<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL590522.7	1	GAATTCTTGTAGCCTTAAGGCAGGTGGGTCTAAGTTTGCTGTCCATTAAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	162417	GAATTCTTGTAGCCTTAAGGCAGGTGGGTCTAAGTTTGCTGTCCATTAAT	162466

AL590522.7	51	GTCTCTTTCAGGGTCATGTCACTCAAAGGAAAAGTATTTCTGGCTTTTGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	162467	GTCTCTTTCAGGGTCATGTCACTCAAAGGAAAAGTATTTCTGGCTTTTGG	162516

AL590522.7	101	TAGCCAAGGGTAAGCTGAAGAAAACATCTTTTAGGTCCGGAACAGAATAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	162517	TAGCCAAGGGTAAGCTGAAGAAAACATCTTTTAGGTCCGGAACAGAATAC	162566

AL590522.7	151	CATTTCTGATCCGGAGATAGAGAGCTCAAAAGAGTATAAGGGTTAGCTAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	162567	CATTTCTGATCCGGAGATAGAGAGCTCAAAAGAGTATAAGGGTTAGCTAC	162616

AL590522.7	201	AGTTGGGTGTATGTCTATCACACTGTGGTTAACTTCCCGTAGATCTTGGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	162617	AGTTGGGTGTATGTCTATCACACTGTGGTTAACTTCCCGTAGATCTTGGA	162666

AL590522.7	251	CGGGGTAGTAGTCATTGGACTTTGGCTTCTTCACAGGCAATAATGGGGTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	162667	CGGGGTAGTAGTCATTGGACTTTGGCTTCTTCACAGGCAATAATGGGGTG	162716

AL590522.7	301	TTCTAGGCTGACTGGCATGACCTAAGGACTCTTAAGGCCAACAGATTCTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	162717	TTCTAGGCTGACTGGCATGACCTAAGGACTCTTAAGGCCAACAGATTCTA	162766

AL590522.7	351	GATATGGGGAATGATCCCCTTTTGTGTCTCTTAGGACATGGGATATTGGC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	162767	GATATGGGGAATGATCCCCTTTTGTGTCTCTTAGGACATGGGATATTGGC	162816

AL590522.7	401	AGACCTGTGCTGGGTGTACTCCTGGCTTGAGCTCTACAAATACACGGGTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	162817	AGACCTGTGCTGGGTGTACTCCTGGCTTGAGCTCTACAAATACACGGGTT	162866

AL590522.7	451	GAATGTTTTCCCTGTCCCATGTCTCTAGTCTCTGTCCATACCTAGGGAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	162867	GAATGTTTTCCCTGTCCCATGTCTCTAGTCTCTGTCCATACCTAGGGAAA	162916

AL590522.7	501	CTCTGTCAGCCAGGCATCCAGGTCTTATTTGGGGGTGGATGGTGACTTGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	162917	CTCTGTCAGCCAGGCATCCAGGTCTTATTTGGGGGTGGATGGTGACTTGT	162966

AL590522.7	551	AGAGTCTAAATTTAGTCTCAAATGCCAGGCCCAGTGTCAGCACCTGGATT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	162967	AGAGTCTAAATTTAGTCTCAAATGCCAGGCCCAGTGTCAGCACCTGGATT	163016

AL590522.7	601	GGATTACCATTCCAGTCCATAAGCTGGATTTTCCCAGAGTCAAAATGAAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	163017	GGATTACCATTCCAGTCCATAAGCTGGATTTTCCCAGAGTCAAAATGAAT	163066

AL590522.7	651	CTGGGGTCTCATTTCAACTAGTAGATCTCTCTCCAACAAGGGGTATGGGC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	163067	CTGGGGTCTCATTTCAACTAGTAGATCTCTCTCCAACAAGGGGTATGGGC	163116

AL590522.7	701	ATTTAGGAATCACTATGAAGGAGAGACACACTTGTCCTATTTTCAAGTCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	163117	ATTTAGGAATCACTATGAAGGAGAGACACACTTGTCCTATTTTCAAGTCT	163166

AL590522.7	751	ATTGTCCTTTGGGTAGTCCATGAATATTGTTTGGCACCTGAGGCTACCTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	163167	ATTGTCCTTTGGGTAGTCCATGAATATTGTTTGGCACCTGAGGCTACCTG	163216

AL590522.7	801	GACACAGGATTTCTAATTAGACAATGGTCTTTAACCTTTATGAGCACTGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	163217	GACACAGGATTTCTAATTAGACAATGGTCTTTAACCTTTATGAGCACTGA	163266

AL590522.7	851	ATGTTGGGCTCTTGTATCCACCAGGAAGTCTAAAGGCTCCCCCACCCACT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	163267	ATGTTGGGCTCTTGTATCCACCAGGAAGTCTAAAGGCTCCCCCACCCACT	163316

AL590522.7	901	CAAAGGGTTATCTTGGGCTTGGAGAAAGGGTCCAAGTCCTGACTTCCTCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	163317	CAAAGGGTTATCTTGGGCTTGGAGAAAGGGTCCAAGTCCTGACTTCCTCA	163366

AL590522.7	951	ATCTTCCTCTTCGTAGTTGATCATAGTCTTGTTTTAGGGATTTTCTTGGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	163367	ATCTTCCTCTTCGTAGTTGATCATAGTCTTGTTTTAGGGATTTTCTTGGG	163416

