<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX649567.3	1	TTAAAGAGACATAGAAACCAGGAACAACACATTATCCTGAAGTGGATTGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	192247	TTAAAGAGACATAGAAACCAGGAACAACACATTATCCTGAAGTGGATTGT	192296

BX649567.3	51	TTTTTATAAAAAGCATCAGGGCAGTTTGTGAACTAGAATGGGTCCTCTCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	192297	TTTTTATAAAAAGCATCAGGGCAGTTTGTGAACTAGAATGGGTCCTCTCT	192346

BX649567.3	101	TGGTGATTGTTACATGACAGCTGTTTGCATCACCTTAGCAACTTAAAGAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	192347	TGGTGATTGTTACATGACAGCTGTTTGCATCACCTTAGCAACTTAAAGAT	192396

BX649567.3	151	AAATTGTTTAAAGATAAATTGGCGTCGTTTCATACAAACATTAAAGAAAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	192397	AAATTGTTTAAAGATAAATTGGCGTCGTTTCATACAAACATTAAAGAAAA	192446

BX649567.3	201	TGGTAATGTCCAACAGGCACAGAGTGCCCACCTAATTACTGTTCCAGGGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	192447	TGGTAATGTCCAACAGGCACAGAGTGCCCACCTAATTACTGTTCCAGGGG	192496

BX649567.3	251	TCCTCAGAGGCTGTTTTCCTACTGTCTTCTTGATTTTTAAAATATATTTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	192497	TCCTCAGAGGCTGTTTTCCTACTGTCTTCTTGATTTTTAAAATATATTTT	192546

BX649567.3	301	AGTTGATTGGTTTTATTCATGCCATAATTGGTGGAAATTAATCCTTGATT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	192547	AGTTGATTGGTTTTATTCATGCCATAATTGGTGGAAATTAATCCTTGATT	192596

BX649567.3	351	CTATAAATTTTTACCTAGTCCGTTTCCAATGTTTTTTGTTTGTTTGTTTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	192597	CTATAAATTTTTACCTAGTCCGTTTCCAATGTTTTTTGTTTGTTTGTTTC	192646

BX649567.3	401	TCTTTCCTTACTTATTTATTTATGCTTTTCTTTTACTTTTTTTGTAAAGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	192647	TCTTTCCTTACTTATTTATTTATGCTTTTCTTTTACTTTTTTTGTAAAGT	192696

BX649567.3	451	GGAATAAGTTAGGAATGAGTATATTATGACCAACTAAACTGAGTAGTTTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	192697	GGAATAAGTTAGGAATGAGTATATTATGACCAACTAAACTGAGTAGTTTT	192746

BX649567.3	501	ATGTCAAGTTGCAAATTATGTTAAGTATCAAATATTTGATTTTTTTAGAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	192747	ATGTCAAGTTGCAAATTATGTTAAGTATCAAATATTTGATTTTTTTAGAT	192796

BX649567.3	551	TTCAAAATAGTCACGTTTTCAGAAAAAATCATTAGTAGTTTTCTAAAAAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	192797	TTCAAAATAGTCACGTTTTCAGAAAAAATCATTAGTAGTTTTCTAAAAAT	192846

BX649567.3	601	AAAATCCTCTTGATTCAACAAAACATACTTGATGTGGTTTTTCCTCCCAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	192847	AAAATCCTCTTGATTCAACAAAACATACTTGATGTGGTTTTTCCTCCCAA	192896

BX649567.3	651	AACAGGCTCCTCCTTGAGTTATTGGGAATAAGTAATGCTTCTCAATAAAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	192897	AACAGGCTCCTCCTTGAGTTATTGGGAATAAGTAATGCTTCTCAATAAAG	192946

BX649567.3	701	CTTCGTGTCAACAAATCTGAACATATAACATCTCAGCTAGAGCAAGTTAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	192947	CTTCGTGTCAACAAATCTGAACATATAACATCTCAGCTAGAGCAAGTTAC	192996

BX649567.3	751	TAAAAATAGGCTCAATTTGTAGCTTGCAGTCATGCCTTCATAACCACTTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	192997	TAAAAATAGGCTCAATTTGTAGCTTGCAGTCATGCCTTCATAACCACTTT	193046

BX649567.3	801	TCAATTAATCCTGCTTAATTCAGAGAATGTATAAATATGTAATTTTGCAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	193047	TCAATTAATCCTGCTTAATTCAGAGAATGTATAAATATGTAATTTTGCAT	193096

BX649567.3	851	GACTTTTAAGGCAGCCATTTTATTTTGAAACGCAACTAACGTTATATGCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	193097	GACTTTTAAGGCAGCCATTTTATTTTGAAACGCAACTAACGTTATATGCA	193146

BX649567.3	901	TAAATTCAATAAATATAAAGCTGTTTTCAAAAATTGAATGTTTTTACTTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	193147	TAAATTCAATAAATATAAAGCTGTTTTCAAAAATTGAATGTTTTTACTTG	193196

BX649567.3	951	TAAGTTATTCTTTCAATAATAATAAAGAGATGATCACTAGTCAGTTTATT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	193197	TAAGTTATTCTTTCAATAATAATAAAGAGATGATCACTAGTCAGTTTATT	193246

