<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL589679.14	1	GAATTCCACAGAACATTAATCTCCACAGAACTGCTGTGCCTGAGAGGAAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	92891	GAATTCCACAGAACATTAATCTCCACAGAACTGCTGTGCCTGAGAGGAAT	92940

AL589679.14	51	TGGGAAAGTTTCTTTCCTAGATGGGGTGGGGACTCTTGACAATTCAGAAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	92941	TGGGAAAGTTTCTTTCCTAGATGGGGTGGGGACTCTTGACAATTCAGAAG	92990

AL589679.14	101	ATCTTATGACAATCATTTTCTGTATTGCTTATACATTAACACATTAAGTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	92991	ATCTTATGACAATCATTTTCTGTATTGCTTATACATTAACACATTAAGTG	93040

AL589679.14	151	AAATATACTTTTCATATAGAAAGTTTCAATAAAGTACACAAAATATAGAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	93041	AAATATACTTTTCATATAGAAAGTTTCAATAAAGTACACAAAATATAGAA	93090

AL589679.14	201	TAGATGAATCTGAGAAGAAGAAAAGAATCAGGACACTCTATCAAAACTAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	93091	TAGATGAATCTGAGAAGAAGAAAAGAATCAGGACACTCTATCAAAACTAA	93140

AL589679.14	251	TATAGTATAAATGGCGTGCGCGCACACACACACACACACACACAGACACA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	93141	TATAGTATAAATGGCGTGCGCGCACACACACACACACACACACAGACACA	93190

AL589679.14	301	CACACATTTATATACATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	93191	CACACATTTATATACATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	93240

AL589679.14	351	TGTAATTGAATGTGGAATTTTTAAAAAGTCAGTCAGAAGTTATAGAGAGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	93241	TGTAATTGAATGTGGAATTTTTAAAAAGTCAGTCAGAAGTTATAGAGAGA	93290

AL589679.14	401	GAGAGGAATAGAGAGAGAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGATATTGC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	93291	GAGAGGAATAGAGAGAGAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGATATTGC	93340

AL589679.14	451	CAAAGAGCACCTTGCATGTTCACCATCTGTTTACTTGTATAAAGATATAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	93341	CAAAGAGCACCTTGCATGTTCACCATCTGTTTACTTGTATAAAGATATAA	93390

AL589679.14	501	CTTGTATGAGATCAGTGTCATATCAGAAAATATATATGCCTGTCTCCAAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	93391	CTTGTATGAGATCAGTGTCATATCAGAAAATATATATGCCTGTCTCCAAA	93440

AL589679.14	551	TTCTGTTTTGGTGTTTAAGTTCCTTATATTAAATTCCATGGTTTCTCACC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	93441	TTCTGTTTTGGTGTTTAAGTTCCTTATATTAAATTCCATGGTTTCTCACC	93490

AL589679.14	601	AAGAACTTAAACACCTCTATTTTCTTCTAAATATTATTTAAAATTTAAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	93491	AAGAACTTAAACACCTCTATTTTCTTCTAAATATTATTTAAAATTTAAAA	93540

AL589679.14	651	GAAATATGCACTGGGAGATGTCTCATGTCTCATGCATTTTGGGAATGTGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	93541	GAAATATGCACTGGGAGATGTCTCATGTCTCATGCATTTTGGGAATGTGT	93590

AL589679.14	701	GAGGACTTGCCAGTTCCAGATTTTTATCTCAGAAGAGTGATGTGATGTTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	93591	GAGGACTTGCCAGTTCCAGATTTTTATCTCAGAAGAGTGATGTGATGTTT	93640

AL589679.14	751	TCACTCTATAACACTCAGACAAGGGAATCAGATTGAAGCAGACTGAAGAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	93641	TCACTCTATAACACTCAGACAAGGGAATCAGATTGAAGCAGACTGAAGAT	93690

AL589679.14	801	TAGATCCATGTAAGAGTAAGAGTAAATGTCTCAAAAGTCAAGGTAAATGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	93691	TAGATCCATGTAAGAGTAAGAGTAAATGTCTCAAAAGTCAAGGTAAATGC	93740

AL589679.14	851	CAAGGTGAAAATTTACCCCAAATGAGTGCTGACATCCAAATCTTGTGTAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	93741	CAAGGTGAAAATTTACCCCAAATGAGTGCTGACATCCAAATCTTGTGTAT	93790

AL589679.14	901	TTAATACTACAAAAAAATGAACTATGCACACATGCCCACACACACACAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	93791	TTAATACTACAAAAAAATGAACTATGCACACATGCCCACACACACACAAA	93840

AL589679.14	951	CACACACACACACGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	93841	CACACACACACACGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	93890

AL589679.14	1001	AGAGAGAGACAGAGAGAGACAGAGAGAGGATAATGTCAATAATACCATTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	93891	AGAGAGAGACAGAGAGAGACAGAGAGAGGATAATGTCAATAATACCATTC	93940

