<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
AL590522.7 1 GAATTCTTGTAGCCTTAAGGCAGGTGGGTCTAAGTTTGCTGTCCATTAAT 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 162417 GAATTCTTGTAGCCTTAAGGCAGGTGGGTCTAAGTTTGCTGTCCATTAAT 162466 AL590522.7 51 GTCTCTTTCAGGGTCATGTCACTCAAAGGAAAAGTATTTCTGGCTTTTGG 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 162467 GTCTCTTTCAGGGTCATGTCACTCAAAGGAAAAGTATTTCTGGCTTTTGG 162516 AL590522.7 101 TAGCCAAGGGTAAGCTGAAGAAAACATCTTTTAGGTCCGGAACAGAATAC 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 162517 TAGCCAAGGGTAAGCTGAAGAAAACATCTTTTAGGTCCGGAACAGAATAC 162566 AL590522.7 151 CATTTCTGATCCGGAGATAGAGAGCTCAAAAGAGTATAAGGGTTAGCTAC 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 162567 CATTTCTGATCCGGAGATAGAGAGCTCAAAAGAGTATAAGGGTTAGCTAC 162616 AL590522.7 201 AGTTGGGTGTATGTCTATCACACTGTGGTTAACTTCCCGTAGATCTTGGA 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 162617 AGTTGGGTGTATGTCTATCACACTGTGGTTAACTTCCCGTAGATCTTGGA 162666 AL590522.7 251 CGGGGTAGTAGTCATTGGACTTTGGCTTCTTCACAGGCAATAATGGGGTG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 162667 CGGGGTAGTAGTCATTGGACTTTGGCTTCTTCACAGGCAATAATGGGGTG 162716 AL590522.7 301 TTCTAGGCTGACTGGCATGACCTAAGGACTCTTAAGGCCAACAGATTCTA 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 162717 TTCTAGGCTGACTGGCATGACCTAAGGACTCTTAAGGCCAACAGATTCTA 162766 AL590522.7 351 GATATGGGGAATGATCCCCTTTTGTGTCTCTTAGGACATGGGATATTGGC 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 162767 GATATGGGGAATGATCCCCTTTTGTGTCTCTTAGGACATGGGATATTGGC 162816 AL590522.7 401 AGACCTGTGCTGGGTGTACTCCTGGCTTGAGCTCTACAAATACACGGGTT 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 162817 AGACCTGTGCTGGGTGTACTCCTGGCTTGAGCTCTACAAATACACGGGTT 162866 AL590522.7 451 GAATGTTTTCCCTGTCCCATGTCTCTAGTCTCTGTCCATACCTAGGGAAA 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 162867 GAATGTTTTCCCTGTCCCATGTCTCTAGTCTCTGTCCATACCTAGGGAAA 162916 AL590522.7 501 CTCTGTCAGCCAGGCATCCAGGTCTTATTTGGGGGTGGATGGTGACTTGT 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 162917 CTCTGTCAGCCAGGCATCCAGGTCTTATTTGGGGGTGGATGGTGACTTGT 162966 AL590522.7 551 AGAGTCTAAATTTAGTCTCAAATGCCAGGCCCAGTGTCAGCACCTGGATT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 162967 AGAGTCTAAATTTAGTCTCAAATGCCAGGCCCAGTGTCAGCACCTGGATT 163016 AL590522.7 601 GGATTACCATTCCAGTCCATAAGCTGGATTTTCCCAGAGTCAAAATGAAT 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 163017 GGATTACCATTCCAGTCCATAAGCTGGATTTTCCCAGAGTCAAAATGAAT 163066 AL590522.7 651 CTGGGGTCTCATTTCAACTAGTAGATCTCTCTCCAACAAGGGGTATGGGC 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 163067 CTGGGGTCTCATTTCAACTAGTAGATCTCTCTCCAACAAGGGGTATGGGC 163116 AL590522.7 701 ATTTAGGAATCACTATGAAGGAGAGACACACTTGTCCTATTTTCAAGTCT 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 163117 ATTTAGGAATCACTATGAAGGAGAGACACACTTGTCCTATTTTCAAGTCT 163166 AL590522.7 751 ATTGTCCTTTGGGTAGTCCATGAATATTGTTTGGCACCTGAGGCTACCTG 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 163167 ATTGTCCTTTGGGTAGTCCATGAATATTGTTTGGCACCTGAGGCTACCTG 163216 AL590522.7 801 GACACAGGATTTCTAATTAGACAATGGTCTTTAACCTTTATGAGCACTGA 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 163217 GACACAGGATTTCTAATTAGACAATGGTCTTTAACCTTTATGAGCACTGA 163266 AL590522.7 851 ATGTTGGGCTCTTGTATCCACCAGGAAGTCTAAAGGCTCCCCCACCCACT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 163267 ATGTTGGGCTCTTGTATCCACCAGGAAGTCTAAAGGCTCCCCCACCCACT 163316 AL590522.7 901 CAAAGGGTTATCTTGGGCTTGGAGAAAGGGTCCAAGTCCTGACTTCCTCA 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 163317 CAAAGGGTTATCTTGGGCTTGGAGAAAGGGTCCAAGTCCTGACTTCCTCA 163366 AL590522.7 951 ATCTTCCTCTTCGTAGTTGATCATAGTCTTGTTTTAGGGATTTTCTTGGG 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 163367 ATCTTCCTCTTCGTAGTTGATCATAGTCTTGTTTTAGGGATTTTCTTGGG 