<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL606528.7	1	TACCACACTCTGCTTTCTCTCCTGTACTTTCCACAGTAAACATGCACTTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	186424	TACCACACTCTGCTTTCTCTCCTGTACTTTCCACAGTAAACATGCACTTC	186473

AL606528.7	51	TTTTATATTAATGAGACAATTTAAAACCAAAGGCATCCCTGACAAAAACT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	186474	TTTTATATTAATGAGACAATTTAAAACCAAAGGCATCCCTGACAAAAACT	186523

AL606528.7	101	CCTTCCCTTCCACTCCTCCTTCTACCATGTGACATGCACAGCCAATCTAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	186524	CCTTCCCTTCCACTCCTCCTTCTACCATGTGACATGCACAGCCAATCTAG	186573

AL606528.7	151	AAAAAGTGGGAATCAAAGCTACTTGATTCCCCATTGTAGTTATTAACTTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	186574	AAAAAGTGGGAATCAAAGCTACTTGATTCCCCATTGTAGTTATTAACTTT	186623

AL606528.7	201	ACAGAATGATCCCTGGCTTGCTAATTCAAGTACACATTTACATTTGCCCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	186624	ACAGAATGATCCCTGGCTTGCTAATTCAAGTACACATTTACATTTGCCCA	186673

AL606528.7	251	CAGGCATTAACGGGGAGGGGGAGGGGGGGAAGTAGGCCAATTCTAAAATA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	186674	CAGGCATTAACGGGGAGGGGGAGGGGGGGAAGTAGGCCAATTCTAAAATA	186723

AL606528.7	301	AATCATCTGGTGGGCAATTAAATACTTGATACAAGTTGAAGGGAAGGAAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	186724	AATCATCTGGTGGGCAATTAAATACTTGATACAAGTTGAAGGGAAGGAAA	186773

AL606528.7	351	AAAAAAAACCCTAACACTACAGGTTAAATCCTATTAAAACAGATTTCTAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	186774	AAAAAAAACCCTAACACTACAGGTTAAATCCTATTAAAACAGATTTCTAA	186823

AL606528.7	401	TGACTTTCTACTCTCTCATAAGAGACCTGGAGTTACATTCAGGGTATATC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	186824	TGACTTTCTACTCTCTCATAAGAGACCTGGAGTTACATTCAGGGTATATC	186873

AL606528.7	451	AAACAGAGATTGAAAATACAAGTATTTAAACTATAATAAGAAACTCAAGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	186874	AAACAGAGATTGAAAATACAAGTATTTAAACTATAATAAGAAACTCAAGG	186923

AL606528.7	501	TGTTTATACTATCAGTTTTTATTTTGAAAGATAAATTATATGTGAAAAGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	186924	TGTTTATACTATCAGTTTTTATTTTGAAAGATAAATTATATGTGAAAAGG	186973

AL606528.7	551	GCACCCTCACTGCCTTCTCCACTGTGGAATCTAGAAAGCGAAGCTCCTAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	186974	GCACCCTCACTGCCTTCTCCACTGTGGAATCTAGAAAGCGAAGCTCCTAG	187023

AL606528.7	601	ATGGTTGGAATAGCCCACCTGTGCGTTGGGTTAATGCCTTGTATATTTTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	187024	ATGGTTGGAATAGCCCACCTGTGCGTTGGGTTAATGCCTTGTATATTTTG	187073

AL606528.7	651	TAAAACTATAAAAAAAAAAAAATTCCTGCTGCTCTCAGAAGTCACGTGTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	187074	TAAAACTATAAAAAAAAAAAAATTCCTGCTGCTCTCAGAAGTCACGTGTA	187123

AL606528.7	701	TCTCTCCATGGGCTCAGCTGTTAGGATGTCAACTTGTCATCAGTACATGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	187124	TCTCTCCATGGGCTCAGCTGTTAGGATGTCAACTTGTCATCAGTACATGC	187173

AL606528.7	751	TCCCAGCCAACACTAGCACAGAACAGGTCCTTCAAGAGCTGCAGAAACCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	187174	TCCCAGCCAACACTAGCACAGAACAGGTCCTTCAAGAGCTGCAGAAACCT	187223

AL606528.7	801	GCGGTATCATGTCTTCCTCTAGAATGGGACTGGTGATGTGGTACCTAAGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	187224	GCGGTATCATGTCTTCCTCTAGAATGGGACTGGTGATGTGGTACCTAAGA	187273

AL606528.7	851	TGGACTGGGACTGTCTAATAGACGAACTGTGTTTTGACTATGCACTGGTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	187274	TGGACTGGGACTGTCTAATAGACGAACTGTGTTTTGACTATGCACTGGTT	187323

AL606528.7	901	AGCCTGCCCTCCTTCAGGACTTCAAAAATCACTAAGGTTTATATATTCAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	187324	AGCCTGCCCTCCTTCAGGACTTCAAAAATCACTAAGGTTTATATATTCAT	187373

AL606528.7	951	AATCTGAGAGGCCTAAGTGAACAGGCCTGAGGGCCCCAAGAAGACTTGAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	187374	AATCTGAGAGGCCTAAGTGAACAGGCCTGAGGGCCCCAAGAAGACTTGAA	187423

