<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL590503.11	1	GAATTCAGCTGGAGAATTAAACACAGCCCTCCCCTCCCGCAAATCACGTG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	52631	GAATTCAGCTGGAGAATTAAACACAGCCCTCCCCTCCCGCAAATCACGTG	52680

AL590503.11	51	CTTACCATGACTATTTGGACCCCAGCCATTAGCACCACCTAGAAAAAGAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	52681	CTTACCATGACTATTTGGACCCCAGCCATTAGCACCACCTAGAAAAAGAG	52730

AL590503.11	101	ATTGTCTTGTTCATCTATTTATTAAAAGTATTAATAGTTGTGCTCATATT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	52731	ATTGTCTTGTTCATCTATTTATTAAAAGTATTAATAGTTGTGCTCATATT	52780

AL590503.11	151	TTAATCCCTATACCTTAATTACCAGCTTCTGTTGCCCTTTAAGATCCATT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	52781	TTAATCCCTATACCTTAATTACCAGCTTCTGTTGCCCTTTAAGATCCATT	52830

AL590503.11	201	GATTTCCGTGTCATGACAGGTAATTGGTCCAGTCCTAGGCTATCCAGTCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	52831	GATTTCCGTGTCATGACAGGTAATTGGTCCAGTCCTAGGCTATCCAGTCA	52880

AL590503.11	251	CCAGCAAAACAACTTCAGGCAACCCATACATCATCCACAGGTTCAGGCAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	52881	CCAGCAAAACAACTTCAGGCAACCCATACATCATCCACAGGTTCAGGCAA	52930

AL590503.11	301	ACACCACATGCCATATGCCAATATTTCTGCTTACCAGTCCTAAATGTATC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	52931	ACACCACATGCCATATGCCAATATTTCTGCTTACCAGTCCTAAATGTATC	52980

AL590503.11	351	TTCAAACTGCTTTCATTTGGAAGCTAGGGTATATATCAGACACCGTTTCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	52981	TTCAAACTGCTTTCATTTGGAAGCTAGGGTATATATCAGACACCGTTTCA	53030

AL590503.11	401	GGGATGTATTCTTTCCTCCAGGCTTGCTCCCTGTGATTACAGATGTTCCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	53031	GGGATGTATTCTTTCCTCCAGGCTTGCTCCCTGTGATTACAGATGTTCCT	53080

AL590503.11	451	CCACAACCAAACGCAGAAAGGGAAATGTACTTTTTATGGGAGTCATTTTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	53081	CCACAACCAAACGCAGAAAGGGAAATGTACTTTTTATGGGAGTCATTTTT	53130

AL590503.11	501	TCTCTTCTCCCTTTCCATTTATTCAGCTTGGGGAAAGGAGATAAAAATGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	53131	TCTCTTCTCCCTTTCCATTTATTCAGCTTGGGGAAAGGAGATAAAAATGT	53180

AL590503.11	551	ATGAGCAGTGGAGTTGAGTACACTGTAAACTCCATCTATTTTTGGCCAAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	53181	ATGAGCAGTGGAGTTGAGTACACTGTAAACTCCATCTATTTTTGGCCAAT	53230

AL590503.11	601	GGCAGACTGATGCACTTACTGTCCTGATGTAGGACTAGCTTACTGCTTCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	53231	GGCAGACTGATGCACTTACTGTCCTGATGTAGGACTAGCTTACTGCTTCC	53280

AL590503.11	651	CTTTGCTTTCTGCTGAAGTTAGGATTTCGCGTAGCAGATTTCTGTAAAGC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	53281	CTTTGCTTTCTGCTGAAGTTAGGATTTCGCGTAGCAGATTTCTGTAAAGC	53330

AL590503.11	701	AGCATCAAATCTACAAGAACAATACAAGAAGATGAAGCAGATGCTTCAGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	53331	AGCATCAAATCTACAAGAACAATACAAGAAGATGAAGCAGATGCTTCAGG	53380

AL590503.11	751	GAAAGGCGATGCCACCCAGTTCATATTCTGGCTTTGAGTAAAATCTCAGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	53381	GAAAGGCGATGCCACCCAGTTCATATTCTGGCTTTGAGTAAAATCTCAGG	53430

AL590503.11	801	GGTTTTCAAATTCCGTACACCATCCAAAAGTGAGAAGTAAAGACACTCTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	53431	GGTTTTCAAATTCCGTACACCATCCAAAAGTGAGAAGTAAAGACACTCTT	53480

AL590503.11	851	TAACATTTAGGAGAGAGTTGACCATGGCTCTGGCCAGACAGGATTTTGCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	53481	TAACATTTAGGAGAGAGTTGACCATGGCTCTGGCCAGACAGGATTTTGCT	53530

AL590503.11	901	AACTTGCAAAAGAAGTAAGCCTTAAGAAAGTGGTGTGTCATGGCTCCTCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	53531	AACTTGCAAAAGAAGTAAGCCTTAAGAAAGTGGTGTGTCATGGCTCCTCA	53580

AL590503.11	951	AAACAGTTGTTTGACAAAAAGAAAAATCATTCTAACTTTCCAGCATACAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	53581	AAACAGTTGTTTGACAAAAAGAAAAATCATTCTAACTTTCCAGCATACAT	53630

