<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL683873.14	1	TATTGAATTATGTGGCTGGAAAGTACTGAGGGAAATAATTGCTGCTTTAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	181699	TATTGAATTATGTGGCTGGAAAGTACTGAGGGAAATAATTGCTGCTTTAT	181748

AL683873.14	51	TGTTGGAGAGGGAATTTGAAAGAGGTGTTCTAGTTAATTCAAGCCCACTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	181749	TGTTGGAGAGGGAATTTGAAAGAGGTGTTCTAGTTAATTCAAGCCCACTC	181798

AL683873.14	101	CAATTTTTCTCCAAGCAAATCACAGCAGGAGAAGAGCAGCTCTTCAGCAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	181799	CAATTTTTCTCCAAGCAAATCACAGCAGGAGAAGAGCAGCTCTTCAGCAG	181848

AL683873.14	151	GAATGTCTCTTTTGATTTTGAACCACGTCTGACACTCATTAAAATAACCG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	181849	GAATGTCTCTTTTGATTTTGAACCACGTCTGACACTCATTAAAATAACCG	181898

AL683873.14	201	AGCGAATGGGAGACAATTAGTGAGCTGATAGCGCTAAGCCAGAGCCTGAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	181899	AGCGAATGGGAGACAATTAGTGAGCTGATAGCGCTAAGCCAGAGCCTGAG	181948

AL683873.14	251	CCACAGACACTGGCTTCTCACCTCCACCCCAACCTCCTGCCAGTTTTTAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	181949	CCACAGACACTGGCTTCTCACCTCCACCCCAACCTCCTGCCAGTTTTTAA	181998

AL683873.14	301	AGGTATTATATTGGAAGTGGTGACAAATTAGGGATAATTAATCAGTAACA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	181999	AGGTATTATATTGGAAGTGGTGACAAATTAGGGATAATTAATCAGTAACA	182048

AL683873.14	351	CAAGAACTGCACCCTTCAAACCCTGAACACCCATAAGAAGCCCATGGGAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	182049	CAAGAACTGCACCCTTCAAACCCTGAACACCCATAAGAAGCCCATGGGAA	182098

AL683873.14	401	AAGCTGCAGATGGTATGGATAGCAAATATGTTATTTACAGATTTATTCGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	182099	AAGCTGCAGATGGTATGGATAGCAAATATGTTATTTACAGATTTATTCGT	182148

AL683873.14	451	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	182149	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGT	182198

AL683873.14	501	GTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACCCATGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	182199	GTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACCCATGC	182248

AL683873.14	551	TTGGACATACTTGTAAAAGGAGGTCAGAAAAAGGTGTCAGGTTCCTTAGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	182249	TTGGACATACTTGTAAAAGGAGGTCAGAAAAAGGTGTCAGGTTCCTTAGA	182298

AL683873.14	601	GCTAGAATTGCGTGGTTATGAGCTGGGTGCTGATTTTATTCCTCTAAAAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	182299	GCTAGAATTGCGTGGTTATGAGCTGGGTGCTGATTTTATTCCTCTAAAAG	182348

AL683873.14	651	AGCAGCAAGCAATCCCAATCGCTAAGCCATTCTTCTGACACTGCTTATTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	182349	AGCAGCAAGCAATCCCAATCGCTAAGCCATTCTTCTGACACTGCTTATTG	182398

AL683873.14	701	TTTTTATTTTTTGTTTTGTTTTGTTGTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTTTTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	182399	TTTTTATTTTTTGTTTTGTTTTGTTGTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTTTTG	182448

AL683873.14	751	TTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTTGAGACAGGGGTTCTCTGTATAACATCCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	182449	TTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTTGAGACAGGGGTTCTCTGTATAACATCCC	182498

AL683873.14	801	TGGCTGTACTGAAACTCGATCCGTACCCCAGGCTGGCCTCAACCTCATGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	182499	TGGCTGTACTGAAACTCGATCCGTACCCCAGGCTGGCCTCAACCTCATGG	182548

AL683873.14	851	AGAGCCACCTGCCTTCCAGAGTGCTGGGATTCAAGGCGTGCTCCGCCACA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	182549	AGAGCCACCTGCCTTCCAGAGTGCTGGGATTCAAGGCGTGCTCCGCCACA	182598

AL683873.14	901	TCTGAGGAGCATCAGAGCAGGCTGTGGTGAGCACCCTTGTCCTCCCAGTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	182599	TCTGAGGAGCATCAGAGCAGGCTGTGGTGAGCACCCTTGTCCTCCCAGTG	182648

AL683873.14	951	CTTGGGTAGCTGAGTCGGGAGGATTCGGAATTCCAAGTCATCCCCCATAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	182649	CTTGGGTAGCTGAGTCGGGAGGATTCGGAATTCCAAGTCATCCCCCATAG	182698

AL683873.14	1001	AAAGGAGCCTGAGTGAGTGACGCCCCGCCTCCAAAACAAAACGAGACCAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	182699	AAAGGAGCCTGAGTGAGTGACGCCCCGCCTCCAAAACAAAACGAGACCAC	182748

