<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL731659.9	1	TTTGAGTCGTTCTTTTTTGCAGCTCCTAGACATCCCTTCTCTCAGAACTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	192066	TTTGAGTCGTTCTTTTTTGCAGCTCCTAGACATCCCTTCTCTCAGAACTC	192115

AL731659.9	51	TTCTCCATACCAAGGCTAGACCCTGGCAGTGGTGGCAGAGGAGGAGGTGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	192116	TTCTCCATACCAAGGCTAGACCCTGGCAGTGGTGGCAGAGGAGGAGGTGT	192165

AL731659.9	101	GTAATAGAGCAAGGCTCTAGTTGGATCTTACATCAGTCCTGTCTGTCAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	192166	GTAATAGAGCAAGGCTCTAGTTGGATCTTACATCAGTCCTGTCTGTCAAA	192215

AL731659.9	151	TACCAAGATAAAGTGGTTCAGATTTTGCTAGTTGTTTGGGAATAGAGTTA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	192216	TACCAAGATAAAGTGGTTCAGATTTTGCTAGTTGTTTGGGAATAGAGTTA	192265

AL731659.9	201	CCAACCATAAAAAGGTTTCACCTAAACATTTTAGAGGGACAAATTCATTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	192266	CCAACCATAAAAAGGTTTCACCTAAACATTTTAGAGGGACAAATTCATTG	192315

AL731659.9	251	TTATAGTCTCCTTCTCAACAGGCATAGAGAGGTATTTAGGTTAAACCATG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	192316	TTATAGTCTCCTTCTCAACAGGCATAGAGAGGTATTTAGGTTAAACCATG	192365

AL731659.9	301	CCAAGCAAGGAAAATAACAACTAAACAATATCCATGAGGAAGTGGCTATG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	192366	CCAAGCAAGGAAAATAACAACTAAACAATATCCATGAGGAAGTGGCTATG	192415

AL731659.9	351	CCAGGCAAGGTGTCTTACCCAAAGCTCAGGCAACAGAATATCAAGGAGAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	192416	CCAGGCAAGGTGTCTTACCCAAAGCTCAGGCAACAGAATATCAAGGAGAG	192465

AL731659.9	401	GAACCCTAGAAAACACTGAGGTCTGACTAGTCAGCAACATATGGAGGAGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	192466	GAACCCTAGAAAACACTGAGGTCTGACTAGTCAGCAACATATGGAGGAGT	192515

AL731659.9	451	GGAGCCCAGCAGTGCAGGAAAGCACCATTGCAAGATTAGTGCTCTCCTCC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	192516	GGAGCCCAGCAGTGCAGGAAAGCACCATTGCAAGATTAGTGCTCTCCTCC	192565

AL731659.9	501	CTAGTCCTCCGTCCTCTCTTCCTTACCTTTCTATCCCCTTTCTCTGCTTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	192566	CTAGTCCTCCGTCCTCTCTTCCTTACCTTTCTATCCCCTTTCTCTGCTTT	192615

AL731659.9	551	CCCTCTCCTTACAACCCCTCTCCCTTGCTCTATTAAAGTCAGTTTGTATC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	192616	CCCTCTCCTTACAACCCCTCTCCCTTGCTCTATTAAAGTCAGTTTGTATC	192665

AL731659.9	601	TTTTTTTTTAAGGGGAGTCAATAGGTGTTTGGTCACTCCTAATTACAAGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	192666	TTTTTTTTTAAGGGGAGTCAATAGGTGTTTGGTCACTCCTAATTACAAGA	192715

AL731659.9	651	ACCATCACACATACAAATGATATTGCTTTAGAAAAAAAAGAGTTGAGTGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	192716	ACCATCACACATACAAATGATATTGCTTTAGAAAAAAAAGAGTTGAGTGT	192765

AL731659.9	701	GACAATGCACACACATTGTCCTAGCACCTGGGAGGCAGAAGCAGGAAATT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	192766	GACAATGCACACACATTGTCCTAGCACCTGGGAGGCAGAAGCAGGAAATT	192815

AL731659.9	751	GTTGAGTTTGGGGATAGCCTTGGGTATAGAGAATCATCTACATCACAAGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	192816	GTTGAGTTTGGGGATAGCCTTGGGTATAGAGAATCATCTACATCACAAGA	192865

AL731659.9	801	CCATCCCTCAAATAAAGAGAAAGTGAAAAGGAAGAGGAGGAAGGGGAGGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	192866	CCATCCCTCAAATAAAGAGAAAGTGAAAAGGAAGAGGAGGAAGGGGAGGG	192915

AL731659.9	851	AGGAGGAAGGTAGGGAGTGCAGAGTTGCATTGGCCATAGTGTCTTACACA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	192916	AGGAGGAAGGTAGGGAGTGCAGAGTTGCATTGGCCATAGTGTCTTACACA	192965

AL731659.9	901	GCAATAGAAAAGTATCTAAGAGAGAAATTTAACAATATCCTGGTTGTGTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	192966	GCAATAGAAAAGTATCTAAGAGAGAAATTTAACAATATCCTGGTTGTGTT	193015

AL731659.9	951	TTTTTCCTTATCTAACATATAAAGGTTCTCGGATTGGGAATTGCTTTATA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	193016	TTTTTCCTTATCTAACATATAAAGGTTCTCGGATTGGGAATTGCTTTATA	193065

