<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
C AL606513.3 172243 GAATTCTCCCCGAGTGGATCCTGGCTTGGCATTGGGAAAGAATGGGCTGG 172194 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 128722 GAATTCTCCCCGAGTGGATCCTGGCTTGGCATTGGGAAAGAATGGGCTGG 128771 C AL606513.3 172193 GATAGGTGCCCTCGCTGTGGCCCCTGTTTTGGCATGCATGTTGTGTGTAT 172144 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 128772 GATAGGTGCCCTCGCTGTGGCCCCTGTTTTGGCATGCATGTTGTGTGTAT 128821 C AL606513.3 172143 GGTGTATGTGTTGGTTGCGGAATGCCCAGGTCCGCACTGCCGCCATGGTG 172094 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 128822 GGTGTATGTGTTGGTTGCGGAATGCCCAGGTCCGCACTGCCGCCATGGTG 128871 C AL606513.3 172093 GTGCAAGCTTTTGCCACAGTGGAAGCAGGGTAGTCACCTCAGATTTGGCT 172044 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 128872 GTGCAAGCTTTTGCCACAGTGGAAGCAGGGTAGTCACCTCAGATTTGGCT 128921 C AL606513.3 172043 TGCTGCCATGAAGAATGAACAATGAAGCCATTGCTCTGTAGGGTTGTAAG 171994 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 128922 TGCTGCCATGAAGAATGAACAATGAAGCCATTGCTCTGTAGGGTTGTAAG 128971 C AL606513.3 171993 GCTAAGCACTGCACAGAGGTTAGTCTGGAAGCTGTTTGACAATCTCTGGG 171944 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 128972 GCTAAGCACTGCACAGAGGTTAGTCTGGAAGCTGTTTGACAATCTCTGGG 129021 C AL606513.3 171943 GGGTATGTCTGATTGCATGAGCGTTGAGTGTCCTTCCCCCAGGAAAAACA 171894 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 129022 GGGTATGTCTGATTGCATGAGCGTTGAGTGTCCTTCCCCCAGGAAAAACA 129071 C AL606513.3 171893 GCATGGGAGCAGGTCAGGGATGCTCTGGGTAAAAACCTGTGAGCCTAAGA 171844 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 129072 GCATGGGAGCAGGTCAGGGATGCTCTGGGTAAAAACCTGTGAGCCTAAGA 129121 C AL606513.3 171843 GTCAATCCTGTACATGGCCCCTATTTCTGCACACTGGGGATCAGACCTCT 171794 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 129122 GTCAATCCTGTACATGGCCCCTATTTCTGCACACTGGGGATCAGACCTCT 129171 C AL606513.3 171793 ATCTTCACCCACGGAGCTTGCTTCAAAAGAATATAAAAGGGGGAATTGTA 171744 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 129172 ATCTTCACCCACGGAGCTTGCTTCAAAAGAATATAAAAGGGGGAATTGTA 129221 C AL606513.3 171743 GGAAGCCATTCCGGACTCCCTGGCCCGGACAGAAATCTGTGCCAGGCAGT 171694 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 129222 GGAAGCCATTCCGGACTCCCTGGCCCGGACAGAAATCTGTGCCAGGCAGT 129271 C AL606513.3 171693 AAACAAGCCCATATTTGGTGGATGGCTCGCCATTAATCCCTGATTGGCTG 171644 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 129272 AAACAAGCCCATATTTGGTGGATGGCTCGCCATTAATCCCTGATTGGCTG 129321 C AL606513.3 171643 AGCAAGCCATTGGCTGAGCAAGCCTGCCTGGTGAGGTGATGTGATCTGTG 171594 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 129322 AGCAAGCCATTGGCTGAGCAAGCCTGCCTGGTGAGGTGATGTGATCTGTG 129371 C AL606513.3 171593 GTGATTGGTTGAGGCGTGGTTGTGGCTTGAGTGGATAAAAATGCTTGTAC 171544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 129372 GTGATTGGTTGAGGCGTGGTTGTGGCTTGAGTGGATAAAAATGCTTGTAC 129421 C AL606513.3 171543 CCTGAGGCTCGGGGGGGGGGGGGGGGAGTTGAAGAGAGAAACTGCCTGAG 171494 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 129422 CCTGAGGCTCGGGGGGGGGGGGGGGGAGTTGAAGAGAGAAACTGCCTGAG 129471 C AL606513.3 171493 TAAACTGCATTAAGAAGAACCTGTGGTTGCGTTTTCCTTGCTGGTCCAGT 171444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 129472 TAAACTGCATTAAGAAGAACCTGTGGTTGCGTTTTCCTTGCTGGTCCAGT 129521 C AL606513.3 171443 TGGATGCAACAATAAATCTTTGTATATTGATAAAAACTTAAGGTTATATT 171394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 129522 TGGATGCAACAATAAATCTTTGTATATTGATAAAAACTTAAGGTTATATT 129571 C AL606513.3 171393 TGGTTATGATATACTATGTATCAACTTTTTAGAGATGTTGTCTAAGTATT 171344 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 129572 TGGTTATGATATACTATGTATCAACTTTTTAGAGATGTTGTCTAAGTATT 129621 C AL606513.3 171343 GAAACTTCAATGTTTACTTCTAGTCCTTTTGAAAGATTTTATTAGAAACT 171294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 129622 GAAACTTCAATGTTTACTTCTAGTCCTTTTGAAAGATTTTATTAGAAACT 129671 C AL606513.3 171293 GTTTAAGATAATTAAGAAATGCAAGTTAATAGTTAAATTATGGTCATGTT 171244 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 129672 GTTTAAGATAATTAAGAAATGCAAGTTAATAGTTAAATTATGGTCATGTT 129721 C AL606513.3 171243 