<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL606745.11	1	GAATTCTCATGCCTAGAAACTCTCCATTAGTTGGTTTGAAGCCAAATCCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	106300	GAATTCTCATGCCTAGAAACTCTCCATTAGTTGGTTTGAAGCCAAATCCT	106349

AL606745.11	51	GGAAAAGCATCCTTTTCTTACTGGATTCTTCATCTGTGATGAAGAAGCTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	106350	GGAAAAGCATCCTTTTCTTACTGGATTCTTCATCTGTGATGAAGAAGCTG	106399

AL606745.11	101	AATGCTGTAGAGGAAAATGGAGGGAATAGGGCTGTTGAGTATAGAGCACA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	106400	AATGCTGTAGAGGAAAATGGAGGGAATAGGGCTGTTGAGTATAGAGCACA	106449

AL606745.11	151	GAGAAGAATCCATTCTGCTCTCATTCAGGTTAGTTTATGACTAGTTTGGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	106450	GAGAAGAATCCATTCTGCTCTCATTCAGGTTAGTTTATGACTAGTTTGGT	106499

AL606745.11	201	TTTTTTCACACCCACCTTCAAGTATTCCAAATTCAACTCTTATTTCAATG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	106500	TTTTTTCACACCCACCTTCAAGTATTCCAAATTCAACTCTTATTTCAATG	106549

AL606745.11	251	TCTCAGACTTGGCAGGCTCCTGTAAAAGAAAATCAGCAACCCTTCGGACA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	106550	TCTCAGACTTGGCAGGCTCCTGTAAAAGAAAATCAGCAACCCTTCGGACA	106599

AL606745.11	301	GTGATTTTGTTTCAAGTTCATCGTGATTCACTTCGCCTACATCTTATAAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	106600	GTGATTTTGTTTCAAGTTCATCGTGATTCACTTCGCCTACATCTTATAAT	106649

AL606745.11	351	TATGCTTATCATGTGTCTTTGCTATAACAGACCTCCAGTTTAATGTCCCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	106650	TATGCTTATCATGTGTCTTTGCTATAACAGACCTCCAGTTTAATGTCCCA	106699

AL606745.11	401	GGTTCCACTACCCAGGCCCCTTTGCTAGGCCTTCTCAGGTCCTACTTTTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	106700	GGTTCCACTACCCAGGCCCCTTTGCTAGGCCTTCTCAGGTCCTACTTTTG	106749

AL606745.11	451	GCTTGTACCCTGTTCCATCTCCATGAGGCTAGTCTTCTGCTTTGGTATTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	106750	GCTTGTACCCTGTTCCATCTCCATGAGGCTAGTCTTCTGCTTTGGTATTC	106799

AL606745.11	501	TATTAAAGATTGCAAGACAGGAAAAAGTTACTGAATAAAATAAGCACTTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	106800	TATTAAAGATTGCAAGACAGGAAAAAGTTACTGAATAAAATAAGCACTTT	106849

AL606745.11	551	ACACATTTGCCCTGATCATGGGAAGAACTGAGCTAGTGGCTCCTACTGCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	106850	ACACATTTGCCCTGATCATGGGAAGAACTGAGCTAGTGGCTCCTACTGCT	106899

AL606745.11	601	GATCATTAAATGTCTTATTAGGAAGAGACTTTGATGGTGAGAATATAAGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	106900	GATCATTAAATGTCTTATTAGGAAGAGACTTTGATGGTGAGAATATAAGC	106949

AL606745.11	651	AATGAATACCAGAGATTTGTTCTAATTTTTTAAAAGTATGACTAAGACTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	106950	AATGAATACCAGAGATTTGTTCTAATTTTTTAAAAGTATGACTAAGACTA	106999

AL606745.11	701	CTTATGCAAAGACTACTGGTCTCATGCCATCCCTATCCTCTCCTTTGCAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	107000	CTTATGCAAAGACTACTGGTCTCATGCCATCCCTATCCTCTCCTTTGCAA	107049

AL606745.11	751	TGTGTGCTCAAACATGTGACATCATCTGATGTAAACAGAAGGAATTGATC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	107050	TGTGTGCTCAAACATGTGACATCATCTGATGTAAACAGAAGGAATTGATC	107099

AL606745.11	801	TATAAAAATTTAGAACATTTGCCTTAGACAGACTCATCTTAATCAATGGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	107100	TATAAAAATTTAGAACATTTGCCTTAGACAGACTCATCTTAATCAATGGA	107149

AL606745.11	851	ATTATGTTTTCTTTTTCAGGGGGCAGTACAGGTACTTCTCCAACCACCTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	107150	ATTATGTTTTCTTTTTCAGGGGGCAGTACAGGTACTTCTCCAACCACCTC	107199

AL606745.11	901	CAGCACTGGGACACCATCCCCTTCGGCTTCTTCTCATCTCTTATCTCCAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	107200	CAGCACTGGGACACCATCCCCTTCGGCTTCTTCTCATCTCTTATCTCCAT	107249

AL606745.11	951	CTTGTTCTCCTCCAACTTTTCATTTGGCCCCGAATACTTTCAATGTGGGC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	107250	CTTGTTCTCCTCCAACTTTTCATTTGGCCCCGAATACTTTCAATGTGGGC	107299