AL731659.9	1001	TGCTGGATGTCACATAGAACAACTTTTCTTGAGGGTGGCAGTATAACTCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	193066	TGCTGGATGTCACATAGAACAACTTTTCTTGAGGGTGGCAGTATAACTCA	193115

AL731659.9	1051	GTGCTGGAGTATGTTTGAGGCCCTGGCTTCTATCATCAACACCAAAACAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	193116	GTGCTGGAGTATGTTTGAGGCCCTGGCTTCTATCATCAACACCAAAACAA	193165

AL731659.9	1101	ATAAATAAGTAAACAAATAACTGGCCTTTTGGCAAGGGCTGGCTGTGCTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	193166	ATAAATAAGTAAACAAATAACTGGCCTTTTGGCAAGGGCTGGCTGTGCTG	193215

AL731659.9	1151	ACAGTACCTGGCAAATAGTCTTCAACTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	193216	ACAGTACCTGGCAAATAGTCTTCAACTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	193265

AL731659.9	1201	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTAAAAAGGACCATT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	193266	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTAAAAAGGACCATT	193315

AL731659.9	1251	TTCCACCCACCATTAGGAACTCAAGGTTCTGTCTTTACATGATATTGATT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	193316	TTCCACCCACCATTAGGAACTCAAGGTTCTGTCTTTACATGATATTGATT	193365

AL731659.9	1301	TAGAATCTTCTCACTATTTCCTCTGGATGCCCTGCCTGCTCACCTGGGAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	193366	TAGAATCTTCTCACTATTTCCTCTGGATGCCCTGCCTGCTCACCTGGGAA	193415

AL731659.9	1351	CCAGTCGTATGGTCCTTCTCTGAAACACACTGCACATACCTGAAGCTCTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	193416	CCAGTCGTATGGTCCTTCTCTGAAACACACTGCACATACCTGAAGCTCTG	193465

AL731659.9	1401	AGATCTGAGCTCTCCAAGACTCTTGTCAGAAAGAAGGAAACATATTTAGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	193466	AGATCTGAGCTCTCCAAGACTCTTGTCAGAAAGAAGGAAACATATTTAGA	193515

AL731659.9	1451	AGGCTGATTGAGGGCTGGGAACAGGTGGCCTTCCTTCTGAAGGATGAGGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	193516	AGGCTGATTGAGGGCTGGGAACAGGTGGCCTTCCTTCTGAAGGATGAGGT	193565

AL731659.9	1501	CATTCTCCACAGAGGCCAACCACACGGCCAGGCTATTGGGGAGATTCCGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	193566	CATTCTCCACAGAGGCCAACCACACGGCCAGGCTATTGGGGAGATTCCGA	193615

AL731659.9	1551	GGCCTTAAGTAGTCATCTGAGCCTCCTTCTTCTGGACAGAGCCACAGAAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	193616	GGCCTTAAGTAGTCATCTGAGCCTCCTTCTTCTGGACAGAGCCACAGAAA	193665

AL731659.9	1601	CAAAGAAAACAATCTGTGCTTCTACTTTTGAATTCTGGGCTTTGCCTTGT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	193666	CAAAGAAAACAATCTGTGCTTCTACTTTTGAATTCTGGGCTTTGCCTTGT	193715

AL731659.9	1651	GTCTTCTTCCTGCACTCCAGTGTCTGCCTTTCTTTTCCTTTCAGTCGTGC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	193716	GTCTTCTTCCTGCACTCCAGTGTCTGCCTTTCTTTTCCTTTCAGTCGTGC	193765

AL731659.9	1701	TTTGGCCGAGGCATATGACATACAACTACTCATTTGGGCTGTGGGTTTAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	193766	TTTGGCCGAGGCATATGACATACAACTACTCATTTGGGCTGTGGGTTTAA	193815

AL731659.9	1751	GTTCTAAGATGAAGCTAGGGAGTGAGAGGAGACAAAGACTCTTGTTAAGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	193816	GTTCTAAGATGAAGCTAGGGAGTGAGAGGAGACAAAGACTCTTGTTAAGA	193865

AL731659.9	1801	AAGTCTCGCAATCAATCAAGCAATAGCAACTGATCAGTCAGCCCATCACC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	193866	AAGTCTCGCAATCAATCAAGCAATAGCAACTGATCAGTCAGCCCATCACC	193915

AL731659.9	1851	CACCGGACTCTCGACTTCTGATGCTCTTTTTTTCCCTCCTCTTCTCAAAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	193916	CACCGGACTCTCGACTTCTGATGCTCTTTTTTTCCCTCCTCTTCTCAAAA	193965

AL731659.9	1901	ACGAAACCTGAGGATTTGAGATGAGTATGCTAGAAAGAGCAGAGTCAAAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	193966	ACGAAACCTGAGGATTTGAGATGAGTATGCTAGAAAGAGCAGAGTCAAAT	194015

AL731659.9	1951	GCAGGCAGGAATGCTAACTCTGACTGTCAGGGGACAGGAATGAGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611944.10	194016	GCAGGCAGGAATGCTAACTCTGACTGTCAGGGGACAGGAATGAGGAATTC	194065

Overview

Query
AL731659.9 - 76568 bps
Hit
AL611944.10 - 194065 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link