AL590503.11	1001	GTTTGACAGCCTGAATTTTAATGCCTTTAATGTTTTAGTGAATATCAGCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	53631	GTTTGACAGCCTGAATTTTAATGCCTTTAATGTTTTAGTGAATATCAGCT	53680

AL590503.11	1051	ATGATGTTATTCCAACTAGGCAAAAAATGAAGACTAAGACACTAAGGGAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	53681	ATGATGTTATTCCAACTAGGCAAAAAATGAAGACTAAGACACTAAGGGAC	53730

AL590503.11	1101	TATTGCCCCTTTAATAAGAAAAGCAATCCATGGAGTGGGAAACAGAAGGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	53731	TATTGCCCCTTTAATAAGAAAAGCAATCCATGGAGTGGGAAACAGAAGGG	53780

AL590503.11	1151	TGTTCTGAGGGTCTTAGAGGACTCTGTCATTTCAAGGCAAGGACTCAGTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	53781	TGTTCTGAGGGTCTTAGAGGACTCTGTCATTTCAAGGCAAGGACTCAGTC	53830

AL590503.11	1201	CAGGGCTCTGCTCTGGAACAACAGAAAAAAATAGCCTGTTTGTCCCTTGC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	53831	CAGGGCTCTGCTCTGGAACAACAGAAAAAAATAGCCTGTTTGTCCCTTGC	53880

AL590503.11	1251	AGTACAGTTGGGCCAGAACTCAGGAGAGCACTGCTAGTATGATTCTGCTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	53881	AGTACAGTTGGGCCAGAACTCAGGAGAGCACTGCTAGTATGATTCTGCTT	53930

AL590503.11	1301	CCAAGTCAGTGAAATAAATTTCTGCTAACTGACATTTGAACCTAACAACC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	53931	CCAAGTCAGTGAAATAAATTTCTGCTAACTGACATTTGAACCTAACAACC	53980

AL590503.11	1351	TAGCTAAGAGCTGTTTCTATAATGGATGAGTTCAAAATGGCTTACAAATT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	53981	TAGCTAAGAGCTGTTTCTATAATGGATGAGTTCAAAATGGCTTACAAATT	54030

AL590503.11	1401	AACATTTGGAACAAAACCTTTCCCAGATAACAGGATTCTTACCCAGAGGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	54031	AACATTTGGAACAAAACCTTTCCCAGATAACAGGATTCTTACCCAGAGGC	54080

AL590503.11	1451	AAACAGAAATAAACAAAACCAAAGAGAAGAAAGAAAAAAACAATCCCTAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	54081	AAACAGAAATAAACAAAACCAAAGAGAAGAAAGAAAAAAACAATCCCTAA	54130

AL590503.11	1501	GGCAGTTTTCCTTTGCCTGGCAAGTTCTGAGATGTTACAGAATGACATTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	54131	GGCAGTTTTCCTTTGCCTGGCAAGTTCTGAGATGTTACAGAATGACATTC	54180

AL590503.11	1551	AAGAAGCCAAAGTTAGACCTTTTGAGTAAAATAATTTTAGCTCTACATAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	54181	AAGAAGCCAAAGTTAGACCTTTTGAGTAAAATAATTTTAGCTCTACATAT	54230

AL590503.11	1601	TGAGGATTTAGTAAAATCTTTTGCCATATTAATTTAATCTAAGCCTCACC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	54231	TGAGGATTTAGTAAAATCTTTTGCCATATTAATTTAATCTAAGCCTCACC	54280

AL590503.11	1651	ATTCAATTATGCCATGTGCATAATTACATTTCAATTTCCATAACCCATTA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	54281	ATTCAATTATGCCATGTGCATAATTACATTTCAATTTCCATAACCCATTA	54330

AL590503.11	1701	ATTTATTTATTAGCAGGTTATAAGGCTAGAGAACTGAAGCTTGAAAAATA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	54331	ATTTATTTATTAGCAGGTTATAAGGCTAGAGAACTGAAGCTTGAAAAATA	54380

AL590503.11	1751	AGTTGTTAAAATGAGTTAATCATTTAAAATATGATTAACTCTCTAATTTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	54381	AGTTGTTAAAATGAGTTAATCATTTAAAATATGATTAACTCTCTAATTTT	54430

AL590503.11	1801	AGTGGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGGTGTGTGTATGTGGTGTGTGTGTGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	54431	AGTGGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGGTGTGTGTATGTGGTGTGTGTGTGT	54480

AL590503.11	1851	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGATGTGTGTATGAGTGGGGTGTGAGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	54481	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGATGTGTGTATGAGTGGGGTGTGAGT	54530

AL590503.11	1901	CTGTGTGGAATGTGTATGTGGTGTGTGTGTATGTATGTATGTATGTGTGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	54531	CTGTGTGGAATGTGTATGTGGTGTGTGTGTATGTATGTATGTATGTGTGG	54580

AL590503.11	1951	TGTGTATGTATATGTGGTGTGCATATCTGTGTGGTGTGTGTGTCGTGTGT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL607105.15	54581	TGTGTATGTATATGTGGTGTGCATATCTGTGTGGTGTGTGTGTCGTGTGT	54630

Overview

Query
AL590503.11 - 169547 bps
Hit
AL607105.15 - 54630 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link