<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL731649.8	1	ATATTAATTTTAGCAATTGATTAGGCACCAATATTAGTAACTTATTTGTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	170872	ATATTAATTTTAGCAATTGATTAGGCACCAATATTAGTAACTTATTTGTT	170921

AL731649.8	51	GCCTAGAACAGAAGATTATTTTAAAAGAAAATTAAATACTAGTCTAAGTA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	170922	GCCTAGAACAGAAGATTATTTTAAAAGAAAATTAAATACTAGTCTAAGTA	170971

AL731649.8	101	GGGAAAATGAGTGGTGGAGTCTGAATTAAGTACTAATAGGACCTTCTGTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	170972	GGGAAAATGAGTGGTGGAGTCTGAATTAAGTACTAATAGGACCTTCTGTG	171021

AL731649.8	151	AATTAAGAGGAAGATACATGTTCTTGGTTTTAATGTAATATATTATAATA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	171022	AATTAAGAGGAAGATACATGTTCTTGGTTTTAATGTAATATATTATAATA	171071

AL731649.8	201	ATATAATACAAATACATAATTTTAGAATCCTTACAAATAGAATTGCTAAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	171072	ATATAATACAAATACATAATTTTAGAATCCTTACAAATAGAATTGCTAAT	171121

AL731649.8	251	TCATATACAGAATTTTATTGTAAACTGTGGTGATCTGAGTCAGAAATGTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	171122	TCATATACAGAATTTTATTGTAAACTGTGGTGATCTGAGTCAGAAATGTC	171171

AL731649.8	301	CCCCATAGACTCACACATTTGAACAATTGTTCCGCAGTTGATGACAGTTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	171172	CCCCATAGACTCACACATTTGAACAATTGTTCCGCAGTTGATGACAGTTT	171221

AL731649.8	351	CTCTGGTTGTAGAACCTTTAGGAGGTGGGGCCTTGCTGGAGGAAGTGTAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	171222	CTCTGGTTGTAGAACCTTTAGGAGGTGGGGCCTTGCTGGAGGAAGTGTAT	171271

AL731649.8	401	CACTTGAGAGTTCATAATCTCACCCTATGTTCCAGTTTACTCTTTCTGCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	171272	CACTTGAGAGTTCATAATCTCACCCTATGTTCCAGTTTACTCTTTCTGCT	171321

AL731649.8	451	TCCTGTGTGTGGACAGAGATGCAATCTCTCAGCTCCTTGCTTTGGCCGCC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	171322	TCCTGTGTGTGGACAGAGATGCAATCTCTCAGCTCCTTGCTTTGGCCGCC	171371

AL731649.8	501	TGATGCCATGGCATCTTGACCATTAGTGAACTTTCCCTCTGGAACCACAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	171372	TGATGCCATGGCATCTTGACCATTAGTGAACTTTCCCTCTGGAACCACAA	171421

AL731649.8	551	GCTTAAATAAACTCTTCCCTAAGTCCCTCTGGGTCATGGTGTTTTATCAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	171422	GCTTAAATAAACTCTTCCCTAAGTCCCTCTGGGTCATGGTGTTTTATCAC	171471

AL731649.8	601	AGCAAAAACAAAACAAAACAAAACAAAGCAAAACAAAACAAAACAAAAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	171472	AGCAAAAACAAAACAAAACAAAACAAAGCAAAACAAAACAAAACAAAAAA	171521

AL731649.8	651	CTAATACACAGATAAAATGTCTCTAGTTTATTCACACACAAACTAAGGGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	171522	CTAATACACAGATAAAATGTCTCTAGTTTATTCACACACAAACTAAGGGT	171571

AL731649.8	701	TCGCTTTACAGGTATGTTTCATTTAAAAGACTCAAACCATGTCTTTGAAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	171572	TCGCTTTACAGGTATGTTTCATTTAAAAGACTCAAACCATGTCTTTGAAA	171621

AL731649.8	751	CACTGCTCTGTGTCATGTTGGACCCCTTTGGCAATGTTCCAACCACATGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	171622	CACTGCTCTGTGTCATGTTGGACCCCTTTGGCAATGTTCCAACCACATGA	171671

AL731649.8	801	ATGTCCACCTGTTCCCACCGCATAACAGCCTTCTTCCTGCCCTACTGTTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	171672	ATGTCCACCTGTTCCCACCGCATAACAGCCTTCTTCCTGCCCTACTGTTG	171721

AL731649.8	851	TCTTTGCAAATGTTGACTTTTCGGTTAGCTCTCTGTTTTATAACTCCCTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	171722	TCTTTGCAAATGTTGACTTTTCGGTTAGCTCTCTGTTTTATAACTCCCTC	171771

AL731649.8	901	AGCCATGTCCCATAATTGCCACCTTCCCAGGGGGTCACCTTCCCCTAATG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	171772	AGCCATGTCCCATAATTGCCACCTTCCCAGGGGGTCACCTTCCCCTAATG	171821

AL731649.8	951	AAGCCATGGCTACACTATGCAGAAAACTTGCCATTACTGTCTCTTATGCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	171822	AAGCCATGGCTACACTATGCAGAAAACTTGCCATTACTGTCTCTTATGCA	171871