AL606528.7	1001	AATGTTTGGGGAGAATTCCTGCCCAGATACAAGCAGTAGACCGTGAATCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	187424	AATGTTTGGGGAGAATTCCTGCCCAGATACAAGCAGTAGACCGTGAATCT	187473

AL606528.7	1051	CCTTTGTGAGCCCAGAAAGCTTTGATTAAAGAGGGTAACTAGAAACTCCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	187474	CCTTTGTGAGCCCAGAAAGCTTTGATTAAAGAGGGTAACTAGAAACTCCC	187523

AL606528.7	1101	ACAACCCCAAGAGCAGTATCTGCCTGTACAAGCTTCCTGCTGTGACCCTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	187524	ACAACCCCAAGAGCAGTATCTGCCTGTACAAGCTTCCTGCTGTGACCCTT	187573

AL606528.7	1151	GACAACACATTCCATCCCCCCCTCCCCCGTCCCGTTCTTTTATGGTAACT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	187574	GACAACACATTCCATCCCCCCCTCCCCCGTCCCGTTCTTTTATGGTAACT	187623

AL606528.7	1201	TTGTATGACAAACATTGTACAGGAATGTCACAGGCCTAGAACATCTCTTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	187624	TTGTATGACAAACATTGTACAGGAATGTCACAGGCCTAGAACATCTCTTA	187673

AL606528.7	1251	AGGGCTAAGCTTGACAAGAGGTTTGGCTCCAGGATATGTAAGGGAGAAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	187674	AGGGCTAAGCTTGACAAGAGGTTTGGCTCCAGGATATGTAAGGGAGAAAA	187723

AL606528.7	1301	AGAAAAGGGAATCAAAATCCTAAGGCCTGACACTGAGTCGGTACACATAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	187724	AGAAAAGGGAATCAAAATCCTAAGGCCTGACACTGAGTCGGTACACATAA	187773

AL606528.7	1351	TTCATAAGCAGCCTACCCATTGTGCTGAGGAGCCAATATCTAAGAACTCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	187774	TTCATAAGCAGCCTACCCATTGTGCTGAGGAGCCAATATCTAAGAACTCC	187823

AL606528.7	1401	AGAACCCATAAAGGCTGGAAGATGAAACATGACTTTTACCACCAACATAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	187824	AGAACCCATAAAGGCTGGAAGATGAAACATGACTTTTACCACCAACATAA	187873

AL606528.7	1451	CCAGGGCATTCTCCCAGAGTATCAGCATGGCACTAAAACTTGGGTGCTTA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	187874	CCAGGGCATTCTCCCAGAGTATCAGCATGGCACTAAAACTTGGGTGCTTA	187923

AL606528.7	1501	TATTGCTTTCTATTTAATATATTGCTTATATTGCTTTCTTTCCGCTTTTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	187924	TATTGCTTTCTATTTAATATATTGCTTATATTGCTTTCTTTCCGCTTTTC	187973

AL606528.7	1551	TAATAGGAAAGCCAACTTCCAGGGAGCCAGGCACTGTTGTCCTGTTACCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	187974	TAATAGGAAAGCCAACTTCCAGGGAGCCAGGCACTGTTGTCCTGTTACCC	188023

AL606528.7	1601	AGGCAATGGCAAGCCACCCCTGAGTTCTAAGCTGGGATCCGGTAACTCTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	188024	AGGCAATGGCAAGCCACCCCTGAGTTCTAAGCTGGGATCCGGTAACTCTG	188073

AL606528.7	1651	GTGGGAAACATCTTTGAGGCATCCATAAATGATCATTATCCATAAACGGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	188074	GTGGGAAACATCTTTGAGGCATCCATAAATGATCATTATCCATAAACGGG	188123

AL606528.7	1701	ATACTGAAAACCAGAATCCTAGGATGATATGGATTTTCATTTTTATCTCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	188124	ATACTGAAAACCAGAATCCTAGGATGATATGGATTTTCATTTTTATCTCC	188173

AL606528.7	1751	CTCACATTCTACCTCTAAACTCTCTTTCTAATAAAAAAAATTAAATCAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	188174	CTCACATTCTACCTCTAAACTCTCTTTCTAATAAAAAAAATTAAATCAAA	188223

AL606528.7	1801	ATCTGACAGCAGAATTTACAATGGATTCTGTAAAAATTCACCTTGTCACC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	188224	ATCTGACAGCAGAATTTACAATGGATTCTGTAAAAATTCACCTTGTCACC	188273

AL606528.7	1851	CCCCTCCTCCAAAAAAAAAAAAAGGGTTCAAGATGAAATCTGTCTTTCAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	188274	CCCCTCCTCCAAAAAAAAAAAAAGGGTTCAAGATGAAATCTGTCTTTCAA	188323

AL606528.7	1901	TTGAGAGAAGAGGCCAAGAGACAATAAAAAGCTATAGGCTTAAATGAGGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	188324	TTGAGAGAAGAGGCCAAGAGACAATAAAAAGCTATAGGCTTAAATGAGGA	188373

AL606528.7	1951	AATGTCTTTACATCATCATTTACTTTTCCGTTTTAATTAAACTTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606488.15	188374	AATGTCTTTACATCATCATTTACTTTTCCGTTTTAATTAAACTTGAATTC	188423

Overview

Query
AL606528.7 - 148066 bps
Hit
AL606488.15 - 188423 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link