163416 AL590522.7 1001 GGCGTTCTCTAGCCCAGTGTCTTTCCTCCTTACAATAAGCATATTGGTTC 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 163417 GGCGTTCTCTAGCCCAGTGTCTTTCCTCCTTACAATAAGCATATTGGTTC 163466 AL590522.7 1051 TTACCTAAGGCTGGTCAGTGTCCTTTTCTAGGTTCTCTCACCTCTGTGAT 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 163467 TTACCTAAGGCTGGTCAGTGTCCTTTTCTAGGTTCTCTCACCTCTGTGAT 163516 AL590522.7 1101 GTTCTGGAGCTGGTGTTTTCTTTTTGTCTGGTCAGGATTATCATTGGCTA 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 163517 GTTCTGGAGCTGGTGTTTTCTTTTTGTCTGGTCAGGATTATCATTGGCTA 163566 AL590522.7 1151 GCAGGACTTTGGTTAGATCTCTGTTTAACATTTTTCCTGTCTTAATTTTC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 163567 GCAGGACTTTGGTTAGATCTCTGTTTAACATTTTTCCTGTCTTAATTTTC 163616 AL590522.7 1201 TTTTCTTCTTTAGCTTCCCTGTTATGGAACACTTTCTCTCTGCACCTTCT 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 163617 TTTTCTTCTTTAGCTTCCCTGTTATGGAACACTTTCTCTCTGCACCTTCT 163666 AL590522.7 1251 ACTAAATCTCTTAATGCCTTTTCCCCTAGTCTTTTTAGTTTCTGTAACTT 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 163667 ACTAAATCTCTTAATGCCTTTTCCCCTAGTCTTTTTAGTTTCTGTAACTT 163716 AL590522.7 1301 CTTTTTAATATCTGGTCCTGACTGATTTATAAATGTTAGCACCATGGTAT 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 163717 CTTTTTAATATCTGGTCCTGACTGATTTATAAATGTTAGCACCATGGTAT 163766 AL590522.7 1351 TAGGATTTTCTGTTTCCTTGCAATCTAAGTGTGTGTATAATGGTAGAGCA 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 163767 TAGGATTTTCTGTTTCCTTGCAATCTAAGTGTGTGTATAATGGTAGAGCA 163816 AL590522.7 1401 TGTCTATAATCTTCTGGAGGAACACTGTTGGACTTCCATTATCTGATTGC 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 163817 TGTCTATAATCTTCTGGAGGAACACTGTTGGACTTCCATTATCTGATTGC 163866 AL590522.7 1451 CTGACATCATAAACTTTAACCAGATTTGTGGGCCACTTAGCAGCTGCCCT 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 163867 CTGACATCATAAACTTTAACCAGATTTGTGGGCCACTTAGCAGCTGCCCT 163916 AL590522.7 1501 GAGACCCGCCATTAGAGACTGGCAATAGACTGGAAGAAGCACCTTACCTG 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 163917 GAGACCCGCCATTAGAGACTGGCAATAGACTGGAAGAAGCACCTTACCTG 163966 AL590522.7 1551 TCCCTGTATTATAGTCCCAAGTTGGTCTCCAGAGAGAGAATCCCTCTTCA 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 163967 TCCCTGTATTATAGTCCCAAGTTGGTCTCCAGAGAGAGAATCCCTCTTCA 164016 AL590522.7 1601 ATATCATCTTGATTCTGAGTTGGAGTGCCATTGGTGCCTGGAACATTCTT 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 164017 ATATCATCTTGATTCTGAGTTGGAGTGCCATTGGTGCCTGGAACATTCTT 164066 AL590522.7 1651 CTGGGCCTCCAGGATGATGTGTTCCTTTTCCTCAGTTGTAAAGAGAATCT 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 164067 CTGGGCCTCCAGGATGATGTGTTCCTTTTCCTCAGTTGTAAAGAGAATCT 164116 AL590522.7 1701 GCAACAATTATTGACCATGGACTACCCCAGGTATGATCTTTGGTTGGTGG 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 164117 GCAACAATTATTGACCATGGACTACCCCAGGTATGATCTTTGGTTGGTGG 164166 AL590522.7 1751 CTTAGACTCTAGGAGATCAGAGGGGTTTCTTCATAAAATGTGTAACTGTA 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 164167 CTTAGACTCTAGGAGATCAGAGGGGTTTCTTCATAAAATGTGTAACTGTA 164216 AL590522.7 1801 TAGAGGTTTATGTGATTTATGAAATAGAAGATTAACAGAAATTCAGCAGT 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 164217 TAGAGGTTTATGTGATTTATGAAATAGAAGATTAACAGAAATTCAGCAGT 164266 AL590522.7 1851 TTTGTAGATCAACTGCGACCTGCTTCTAGACACCACAAATTGACTTGATG 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 164267 TTTGTAGATCAACTGCGACCTGCTTCTAGACACCACAAATTGACTTGATG 164316 AL590522.7 1901 ATTCTGCATCCACATGGACATTAGTCACAGATTAGTAAAGATGTTAGACA 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 164317 ATTCTGCATCCACATGGACATTAGTCACAGATTAGTAAAGATGTTAGACA 164366 AL590522.7 1951 TCATGAACAAGCCTTGAGGTTATATGAGTGGTTTAGCCCAAAGCATAAGA 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL592443.2 164367 TCATGAACAAGCCTTGAGGTTATATGAGTGGTTTAGCCCAAAGCATAAGA 164416
