<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL672149.4	1	ACCAATGAAAAGGGCATCACAGTCAATACGTGAAGAGACAAATGCATGGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	97496	ACCAATGAAAAGGGCATCACAGTCAATACGTGAAGAGACAAATGCATGGA	97545

AL672149.4	51	TGACAGTCTCAGCATCCCTGCTACTGATTAAGGGACGCGGTTAGGAAAAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	97546	TGACAGTCTCAGCATCCCTGCTACTGATTAAGGGACGCGGTTAGGAAAAG	97595

AL672149.4	101	CAACGTGAATAAAAGAATGCAGATTTAATAACAGATTTAATGTGAGACTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	97596	CAACGTGAATAAAAGAATGCAGATTTAATAACAGATTTAATGTGAGACTG	97645

AL672149.4	151	AAAGGAGAGTGTAGAGTTGAAGATTACACCTACATTTTTGACAGACGTAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	97646	AAAGGAGAGTGTAGAGTTGAAGATTACACCTACATTTTTGACAGACGTAG	97695

AL672149.4	201	ATGTTTTAATGTGAGAGCCAGCAATCTCACAGGGTCTCAAACTGGTCGAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	97696	ATGTTTTAATGTGAGAGCCAGCAATCTCACAGGGTCTCAAACTGGTCGAA	97745

AL672149.4	251	ATATTGCTGGTTAGTGCTGGGGTGCCAATAAAAATGATCTCAGTTTTGTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	97746	ATATTGCTGGTTAGTGCTGGGGTGCCAATAAAAATGATCTCAGTTTTGTC	97795

AL672149.4	301	CATGTTGAGTTTCAAAGAATTTGAGTTAAGCCAATCATTAATGTCCTTCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	97796	CATGTTGAGTTTCAAAGAATTTGAGTTAAGCCAATCATTAATGTCCTTCA	97845

AL672149.4	351	CAGAGAATGTGTTCACACATGACGATTACATATAAAATCAATGGAAATAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	97846	CAGAGAATGTGTTCACACATGACGATTACATATAAAATCAATGGAAATAA	97895

AL672149.4	401	AGGCAAATTGCGCTGCAAATTTGGCACAGAATGTGCAATTGTGTGGAATT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	97896	AGGCAAATTGCGCTGCAAATTTGGCACAGAATGTGCAATTGTGTGGAATT	97945

AL672149.4	451	TACCTCTTTCATTTCTTGTATGCAACGTTTCCCTACTTCAACTCGAGCAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	97946	TACCTCTTTCATTTCTTGTATGCAACGTTTCCCTACTTCAACTCGAGCAG	97995

AL672149.4	501	AAAATTCACATGAGGCAAAAAACATCCCATGAGTAATCTAGAGCGAGTGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	97996	AAAATTCACATGAGGCAAAAAACATCCCATGAGTAATCTAGAGCGAGTGA	98045

AL672149.4	551	CATGATCAATTGTATATGGTTTCAATTAATGCTTTTATTTAGTTATTATT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	98046	CATGATCAATTGTATATGGTTTCAATTAATGCTTTTATTTAGTTATTATT	98095

AL672149.4	601	TTTACAAATTAGCTAAGTAAAATTGATGGTTTAAATCCCCTATAATTGCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	98096	TTTACAAATTAGCTAAGTAAAATTGATGGTTTAAATCCCCTATAATTGCA	98145

AL672149.4	651	TCAGTTAATGATTCTACCTTAAGTCTTTTATGAATAACTAAATGCAGCAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	98146	TCAGTTAATGATTCTACCTTAAGTCTTTTATGAATAACTAAATGCAGCAT	98195

AL672149.4	701	TGGGTTCGTGTCCTAACGTTTTATCCTACTCATCAGATTATGCTACCAAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	98196	TGGGTTCGTGTCCTAACGTTTTATCCTACTCATCAGATTATGCTACCAAC	98245

AL672149.4	751	ACTGTGTTTGAATGATTCTGCGGTTGAGGTTAGAGATTAGGTAGTTTAGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	98246	ACTGTGTTTGAATGATTCTGCGGTTGAGGTTAGAGATTAGGTAGTTTAGA	98295

AL672149.4	801	GTGATATTACAGCTTCATATCACACTACTCCACATTAAAATTTACACTGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	98296	GTGATATTACAGCTTCATATCACACTACTCCACATTAAAATTTACACTGG	98345

AL672149.4	851	TAGCAAAATCTGATGGGTAGCATATTGCGTCATCAAAATGTGCGACATAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	98346	TAGCAAAATCTGATGGGTAGCATATTGCGTCATCAAAATGTGCGACATAC	98395

AL672149.4	901	TATTTCAATGGGAGGTAGGACGATCTGACAAAGTAGGACAAATCGACAAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	98396	TATTTCAATGGGAGGTAGGACGATCTGACAAAGTAGGACAAATCGACAAG	98445

AL672149.4	951	ACATCGGATTGTTTATAGTAGGGCTAGGTGATATGGCAAAAATGCAATCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	98446	ACATCGGATTGTTTATAGTAGGGCTAGGTGATATGGCAAAAATGCAATCT	98495

AL672149.4	1001	CGATAATCCTTTTCCATATTGATAAATAACGATATGTATTGCGATATAAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	98496	CGATAATCCTTTTCCATATTGATAAATAACGATATGTATTGCGATATAAG	98545

