<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL513014.9	1	GAATTCCTAACTAATTGGGACCAGGTCTGAGGATCACTGCATAAATGTTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	51868	GAATTCCTAACTAATTGGGACCAGGTCTGAGGATCACTGCATAAATGTTT	51917

AL513014.9	51	TGTGATTAGCCCTCATGGAGGCTCCTGAGAGAAATGCCACCCACGGCAGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	51918	TGTGATTAGCCCTCATGGAGGCTCCTGAGAGAAATGCCACCCACGGCAGA	51967

AL513014.9	101	TGCGGTCTCCCGAAGAACTTATGGACTATTTTCCACCAATGAAAGACTGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	51968	TGCGGTCTCCCGAAGAACTTATGGACTATTTTCCACCAATGAAAGACTGT	52017

AL513014.9	151	CATTGGAAGCCTGCCACATGCTAGGCTCAGTTCTATTCTGGCTCCCAGGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	52018	CATTGGAAGCCTGCCACATGCTAGGCTCAGTTCTATTCTGGCTCCCAGGA	52067

AL513014.9	201	TCCAGCAGTGACTACAAAGTCCCTAAAGTCCCAGGTCTGGTGAAGTCACA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	52068	TCCAGCAGTGACTACAAAGTCCCTAAAGTCCCAGGTCTGGTGAAGTCACA	52117

AL513014.9	251	CAGCATTAGAGAGGGGGGACACAGACAGGAAAAGATGCAGAAATGCCCAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	52118	CAGCATTAGAGAGGGGGGACACAGACAGGAAAAGATGCAGAAATGCCCAG	52167

AL513014.9	301	AGTTGGGGGAGAGATGTGTTGTTGACAAATGAGGTGCAGGATGGGAAGGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	52168	AGTTGGGGGAGAGATGTGTTGTTGACAAATGAGGTGCAGGATGGGAAGGA	52217

AL513014.9	351	TCAGACATGGCCGCCCAGGAGGGATTGGCTGACAAATGCCTGAAGCCTAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	52218	TCAGACATGGCCGCCCAGGAGGGATTGGCTGACAAATGCCTGAAGCCTAA	52267

AL513014.9	401	AGGAAGTCAAAGTCTGGCCCTGTGGATGTCTAAAGGGAGAGTGTTCCAGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	52268	AGGAAGTCAAAGTCTGGCCCTGTGGATGTCTAAAGGGAGAGTGTTCCAGG	52317

AL513014.9	451	AATAGCAAAGAGGCCGCTGTGTCTGTAGCACAGCAGGAATGGCAGAGAGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	52318	AATAGCAAAGAGGCCGCTGTGTCTGTAGCACAGCAGGAATGGCAGAGAGT	52367

AL513014.9	501	GGTAGATGAGATCCAAGAACTTGGGGCGCCTCACCACTTCTAAAGTCCCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	52368	GGTAGATGAGATCCAAGAACTTGGGGCGCCTCACCACTTCTAAAGTCCCA	52417

AL513014.9	551	TAGAGTGTGTGCAGACTCGGGTTTTGACTGTGTATGAGACAGGGCTCATT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	52418	TAGAGTGTGTGCAGACTCGGGTTTTGACTGTGTATGAGACAGGGCTCATT	52467

AL513014.9	601	GGTCAGTGCTCCGTTGAATGATGCTATATTACCTACCTTCTAGCATTCTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	52468	GGTCAGTGCTCCGTTGAATGATGCTATATTACCTACCTTCTAGCATTCTG	52517

AL513014.9	651	GCTGTTCCCTTGACAGTAAAGTAAAGGGTTCAGCATGTACCTCAGTTGGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	52518	GCTGTTCCCTTGACAGTAAAGTAAAGGGTTCAGCATGTACCTCAGTTGGT	52567

AL513014.9	701	GGAGTGCCTGCTTAGCATGCTGGAAGCCCTGAGTTTGGTAAATGTCGCAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	52568	GGAGTGCCTGCTTAGCATGCTGGAAGCCCTGAGTTTGGTAAATGTCGCAT	52617

AL513014.9	751	GATAATACATGTCTGTAATTCTAGCAATCAGGTGATAGAAACCAGAGAAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	52618	GATAATACATGTCTGTAATTCTAGCAATCAGGTGATAGAAACCAGAGAAT	52667

AL513014.9	801	AGAAGTTCAAGGTCATCCTTGGCTACATAATGAGTTCTGGGTCAGCCTGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	52668	AGAAGTTCAAGGTCATCCTTGGCTACATAATGAGTTCTGGGTCAGCCTGG	52717

AL513014.9	851	GACCTGGAACACACAGGGTCTGACCCCAAAAAAGTAGAATACAAAGGCAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	52718	GACCTGGAACACACAGGGTCTGACCCCAAAAAAGTAGAATACAAAGGCAA	52767

AL513014.9	901	GCAACCAATGGGAGCACCATTAGAGGAATCCAGATGACAGCTGGTAGAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	52768	GCAACCAATGGGAGCACCATTAGAGGAATCCAGATGACAGCTGGTAGAAA	52817

AL513014.9	951	CTCGATGAGACCCTACTGTGCTTGAGCCAGGGATATGTGGCGTGGGATGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	52818	CTCGATGAGACCCTACTGTGCTTGAGCCAGGGATATGTGGCGTGGGATGA	52867

