<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645951.20	1	TAGGGAGGTTGGGACAGATCTGGGAGGAATCAGGAAAGTGAATATGGTCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	160144	TAGGGAGGTTGGGACAGATCTGGGAGGAATCAGGAAAGTGAATATGGTCA	160193

AL645951.20	51	AACACATGGTATAAAATTCTCAAATAATTTATAAAAATATAATTAAAAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	160194	AACACATGGTATAAAATTCTCAAATAATTTATAAAAATATAATTAAAAAA	160243

AL645951.20	101	GAAAGTGGCCTTTGAAGGTGAGAATAATATTGAATAAATAAATAAATATC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	160244	GAAAGTGGCCTTTGAAGGTGAGAATAATATTGAATAAATAAATAAATATC	160293

AL645951.20	151	ATCTTGTGAAAGAAAGTTGTGTATGTAGTTTTAAAAGCAACACTCTACCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	160294	ATCTTGTGAAAGAAAGTTGTGTATGTAGTTTTAAAAGCAACACTCTACCA	160343

AL645951.20	201	CCTTTGCTCAGGACCACAGCATGAACTCTGTCTCCTTCTGACTCCCTTTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	160344	CCTTTGCTCAGGACCACAGCATGAACTCTGTCTCCTTCTGACTCCCTTTT	160393

AL645951.20	251	GTTCTACCCAATTGATCGATTGATTGCAACCAGACCTAATCTGGCTTCCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	160394	GTTCTACCCAATTGATCGATTGATTGCAACCAGACCTAATCTGGCTTCCT	160443

AL645951.20	301	TTTGAATCTGTGGATAAAAGACACACAGACAGTTTTGTTACCTTAACTTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	160444	TTTGAATCTGTGGATAAAAGACACACAGACAGTTTTGTTACCTTAACTTG	160493

AL645951.20	351	CCTGCTACATACAGTTCCTGGGTGCAGATACCTCCCTGGAAAGGCATGCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	160494	CCTGCTACATACAGTTCCTGGGTGCAGATACCTCCCTGGAAAGGCATGCC	160543

AL645951.20	401	CTTACCAATTTATTATCTCCATCTCTCTTCTATGTCCTTGGCCACCCACC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	160544	CTTACCAATTTATTATCTCCATCTCTCTTCTATGTCCTTGGCCACCCACC	160593

AL645951.20	451	TATAGCGGACCCCACAGGCCCTAGCTCTTCCAGGGGCCTTACATAATTGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	160594	TATAGCGGACCCCACAGGCCCTAGCTCTTCCAGGGGCCTTACATAATTGC	160643

AL645951.20	501	TATGTCCCCTTTCCTCCAAGCATGGCAGAAGAAGCATCACTCTCCTTCCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	160644	TATGTCCCCTTTCCTCCAAGCATGGCAGAAGAAGCATCACTCTCCTTCCC	160693

AL645951.20	551	TGCATCTCCTTGTCCTCTTGAGACCCAGAAGTCCTACTTGTACCTCTGCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	160694	TGCATCTCCTTGTCCTCTTGAGACCCAGAAGTCCTACTTGTACCTCTGCC	160743

AL645951.20	601	CAGTAATTGGCTCCCAGTCTTTTTTATTGACAAATCAAAAACCAATTAGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	160744	CAGTAATTGGCTCCCAGTCTTTTTTATTGACAAATCAAAAACCAATTAGG	160793

AL645951.20	651	GGACTAGAACTTAGTATCAAAACCTCCTCATACAGAAAGTCATACATATT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	160794	GGACTAGAACTTAGTATCAAAACCTCCTCATACAGAAAGTCATACATATT	160843

AL645951.20	701	CTTGGCTTATAAAGATGTCATGGTTTGTTCATTTCTATTATTGTGATAAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	160844	CTTGGCTTATAAAGATGTCATGGTTTGTTCATTTCTATTATTGTGATAAA	160893

AL645951.20	751	ATTCCTTCTGAACAAAAAGCAACTCAGGAGAGGAGGGGTATTTAACTTAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	160894	ATTCCTTCTGAACAAAAAGCAACTCAGGAGAGGAGGGGTATTTAACTTAT	160943

AL645951.20	801	AGTTTCTGGTTGTGGTTCAACATTGCAAGGAAGTCAGGAAAGGAACTTTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	160944	AGTTTCTGGTTGTGGTTCAACATTGCAAGGAAGTCAGGAAAGGAACTTTA	160993

AL645951.20	851	TGCAGCTGATCATGCCACATTCTTATTCAAGATCAGAGAGAAATAATTGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	160994	TGCAGCTGATCATGCCACATTCTTATTCAAGATCAGAGAGAAATAATTGC	161043

AL645951.20	901	ATACATACTCAACTGTACAAGTGAGTCTGTGCTTGTTTTGATTTCTCTAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	161044	ATACATACTCAACTGTACAAGTGAGTCTGTGCTTGTTTTGATTTCTCTAC	161093

AL645951.20	951	TCTTACTCAGTTCAAGGATCCTTGTCTAGGGAATGCTACTGCCCACAGTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	161094	TCTTACTCAGTTCAAGGATCCTTGTCTAGGGAATGCTACTGCCCACAGTG	161143

