<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL606496.12	1	GAATTCTGGGAATCCGAAGGTGGTGGGGACAGAAAAGGGCATCATGAATC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	125434	GAATTCTGGGAATCCGAAGGTGGTGGGGACAGAAAAGGGCATCATGAATC	125483

AL606496.12	51	ATGTTTATAAATACTAGCGATTGTGTCACAGGGTCCAAGGATCACCAGGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	125484	ATGTTTATAAATACTAGCGATTGTGTCACAGGGTCCAAGGATCACCAGGG	125533

AL606496.12	101	ATGATGACCTGAAGGCTTTATGACAGCCCAGGCAGGCACTGGCCCCTGCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	125534	ATGATGACCTGAAGGCTTTATGACAGCCCAGGCAGGCACTGGCCCCTGCT	125583

AL606496.12	151	CAGAAGAGCAGATGCGGGGTATCTGGGAGAAGTGGCTCTATTACAAGGAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	125584	CAGAAGAGCAGATGCGGGGTATCTGGGAGAAGTGGCTCTATTACAAGGAG	125633

AL606496.12	201	AACTGGGGGACTTGGTGAGGGCTCATAGGGATGGAGGGCAAAAGATGAGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	125634	AACTGGGGGACTTGGTGAGGGCTCATAGGGATGGAGGGCAAAAGATGAGA	125683

AL606496.12	251	TGCTACAGTATGGTGCTCTGCAGCAGGCTATGGCGCCCCGCAGCAGGCTA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	125684	TGCTACAGTATGGTGCTCTGCAGCAGGCTATGGCGCCCCGCAGCAGGCTA	125733

AL606496.12	301	TGGCGCCCTGCAGCAGGCTATGGCGCCCCGCAGAAGGCTATGGCGCCCCG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	125734	TGGCGCCCTGCAGCAGGCTATGGCGCCCCGCAGAAGGCTATGGCGCCCCG	125783

AL606496.12	351	CAGCAGTCTACGGCGCCCTGCAGAAGGTTATGGTGTCCTGCAGCATGCTA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	125784	CAGCAGTCTACGGCGCCCTGCAGAAGGTTATGGTGTCCTGCAGCATGCTA	125833

AL606496.12	401	TGGCGCCCTGCAGCAGGTTATGGTGCTCTGCAGCAGGCTATGGAGCCCCG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	125834	TGGCGCCCTGCAGCAGGTTATGGTGCTCTGCAGCAGGCTATGGAGCCCCG	125883

AL606496.12	451	CAGCAGGCTATGGCGCCCTGCAGCAGGTTATGGTGTCCTGCAGCAGGCTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	125884	CAGCAGGCTATGGCGCCCTGCAGCAGGTTATGGTGTCCTGCAGCAGGCTA	125933

AL606496.12	501	TGGCGCCCTGCAGCAGGTTATGGTGTCCTGCAGCAGGCTATGGCGCTCTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	125934	TGGCGCCCTGCAGCAGGTTATGGTGTCCTGCAGCAGGCTATGGCGCTCTG	125983

AL606496.12	551	CAACAGGCTAGGAACCAGTGTGCATGCATACCATTCCCGCCTCTGTTCCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	125984	CAACAGGCTAGGAACCAGTGTGCATGCATACCATTCCCGCCTCTGTTCCT	126033

AL606496.12	601	TACTTGGTGTGCCAAGCTGGGTGTGCTTCTTAACTTGTCTAGAAAATGAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	126034	TACTTGGTGTGCCAAGCTGGGTGTGCTTCTTAACTTGTCTAGAAAATGAA	126083

AL606496.12	651	GATGGCAACAGGGTATCTTTCAGCTGGACAATTTGAAGATTAGATAAGTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	126084	GATGGCAACAGGGTATCTTTCAGCTGGACAATTTGAAGATTAGATAAGTG	126133

AL606496.12	701	CGTTCATGTGCTGTAGTTTGGGTTCTCACAGGATCCCAAAATGAGAATTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	126134	CGTTCATGTGCTGTAGTTTGGGTTCTCACAGGATCCCAAAATGAGAATTA	126183

AL606496.12	751	GTTACAAAGCATTATCCTGGGCCTCAGGTCTTTGTCTGGCCTCCCACACA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	126184	GTTACAAAGCATTATCCTGGGCCTCAGGTCTTTGTCTGGCCTCCCACACA	126233

AL606496.12	801	GCTCTCCTGTTACTTTCTCTTCCACCAGGACAGATATTCCCCAAGGCCTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	126234	GCTCTCCTGTTACTTTCTCTTCCACCAGGACAGATATTCCCCAAGGCCTT	126283

AL606496.12	851	CACTGAGTAGAGCTGGTGCCAACATTATGAATTTGAAGCTCCAAACCTGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	126284	CACTGAGTAGAGCTGGTGCCAACATTATGAATTTGAAGCTCCAAACCTGT	126333

AL606496.12	901	GAGATATATAAAGCTCCTTTCTTTTTTTTAAAGGATAAAATACTTAGCTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	126334	GAGATATATAAAGCTCCTTTCTTTTTTTTAAAGGATAAAATACTTAGCTT	126383

AL606496.12	951	CAGGTACTTTATTCTACTAATATTTGATGTACTAATATATAGCACACATA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	126384	CAGGTACTTTATTCTACTAATATTTGATGTACTAATATATAGCACACATA	126433