AL513014.9	1001	GTAGGCAAGAATGAGACCAAGTTGGGCTTGAATATCTTGAAAGGTATCAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	52868	GTAGGCAAGAATGAGACCAAGTTGGGCTTGAATATCTTGAAAGGTATCAT	52917

AL513014.9	1051	TGTTCTTTGTTTCTTGAGATGATGGTGGCTGTTGAGAGAGCTGGTGGGGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	52918	TGTTCTTTGTTTCTTGAGATGATGGTGGCTGTTGAGAGAGCTGGTGGGGG	52967

AL513014.9	1101	CTAGGGGAGCCAGCGTGGGCTGAGGAGACCAGAATCAGATATGGACAGTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	52968	CTAGGGGAGCCAGCGTGGGCTGAGGAGACCAGAATCAGATATGGACAGTC	53017

AL513014.9	1151	AAGCTTATAGAAATTGGGATGGCTTTGGGAAGTCCTCTATATACTCAAAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	53018	AAGCTTATAGAAATTGGGATGGCTTTGGGAAGTCCTCTATATACTCAAAA	53067

AL513014.9	1201	TAGTGGAGACTCAAGAAATGTCTGTTGAAATGTTGACTGTAAAGCAGCAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	53068	TAGTGGAGACTCAAGAAATGTCTGTTGAAATGTTGACTGTAAAGCAGCAT	53117

AL513014.9	1251	AAATATGCATAAAGATTATCCATAGATGTAGCCCTAGTTTGTGGGAATTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	53118	AAATATGCATAAAGATTATCCATAGATGTAGCCCTAGTTTGTGGGAATTC	53167

AL513014.9	1301	AAGCTATAGAAATCTCTATAGACTGTTCCAGAAGACCAGGAGTTCAGCAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	53168	AAGCTATAGAAATCTCTATAGACTGTTCCAGAAGACCAGGAGTTCAGCAA	53217

AL513014.9	1351	TGCAATGTTAACTGTTGGAAACTCTCCAGGGAGGGTCAGGGAAAGTCGAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	53218	TGCAATGTTAACTGTTGGAAACTCTCCAGGGAGGGTCAGGGAAAGTCGAG	53267

AL513014.9	1401	GGAGAAAGGGCTAGAATACCTTGTGCAGGTATAGGAGTTTTCACCTGCAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	53268	GGAGAAAGGGCTAGAATACCTTGTGCAGGTATAGGAGTTTTCACCTGCAG	53317

AL513014.9	1451	ACGTGAGAGTGTCGTATCACTGGAAGCTGTGTGTCATACCCTTGCTAATT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	53318	ACGTGAGAGTGTCGTATCACTGGAAGCTGTGTGTCATACCCTTGCTAATT	53367

AL513014.9	1501	ATAGAAGTGTGTATGCAAACTGCCTCTGACCACTCTCAGTCTTTGATGCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	53368	ATAGAAGTGTGTATGCAAACTGCCTCTGACCACTCTCAGTCTTTGATGCT	53417

AL513014.9	1551	CTACATACCCAGTTCTAGTGCTTGCTCTTCGGCCTTTTGGGTCCAAGGCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	53418	CTACATACCCAGTTCTAGTGCTTGCTCTTCGGCCTTTTGGGTCCAAGGCT	53467

AL513014.9	1601	GTACCTCACAGGCTCTCTGCTGGAGGAGACCTACAGGGGTTATTGATTTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	53468	GTACCTCACAGGCTCTCTGCTGGAGGAGACCTACAGGGGTTATTGATTTA	53517

AL513014.9	1651	TTCTACCTCAAAGAAGGAAGCAGGGGTGTCTCCCAGTTCTTGAACTCCCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	53518	TTCTACCTCAAAGAAGGAAGCAGGGGTGTCTCCCAGTTCTTGAACTCCCC	53567

AL513014.9	1701	ACATGCTGTTTTCAATTTCTCTTTATTGTAATCTTTCTGTAAGACGGTCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	53568	ACATGCTGTTTTCAATTTCTCTTTATTGTAATCTTTCTGTAAGACGGTCC	53617

AL513014.9	1751	TTTGCAGCAGGGCTTTGTATTGGAGCATGTTACTTCTTCAGTGCTAGGGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	53618	TTTGCAGCAGGGCTTTGTATTGGAGCATGTTACTTCTTCAGTGCTAGGGC	53667

AL513014.9	1801	TCAAACTGAGGACCTTAAGGAGAACTCTAGGCAGGTACTTTACTGCTGAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	53668	TCAAACTGAGGACCTTAAGGAGAACTCTAGGCAGGTACTTTACTGCTGAG	53717

AL513014.9	1851	CTATAGCCCCCTTCCTCTTTGTAGCCTAGAAAAAAAATTAAAAGAACCTA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	53718	CTATAGCCCCCTTCCTCTTTGTAGCCTAGAAAAAAAATTAAAAGAACCTA	53767

AL513014.9	1901	TTACCATACCAGGAACTCTCCCAAATTCTGAAATAGACAGTCCAGTATTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	53768	TTACCATACCAGGAACTCTCCCAAATTCTGAAATAGACAGTCCAGTATTT	53817

AL513014.9	1951	TTCCATCACCAAGCACTTGAGTTGAATAATGTATCTACTGCGGGACAAAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591851.12	53818	TTCCATCACCAAGCACTTGAGTTGAATAATGTATCTACTGCGGGACAAAA	53867

Overview

Query
AL513014.9 - 80460 bps
Hit
AL591851.12 - 53867 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link