AL606745.11	1001	TGTCGAGAAAGCCAGCTGTGTAATCTAAACCTCTCTGATTATCCACCATG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	107300	TGTCGAGAAAGCCAGCTGTGTAATCTAAACCTCTCTGATTATCCACCATG	107349

AL606745.11	1051	TGCCCGAAGCAACATGGCTGCCTTACAGAGCTATCCAGGGCTGAGTGACA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	107350	TGCCCGAAGCAACATGGCTGCCTTACAGAGCTATCCAGGGCTGAGTGACA	107399

AL606745.11	1101	GTGGCTACAACCGGCTCCAGAGTGGCACAGCTTCAGCCACTCAGCCCTCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	107400	GTGGCTACAACCGGCTCCAGAGTGGCACAGCTTCAGCCACTCAGCCCTCT	107449

AL606745.11	1151	GAAACCTTCATGCCTCAGAGGACTCCATCTCTGATCTCAGGAATACCAAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	107450	GAAACCTTCATGCCTCAGAGGACTCCATCTCTGATCTCAGGAATACCAAC	107499

AL606745.11	1201	ACCTCCCTCGTTGCCCAGCAACAGCAAGATGGAAGCCTATGGTGGCCAGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	107500	ACCTCCCTCGTTGCCCAGCAACAGCAAGATGGAAGCCTATGGTGGCCAGT	107549

AL606745.11	1251	TGGGGTCCTTCCCCACTTCCCAGTTTCAGTATGTCATGCAGGCAGGCAAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	107550	TGGGGTCCTTCCCCACTTCCCAGTTTCAGTATGTCATGCAGGCAGGCAAT	107599

AL606745.11	1301	GCAGCCTCCAGTTCCTCATCGCCACACATGTTTGGTGGCAGCCACATGCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	107600	GCAGCCTCCAGTTCCTCATCGCCACACATGTTTGGTGGCAGCCACATGCA	107649

AL606745.11	1351	GCAGAGCTCCTATAATGCCTTCTCCCTCCATAATCCCTACAATCTGTATG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	107650	GCAGAGCTCCTATAATGCCTTCTCCCTCCATAATCCCTACAATCTGTATG	107699

AL606745.11	1401	GATACAATTTCCCCACTTCCCCCAGGCTAGCTGCAAGCCCAGAGAAACTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	107700	GATACAATTTCCCCACTTCCCCCAGGCTAGCTGCAAGCCCAGAGAAACTG	107749

AL606745.11	1451	AGCGCGTCTCAAAGCACTTTACTCTGTTCTTCTCCTTCTAATGGGGCCTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	107750	AGCGCGTCTCAAAGCACTTTACTCTGTTCTTCTCCTTCTAATGGGGCCTT	107799

AL606745.11	1501	TGGAGAGAGGCAGTACCTGCCTACAGGGATGGAGCATAGCATGCACATGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	107800	TGGAGAGAGGCAGTACCTGCCTACAGGGATGGAGCATAGCATGCACATGA	107849

AL606745.11	1551	TCAGCCCTTCAACTAATAATCAGCAGGCTACCAACACCTGTGATGGCCGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	107850	TCAGCCCTTCAACTAATAATCAGCAGGCTACCAACACCTGTGATGGCCGA	107899

AL606745.11	1601	CAGTATGGGGCAGTCCCAGGCTCTGCCTCTCAGATGTCCGTACACATGGT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	107900	CAGTATGGGGCAGTCCCAGGCTCTGCCTCTCAGATGTCCGTACACATGGT	107949

AL606745.11	1651	TTAAAGAGCAGTGCACACACTATCGAGGTGATGGCGGCCAAGACTCCAGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	107950	TTAAAGAGCAGTGCACACACTATCGAGGTGATGGCGGCCAAGACTCCAGA	107999

AL606745.11	1701	ATCTCTGTGGGTGGATCATCCTCCTTGGGAGGCATGTGCCTTGGGAAAAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	108000	ATCTCTGTGGGTGGATCATCCTCCTTGGGAGGCATGTGCCTTGGGAAAAT	108049

AL606745.11	1751	AGGAATTGTGTGTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTTTCTGGATAAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	108050	AGGAATTGTGTGTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTTTCTGGATAAG	108099

AL606745.11	1801	GAAAACAGAGAACAACAATAGATACCGCTGAAGGATCCTTGGAGTCCATC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	108100	GAAAACAGAGAACAACAATAGATACCGCTGAAGGATCCTTGGAGTCCATC	108149

AL606745.11	1851	ATCCATATCTCAGTGGTCATTCTTCTGCCTTCCAAAATCTTAGTTTTATA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	108150	ATCCATATCTCAGTGGTCATTCTTCTGCCTTCCAAAATCTTAGTTTTATA	108199

AL606745.11	1901	AAAGCATTGTGTATGACAGAGTGGCCTTGAAGAGACTGAATAATCATTTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	108200	AAAGCATTGTGTATGACAGAGTGGCCTTGAAGAGACTGAATAATCATTTT	108249

AL606745.11	1951	ATAATAATGTTGAAGGAAATGCTAGCATGTAGCAGCCAAGACAAGTTTTA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606747.13	108250	ATAATAATGTTGAAGGAAATGCTAGCATGTAGCAGCCAAGACAAGTTTTA	108299

Overview

Query
AL606745.11 - 192332 bps
Hit
AL606747.13 - 108299 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link