<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL671965.6	1	GACACAAAGTGAAAATAAAATGACATTTTACAGAAATATTGAGACCGAGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	199991	GACACAAAGTGAAAATAAAATGACATTTTACAGAAATATTGAGACCGAGG	200040

AL671965.6	51	GCCATGCTATCAGAAAGTATGTGAGCACAGCAAATGTTTCAAAGCAGGAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	200041	GCCATGCTATCAGAAAGTATGTGAGCACAGCAAATGTTTCAAAGCAGGAG	200090

AL671965.6	101	ACCCCACCACCTCTTCTTTCATTATCATTTTCCTATGGGCTCCATACTTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	200091	ACCCCACCACCTCTTCTTTCATTATCATTTTCCTATGGGCTCCATACTTT	200140

AL671965.6	151	CCCAGGTACTGTACCTTTCAGATTGACATCTAGGATGGTCTGCCTGGGAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	200141	CCCAGGTACTGTACCTTTCAGATTGACATCTAGGATGGTCTGCCTGGGAA	200190

AL671965.6	201	TGACACCTGTGACATCAATGACAGCAGCAGTGTGGATGACAACAGAGATG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	200191	TGACACCTGTGACATCAATGACAGCAGCAGTGTGGATGACAACAGAGATG	200240

AL671965.6	251	CCCTGGCAGGCTCTCCTCAGGCACTGGGCATCCAGAATGTCTCCTTCCAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	200241	CCCTGGCAGGCTCTCCTCAGGCACTGGGCATCCAGAATGTCTCCTTCCAA	200290

AL671965.6	301	CACTGTCACCTTGGTCTTTGTCTGCAGCTCTGTGGACACAAAGCAGGTCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	200291	CACTGTCACCTTGGTCTTTGTCTGCAGCTCTGTGGACACAAAGCAGGTCC	200340

AL671965.6	351	CTGGGAAACTTTCTGCATGGGACGAATATTTCCTGACACATGTGTCAGTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	200341	CTGGGAAACTTTCTGCATGGGACGAATATTTCCTGACACATGTGTCAGTT	200390

AL671965.6	401	ACCTAGGCCTTCAAGGGCAGTCATGGTAAGAAGACAATAAGGAGGAGGCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	200391	ACCTAGGCCTTCAAGGGCAGTCATGGTAAGAAGACAATAAGGAGGAGGCT	200440

AL671965.6	451	TTTCTTCTGAAAGAAGCATAAACACTCAAAAATCAGAATGTAGCAGTTAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	200441	TTTCTTCTGAAAGAAGCATAAACACTCAAAAATCAGAATGTAGCAGTTAT	200490

AL671965.6	501	CAGGAATGAGGAAGCACCAATATCCACCACATCCCTTTGTACAAAATGCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	200491	CAGGAATGAGGAAGCACCAATATCCACCACATCCCTTTGTACAAAATGCA	200540

AL671965.6	551	TCTGAGCAGTAAGACGCCATTTCTGTTTTATACACAAACAGATTTATGGG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	200541	TCTGAGCAGTAAGACGCCATTTCTGTTTTATACACAAACAGATTTATGGG	200590

AL671965.6	601	AAATTCCTACATTCACTAAAGCAACTGGAGGAGTGGTGGCACAGATATGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	200591	AAATTCCTACATTCACTAAAGCAACTGGAGGAGTGGTGGCACAGATATGT	200640

AL671965.6	651	AAGGAGGGAGAATAGGACTCAGTTGATAGGGAATGGGGAAATCATGTGTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	200641	AAGGAGGGAGAATAGGACTCAGTTGATAGGGAATGGGGAAATCATGTGTG	200690

AL671965.6	701	GATTTGAAGGAGAAACAGGGTGATGGAGTTCTGTCTTGGGAAGCTATAAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	200691	GATTTGAAGGAGAAACAGGGTGATGGAGTTCTGTCTTGGGAAGCTATAAT	200740

AL671965.6	751	ATCAATCCGAGATTACAAACTGTGAAGGCATTGGGGAAATCTGAGCAAGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	200741	ATCAATCCGAGATTACAAACTGTGAAGGCATTGGGGAAATCTGAGCAAGG	200790

AL671965.6	801	AACATGCTAACAAGCTTGTGTCCTATGAACTTCCAGTGAGGAGGATTCAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	200791	AACATGCTAACAAGCTTGTGTCCTATGAACTTCCAGTGAGGAGGATTCAG	200840

AL671965.6	851	AAGAGGGAGACACAAAGATGGACATTCAGCCCTGCCCCTGATAGGTCTTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	200841	AAGAGGGAGACACAAAGATGGACATTCAGCCCTGCCCCTGATAGGTCTTG	200890

AL671965.6	901	ACACTTGGGTCTGTGCTGAGAACAAATGAAGAGTTAGCTGAATTACAGAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	200891	ACACTTGGGTCTGTGCTGAGAACAAATGAAGAGTTAGCTGAATTACAGAC	200940

AL671965.6	951	AGGGAAACAGATCCTCTGTGAGAGAACTATCTTTCAGCATACAGCAGGTA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	200941	AGGGAAACAGATCCTCTGTGAGAGAACTATCTTTCAGCATACAGCAGGTA	200990

