<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645662.8	1	TCCATAAGTGCAGTGTAATATGCTATAACCATCTTAAACAACACAGCCTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	185349	TCCATAAGTGCAGTGTAATATGCTATAACCATCTTAAACAACACAGCCTT	185398

AL645662.8	51	CTTTACAGGGAGTAAATCAAACTTTTAAATAGTTTTCTGGTATGTCCAAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	185399	CTTTACAGGGAGTAAATCAAACTTTTAAATAGTTTTCTGGTATGTCCAAT	185448

AL645662.8	101	CAGGCAAAACGCAAAATTCCCTCAGAGTGGAGTTAACCAGTCATAGCATC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	185449	CAGGCAAAACGCAAAATTCCCTCAGAGTGGAGTTAACCAGTCATAGCATC	185498

AL645662.8	151	TTTCATTTTAATGCTCCACCGCAAATTTCATATCTTCAATTCGAGCAGTA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	185499	TTTCATTTTAATGCTCCACCGCAAATTTCATATCTTCAATTCGAGCAGTA	185548

AL645662.8	201	TTCACTCTCAGGATAGTCAGATATTTGAAAGTTTGGAGTTTGTAAGACAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	185549	TTCACTCTCAGGATAGTCAGATATTTGAAAGTTTGGAGTTTGTAAGACAG	185598

AL645662.8	251	AAGTGTCATTCATAGTGAGAGATTACAGTCCTAGAAACTTGTGGTATGAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	185599	AAGTGTCATTCATAGTGAGAGATTACAGTCCTAGAAACTTGTGGTATGAA	185648

AL645662.8	301	CCACAGAACTAAGGAGAAACTTCAGCTCTACTAGTCAAATGTGCTGCAGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	185649	CCACAGAACTAAGGAGAAACTTCAGCTCTACTAGTCAAATGTGCTGCAGC	185698

AL645662.8	351	ACAGCTCTGCTCCACAGTGAGCATTCCTAACAAAAGAAGATGATAGGATA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	185699	ACAGCTCTGCTCCACAGTGAGCATTCCTAACAAAAGAAGATGATAGGATA	185748

AL645662.8	401	CAGATCGTCATGGACTTCATAGGTGCTGGTTCTGCAGAAATATGATGCAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	185749	CAGATCGTCATGGACTTCATAGGTGCTGGTTCTGCAGAAATATGATGCAT	185798

AL645662.8	451	ATTATTGTTTGAAAGAGCTAAGAATGACTCAATTCAAAAGAACATATCTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	185799	ATTATTGTTTGAAAGAGCTAAGAATGACTCAATTCAAAAGAACATATCTG	185848

AL645662.8	501	CCATCAATAGAGACATCTTTGAGAACACAACATAGCTGGTGTATTTCTCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	185849	CCATCAATAGAGACATCTTTGAGAACACAACATAGCTGGTGTATTTCTCT	185898

AL645662.8	551	TACACCTACATTGTTAAAATCTGTTGCCCCATACCTATTATCATGGTGGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	185899	TACACCTACATTGTTAAAATCTGTTGCCCCATACCTATTATCATGGTGGC	185948

AL645662.8	601	CCCCAAATAAAGATAGGATTGAGTCTTTTCTACAGGGAAGGTATCTCCCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	185949	CCCCAAATAAAGATAGGATTGAGTCTTTTCTACAGGGAAGGTATCTCCCT	185998

AL645662.8	651	GCCTTTGTCCCTAAACTGAATGCCCTCCTGGGCAGTGTCCTCTTGGCTTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	185999	GCCTTTGTCCCTAAACTGAATGCCCTCCTGGGCAGTGTCCTCTTGGCTTC	186048

AL645662.8	701	TGTTTCCATCATCTTTCTTCTCAGCATCCACTGTTTCAATGTGATGATCC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	186049	TGTTTCCATCATCTTTCTTCTCAGCATCCACTGTTTCAATGTGATGATCC	186098

AL645662.8	751	AAGCCCAGCAACCCTGGAGCCGCAGTGATTTTATTTATCCCACATCCTAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	186099	AAGCCCAGCAACCCTGGAGCCGCAGTGATTTTATTTATCCCACATCCTAT	186148

AL645662.8	801	CCAGTACCCTAAAAAATTCGTGAAAGAATTTGCCTTAGAGAGACAGAACA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	186149	CCAGTACCCTAAAAAATTCGTGAAAGAATTTGCCTTAGAGAGACAGAACA	186198

AL645662.8	851	CCAATGCACAGTGACTGCCCAAACCTAGCTGCCTGTTACTTATGCTGAAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	186199	CCAATGCACAGTGACTGCCCAAACCTAGCTGCCTGTTACTTATGCTGAAA	186248

AL645662.8	901	AAGGTCTATAGCTGATGGTTCAGTTCAAATCATGAAGATTGTAGAGAGAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	186249	AAGGTCTATAGCTGATGGTTCAGTTCAAATCATGAAGATTGTAGAGAGAT	186298

AL645662.8	951	CCTATTTGCAGTTCCTGAGTTTCTTGTTTTCCTACCCAAATTCCATCCTA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	186299	CCTATTTGCAGTTCCTGAGTTTCTTGTTTTCCTACCCAAATTCCATCCTA	186348

