<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645759.11	1	GATTTGTTCCATTCCTGTCATGTACAGCTCCTGTCTATATAAACTTTTTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	209350	GATTTGTTCCATTCCTGTCATGTACAGCTCCTGTCTATATAAACTTTTTT	209399

AL645759.11	51	TTTTTTTTTGGAAATAAAACAGTAGCAATAAAAAGAGAATTTTTCTAAGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	209400	TTTTTTTTTGGAAATAAAACAGTAGCAATAAAAAGAGAATTTTTCTAAGA	209449

AL645759.11	101	ACAGTTTTTGTGGTGAAATTGTAGTACTTATGTAACAAAGCTGACAGAGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	209450	ACAGTTTTTGTGGTGAAATTGTAGTACTTATGTAACAAAGCTGACAGAGC	209499

AL645759.11	151	TGTTGTGGCTGGTGCGTTTAAGAAATATGGTGTTCTCTTAGGACTTGCTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	209500	TGTTGTGGCTGGTGCGTTTAAGAAATATGGTGTTCTCTTAGGACTTGCTT	209549

AL645759.11	201	ACTGTTCTAAAAACTCTGCAACGAAAGTTTGAACAAACTTAAGATTTTAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	209550	ACTGTTCTAAAAACTCTGCAACGAAAGTTTGAACAAACTTAAGATTTTAC	209599

AL645759.11	251	TGTGATGTTGGTAGGTCACATCTTAACCTACACATTGCTTTCACCTTTTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	209600	TGTGATGTTGGTAGGTCACATCTTAACCTACACATTGCTTTCACCTTTTT	209649

AL645759.11	301	TAGAAAGACTTACACATTAAAAGCAAAGGGCAACTCATTACTTTTTGTAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	209650	TAGAAAGACTTACACATTAAAAGCAAAGGGCAACTCATTACTTTTTGTAT	209699

AL645759.11	351	TTTTCCTTTTGTGTATTCATGAATAAGGTGTCTTAAAAATATAAATCTTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	209700	TTTTCCTTTTGTGTATTCATGAATAAGGTGTCTTAAAAATATAAATCTTG	209749

AL645759.11	401	TAGATGACTATTCATAACTAACTAGACTATCATTTGCTCTACCATAATCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	209750	TAGATGACTATTCATAACTAACTAGACTATCATTTGCTCTACCATAATCA	209799

AL645759.11	451	GTGACATTCTTCAAAAGTAGGGTATTGTCATAACAGTTACTATAGATATT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	209800	GTGACATTCTTCAAAAGTAGGGTATTGTCATAACAGTTACTATAGATATT	209849

AL645759.11	501	TAGAATAAGGCAGCCTATTTAATGTTCCTTTTGACAAAAAGTCCTGTTTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	209850	TAGAATAAGGCAGCCTATTTAATGTTCCTTTTGACAAAAAGTCCTGTTTT	209899

AL645759.11	551	ACTGATTTTTATTTTGTATGTGCATATGCACATGATGGTGTGTGTGTGTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	209900	ACTGATTTTTATTTTGTATGTGCATATGCACATGATGGTGTGTGTGTGTG	209949

AL645759.11	601	ATGTCTGTGTTTTGTGGAGACTAGAGTTGACATCAGGTGCTTTCCTCAGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	209950	ATGTCTGTGTTTTGTGGAGACTAGAGTTGACATCAGGTGCTTTCCTCAGT	209999

AL645759.11	651	CTCTCTTCTGTCTTATATCTTAAGACAGGGTCCTTGAACAAAGTTGGAGC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	210000	CTCTCTTCTGTCTTATATCTTAAGACAGGGTCCTTGAACAAAGTTGGAGC	210049

AL645759.11	701	TCATTGCTTCCACTAGGCTGGTTAGCCGATGAACTCTGGGGATCCTACTC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	210050	TCATTGCTTCCACTAGGCTGGTTAGCCGATGAACTCTGGGGATCCTACTC	210099

AL645759.11	751	TTTCTAGCTCCCCAGGTCTGTTTTACAATTGCATGGTGCCATACCTATCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	210100	TTTCTAGCTCCCCAGGTCTGTTTTACAATTGCATGGTGCCATACCTATCT	210149

AL645759.11	801	TTTATAGGGGTACTGGAGATCCAAGCTCAGTGCTTCATGCAAGCACTATA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	210150	TTTATAGGGGTACTGGAGATCCAAGCTCAGTGCTTCATGCAAGCACTATA	210199

AL645759.11	851	CCAGCTAAGCCATTTCCCTGGCCCTGCTTATCTAAAAGTAGAGATTGTTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	210200	CCAGCTAAGCCATTTCCCTGGCCCTGCTTATCTAAAAGTAGAGATTGTTG	210249

AL645759.11	901	ATTCATAATTTTTAACAATGATTTTTTCTAAGTTGAAAAAACTCATTAAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	210250	ATTCATAATTTTTAACAATGATTTTTTCTAAGTTGAAAAAACTCATTAAG	210299

AL645759.11	951	AAGGATGGCTGAGGTCTAAACTGGAGTGACTTGATTGTTGTGGCAGCAGC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	210300	AAGGATGGCTGAGGTCTAAACTGGAGTGACTTGATTGTTGTGGCAGCAGC	210349