AAATACTAGTTTAGTCAATGACAGAAAGATGTTTTCTAGGTTGAGCAGTA 171194 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 129722 AAATACTAGTTTAGTCAATGACAGAAAGATGTTTTCTAGGTTGAGCAGTA 129771 C AL606513.3 171193 ACTATACAGGCAGAAGGGTAGATATTTTAAAGAAGCACATGTATCCAATG 171144 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 129772 ACTATACAGGCAGAAGGGTAGATATTTTAAAGAAGCACATGTATCCAATG 129821 C AL606513.3 171143 CTTTTCAATGGGTATTGATTCAACGAACCCAAAGAATGAGCATTCTCCAC 171094 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 129822 CTTTTCAATGGGTATTGATTCAACGAACCCAAAGAATGAGCATTCTCCAC 129871 C AL606513.3 171093 CCTTCGGGAGGAGAATGGCTGAAACCCTGGCTCTGTCAAGGGAGGACATT 171044 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 129872 CCTTCGGGAGGAGAATGGCTGAAACCCTGGCTCTGTCAAGGGAGGACATT 129921 C AL606513.3 171043 TCCTTCTCAAGGCTTCATACAGTTCTAATGACATATGCAGCTTTTCTGAT 170994 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 129922 TCCTTCTCAAGGCTTCATACAGTTCTAATGACATATGCAGCTTTTCTGAT 129971 C AL606513.3 170993 TTTTCCTTCTGTTATAAAATTCTTGCAATAGAAAATGTGAAAAGAAGGGA 170944 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 129972 TTTTCCTTCTGTTATAAAATTCTTGCAATAGAAAATGTGAAAAGAAGGGA 130021 C AL606513.3 170943 AGAGTCTTTCTCTTTCTAGTTTTGCCAAACATCATTAAAGCCGTTTTTTG 170894 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 130022 AGAGTCTTTCTCTTTCTAGTTTTGCCAAACATCATTAAAGCCGTTTTTTG 130071 C AL606513.3 170893 GTTTTGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGTCAGTTTGTTCTCTGATTT 170844 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 130072 GTTTTGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGTCAGTTTGTTCTCTGATTT 130121 C AL606513.3 170843 GTTTAAGAAAGGAGTGAAAATCTTTTCAGTTTCCATTGTGTGTAGATGTG 170794 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 130122 GTTTAAGAAAGGAGTGAAAATCTTTTCAGTTTCCATTGTGTGTAGATGTG 130171 C AL606513.3 170793 TAGGTGGGTGTGCATGTACACATGTACAAGCATGTATGTATTGAATATAT 170744 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 130172 TAGGTGGGTGTGCATGTACACATGTACAAGCATGTATGTATTGAATATAT 130221 C AL606513.3 170743 ACACATTTTGTGATTGGGCAGACATAGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG 170694 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 130222 ACACATTTTGTGATTGGGCAGACATAGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG 130271 C AL606513.3 170693 TGTGTGTATCTGTGTGTACTGTGAAGGCAAACATGTAAGAATGGATGAAC 170644 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 130272 TGTGTGTATCTGTGTGTACTGTGAAGGCAAACATGTAAGAATGGATGAAC 130321 C AL606513.3 170643 ATGTGTGTGAATGGTGGGCACATGTATGTTAGTGGGTGAGCACATGTGTG 170594 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 130322 ATGTGTGTGAATGGTGGGCACATGTATGTTAGTGGGTGAGCACATGTGTG 130371 C AL606513.3 170593 TGACTGGATGGGCACATGCATGTGAATTGGTGAGCATATATGTGTGTTGG 170544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 130372 TGACTGGATGGGCACATGCATGTGAATTGGTGAGCATATATGTGTGTTGG 130421 C AL606513.3 170543 GTGGACACATATGTGTGAGTGGGTGGGTACATTTGTGTAAGTGAGTAGAT 170494 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 130422 GTGGACACATATGTGTGAGTGGGTGGGTACATTTGTGTAAGTGAGTAGAT 130471 C AL606513.3 170493 CCATGAGTATGTGAGGTTACACACTTACATTTGTGCTCATACACATGAGA 170444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 130472 CCATGAGTATGTGAGGTTACACACTTACATTTGTGCTCATACACATGAGA 130521 C AL606513.3 170443 CAGAGACTGAGGCTGACATCAAGAATCATCCTTCCTCTTCCACTTTACTA 170394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 130522 CAGAGACTGAGGCTGACATCAAGAATCATCCTTCCTCTTCCACTTTACTA 130571 C AL606513.3 170393 AGTCAGAATCTTTCTTTAAAAAAAAAAACCCACTAGATATTTTCTTAATT 170344 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 130572 AGTCAGAATCTTTCTTTAAAAAAAAAAACCCACTAGATATTTTCTTAATT 130621 C AL606513.3 170343 TACATTTCAAATGTTATCCTCTTTCCCGGTCCCCTCCCCTGAAACTCCCT 170294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 130622 TACATTTCAAATGTTATCCTCTTTCCCGGTCCCCTCCCCTGAAACTCCCT 130671 C AL606513.3 170293 ATCCCATTCCCCATCCCCCTGCTTCTATGAGGGTGTTCTTACACACACCA 170244 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL606472.13 130672 ATCCCATTCCCCATCCCCCTGCTTCTATGAGGGTGTTCTTACACACACCA 130721