BX649567.3	1001	TTTCATAGTTGAATTGATTTAGTTGAACTTCATTGGGTGTTCTTATGTTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	193247	TTTCATAGTTGAATTGATTTAGTTGAACTTCATTGGGTGTTCTTATGTTT	193296

BX649567.3	1051	TAGTCATGAGTCCATGCTCTTTAACAAGCTAAAGGAAACCATATTATATG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	193297	TAGTCATGAGTCCATGCTCTTTAACAAGCTAAAGGAAACCATATTATATG	193346

BX649567.3	1101	CTAAAAGATGTCAGTTTGTGAACAATTTAATGAATATATAGAGTTACAAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	193347	CTAAAAGATGTCAGTTTGTGAACAATTTAATGAATATATAGAGTTACAAC	193396

BX649567.3	1151	ATTTTTCCCGATTGGATGTTGGGGTTTACTATAATTCTTTGTTACTTTAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	193397	ATTTTTCCCGATTGGATGTTGGGGTTTACTATAATTCTTTGTTACTTTAT	193446

BX649567.3	1201	ATGTGAATATACTCACTACTCACTATGTTTATGTATGTAGGAAACATGCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	193447	ATGTGAATATACTCACTACTCACTATGTTTATGTATGTAGGAAACATGCT	193496

BX649567.3	1251	AGTGATGAAAATTCAAGCAGTTATTACCCTAGTTTTCTTTCATTAACAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	193497	AGTGATGAAAATTCAAGCAGTTATTACCCTAGTTTTCTTTCATTAACAAA	193546

BX649567.3	1301	ATACAGAATAGAAATTATCTACTTATTCTTGGAGGTCTTAAAATATCTTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	193547	ATACAGAATAGAAATTATCTACTTATTCTTGGAGGTCTTAAAATATCTTT	193596

BX649567.3	1351	TCAGTTGACTGATAATTCTGCTATCAAGAGCTACAAGTAGGTGCTCTGGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	193597	TCAGTTGACTGATAATTCTGCTATCAAGAGCTACAAGTAGGTGCTCTGGC	193646

BX649567.3	1401	CGTCTATATCTGTATTTCCATATATTCAATTCCTTACTATATATTTCTCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	193647	CGTCTATATCTGTATTTCCATATATTCAATTCCTTACTATATATTTCTCA	193696

BX649567.3	1451	TTTGATATTCTATACCCAATTCAAACAAAACCATTTCATGTATACAATGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	193697	TTTGATATTCTATACCCAATTCAAACAAAACCATTTCATGTATACAATGT	193746

BX649567.3	1501	ACTTTTATTTATGCTTTTCTCTATCATTAAGTAGAAAGCCATTTGCACCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	193747	ACTTTTATTTATGCTTTTCTCTATCATTAAGTAGAAAGCCATTTGCACCT	193796

BX649567.3	1551	TAGTCTAAATCTGAAATGTGCCTCTACCTAACCTTTGTAATACATTTTCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	193797	TAGTCTAAATCTGAAATGTGCCTCTACCTAACCTTTGTAATACATTTTCA	193846

BX649567.3	1601	CTATTTCTTAGTTATTAGAATAAATTTACATAATTTCTGAAACAACTTTC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	193847	CTATTTCTTAGTTATTAGAATAAATTTACATAATTTCTGAAACAACTTTC	193896

BX649567.3	1651	TCTATGGAGTATTCCCTTTAGTTTCTTTTCCCTTCCAAACAATTTAATGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	193897	TCTATGGAGTATTCCCTTTAGTTTCTTTTCCCTTCCAAACAATTTAATGA	193946

BX649567.3	1701	ATTACAAATATGGGGGAGATATTTTTTCAATGGGTAAGACTTGACTTCTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	193947	ATTACAAATATGGGGGAGATATTTTTTCAATGGGTAAGACTTGACTTCTA	193996

BX649567.3	1751	CAAATACATGTTTAATTCCTTCTCAAAATTATTTCTACTTCCTCTTATTC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	193997	CAAATACATGTTTAATTCCTTCTCAAAATTATTTCTACTTCCTCTTATTC	194046

BX649567.3	1801	AACACTGTGCTAGATTTTAGGGATATATAATAAGACAATATATGAGGTCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	194047	AACACTGTGCTAGATTTTAGGGATATATAATAAGACAATATATGAGGTCC	194096

BX649567.3	1851	TTGCTGTTGTGAAAGGTACATTCTTATCTTTGGCAAATTGTAGAATCTTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	194097	TTGCTGTTGTGAAAGGTACATTCTTATCTTTGGCAAATTGTAGAATCTTT	194146

BX649567.3	1901	AGCTTTGGTATGCAAGGGCATTGGTGTTTGGTACATGCTTGGCTCTTTGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	194147	AGCTTTGGTATGCAAGGGCATTGGTGTTTGGTACATGCTTGGCTCTTTGC	194196

BX649567.3	1951	CTTAAGAATTGCCTCTTTCCACCATGCATATTTCACCTGTGTGGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627230.15	194197	CTTAAGAATTGCCTCTTTCCACCATGCATATTTCACCTGTGTGGGAATTC	194246

Overview

Query
BX649567.3 - 99502 bps
Hit
AL627230.15 - 194246 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link