<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL583890.13	1	GAATTCCATGTTCTTGTCTTTTTTTTTTTAAATAGGTATTTCTTGTTTCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	190333	GAATTCCATGTTCTTGTCTTTTTTTTTTTAAATAGGTATTTCTTGTTTCT	190382

AL583890.13	51	GCATATTATTTGAATATCTCTTCTGATTATTTTGGTTAATTTAAATTCTA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	190383	GCATATTATTTGAATATCTCTTCTGATTATTTTGGTTAATTTAAATTCTA	190432

AL583890.13	101	CTGTTTTGAGAGTTTTATACATTGTAAGACCCCATGATTCTATTCCTGAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	190433	CTGTTTTGAGAGTTTTATACATTGTAAGACCCCATGATTCTATTCCTGAG	190482

AL583890.13	151	TTTGGGATCATGCCTTATTCAGTGTGGTGTTCTTAGTATTTACCACAGTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	190483	TTTGGGATCATGCCTTATTCAGTGTGGTGTTCTTAGTATTTACCACAGTG	190532

AL583890.13	201	CCTAGGATATGGTAAGGACTTGAGTGATAGGTATTGTATAAAAGCGTGAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	190533	CCTAGGATATGGTAAGGACTTGAGTGATAGGTATTGTATAAAAGCGTGAT	190582

AL583890.13	251	TTCCTCATACTGTCATGTCATTTTATATCATGTAGGAGCTTACATTTCTA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	190583	TTCCTCATACTGTCATGTCATTTTATATCATGTAGGAGCTTACATTTCTA	190632

AL583890.13	301	ATAAAATAGTATTGCTGTCTTAAAAAAAACCAAAACCAAACAAACAAAAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	190633	ATAAAATAGTATTGCTGTCTTAAAAAAAACCAAAACCAAACAAACAAAAA	190682

AL583890.13	351	CCCAAACAAACAAAAAAGACCCCATGATTCACCAAAGAGTGACACCCCTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	190683	CCCAAACAAACAAAAAAGACCCCATGATTCACCAAAGAGTGACACCCCTG	190732

AL583890.13	401	AAATCAAATAGTGTGTAAATGCAGAGTGTTTTATTCTGCAGAAGTCCAGC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	190733	AAATCAAATAGTGTGTAAATGCAGAGTGTTTTATTCTGCAGAAGTCCAGC	190782

AL583890.13	451	ATACTGGGGTTTTTCATTACCAAGATAGAGAGACAACCAAGTGAGCTTGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	190783	ATACTGGGGTTTTTCATTACCAAGATAGAGAGACAACCAAGTGAGCTTGA	190832

AL583890.13	501	AGGCCTGACTTAATGCACATTAGGGGATTCCAGGTCCCTCTCTACAGACA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	190833	AGGCCTGACTTAATGCACATTAGGGGATTCCAGGTCCCTCTCTACAGACA	190882

AL583890.13	551	TTCTAGAACTATTACCATGGGTAGAAACTGTTGCCAGGAAATCTGGAAAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	190883	TTCTAGAACTATTACCATGGGTAGAAACTGTTGCCAGGAAATCTGGAAAT	190932

AL583890.13	601	TGCTGCTGACCCATTGTCCTTGCCTCAGGCCAGGAGATGGGCAGACTTGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	190933	TGCTGCTGACCCATTGTCCTTGCCTCAGGCCAGGAGATGGGCAGACTTGC	190982

AL583890.13	651	CTGGACTTACCAAGTCCTGAATTGTCAATTTGAAGCCTGTCATGGAGTCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	190983	CTGGACTTACCAAGTCCTGAATTGTCAATTTGAAGCCTGTCATGGAGTCA	191032

AL583890.13	701	GCCTATCCTTCTCAACATGAGTAGTGTGTTGTTCTAGCCCTCCCTCCCTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	191033	GCCTATCCTTCTCAACATGAGTAGTGTGTTGTTCTAGCCCTCCCTCCCTT	191082

AL583890.13	751	TCTTGCATCTCCCATGACTCCCTTTCAAATTCATTATCCTTTCTTCTTTA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	191083	TCTTGCATCTCCCATGACTCCCTTTCAAATTCATTATCCTTTCTTCTTTA	191132

AL583890.13	801	TTATTATATAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	191133	TTATTATATAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTTG	191182

AL583890.13	851	GTATAAGCATTTTCAATTGAATAAAATATCCATTTTTTTTCTTTCCTGGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	191183	GTATAAGCATTTTCAATTGAATAAAATATCCATTTTTTTTCTTTCCTGGT	191232

AL583890.13	901	GACCACCGATTCTCCATCTCTCTGAAGCCTGTACAGATATCTCTGTATCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	191233	GACCACCGATTCTCCATCTCTCTGAAGCCTGTACAGATATCTCTGTATCT	191282

AL583890.13	951	GTACTGGCTTGTTAGATTACTTCCATCCACATGGCAAATGATTTAATTTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	191283	GTACTGGCTTGTTAGATTACTTCCATCCACATGGCAAATGATTTAATTTG	191332

