<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL646015.8	1	GATTCCCAGCAACCACATGGTGGCTAACAACCATCTGTAATGAGATATGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	152686	GATTCCCAGCAACCACATGGTGGCTAACAACCATCTGTAATGAGATATGA	152735

AL646015.8	51	TAGTGTACTCACATTAAAAAAATTATTTCAGGGAAAAACTTACTGAACAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	152736	TAGTGTACTCACATTAAAAAAATTATTTCAGGGAAAAACTTACTGAACAG	152785

AL646015.8	101	AATACCAATGGCTCAGGCTTAAAATCAACAATTGATACATTCAAGACCTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	152786	AATACCAATGGCTCAGGCTTAAAATCAACAATTGATACATTCAAGACCTC	152835

AL646015.8	151	TTGAAACTGAAAAGCTTTTATAAGGCAAAGGACACTGTAATAGGACAAAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	152836	TTGAAACTGAAAAGCTTTTATAAGGCAAAGGACACTGTAATAGGACAAAA	152885

AL646015.8	201	CAGCAACCTACAGACTGGGGAAAGAGTTTCACTAACCCTATATCCCATAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	152886	CAGCAACCTACAGACTGGGGAAAGAGTTTCACTAACCCTATATCCCATAG	152935

AL646015.8	251	ACAGCTATTATACAAAATATATACAGAATTTAAGACTGTAGACTCTAAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	152936	ACAGCTATTATACAAAATATATACAGAATTTAAGACTGTAGACTCTAAAA	152985

AL646015.8	301	AAAAACAAAACAAAAATCCAAAAAAAAAAAAAACCAAATATAGGGTACAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	152986	AAAAACAAAACAAAAATCCAAAAAAAAAAAAAACCAAATATAGGGTACAG	153035

AL646015.8	351	AGTTAAAAAGAGAATTCTCAACTGAGGAATATATCAAATGGCCAGGAAGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	153036	AGTTAAAAAGAGAATTCTCAACTGAGGAATATATCAAATGGCCAGGAAGA	153085

AL646015.8	401	ACTTAAAGAAATGCTCAACATTCTTAGTCATCAGGGAAATGCAAATCCAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	153086	ACTTAAAGAAATGCTCAACATTCTTAGTCATCAGGGAAATGCAAATCCAA	153135

AL646015.8	451	ACAACCCAAAGATTTCACCTCACACCAATTAGAAAGTCTAAGATAAAAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	153136	ACAACCCAAAGATTTCACCTCACACCAATTAGAAAGTCTAAGATAAAAAA	153185

AL646015.8	501	CTCAAGTGATAGTACATGCTGGAGAGGATGTGGAGAAAAAGGCACACTCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	153186	CTCAAGTGATAGTACATGCTGGAGAGGATGTGGAGAAAAAGGCACACTCC	153235

AL646015.8	551	TCCACTACTGCTGGTTTTGCAAACTGGTACAACCATTCTGAAACTCAATC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	153236	TCCACTACTGCTGGTTTTGCAAACTGGTACAACCATTCTGAAACTCAATC	153285

AL646015.8	601	TGGCACTTCCTCAGAAAACTGGAAATAGTTCTATCTGAAGATCCAGTGAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	153286	TGGCACTTCCTCAGAAAACTGGAAATAGTTCTATCTGAAGATCCAGTGAA	153335

AL646015.8	651	TACATTCCTGGCCATATACCCAGAAGATGCTCCATACCACAAGGACATGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	153336	TACATTCCTGGCCATATACCCAGAAGATGCTCCATACCACAAGGACATGT	153385

AL646015.8	701	GCTCCACCATGTTCATAGCAGTCTAATCTGTAATAACCAGAAACTGGAAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	153386	GCTCCACCATGTTCATAGCAGTCTAATCTGTAATAACCAGAAACTGGAAG	153435

AL646015.8	751	CAACCCAGATGTCCCTCAACTGAAGAATGGATGCAGAAAATGTGGTTCAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	153436	CAACCCAGATGTCCCTCAACTGAAGAATGGATGCAGAAAATGTGGTTCAT	153485

AL646015.8	801	TTACACGGTGGAATACTATTCAGCTATTAAAAGCGAACACATCATGAATT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	153486	TTACACGGTGGAATACTATTCAGCTATTAAAAGCGAACACATCATGAATT	153535

AL646015.8	851	TTGCAAGCAAATGGATGGAAGTAGAAAATATCATCCTGAGTGAGGCAACC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	153536	TTGCAAGCAAATGGATGGAAGTAGAAAATATCATCCTGAGTGAGGCAACC	153585

AL646015.8	901	CAGATCCAAAAGCACGTGCATGGTATTGGTATGCACTCATTGATAAGTGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	153586	CAGATCCAAAAGCACGTGCATGGTATTGGTATGCACTCATTGATAAGTGG	153635

AL646015.8	951	ATATTAGCCAGTAAGTACAGAATGCCCTCAATACACCCACAGATTGTAAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	153636	ATATTAGCCAGTAAGTACAGAATGCCCTCAATACACCCACAGATTGTAAG	153685

AL646015.8	1001	AAGTTAAAGAAGGAAGGCCCAAGTGAAGATGCTTCAATCCCACTTAGAAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	153686	AAGTTAAAGAAGGAAGGCCCAAGTGAAGATGCTTCAATCCCACTTAGAAG	153735