AL645951.20	1001	GGTGGGGTTTCTCATACCAGTTAATGAAGATAACCTATCTCAAAGCCATG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	161144	GGTGGGGTTTCTCATACCAGTTAATGAAGATAACCTATCTCAAAGCCATG	161193

AL645951.20	1051	TCTACAAATCTACCCAAAGTAGGCAATCCCTTATTTGAAACTATCTTCCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	161194	TCTACAAATCTACCCAAAGTAGGCAATCCCTTATTTGAAACTATCTTCCC	161243

AL645951.20	1101	AGGTGAGTCTAGGCTGTGTCAAATTAACAATTAAAGTTCACTATCACATG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	161244	AGGTGAGTCTAGGCTGTGTCAAATTAACAATTAAAGTTCACTATCACATG	161293

AL645951.20	1151	ATTCATCTCTCAGAGGTTTAGAGCAAAATATGGTGGAAATGCTTGGAGAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	161294	ATTCATCTCTCAGAGGTTTAGAGCAAAATATGGTGGAAATGCTTGGAGAA	161343

AL645951.20	1201	TCACACCCACTCTCACCCAGTCCCATCACCATCATCTGCTCCCAATTCTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	161344	TCACACCCACTCTCACCCAGTCCCATCACCATCATCTGCTCCCAATTCTG	161393

AL645951.20	1251	TAATCAACTAGCTGACACAATTGTCCTTGACCTGGCTTTCTTATTCAACC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	161394	TAATCAACTAGCTGACACAATTGTCCTTGACCTGGCTTTCTTATTCAACC	161443

AL645951.20	1301	TGATTAACCAATGGAAGATATCAATGGTTTCATTTGCTTAAAAAATTCCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	161444	TGATTAACCAATGGAAGATATCAATGGTTTCATTTGCTTAAAAAATTCCT	161493

AL645951.20	1351	CTTTTATTGAGAATAAATTTTTCTCATACAGTATCTCTATTACCAGTTCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	161494	CTTTTATTGAGAATAAATTTTTCTCATACAGTATCTCTATTACCAGTTCT	161543

AL645951.20	1401	CCTCCCAGATCTACCCACTTTCTATCTCTCGTTAAAAAACAAACAGACTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	161544	CCTCCCAGATCTACCCACTTTCTATCTCTCGTTAAAAAACAAACAGACTC	161593

AL645951.20	1451	CTAAGAAATAATAAGAAAATAAAATGTATTATAGGATAAAACTAACACAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	161594	CTAAGAAATAATAAGAAAATAAAATGTATTATAGGATAAAACTAACACAT	161643

AL645951.20	1501	TTAAATTGGATAAACAAACAAACAAACAGATGGAAAGGAGCTCAAGAAAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	161644	TTAAATTGGATAAACAAACAAACAAACAGATGGAAAGGAGCTCAAGAAAA	161693

AL645951.20	1551	GGCACAAGAAACAGATACAGAGGCAGAGGCTCACTTGTTTACACATTCAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	161694	GGCACAAGAAACAGATACAGAGGCAGAGGCTCACTTGTTTACACATTCAC	161743

AL645951.20	1601	TTGCTTTCACATAAAAACACTAAATCAGAAGCCATAACATATATGCAAAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	161744	TTGCTTTCACATAAAAACACTAAATCAGAAGCCATAACATATATGCAAAG	161793

AL645951.20	1651	TACCTATAATATATATAGGGTAAAAGAGAGAAAAATAAAATACAAAATAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	161794	TACCTATAATATATATAGGGTAAAAGAGAGAAAAATAAAATACAAAATAA	161843

AL645951.20	1701	GATAAATTTTAAAAGTGCTCTGATATGACATTATGAGACAAGGAACCTCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	161844	GATAAATTTTAAAAGTGCTCTGATATGACATTATGAGACAAGGAACCTCC	161893

AL645951.20	1751	ACAGATGCCATTGAGCTCATTTTCTGTTGTCTATCTACTGTTGGACACGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	161894	ACAGATGCCATTGAGCTCATTTTCTGTTGTCTATCTACTGTTGGACACGC	161943

AL645951.20	1801	AGGCTACTCTTACAAGTAGTTTGTTTCATCAGTGGGACTCTCTTGGAGAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	161944	AGGCTACTCTTACAAGTAGTTTGTTTCATCAGTGGGACTCTCTTGGAGAA	161993

AL645951.20	1851	CACTACATTTTCATTTGTGAATGGATATCAGTTGGATATCAGTTGGAGAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	161994	CACTACATTTTCATTTGTGAATGGATATCAGTTGGATATCAGTTGGAGAT	162043

AL645951.20	1901	CGCTTCTGGGTTAGTAGGCATGTGTCCACTTCTCCTTTCAGTCTTAGGAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	162044	CGCTTCTGGGTTAGTAGGCATGTGTCCACTTCTCCTTTCAGTCTTAGGAC	162093

AL645951.20	1951	CCAATGGGTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTGTTTGATGGGCTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL596283.10	162094	CCAATGGGTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTGTTTGATGGGCTGAATTC	162143

Overview

Query
AL645951.20 - 129519 bps
Hit
AL596283.10 - 162143 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link