AL672149.4	1051	TTGTTAATGCTTCCAGAAAACAGTTTTCCAACAATGACTGAAGCCACAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	98546	TTGTTAATGCTTCCAGAAAACAGTTTTCCAACAATGACTGAAGCCACAAA	98595

AL672149.4	1101	GATCAGACGCTTTATTAAATAACATTTTAAACTGTTGTTTATTAACAAAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	98596	GATCAGACGCTTTATTAAATAACATTTTAAACTGTTGTTTATTAACAAAA	98645

AL672149.4	1151	ATAGCTTACACATAACTGATTTTTGGATGTTCCGATGTTCTGTCATATAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	98646	ATAGCTTACACATAACTGATTTTTGGATGTTCCGATGTTCTGTCATATAC	98695

AL672149.4	1201	TTTTGATATTCTGAAGAACTGTAACTGACAGTATAAATACAGAACACAAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	98696	TTTTGATATTCTGAAGAACTGTAACTGACAGTATAAATACAGAACACAAT	98745

AL672149.4	1251	AATAATAATAATAATTCCTTATATTTATATAGCACTTTTATGGATACTCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	98746	AATAATAATAATAATTCCTTATATTTATATAGCACTTTTATGGATACTCA	98795

AL672149.4	1301	AAGTTCTTTACAAATTTTTTGGGGACCAAAAGTGTGCAGCATCCTCCTGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	98796	AAGTTCTTTACAAATTTTTTGGGGACCAAAAGTGTGCAGCATCCTCCTGG	98845

AL672149.4	1351	ATGACACTACAGTAGCCATATCGCGCCAAACCGCACACCAGTTGATTAGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	98846	ATGACACTACAGTAGCCATATCGCGCCAAACCGCACACCAGTTGATTAGT	98895

AL672149.4	1401	GGAAAGGAGAAAGGGTGATGAAGCCAATTATGAAATGGGGATGGTTAGGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	98896	GGAAAGGAGAAAGGGTGATGAAGCCAATTATGAAATGGGGATGGTTAGGA	98945

AL672149.4	1451	TGTCATGATGGACAGAGGCCAGTGGGCAAATTTGTTAAACCCCTACTCTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	98946	TGTCATGATGGACAGAGGCCAGTGGGCAAATTTGTTAAACCCCTACTCTT	98995

AL672149.4	1501	TTTCCAAGGACATCCTGGGATTTTTAACAACCACAGAGAGTCATGTCCTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	98996	TTTCCAAGGACATCCTGGGATTTTTAACAACCACAGAGAGTCATGTCCTC	99045

AL672149.4	1551	GATTTAACATGTCATCTGAAAGATGGCACTCACTGAGCAGTACTTGCATG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	99046	GATTTAACATGTCATCTGAAAGATGGCACTCACTGAGCAGTACTTGCATG	99095

AL672149.4	1601	TACTTATTTCATTTTTAAAAAACAAAAAATTACAAAAATATTTTAAAATA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	99096	TACTTATTTCATTTTTAAAAAACAAAAAATTACAAAAATATTTTAAAATA	99145

AL672149.4	1651	AATGTTTTACTTAATTAAAAATGGCTAAATAGTAATCAATAAAATAAACA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	99146	AATGTTTTACTTAATTAAAAATGGCTAAATAGTAATCAATAAAATAAACA	99195

AL672149.4	1701	AGAGTTTAACAGCAAATACTGCCGGCAGGAAAGTGAATCGAGCTCGCTAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	99196	AGAGTTTAACAGCAAATACTGCCGGCAGGAAAGTGAATCGAGCTCGCTAA	99245

AL672149.4	1751	TCAATACTGGGTGGCGTAGCATATCTCTAATATCAACACAATGACAGATT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	99246	TCAATACTGGGTGGCGTAGCATATCTCTAATATCAACACAATGACAGATT	99295

AL672149.4	1801	CCCGCAAATGTCTGCTGCGTGATTGTCTCTTAGATCAATATCAAATAAAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	99296	CCCGCAAATGTCTGCTGCGTGATTGTCTCTTAGATCAATATCAAATAAAA	99345

AL672149.4	1851	ATGTCCATAGCTTATCATCGTTATCAACATTAATATTATCGCGATTCGAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	99346	ATGTCCATAGCTTATCATCGTTATCAACATTAATATTATCGCGATTCGAT	99395

AL672149.4	1901	ATAATATCGTTTATCGGCCCAGCCCTAGTTTACAGTAACTTTTTTACATT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	99396	ATAATATCGTTTATCGGCCCAGCCCTAGTTTACAGTAACTTTTTTACATT	99445

AL672149.4	1951	TTCGACTACAGCAACTTAACCGCTTTAAGTCAAGCTGAAAGTAAATGATC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592543.14	99446	TTCGACTACAGCAACTTAACCGCTTTAAGTCAAGCTGAAAGTAAATGATC	99495

Overview

Query
AL672149.4 - 15645 bps
Hit
AL592543.14 - 99495 bps
Total alignments
5
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001934200012000197496994951
291.2318928848765163-133203334871
385.168717454565629142786429671
4100323551635197-162595626291
589.0516730048645163-189200894911
Short-link