AL646015.8	1051	GGGGAACTAAATATTCATGGGAAACAGAGGGAAAGGGGGACCTGAATGGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	153736	GGGGAACTAAATATTCATGGGAAACAGAGGGAAAGGGGGACCTGAATGGG	153785

AL646015.8	1101	AGAGTGGGGATGGGAGGTAAGAGAGATAAGATAGGAGAGAAGCTCAGAGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	153786	AGAGTGGGGATGGGAGGTAAGAGAGATAAGATAGGAGAGAAGCTCAGAGA	153835

AL646015.8	1151	GACAAGAGAACAAAAGTGAATATGCTGCTGGTGGGGGTAGGGAAACTTCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	153836	GACAAGAGAACAAAAGTGAATATGCTGCTGGTGGGGGTAGGGAAACTTCT	153885

AL646015.8	1201	AAAAAGTCCCAGAGACCTGGGCTATGAGAGGGGCCCAGGACTCAATGTGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	153886	AAAAAGTCCCAGAGACCTGGGCTATGAGAGGGGCCCAGGACTCAATGTGG	153935

AL646015.8	1251	GTAACCTTAGCTGAAATGCCCAAAACTAAGGAGATAGAAAAAGAAAAGCC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	153936	GTAACCTTAGCTGAAATGCCCAAAACTAAGGAGATAGAAAAAGAAAAGCC	153985

AL646015.8	1301	CACCTCTAGTAGTTAGACAGGGGCCCCAATGGAGGGATGGGGACACCAAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	153986	CACCTCTAGTAGTTAGACAGGGGCCCCAATGGAGGGATGGGGACACCAAC	154035

AL646015.8	1351	CCATCTTCAAATTTTTGACCCAGAATTGTTCCTGTCTAAAAGAAATGCAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	154036	CCATCTTCAAATTTTTGACCCAGAATTGTTCCTGTCTAAAAGAAATGCAT	154085

AL646015.8	1401	GGACAAAAATGGAGCAGAGACTGAAGGAAAGACTTACCAGTGACAGACCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	154086	GGACAAAAATGGAGCAGAGACTGAAGGAAAGACTTACCAGTGACAGACCC	154135

AL646015.8	1451	AACTTGGGATCCAACCCATGGGCAGGCACCAAACTCTGACACTATTACTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	154136	AACTTGGGATCCAACCCATGGGCAGGCACCAAACTCTGACACTATTACTG	154185

AL646015.8	1501	ATGGTATGCTGTGCTTGCAGACAGGAGCCTAGCATGGCTGTCTTCTGAGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	154186	ATGGTATGCTGTGCTTGCAGACAGGAGCCTAGCATGGCTGTCTTCTGAGA	154235

AL646015.8	1551	GGCCCTATGAGCAGCTGACTGAGACAGATGCAGGTACTTACAGCTGACTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	154236	GGCCCTATGAGCAGCTGACTGAGACAGATGCAGGTACTTACAGCTGACTG	154285

AL646015.8	1601	AGGTCAGGGACCCCTATGGAAGAGTTAGGGGAAGGATTGAAGGAACTGAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	154286	AGGTCAGGGACCCCTATGGAAGAGTTAGGGGAAGGATTGAAGGAACTGAA	154335

AL646015.8	1651	GGGATGGCAACCACACAGGAAGACCAACAGTGTCAACTGGGACCCTGGGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	154336	GGGATGGCAACCACACAGGAAGACCAACAGTGTCAACTGGGACCCTGGGG	154385

AL646015.8	1701	AGCTCCCAGGGACTAAGTTACCAACCAAAGAGCATACACAGGCTGGTCTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	154386	AGCTCCCAGGGACTAAGTTACCAACCAAAGAGCATACACAGGCTGGTCTG	154435

AL646015.8	1751	GAACCGCAACCCCTCTCCCTCCTCCTCCTCACTTACCCACTCTGCCAAAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	154436	GAACCGCAACCCCTCTCCCTCCTCCTCCTCACTTACCCACTCTGCCAAAC	154485

AL646015.8	1801	AGCACATATTTACCTTGTCTGCCCCAATGGGAGCCTAATCCTGTAGAGAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	154486	AGCACATATTTACCTTGTCTGCCCCAATGGGAGCCTAATCCTGTAGAGAC	154535

AL646015.8	1851	TTGATGCCCCAGCAAAGGGGGATGGGAGGGCACCCTCTCAGAGGTGAAGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	154536	TTGATGCCCCAGCAAAGGGGGATGGGAGGGCACCCTCTCAGAGGTGAAGG	154585

AL646015.8	1901	GGAGAGGGTAGGGGGTAAAAATTCTAGGAGGGAGGATGGGGGCAACATTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	154586	GGAGAGGGTAGGGGGTAAAAATTCTAGGAGGGAGGATGGGGGCAACATTT	154635

AL646015.8	1951	GGAATGTAAATAAATTAATTTTTTAAAAAAGGAAAGGTGCTGATGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606511.8	154636	GGAATGTAAATAAATTAATTTTTTAAAAAAGGAAAGGTGCTGATGAATTC	154685

Overview

Query
AL646015.8 - 62464 bps
Hit
AL606511.8 - 154685 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link