AL589679.14	1051	CATTCGATGTTTAGACTCAGGCTAACATTGAAGAAAATGAAAATTTTGAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	93941	CATTCGATGTTTAGACTCAGGCTAACATTGAAGAAAATGAAAATTTTGAC	93990

AL589679.14	1101	TACCCTGCTTGGTCTGGACTCGAAGAACTGCAGTCACCTAATGAAGACAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	93991	TACCCTGCTTGGTCTGGACTCGAAGAACTGCAGTCACCTAATGAAGACAC	94040

AL589679.14	1151	TCATCTTTTTGCCGTTTATAATCTATGCCGCTGCATTAAAAGGGACATCC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	94041	TCATCTTTTTGCCGTTTATAATCTATGCCGCTGCATTAAAAGGGACATCC	94090

AL589679.14	1201	ATAAGATAGACAGCTATATCAAAGTCTTGAGGTGCCGAGTTGTCTTTCAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	94091	ATAAGATAGACAGCTATATCAAAGTCTTGAGGTGCCGAGTTGTCTTTCAG	94140

AL589679.14	1251	AACGAATGTTGAGTGCCCACCCAGCGAAGCCCTGCCCACATGGTCTTTGT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	94141	AACGAATGTTGAGTGCCCACCCAGCGAAGCCCTGCCCACATGGTCTTTGT	94190

AL589679.14	1301	TGAACCAGACTTGTAATGCTTTCCCCTCCTCAGTTATGTAGAGCTATAAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	94191	TGAACCAGACTTGTAATGCTTTCCCCTCCTCAGTTATGTAGAGCTATAAT	94240

AL589679.14	1351	GGAATTATTGTCATAAAATAAAATAAAATTATTTAGATTCAATGTGAAAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	94241	GGAATTATTGTCATAAAATAAAATAAAATTATTTAGATTCAATGTGAAAT	94290

AL589679.14	1401	TTGAAGTGTCTTGTTTCCCTTTAATATCATTTGGGTCCAGGCGTTGGTGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	94291	TTGAAGTGTCTTGTTTCCCTTTAATATCATTTGGGTCCAGGCGTTGGTGA	94340

AL589679.14	1451	TGTGTTGCATGTAACATTCTCAAGTTTGACAGTCACATAAGCTATTGTAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	94341	TGTGTTGCATGTAACATTCTCAAGTTTGACAGTCACATAAGCTATTGTAG	94390

AL589679.14	1501	ATCTCAGTGAACAGAGGTAGACAAATTAACACAACCAAAGAGATTGGCAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	94391	ATCTCAGTGAACAGAGGTAGACAAATTAACACAACCAAAGAGATTGGCAC	94440

AL589679.14	1551	AATTCATCAGCTCTGTGATATCAAGAAGATAGATATATCTGAGGTAGTTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	94441	AATTCATCAGCTCTGTGATATCAAGAAGATAGATATATCTGAGGTAGTTT	94490

AL589679.14	1601	ATTTAAAAAACATTTTATTAGCAAATTGTTAGGCTAATAACAAATAAGTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	94491	ATTTAAAAAACATTTTATTAGCAAATTGTTAGGCTAATAACAAATAAGTT	94540

AL589679.14	1651	CAATTTCTATTTTACTATTCCTAATTACAATTATTTTAAATATTCCACAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	94541	CAATTTCTATTTTACTATTCCTAATTACAATTATTTTAAATATTCCACAA	94590

AL589679.14	1701	TATACAAGTGGAGAAGTATGAAACATATATGTATTTCTCCAGCCCATCTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	94591	TATACAAGTGGAGAAGTATGAAACATATATGTATTTCTCCAGCCCATCTG	94640

AL589679.14	1751	GCACCTTGATTATCTTTAAGGTCAGCTTAGAAAGAATCCACATGCTTAGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	94641	GCACCTTGATTATCTTTAAGGTCAGCTTAGAAAGAATCCACATGCTTAGA	94690

AL589679.14	1801	TTTATGTGGTTCTGTCAACATTTCATGTCATATCCAGGGTATGTGACACT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	94691	TTTATGTGGTTCTGTCAACATTTCATGTCATATCCAGGGTATGTGACACT	94740

AL589679.14	1851	CTCTTCACCCTCCAGATTTTAAGGTTTCATAGCAGTGAAGGCTGAATGTA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	94741	CTCTTCACCCTCCAGATTTTAAGGTTTCATAGCAGTGAAGGCTGAATGTA	94790

AL589679.14	1901	TACATTATTGATGTTTCTGCACTATCCCCTTTCATTAATGGTGTCTGAAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	94791	TACATTATTGATGTTTCTGCACTATCCCCTTTCATTAATGGTGTCTGAAT	94840

AL589679.14	1951	TTCTTGAAAACAAGGATAAATGAAAAAAATTGTGATAAATTAATTTTGAT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591843.14	94841	TTCTTGAAAACAAGGATAAATGAAAAAAATTGTGATAAATTAATTTTGAT	94890

Overview

Query
AL589679.14 - 207737 bps
Hit
AL591843.14 - 94890 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link