AL645662.8	1001	TTGTATAATTACATGATTTCTACCAGGAATGAAATCTTTGTGACATAGAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	186349	TTGTATAATTACATGATTTCTACCAGGAATGAAATCTTTGTGACATAGAT	186398

AL645662.8	1051	AAACTAAATTCCTTTTTGACATTTAAGATAATCAACATTGAATCCTTATA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	186399	AAACTAAATTCCTTTTTGACATTTAAGATAATCAACATTGAATCCTTATA	186448

AL645662.8	1101	CATTTTCCTAAGCTTAAGGTTTCTGCACAGAGGATAGTTTCACTTCCTTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	186449	CATTTTCCTAAGCTTAAGGTTTCTGCACAGAGGATAGTTTCACTTCCTTG	186498

AL645662.8	1151	ACAGGCTCACATAGCTGTCTATCAACATACCAAAGATGGACTCTGTCGTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	186499	ACAGGCTCACATAGCTGTCTATCAACATACCAAAGATGGACTCTGTCGTG	186548

AL645662.8	1201	GCCCAGAGGCTGTATCTCTTCACTCATTAGCTCAAAATTTGATAGTGCCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	186549	GCCCAGAGGCTGTATCTCTTCACTCATTAGCTCAAAATTTGATAGTGCCA	186598

AL645662.8	1251	AATTCAAATTTTTACATATCTGATTATTTTTAAATTAGCCCAAAGCAAGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	186599	AATTCAAATTTTTACATATCTGATTATTTTTAAATTAGCCCAAAGCAAGC	186648

AL645662.8	1301	ATATTTTTTCACCAGTCAGAGTCTGCCTGCTTGCATGCCATACACAACCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	186649	ATATTTTTTCACCAGTCAGAGTCTGCCTGCTTGCATGCCATACACAACCT	186698

AL645662.8	1351	CATTCTGACAATGTTTAAGCCACTAAAAAATATATATATCTTTGCAGTCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	186699	CATTCTGACAATGTTTAAGCCACTAAAAAATATATATATCTTTGCAGTCA	186748

AL645662.8	1401	CAAGTCTCCCAGCTGTGCTTCTTTGGGGAGCCTCCTTACCCAGGGACGCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	186749	CAAGTCTCCCAGCTGTGCTTCTTTGGGGAGCCTCCTTACCCAGGGACGCC	186798

AL645662.8	1451	CTACCATGAGCTATGATTTGAGTGCAGTTCAAGTTTTCCTCAGGAGCCAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	186799	CTACCATGAGCTATGATTTGAGTGCAGTTCAAGTTTTCCTCAGGAGCCAC	186848

AL645662.8	1501	TAGATTTAGTCTTTAGTGTAGCACCAATGGGTGAGGTTTATTGGGAGTTA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	186849	TAGATTTAGTCTTTAGTGTAGCACCAATGGGTGAGGTTTATTGGGAGTTA	186898

AL645662.8	1551	CTATGATCACAGGAGTTATGCCATCCTCCGAATGATCTTCTTGCTCCATG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	186899	CTATGATCACAGGAGTTATGCCATCCTCCGAATGATCTTCTTGCTCCATG	186948

AL645662.8	1601	ACCCAAACTGCGGCCACTTATTCCACCATGAGTGTCACCATTTACTATTC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	186949	ACCCAAACTGCGGCCACTTATTCCACCATGAGTGTCACCATTTACTATTC	186998

AL645662.8	1651	CTGATGGACTCCTATCTTGAGCCAGAACCTATACTACACTGTTTGGAACT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	186999	CTGATGGACTCCTATCTTGAGCCAGAACCTATACTACACTGTTTGGAACT	187048

AL645662.8	1701	TGAGTCTTTAAAGCTGGGAGCTAAATAAAGCTTGTTTTCATGAGTAATAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	187049	TGAGTCTTTAAAGCTGGGAGCTAAATAAAGCTTGTTTTCATGAGTAATAT	187098

AL645662.8	1751	GTATCTGGTATTTTGTCACAGTTTGATGCATAGCTGAAAACTACAGCCAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	187099	GTATCTGGTATTTTGTCACAGTTTGATGCATAGCTGAAAACTACAGCCAT	187148

AL645662.8	1801	CTAGAGCCTTGTCGGGTTGCCCTTGCCCCTCCCAGAGGGCATGCTGAGAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	187149	CTAGAGCCTTGTCGGGTTGCCCTTGCCCCTCCCAGAGGGCATGCTGAGAA	187198

AL645662.8	1851	TGGATCCCTCCTGGCACCCCTAGGCAAAGGCTACTCAGCAAAGCTAAGCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	187199	TGGATCCCTCCTGGCACCCCTAGGCAAAGGCTACTCAGCAAAGCTAAGCA	187248

AL645662.8	1901	TGCACTGTAGCCTCTTAGGATCTTAGCTGTCTTCTTGGCTTTCTCCTGAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	187249	TGCACTGTAGCCTCTTAGGATCTTAGCTGTCTTCTTGGCTTTCTCCTGAG	187298

AL645662.8	1951	ATCCGACTCAATGCAAAGAAAGCACCAGACTCTGAAATGGGAAGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606525.7	187299	ATCCGACTCAATGCAAAGAAAGCACCAGACTCTGAAATGGGAAGGAATTC	187348

Overview

Query
AL645662.8 - 15603 bps
Hit
AL606525.7 - 187348 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link