AL731649.8	1001	GAAGGGTCAGCATCACCCTCTTAGGTCAACAATGACTGCACAGCCATTCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	171872	GAAGGGTCAGCATCACCCTCTTAGGTCAACAATGACTGCACAGCCATTCT	171921

AL731649.8	1051	CTTCCTGACACTACAGTTAACTTGTTTCTTTTATACATTAAACTTCTATG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	171922	CTTCCTGACACTACAGTTAACTTGTTTCTTTTATACATTAAACTTCTATG	171971

AL731649.8	1101	TGCTAATAAAACATGCAGTAAAATAGGAAATGGCATCTTTATCAGTCCTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	171972	TGCTAATAAAACATGCAGTAAAATAGGAAATGGCATCTTTATCAGTCCTA	172021

AL731649.8	1151	AGTACTGCTAATGATTTTTATGATACAGCCTCACATTACATAAACCTCAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	172022	AGTACTGCTAATGATTTTTATGATACAGCCTCACATTACATAAACCTCAT	172071

AL731649.8	1201	GAAACTGAATGTCAATGCCTTTTATACATAGGAAAGCCTCATTGTAGTTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	172072	GAAACTGAATGTCAATGCCTTTTATACATAGGAAAGCCTCATTGTAGTTG	172121

AL731649.8	1251	TCTTATAACTTGCAGCATGTCTGTTTTCTTCTCCTTCTTTAAAAATAAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	172122	TCTTATAACTTGCAGCATGTCTGTTTTCTTCTCCTTCTTTAAAAATAAAA	172171

AL731649.8	1301	CCAGTGGGTATGGTGTTATATACCTATAATTTCAGCATTCAGGAGGCTGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	172172	CCAGTGGGTATGGTGTTATATACCTATAATTTCAGCATTCAGGAGGCTGA	172221

AL731649.8	1351	GGCAGGACCATGCACTGAAGGCTAGTTACACTGTGAATTGAAGAACAAAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	172222	GGCAGGACCATGCACTGAAGGCTAGTTACACTGTGAATTGAAGAACAAAG	172271

AL731649.8	1401	CCTGGGGCTAAAGTGAGAAGTGAGGCCATAGACTAAAAATAAGTAAGTCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	172272	CCTGGGGCTAAAGTGAGAAGTGAGGCCATAGACTAAAAATAAGTAAGTCT	172321

AL731649.8	1451	TAACAACTAGCCCTCTCCAGTAAGACCCATGTATACCTTCTAAGCCACGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	172322	TAACAACTAGCCCTCTCCAGTAAGACCCATGTATACCTTCTAAGCCACGC	172371

AL731649.8	1501	ACCCACTACACATCTGCTAAGAGAACCCAGCACTCTAGAGTACCTCTTTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	172372	ACCCACTACACATCTGCTAAGAGAACCCAGCACTCTAGAGTACCTCTTTC	172421

AL731649.8	1551	CCCGGACCCCTTAACTCCTAGACCCATATGTCCCAACAGGCCACATAATG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	172422	CCCGGACCCCTTAACTCCTAGACCCATATGTCCCAACAGGCCACATAATG	172471

AL731649.8	1601	CCGTGGCCCTGGTCCCTGCTCAGTAAGAGACCTTGCCCCTGATCCCCCAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	172472	CCGTGGCCCTGGTCCCTGCTCAGTAAGAGACCTTGCCCCTGATCCCCCAC	172521

AL731649.8	1651	ATCTTCCACTCCAGTCCCAGAACCCATGAGTTCCAGCCATTTCATATGTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	172522	ATCTTCCACTCCAGTCCCAGAACCCATGAGTTCCAGCCATTTCATATGTT	172571

AL731649.8	1701	CACTGCAGCCATGAACCAGGTAAAGACACCTGATCTCTCTGTTCACCTCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	172572	CACTGCAGCCATGAACCAGGTAAAGACACCTGATCTCTCTGTTCACCTCA	172621

AL731649.8	1751	AGATTTCTCCAAATGGTCCAGCCAACTGACTCAGTTTGGGATTCCAGTCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	172622	AGATTTCTCCAAATGGTCCAGCCAACTGACTCAGTTTGGGATTCCAGTCC	172671

AL731649.8	1801	AGTGAGTTAAAAACCCATATCAAAAGATAACTACAATCCTGACTTCAGAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	172672	AGTGAGTTAAAAACCCATATCAAAAGATAACTACAATCCTGACTTCAGAT	172721

AL731649.8	1851	GCAGAGGTCCTTTAAAAAAAAAACACAGCAATATGATTTTCATATGCCCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	172722	GCAGAGGTCCTTTAAAAAAAAAACACAGCAATATGATTTTCATATGCCCA	172771

AL731649.8	1901	ATAGGATTGTCAATGTGCGTTTTTTTCCCAACAAATCACCAAGCCCATAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	172772	ATAGGATTGTCAATGTGCGTTTTTTTCCCAACAAATCACCAAGCCCATAT	172821

AL731649.8	1951	TAAAAGTCTCTAAGGAGAACAACTTAGATGCAATTCAACAGGAAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607131.15	172822	TAAAAGTCTCTAAGGAGAACAACTTAGATGCAATTCAACAGGAAGAATTC	172871

Overview

Query
AL731649.8 - 42074 bps
Hit
AL607131.15 - 172871 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link