AL683873.14	1051	CACCACCACCACCAATAACAACAACAAGCGCTCTTTGCTTGAACATTATA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	182749	CACCACCACCACCAATAACAACAACAAGCGCTCTTTGCTTGAACATTATA	182798

AL683873.14	1101	GTGGTCCACATCTGTAATTCCAAGCATGAGGCATGAAGATTACATGACTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	182799	GTGGTCCACATCTGTAATTCCAAGCATGAGGCATGAAGATTACATGACTT	182848

AL683873.14	1151	CAAGCCCAGCTTAAGTGATATCTTTAGTCCTAAGTAAACCTAGGTTATAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	182849	CAAGCCCAGCTTAAGTGATATCTTTAGTCCTAAGTAAACCTAGGTTATAG	182898

AL683873.14	1201	AGAAGGACTTGGTCTCAAAACAAAGCAAACACCAACCACCACCACCAAAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	182899	AGAAGGACTTGGTCTCAAAACAAAGCAAACACCAACCACCACCACCAAAA	182948

AL683873.14	1251	ACAAAAAAAACCAAACCCTTATGAATTCAGGTTGTTTTTTAAAGTTTTCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	182949	ACAAAAAAAACCAAACCCTTATGAATTCAGGTTGTTTTTTAAAGTTTTCA	182998

AL683873.14	1301	AGTCATTCTCTTCTTTTTGCCAGAACCTAAATTTAATAGTTGTTGACCGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	182999	AGTCATTCTCTTCTTTTTGCCAGAACCTAAATTTAATAGTTGTTGACCGA	183048

AL683873.14	1351	GTACTGGATTTTTTTTTTTCCAAATAGATCAATGGTACACGTTATGTTCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	183049	GTACTGGATTTTTTTTTTTCCAAATAGATCAATGGTACACGTTATGTTCT	183098

AL683873.14	1401	GTGATCTAAGAAATAACCTTTCAATCCAAATTAATATAATGTCTATGCCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	183099	GTGATCTAAGAAATAACCTTTCAATCCAAATTAATATAATGTCTATGCCT	183148

AL683873.14	1451	AACTTAGGGCCTTGACCCTTCCCTAGTATAACTGCCCGTGTTGGGCCTTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	183149	AACTTAGGGCCTTGACCCTTCCCTAGTATAACTGCCCGTGTTGGGCCTTT	183198

AL683873.14	1501	ACAGAAACATAAGCACTGAAATTGAAGTCAACATGAAATTAGAAATCTAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	183199	ACAGAAACATAAGCACTGAAATTGAAGTCAACATGAAATTAGAAATCTAG	183248

AL683873.14	1551	GGGCCATCAGCCCTTGAAAAGGCCACTCCTCACTTGAGTCATCTTGAATG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	183249	GGGCCATCAGCCCTTGAAAAGGCCACTCCTCACTTGAGTCATCTTGAATG	183298

AL683873.14	1601	TTTCCATCCGGGAGGTACATGCCTCCTCCTCCCTACACATCAGCACAACA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	183299	TTTCCATCCGGGAGGTACATGCCTCCTCCTCCCTACACATCAGCACAACA	183348

AL683873.14	1651	CGTGTGTTTTTGGAAACGAGAAGCTGCTTCCTGCTTGTGGTCCCTGAAGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	183349	CGTGTGTTTTTGGAAACGAGAAGCTGCTTCCTGCTTGTGGTCCCTGAAGG	183398

AL683873.14	1701	CTCTTTCCAGGTCTGAGGAACGTCCGTTTTCAAACAATGAGACGTTAAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	183399	CTCTTTCCAGGTCTGAGGAACGTCCGTTTTCAAACAATGAGACGTTAAAA	183448

AL683873.14	1751	CCAACCAGTGGCACAGCACTTTGCGGGTGGGCTGGACACCCGCAGGGGCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	183449	CCAACCAGTGGCACAGCACTTTGCGGGTGGGCTGGACACCCGCAGGGGCT	183498

AL683873.14	1801	TACCATACAAGTGTCTAGGTCTTCCAGCCTCTCCACCTCTGTGAGATCCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	183499	TACCATACAAGTGTCTAGGTCTTCCAGCCTCTCCACCTCTGTGAGATCCT	183548

AL683873.14	1851	CTACCGTGAGGATGGCCCGTTTCACCGGCTTCTCCTCCACCAGCTCCACC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	183549	CTACCGTGAGGATGGCCCGTTTCACCGGCTTCTCCTCCACCAGCTCCACC	183598

AL683873.14	1901	TCTAGGTCCTCTCGCTGGGGAAGGCTCTTGTTTAGCCTGCTGAAATGGTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	183599	TCTAGGTCCTCTCGCTGGGGAAGGCTCTTGTTTAGCCTGCTGAAATGGTT	183648

AL683873.14	1951	GGCCTAGCGTCAAGAGAGCACAGGGGGAAAAAGAGTTGATTAGTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606464.11	183649	GGCCTAGCGTCAAGAGAGCACAGGGGGAAAAAGAGTTGATTAGTGAATTC	183698

Overview

Query
AL683873.14 - 104602 bps
Hit
AL606464.11 - 183698 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link