAAGC	69480

AL669819.13	801	TAGTTCGGGTCCCTCAGCTCACCACTGACACACAGGACAGTTTTAGTGGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	69481	TAGTTCGGGTCCCTCAGCTCACCACTGACACACAGGACAGTTTTAGTGGA	69530

AL669819.13	851	GAGAAGAGCCCCAAATGTCTATCAGGACAAGGCTTTATAGTAAGCAGCAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	69531	GAGAAGAGCCCCAAATGTCTATCAGGACAAGGCTTTATAGTAAGCAGCAA	69580

AL669819.13	901	GCAGGGAGTACATGTGCAAGCATCTAATTGAAAATCTACTGTGGCCTTTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	69581	GCAGGGAGTACATGTGCAAGCATCTAATTGAAAATCTACTGTGGCCTTTA	69630

AL669819.13	951	ACATAACTAGCTGGTGTTGGGAGTCATATCACAAACTTAATTTCTGTTCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	69631	ACATAACTAGCTGGTGTTGGGAGTCATATCACAAACTTAATTTCTGTTCT	69680

AL669819.13	1001	CTACTTTAGTGGTGGTTAGGCAGGGGGTGGGCTTGTAACCTGGGGGTGCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	69681	CTACTTTAGTGGTGGTTAGGCAGGGGGTGGGCTTGTAACCTGGGGGTGCA	69730

AL669819.13	1051	GGTTTGTTGGGGGTGTAACCTGGAGACTGGAGCTTGGTCTGGGTTTTGTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	69731	GGTTTGTTGGGGGTGTAACCTGGAGACTGGAGCTTGGTCTGGGTTTTGTT	69780

AL669819.13	1101	GGGGGGCAACTTGGAAACTAATGTTAGGTACCAGCCTGTTAGTTTGCCTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	69781	GGGGGGCAACTTGGAAACTAATGTTAGGTACCAGCCTGTTAGTTTGCCTG	69830

AL669819.13	1151	AGTTCAAACTTAGATCAGGTTCTCCAAAATTAGAGACTTGAATTGAAAAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	69831	AGTTCAAACTTAGATCAGGTTCTCCAAAATTAGAGACTTGAATTGAAAAG	69880

AL669819.13	1201	ATTTGGCCTCTCACTATGTGACAGATAGAACCATCGCTACCACAGATGAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	69881	ATTTGGCCTCTCACTATGTGACAGATAGAACCATCGCTACCACAGATGAA	69930

AL669819.13	1251	TTGTATAGGTTTTCTTAAAGCTTTATACAAGGCTATTGGATTTTTGAAAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	69931	TTGTATAGGTTTTCTTAAAGCTTTATACAAGGCTATTGGATTTTTGAAAT	69980

AL669819.13	1301	AGGGGTGGTGAGCCAGTCACGATTTTGAGTCCCATTTTGTAGTTTAGTAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	69981	AGGGGTGGTGAGCCAGTCACGATTTTGAGTCCCATTTTGTAGTTTAGTAT	70030

AL669819.13	1351	ACAAGGAATAAACCTACCAAGTACATCAATGACCTTGAACTTCCTGTGGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	70031	ACAAGGAATAAACCTACCAAGTACATCAATGACCTTGAACTTCCTGTGGT	70080

AL669819.13	1401	GGAGTCAGGGTGTCTCTTGTCTGTTCAGATCCTTGTGGAAGCTTAGTCAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	70081	GGAGTCAGGGTGTCTCTTGTCTGTTCAGATCCTTGTGGAAGCTTAGTCAG	70130

AL669819.13	1451	AAAACAGACCTTTGGTAATCTCTATCATGTATTCTGTGCCTGTTTTTAAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	70131	AAAACAGACCTTTGGTAATCTCTATCATGTATTCTGTGCCTGTTTTTAAA	70180

AL669819.13	1501	GAAAGTCTTAAAGATGAAAAGGCAGACACCACCTACTCTGAGACTCAGAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	70181	GAAAGTCTTAAAGATGAAAAGGCAGACACCACCTACTCTGAGACTCAGAT	70230

AL669819.13	1551	GTAAGTCCCAGCGTAGGTTCCCAGCTGGGAATTGGGACAGAGGACAGGAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	70231	GTAAGTCCCAGCGTAGGTTCCCAGCTGGGAATTGGGACAGAGGACAGGAC	70280

AL669819.13	1601	GAGAAACTGGAAAGTAGTCCCAGAAGCTTAGTGGGTTATATTTTTCTGAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	70281	GAGAAACTGGAAAGTAGTCCCAGAAGCTTAGTGGGTTATATTTTTCTGAG	70330

AL669819.13	1651	AGCGGGGGCTGGGGCAGGGGCGGGGATGTGACAGGATCAAGTGCTTTTGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	70331	AGCGGGGGCTGGGGCAGGGGCGGGGATGTGACAGGATCAAGTGCTTTTGT	70380

AL669819.13	1701	TGATGTTCTGCTTTCTGAGTCCACATTTTTCTTCTGAGCAGTTAAACCCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	70381	TGATGTTCTGCTTTCTGAGTCCACATTTTTCTTCTGAGCAGTTAAACCCT	70430

AL669819.13	1751	ATTGATGGCGAGGATAACTTCTGAGTCACATAAAGGTAATGATTTGGAGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	70431	ATTGATGGCGAGGATAACTTCTGAGTCACATAAAGGTAATGATTTGGAGG	70480

AL669819.13	1801	AAGAGGGAAGCTGTGCTCCAGAGACGGAGACTGTGCAGACTTTCTGACAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	70481	AAGAGGGAAGCTGTGCTCCAGAGACGGAGACTGTGCAGACTTTCTGACAG	70530

AL669819.13	1851	GGCTGCACTGACAACTGAAGTCTTTGCTGTGCTTGACTTGAGCTAAGAAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	70531	GGCTGCACTGACAACTGAAGTCTTTGCTGTGCTTGACTTGAGCTAAGAAC	70580

AL669819.13	1901	CACATGAATCCTAAAGAACAAATACAAACTGGGAAGCCTGACCCTGGCAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	70581	CACATGAATCCTAAAGAACAAATACAAACTGGGAAGCCTGACCCTGGCAG	70630

AL669819.13	1951	GCCTGACCCAGCACTCACCTTCACCACAGGCTCTACGGTGAGGAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627387.5	70631	GCCTGACCCAGCACTCACCTTCACCACAGGCTCTACGGTGAGGAGAATTC	70680

Overview

Query
AL669819.13 - 173769 bps
Hit
AL627387.5 - 70680 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link