AL606496.12	1001	TAATATGTTTAGAACAGAAACTGACCTCCATGACACATTTGCATACTAGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	126434	TAATATGTTTAGAACAGAAACTGACCTCCATGACACATTTGCATACTAGT	126483

AL606496.12	1051	AATTATTGCCAATGACTAAAAGGCGATAGTTAATTTGATGTCATTTATTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	126484	AATTATTGCCAATGACTAAAAGGCGATAGTTAATTTGATGTCATTTATTT	126533

AL606496.12	1101	GAGATGAGAAAGACTAGAAGCACGAGTTTAAGTAAAGTATTGGGAAATTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	126534	GAGATGAGAAAGACTAGAAGCACGAGTTTAAGTAAAGTATTGGGAAATTA	126583

AL606496.12	1151	TTTGGGAGATTTTTAAGACTTCTAAGATGAGGTGCTGAACGGGGCTAGGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	126584	TTTGGGAGATTTTTAAGACTTCTAAGATGAGGTGCTGAACGGGGCTAGGA	126633

AL606496.12	1201	AAGCTGGGGGTTCTGGGAGAAGTCAAATCTAGGACATAAATCTATCGTTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	126634	AAGCTGGGGGTTCTGGGAGAAGTCAAATCTAGGACATAAATCTATCGTTC	126683

AL606496.12	1251	AAAGCTGAAGTCCTAGAAGATGACCTAATACCGAGGAGCCGGAGAAAGGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	126684	AAAGCTGAAGTCCTAGAAGATGACCTAATACCGAGGAGCCGGAGAAAGGA	126733

AL606496.12	1301	GAAAGAGCAAGCACTGGAAGTGAGCGGTGCTTTGAGGAACTGGGATCGTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	126734	GAAAGAGCAAGCACTGGAAGTGAGCGGTGCTTTGAGGAACTGGGATCGTT	126783

AL606496.12	1351	TTCTGCTCCATCCTTCTGAGAAGTCATCTGTGGGCTTGGAAGTTGGACAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	126784	TTCTGCTCCATCCTTCTGAGAAGTCATCTGTGGGCTTGGAAGTTGGACAG	126833

AL606496.12	1401	TGAAAGATACTGAGGGAGGATCAGCCGCACTGTGCACTGTGGAAGGGAGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	126834	TGAAAGATACTGAGGGAGGATCAGCCGCACTGTGCACTGTGGAAGGGAGA	126883

AL606496.12	1451	GCTCCAGCACTGAGCGAGACTCAAGCCTGCGCCGTGAGTTATGAAGCTCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	126884	GCTCCAGCACTGAGCGAGACTCAAGCCTGCGCCGTGAGTTATGAAGCTCA	126933

AL606496.12	1501	GTGACGTCAAGAGTGTGCGGAGGGCCGGGGCTCCAGTTTCTCGCATCTGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	126934	GTGACGTCAAGAGTGTGCGGAGGGCCGGGGCTCCAGTTTCTCGCATCTGC	126983

AL606496.12	1551	TTAGTATGGCAAACGCAGGCTCCACACACCCTAACTCCACGTCAGTGCTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	126984	TTAGTATGGCAAACGCAGGCTCCACACACCCTAACTCCACGTCAGTGCTG	127033

AL606496.12	1601	CAGTAAGTCTCTCAGAGTCCTCAACCCTCCCGGATCTTCCAGAGAAGAGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	127034	CAGTAAGTCTCTCAGAGTCCTCAACCCTCCCGGATCTTCCAGAGAAGAGC	127083

AL606496.12	1651	GGGAATCTGACAGTACAAACACTGACTGGCACACTCCTGTATGTGCGCAC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	127084	GGGAATCTGACAGTACAAACACTGACTGGCACACTCCTGTATGTGCGCAC	127133

AL606496.12	1701	ATGGGCACATAGCATCAGTAAGTGTACCTTGAGAGTCAAGGGATTCTGTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	127134	ATGGGCACATAGCATCAGTAAGTGTACCTTGAGAGTCAAGGGATTCTGTG	127183

AL606496.12	1751	CCTATGACCAAAAATAAAGGATGCTCTTTGAGGGCTGGGAGGCTTTCCTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	127184	CCTATGACCAAAAATAAAGGATGCTCTTTGAGGGCTGGGAGGCTTTCCTG	127233

AL606496.12	1801	CCTTCCTCAATGATCATAGTGTTCTTAATATATTAAGTAAATTAAGATAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	127234	CCTTCCTCAATGATCATAGTGTTCTTAATATATTAAGTAAATTAAGATAG	127283

AL606496.12	1851	TTGGGATATATGAGACCTTATTTCAAATAAAATATTTTGTCTATACATGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	127284	TTGGGATATATGAGACCTTATTTCAAATAAAATATTTTGTCTATACATGT	127333

AL606496.12	1901	AAGATATATAAATATTATATTAAGTAATAACATATGAATGATTTATATTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	127334	AAGATATATAAATATTATATTAAGTAATAACATATGAATGATTTATATTG	127383

AL606496.12	1951	TAAGTATTATCATCCTAATTATAATGTTAAAGATAACTTAATGACCGCAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606764.19	127384	TAAGTATTATCATCCTAATTATAATGTTAAAGATAACTTAATGACCGCAA	127433

Overview

Query
AL606496.12 - 214870 bps
Hit
AL606764.19 - 127433 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link