AL645759.11	1001	TCTTAAGCAGCTTACCTGTCTCTTAAGCTGAGCCATTGTTCCTTACTGGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	210350	TCTTAAGCAGCTTACCTGTCTCTTAAGCTGAGCCATTGTTCCTTACTGGC	210399

AL645759.11	1051	TCCTTGCAGCAGGCTTCTGCTGGGCAGGGCAGGGCAGGGCATACTGAGAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	210400	TCCTTGCAGCAGGCTTCTGCTGGGCAGGGCAGGGCAGGGCATACTGAGAG	210449

AL645759.11	1101	GAATAGAGATGCTGTTAGAATCTTTGGGGATTAAACTGGGTATGGATACC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	210450	GAATAGAGATGCTGTTAGAATCTTTGGGGATTAAACTGGGTATGGATACC	210499

AL645759.11	1151	CAGTAAGCCATGGATGGAAGAAAAACAGTAGCTTCAGTAGTGAAAGGACA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	210500	CAGTAAGCCATGGATGGAAGAAAAACAGTAGCTTCAGTAGTGAAAGGACA	210549

AL645759.11	1201	AAAAAATTGGAAAACAAGTCTTTGGGACTATGTGGAGGGGGAGGTGGCAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	210550	AAAAAATTGGAAAACAAGTCTTTGGGACTATGTGGAGGGGGAGGTGGCAT	210599

AL645759.11	1251	TGTGCTCTGGGCTTTTTCCTTCACTGTTACTGACTATTGCCTTGTTGCAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	210600	TGTGCTCTGGGCTTTTTCCTTCACTGTTACTGACTATTGCCTTGTTGCAC	210649

AL645759.11	1301	ACTGTGTTTTGTACTCATTCAAAATTATTAGGGTCGGAACAACTGTTAAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	210650	ACTGTGTTTTGTACTCATTCAAAATTATTAGGGTCGGAACAACTGTTAAT	210699

AL645759.11	1351	TAAAGATTATTCTGTTTTCATAATAGATTGCCTTGCAGTCAGTAGTGACT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	210700	TAAAGATTATTCTGTTTTCATAATAGATTGCCTTGCAGTCAGTAGTGACT	210749

AL645759.11	1401	TGTTCTCAGAGCTGAGTCAAGTCCAATGGGGAAAATGACACCTTAACCAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	210750	TGTTCTCAGAGCTGAGTCAAGTCCAATGGGGAAAATGACACCTTAACCAT	210799

AL645759.11	1451	ATTACAATATAGTTCCACTTGAACAGTGCACATACTTGCATTGAAAAAAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	210800	ATTACAATATAGTTCCACTTGAACAGTGCACATACTTGCATTGAAAAAAA	210849

AL645759.11	1501	ATGTGGGTGATTAAAAATGACCTAATTTCAGATGCTTATATCCCAACACA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	210850	ATGTGGGTGATTAAAAATGACCTAATTTCAGATGCTTATATCCCAACACA	210899

AL645759.11	1551	GACCTGCAAGAAACATAAAAAAGCAAGGTTGTACTATGCATTTGAAAATT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	210900	GACCTGCAAGAAACATAAAAAAGCAAGGTTGTACTATGCATTTGAAAATT	210949

AL645759.11	1601	CCTGTGTGTGGGGAAGTTATAGGGAACTTTTGGGATAGCATTTGAAATGT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	210950	CCTGTGTGTGGGGAAGTTATAGGGAACTTTTGGGATAGCATTTGAAATGT	210999

AL645759.11	1651	ATATAAAGAAAATATCTAATAAAAAAAGAGAAAATTCCTAATTAGATAAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	211000	ATATAAAGAAAATATCTAATAAAAAAAGAGAAAATTCCTAATTAGATAAT	211049

AL645759.11	1701	AAGAGACTCCAGTGAGAGCAAATTAGATGAAATCTCAAGGAAGTTAAAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	211050	AAGAGACTCCAGTGAGAGCAAATTAGATGAAATCTCAAGGAAGTTAAAAA	211099

AL645759.11	1751	AGAATAATAAAGGATGTTCAGTGAAAGGAGAGGACATGAATAAACTGAGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	211100	AGAATAATAAAGGATGTTCAGTGAAAGGAGAGGACATGAATAAACTGAGC	211149

AL645759.11	1801	AAATTAAAAAAGCATGAACAATTGAATGAAATTAAGATGTCAATACATAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	211150	AAATTAAAAAAGCATGAACAATTGAATGAAATTAAGATGTCAATACATAG	211199

AL645759.11	1851	ATAAGAAAGAGGTGTTCATTAGAGACACTGGAAGTGCTGAAAATAAATTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	211200	ATAAGAAAGAGGTGTTCATTAGAGACACTGGAAGTGCTGAAAATAAATTG	211249

AL645759.11	1901	GTTTGGAAATTTGGAAATGAAAATGCCAATAAATTAAAAATAAAAAATCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	211250	GTTTGGAAATTTGGAAATGAAAATGCCAATAAATTAAAAATAAAAAATCT	211299

AL645759.11	1951	TAGAGAAAGTCTCACCAATAAAATAAATAGATCAAATGAAAAGTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627102.21	211300	TAGAGAAAGTCTCACCAATAAAATAAATAGATCAAATGAAAAGTGAATTC	211349

Overview

Query
AL645759.11 - 118244 bps
Hit
AL627102.21 - 211349 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link