AL583890.13	1001	TCACACACATGTTGCTGTTATGCAGGTTTTGTTTAGGCAACCACATGTTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	191333	TCACACACATGTTGCTGTTATGCAGGTTTTGTTTAGGCAACCACATGTTG	191382

AL583890.13	1051	AGATTTGATGGATGCATACCCTGCCATGTGTAGAAGACACCACGTAGCAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	191383	AGATTTGATGGATGCATACCCTGCCATGTGTAGAAGACACCACGTAGCAA	191432

AL583890.13	1101	TAGCTGGTGGTCACCTGGTCTGGTCACCTGGTCTTAACAATCTTTCGGCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	191433	TAGCTGGTGGTCACCTGGTCTGGTCACCTGGTCTTAACAATCTTTCGGCT	191482

AL583890.13	1151	CCCTCTTTAGGGATGTTCTCTGAGCCACAGGTACAGTAGCTTATTGTAAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	191483	CCCTCTTTAGGGATGTTCTCTGAGCCACAGGTACAGTAGCTTATTGTAAA	191532

AL583890.13	1201	TGTACCAACTGGGACTGGGCACCCCATGGTAGTTTATTCTCTATGTATAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	191533	TGTACCAACTGGGACTGGGCACCCCATGGTAGTTTATTCTCTATGTATAT	191582

AL583890.13	1251	GTAGTAACCCCTTGATGTTTTAATCTCTACTATGTCTTAAGTTCTAGAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	191583	GTAGTAACCCCTTGATGTTTTAATCTCTACTATGTCTTAAGTTCTAGAAA	191632

AL583890.13	1301	AGTTTCCTTGGGCCATACATTGTAATTATTTATTTACAATAAAATCTGTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	191633	AGTTTCCTTGGGCCATACATTGTAATTATTTATTTACAATAAAATCTGTG	191682

AL583890.13	1351	TATTAATTTGAGTTTCTAAAAGGGAATTTTGTTTTTGATTCAGCATCTCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	191683	TATTAATTTGAGTTTCTAAAAGGGAATTTTGTTTTTGATTCAGCATCTCT	191732

AL583890.13	1401	TTCTGAGTTCAGTATGTTTTCCTTCAAATATAGTTTTGTGTTTGTTTATT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	191733	TTCTGAGTTCAGTATGTTTTCCTTCAAATATAGTTTTGTGTTTGTTTATT	191782

AL583890.13	1451	GTATTGTGTTAATGGGAAAACTAAATATTAAGACAGATGAAATAAGAACA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	191783	GTATTGTGTTAATGGGAAAACTAAATATTAAGACAGATGAAATAAGAACA	191832

AL583890.13	1501	AAGACCCAACTGTAGTCTGAACAAAGGAGATGAGTAGCAAAAGTGACAGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	191833	AAGACCCAACTGTAGTCTGAACAAAGGAGATGAGTAGCAAAAGTGACAGA	191882

AL583890.13	1551	ACATGTGCACAGGCATGCTGCTCACATGTGCATGCAATCTCTCTCTCTCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	191883	ACATGTGCACAGGCATGCTGCTCACATGTGCATGCAATCTCTCTCTCTCT	191932

AL583890.13	1601	CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACACACACACACA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	191933	CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACACACACACACA	191982

AL583890.13	1651	CACACACACACACACACACTTAAAAATAAATCCTAAAAATATTCTTGAAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	191983	CACACACACACACACACACTTAAAAATAAATCCTAAAAATATTCTTGAAA	192032

AL583890.13	1701	AAGAAAAAAGAAGAAGCACTAGGAAGCTGCAGGCAGAGCTTAAGGGTTCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	192033	AAGAAAAAAGAAGAAGCACTAGGAAGCTGCAGGCAGAGCTTAAGGGTTCC	192082

AL583890.13	1751	TTCTGCTGGGACTTTTGAAAGGCCAGAATGCTCACAGAAACAAAAACAGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	192083	TTCTGCTGGGACTTTTGAAAGGCCAGAATGCTCACAGAAACAAAAACAGT	192132

AL583890.13	1801	ACAAGAAAGTTTTACTGCCATTTCAGAGGAAAGCAAGTACTCTATCGGGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	192133	ACAAGAAAGTTTTACTGCCATTTCAGAGGAAAGCAAGTACTCTATCGGGA	192182

AL583890.13	1851	ATTGAGCTAGAGGCTATTCATGGTATACTCTGGCAAAGAACCTGGCTACA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	192183	ATTGAGCTAGAGGCTATTCATGGTATACTCTGGCAAAGAACCTGGCTACA	192232

AL583890.13	1901	TTTCATCCATGTTTTGAAATTTTGATTGAGGTTTAACTAGTAAGTAATGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	192233	TTTCATCCATGTTTTGAAATTTTGATTGAGGTTTAACTAGTAAGTAATGG	192282

AL583890.13	1951	ACTGCATTTGGCATAGAAAATTTCAAGACAGCATCACATTCAGAATGTGG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606745.11	192283	ACTGCATTTGGCATAGAAAATTTCAAGACAGCATCACATTCAGAATGTGG	192332

Overview

Query
AL583890.13 - 122919 bps
Hit
AL606745.11 - 192332 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link