AL590522.7	1001	GGCGTTCTCTAGCCCAGTGTCTTTCCTCCTTACAATAAGCATATTGGTTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	163417	GGCGTTCTCTAGCCCAGTGTCTTTCCTCCTTACAATAAGCATATTGGTTC	163466

AL590522.7	1051	TTACCTAAGGCTGGTCAGTGTCCTTTTCTAGGTTCTCTCACCTCTGTGAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	163467	TTACCTAAGGCTGGTCAGTGTCCTTTTCTAGGTTCTCTCACCTCTGTGAT	163516

AL590522.7	1101	GTTCTGGAGCTGGTGTTTTCTTTTTGTCTGGTCAGGATTATCATTGGCTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	163517	GTTCTGGAGCTGGTGTTTTCTTTTTGTCTGGTCAGGATTATCATTGGCTA	163566

AL590522.7	1151	GCAGGACTTTGGTTAGATCTCTGTTTAACATTTTTCCTGTCTTAATTTTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	163567	GCAGGACTTTGGTTAGATCTCTGTTTAACATTTTTCCTGTCTTAATTTTC	163616

AL590522.7	1201	TTTTCTTCTTTAGCTTCCCTGTTATGGAACACTTTCTCTCTGCACCTTCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	163617	TTTTCTTCTTTAGCTTCCCTGTTATGGAACACTTTCTCTCTGCACCTTCT	163666

AL590522.7	1251	ACTAAATCTCTTAATGCCTTTTCCCCTAGTCTTTTTAGTTTCTGTAACTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	163667	ACTAAATCTCTTAATGCCTTTTCCCCTAGTCTTTTTAGTTTCTGTAACTT	163716

AL590522.7	1301	CTTTTTAATATCTGGTCCTGACTGATTTATAAATGTTAGCACCATGGTAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	163717	CTTTTTAATATCTGGTCCTGACTGATTTATAAATGTTAGCACCATGGTAT	163766

AL590522.7	1351	TAGGATTTTCTGTTTCCTTGCAATCTAAGTGTGTGTATAATGGTAGAGCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	163767	TAGGATTTTCTGTTTCCTTGCAATCTAAGTGTGTGTATAATGGTAGAGCA	163816

AL590522.7	1401	TGTCTATAATCTTCTGGAGGAACACTGTTGGACTTCCATTATCTGATTGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	163817	TGTCTATAATCTTCTGGAGGAACACTGTTGGACTTCCATTATCTGATTGC	163866

AL590522.7	1451	CTGACATCATAAACTTTAACCAGATTTGTGGGCCACTTAGCAGCTGCCCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	163867	CTGACATCATAAACTTTAACCAGATTTGTGGGCCACTTAGCAGCTGCCCT	163916

AL590522.7	1501	GAGACCCGCCATTAGAGACTGGCAATAGACTGGAAGAAGCACCTTACCTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	163917	GAGACCCGCCATTAGAGACTGGCAATAGACTGGAAGAAGCACCTTACCTG	163966

AL590522.7	1551	TCCCTGTATTATAGTCCCAAGTTGGTCTCCAGAGAGAGAATCCCTCTTCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	163967	TCCCTGTATTATAGTCCCAAGTTGGTCTCCAGAGAGAGAATCCCTCTTCA	164016

AL590522.7	1601	ATATCATCTTGATTCTGAGTTGGAGTGCCATTGGTGCCTGGAACATTCTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	164017	ATATCATCTTGATTCTGAGTTGGAGTGCCATTGGTGCCTGGAACATTCTT	164066

AL590522.7	1651	CTGGGCCTCCAGGATGATGTGTTCCTTTTCCTCAGTTGTAAAGAGAATCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	164067	CTGGGCCTCCAGGATGATGTGTTCCTTTTCCTCAGTTGTAAAGAGAATCT	164116

AL590522.7	1701	GCAACAATTATTGACCATGGACTACCCCAGGTATGATCTTTGGTTGGTGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	164117	GCAACAATTATTGACCATGGACTACCCCAGGTATGATCTTTGGTTGGTGG	164166

AL590522.7	1751	CTTAGACTCTAGGAGATCAGAGGGGTTTCTTCATAAAATGTGTAACTGTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	164167	CTTAGACTCTAGGAGATCAGAGGGGTTTCTTCATAAAATGTGTAACTGTA	164216

AL590522.7	1801	TAGAGGTTTATGTGATTTATGAAATAGAAGATTAACAGAAATTCAGCAGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	164217	TAGAGGTTTATGTGATTTATGAAATAGAAGATTAACAGAAATTCAGCAGT	164266

AL590522.7	1851	TTTGTAGATCAACTGCGACCTGCTTCTAGACACCACAAATTGACTTGATG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	164267	TTTGTAGATCAACTGCGACCTGCTTCTAGACACCACAAATTGACTTGATG	164316

AL590522.7	1901	ATTCTGCATCCACATGGACATTAGTCACAGATTAGTAAAGATGTTAGACA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	164317	ATTCTGCATCCACATGGACATTAGTCACAGATTAGTAAAGATGTTAGACA	164366

AL590522.7	1951	TCATGAACAAGCCTTGAGGTTATATGAGTGGTTTAGCCCAAAGCATAAGA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL592443.2	164367	TCATGAACAAGCCTTGAGGTTATATGAGTGGTTTAGCCCAAAGCATAAGA	164416

Overview

Query
AL590522.7 - 211776 bps
Hit
AL592443.2 - 164416 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link