AL671965.6	1001	CCAGAAGCATCCACTGATGCTGCATATGTCACCCCTTAAGAGACCCATGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	200991	CCAGAAGCATCCACTGATGCTGCATATGTCACCCCTTAAGAGACCCATGT	201040

AL671965.6	1051	TGCAGACAGGAAGCTGGGGCAGGGGATGCATAAATATCTTCAGCTTCTAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	201041	TGCAGACAGGAAGCTGGGGCAGGGGATGCATAAATATCTTCAGCTTCTAT	201090

AL671965.6	1101	GTAATCCACACAATGTGACTGATAATCCCTTATTCAGATGAATTATCTTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	201091	GTAATCCACACAATGTGACTGATAATCCCTTATTCAGATGAATTATCTTA	201140

AL671965.6	1151	CAAAAGAAGCATTGTGACACAGGCAATCTACACCAGTCTCTGGCACTGTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	201141	CAAAAGAAGCATTGTGACACAGGCAATCTACACCAGTCTCTGGCACTGTC	201190

AL671965.6	1201	CTCCTAGCTGAACACTGTTTTCTAAGGTCTCTGCAGGGTTATCTTGAGGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	201191	CTCCTAGCTGAACACTGTTTTCTAAGGTCTCTGCAGGGTTATCTTGAGGG	201240

AL671965.6	1251	TGTGAAGATAATGACACTAAAAACTGCACAGTCATTCCAGAGCTTACTCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	201241	TGTGAAGATAATGACACTAAAAACTGCACAGTCATTCCAGAGCTTACTCT	201290

AL671965.6	1301	TGCCCCAGGGGCAGCAATATCAGCAAAGAAGAATGCTGAGTTCCAGAAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	201291	TGCCCCAGGGGCAGCAATATCAGCAAAGAAGAATGCTGAGTTCCAGAAAA	201340

AL671965.6	1351	GTCTTCTGTCATTTCCTCTGTGAAGATGAAGGTCAGAGGGGAATGACGTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	201341	GTCTTCTGTCATTTCCTCTGTGAAGATGAAGGTCAGAGGGGAATGACGTT	201390

AL671965.6	1401	GGAGAATGGAGGTGAAGCATCTGTGGCCCTCCCCTGACTCAGCTCCCTAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	201391	GGAGAATGGAGGTGAAGCATCTGTGGCCCTCCCCTGACTCAGCTCCCTAA	201440

AL671965.6	1451	AATGCTCAGTATATGTTGTCTGACTCAGTTTCTCACTCTTTGCCCCTCTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	201441	AATGCTCAGTATATGTTGTCTGACTCAGTTTCTCACTCTTTGCCCCTCTC	201490

AL671965.6	1501	TGTCTCTCTTTCACTCACTGATTTCACTCTTCAACCTTCAACTCCACGGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	201491	TGTCTCTCTTTCACTCACTGATTTCACTCTTCAACCTTCAACTCCACGGG	201540

AL671965.6	1551	GGAGACTGTTGAATGACTTCCCTCTGCCAAACCACACTAGAAAAGGAACA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	201541	GGAGACTGTTGAATGACTTCCCTCTGCCAAACCACACTAGAAAAGGAACA	201590

AL671965.6	1601	AGCAACCATACCAAGTAGAAAAGACAGAGACCCTCTGCAGAGGCTGCAAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	201591	AGCAACCATACCAAGTAGAAAAGACAGAGACCCTCTGCAGAGGCTGCAAT	201640

AL671965.6	1651	CCAGCATCCTTGCTAATGCTGCAGAGCCCTAAACAAGTATATACTGATAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	201641	CCAGCATCCTTGCTAATGCTGCAGAGCCCTAAACAAGTATATACTGATAT	201690

AL671965.6	1701	TACTTTACAGGAAGAACACAACTGTGAGATTGCCAGATGGGAAGAAAGAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	201691	TACTTTACAGGAAGAACACAACTGTGAGATTGCCAGATGGGAAGAAAGAC	201740

AL671965.6	1751	AGTGTCTGGAACTCCAGCAGCTGGGTTTGTGGCCACCATCTCTAGATCAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	201741	AGTGTCTGGAACTCCAGCAGCTGGGTTTGTGGCCACCATCTCTAGATCAG	201790

AL671965.6	1801	ATACAAGACAGACTATAGTCCCACAACTGTGGTGTATTTTACGCTGTGTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	201791	ATACAAGACAGACTATAGTCCCACAACTGTGGTGTATTTTACGCTGTGTG	201840

AL671965.6	1851	ATCATGAATCTTCCAGATGTGTTCAAGCATGGAGAAGCCTTAAGTTCCAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	201841	ATCATGAATCTTCCAGATGTGTTCAAGCATGGAGAAGCCTTAAGTTCCAA	201890

AL671965.6	1901	GAGGGCTTCCATATTTGCTAGAAAAGATTCCCCCCAATGCTCAGTCAGTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	201891	GAGGGCTTCCATATTTGCTAGAAAAGATTCCCCCCAATGCTCAGTCAGTA	201940

AL671965.6	1951	CTCCCAACAGTCACACAAATAGAGACTCTGACCCACTTACTGGAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606755.7	201941	CTCCCAACAGTCACACAAATAGAGACTCTGACCCACTTACTGGAGAATTC	201990

Overview

Query
AL671965.6 - 43437 bps
Hit
AL606755.7 - 201990 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link