<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL589871.13	1	GAATTCTTTATATATTTTGGATGTTAACCCTCTATCAGATATAGGATTAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	49023	GAATTCTTTATATATTTTGGATGTTAACCCTCTATCAGATATAGGATTAG	49072

AL589871.13	51	TGAAGATATTTTTCTCCAATCTGTAGGTTGCCAATTTGTCCTATTGACTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	49073	TGAAGATATTTTTCTCCAATCTGTAGGTTGCCAATTTGTCCTATTGACTG	49122

AL589871.13	101	TGTCTTCTGTCTTACAGAAGCTTTTCAGTTTCATGAGGTCCCATTTATCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	49123	TGTCTTCTGTCTTACAGAAGCTTTTCAGTTTCATGAGGTCCCATTTATCA	49172

AL589871.13	151	AGTGTTGATCTTAGACCTTGAGCAATTAGTGTTCTGTTCTGGAAATTTCC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	49173	AGTGTTGATCTTAGACCTTGAGCAATTAGTGTTCTGTTCTGGAAATTTCC	49222

AL589871.13	201	CACTTTTTCTATTAGATTCAATGAATCTGGTTTTACATTGAGATCCTTGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	49223	CACTTTTTCTATTAGATTCAATGAATCTGGTTTTACATTGAGATCCTTGA	49272

AL589871.13	251	TTCATGTGAACTTGAGCTTTGTGCAGGGTCATAAATATGTATCTATTTTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	49273	TTCATGTGAACTTGAGCTTTGTGCAGGGTCATAAATATGTATCTATTTTC	49322

AL589871.13	301	ATTCTTCTACATACAAACACCAAGTTAGACCAGCACCATTTATTGAAGAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	49323	ATTCTTCTACATACAAACACCAAGTTAGACCAGCACCATTTATTGAAGAC	49372

AL589871.13	351	ACTTTCTTTTTTTCCACTGTATGGTTTTAGTTTCTTTGTTAAAGATCAAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	49373	ACTTTCTTTTTTTCCACTGTATGGTTTTAGTTTCTTTGTTAAAGATCAAG	49422

AL589871.13	401	TGACCATAGATATGTGGGTTTATTTCTGGGTCTTCAATTTTATTCCATTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	49423	TGACCATAGATATGTGGGTTTATTTCTGGGTCTTCAATTTTATTCCATTG	49472

AL589871.13	451	ATCAACATGTCTGTCTCTGTACGAATACCATGCAATCTTTATCGCTACTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	49473	ATCAACATGTCTGTCTCTGTACGAATACCATGCAATCTTTATCGCTACTG	49522

AL589871.13	501	CTTTGTAGTACAGCTTGAGGTCAGGAATGATGATTCCCCCAGATGTTCTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	49523	CTTTGTAGTACAGCTTGAGGTCAGGAATGATGATTCCCCCAGATGTTCTT	49572

AL589871.13	551	TTACTATGGTGAATGACAGATTTTGATGTGTTCTTGAATTTGGTTTGTGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	49573	TTACTATGGTGAATGACAGATTTTGATGTGTTCTTGAATTTGGTTTGTGA	49622

AL589871.13	601	GAATTTTATTGAGTACTTTTGCATTATTGGTGAAATTGGCCTGAAGTTCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	49623	GAATTTTATTGAGTACTTTTGCATTATTGGTGAAATTGGCCTGAAGTTCT	49672

AL589871.13	651	CTTTCTTGGTTGGGTCTTTATGTGGTTGAGGTATAAGTGTAACTGTGGCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	49673	CTTTCTTGGTTGGGTCTTTATGTGGTTGAGGTATAAGTGTAACTGTGGCT	49722

AL589871.13	701	TCAAATAATAAATTAGGTAGTGTTCCTTTTGATTCTATTTTGTGGAATAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	49723	TCAAATAATAAATTAGGTAGTGTTCCTTTTGATTCTATTTTGTGGAATAG	49772

AL589871.13	751	TTTGAGAAGTATTGGTATTAGGTCTTCTGTGAAGGTCTAGTAGAATTCCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	49773	TTTGAGAAGTATTGGTATTAGGTCTTCTGTGAAGGTCTAGTAGAATTCCT	49822

AL589871.13	801	CACTAAAATCATCTGGCCTTGGCATTTTATTGGTTGGGAGGTTTGTAATG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	49823	CACTAAAATCATCTGGCCTTGGCATTTTATTGGTTGGGAGGTTTGTAATG	49872

AL589871.13	851	TTTGTGTCTACTTCCTTAGGGGTTATAGGACTGTTTAGTTTACCTGATCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	49873	TTTGTGTCTACTTCCTTAGGGGTTATAGGACTGTTTAGTTTACCTGATCT	49922

AL589871.13	901	TGATTTAACTTTGGTATGTGGTATCTGTCTAAAAAAAAAAAAAAAACAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	49923	TGATTTAACTTTGGTATGTGGTATCTGTCTAAAAAAAAAAAAAAAACAAA	49972

AL589871.13	951	AAAAACCCCATCAGTTTCATATAGATTTTCCAGTTTTGTTGAATGTAGGC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	49973	AAAAACCCCATCAGTTTCATATAGATTTTCCAGTTTTGTTGAATGTAGGC	50022

AL589871.13	1001	TTTCATAGTAGGTTCTGATTTTTTTTTAAATTGATTTAGTTACTGTTGTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	50023	TTTCATAGTAGGTTCTGATTTTTTTTTAAATTGATTTAGTTACTGTTGTA	50072

AL589871.13	1051	ATGTTTCCCTTTTCATTTCTGATTTTTATTAATTTGGATACTGTCTCTGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	50073	ATGTTTCCCTTTTCATTTCTGATTTTTATTAATTTGGATACTGTCTCTGT	50122

AL589871.13	1101	GCCCTTTAGTTAGTTTGGCTAGAGGTTTGTCTATCTTGTTAATTTTCTCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	50123	GCCCTTTAGTTAGTTTGGCTAGAGGTTTGTCTATCTTGTTAATTTTCTCA	50172

AL589871.13	1151	AAGAACCAGCTCTTGGTTTTGTTGATTCTTTGTATCACTCTCTTTGCTTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	50173	AAGAACCAGCTCTTGGTTTTGTTGATTCTTTGTATCACTCTCTTTGCTTC	50222

AL589871.13	1201	TAACTGGTTGATTTTGACCTAGAGTTTGACTATTTCTTGCTTGTCTTTGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	50223	TAACTGGTTGATTTTGACCTAGAGTTTGACTATTTCTTGCTTGTCTTTGT	50272

AL589871.13	1251	TACTGTCTTATATGCAACAAAATGCTAGATCCTGTTTATTTATCCAGTCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	50273	TACTGTCTTATATGCAACAAAATGCTAGATCCTGTTTATTTATCCAGTCT	50322

AL589871.13	1301	GTTACCCTGTGTCTTTTTATTGTAGGAATTGAGTCCATTGATGATGAGAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	50323	GTTACCCTGTGTCTTTTTATTGTAGGAATTGAGTCCATTGATGATGAGAG	50372

AL589871.13	1351	ATATTAAAGAGAGATGATTGTTCATTCCTGATATTTTTTGTTGCTGGAGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	50373	ATATTAAAGAGAGATGATTGTTCATTCCTGATATTTTTTGTTGCTGGAGG	50422

AL589871.13	1401	TTGTATTATGTGTATGTGATTGTCTTCTTTTGGACTTGTTGTGAGATGTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	50423	TTGTATTATGTGTATGTGATTGTCTTCTTTTGGACTTGTTGTGAGATGTT	50472

AL589871.13	1451	TAATTTCTCCTGCTTTCTTAGGTGTAGTTACCCTCCTTGTGTTGGAGTTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	50473	TAATTTCTCCTGCTTTCTTAGGTGTAGTTACCCTCCTTGTGTTGGAGTTT	50522

AL589871.13	1501	TCCTTCCAGTGTCGTCTGTAGAGTTGGATTAGTAGAACAATATTGTTTAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	50523	TCCTTCCAGTGTCGTCTGTAGAGTTGGATTAGTAGAACAATATTGTTTAA	50572

AL589871.13	1551	ATTTGGTTTTGTCATGGGATATCTTGGTTTCTCCATTATGGTGATTGAGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	50573	ATTTGGTTTTGTCATGGGATATCTTGGTTTCTCCATTATGGTGATTGAGA	50622

AL589871.13	1601	GGTTTGTTGGGTGTAGTATCCTGGGCTGGCATTTGTGTTCTCTTTGGGTC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	50623	GGTTTGTTGGGTGTAGTATCCTGGGCTGGCATTTGTGTTCTCTTTGGGTC	50672

AL589871.13	1651	TGGATGGCATCTGTCCAGGATCTTCTGGCTTTTAGAGTCTCTTTTGAGAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	50673	TGGATGGCATCTGTCCAGGATCTTCTGGCTTTTAGAGTCTCTTTTGAGAT	50722

AL589871.13	1701	GTCTGGTGTAATTTTGACAGGTCTGTCTTTATATGTTACTTGGCCTTTTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	50723	GTCTGGTGTAATTTTGACAGGTCTGTCTTTATATGTTACTTGGCCTTTTT	50772

AL589871.13	1751	CACTTACAGCTTTTAATATTCTTTCTTTGTTCTGTGCATTTAGTGTTTTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	50773	CACTTACAGCTTTTAATATTCTTTCTTTGTTCTGTGCATTTAGTGTTTTA	50822

AL589871.13	1801	ATTATTATATTACAAGAGTATTTTCTTTTACGGTTCAATCTACTTGGTGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	50823	ATTATTATATTACAAGAGTATTTTCTTTTACGGTTCAATCTACTTGGTGT	50872

AL589871.13	1851	TCTATAGGCTTCTTGTACATTTATGGCCATTTCTTTATTTAAGTTAAGGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	50873	TCTATAGGCTTCTTGTACATTTATGGCCATTTCTTTATTTAAGTTAAGGA	50922

AL589871.13	1901	AGTTTTCTTCTATATTTTTGTTGAAGATGTGTTCTAGCCCTTTGAGCTGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	50923	AGTTTTCTTCTATATTTTTGTTGAAGATGTGTTCTAGCCCTTTGAGCTGG	50972

AL589871.13	1951	GAATCATCACCATCTTCTATTCCTATTTTTCATAGGTTTGATCTTTTCAT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606533.4	50973	GAATCATCACCATCTTCTATTCCTATTTTTCATAGGTTTGATCTTTTCAT	51022

Overview

Query
AL589871.13 - 217643 bps
Hit
AL606533.4 - 51022 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link