<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662889.5	1	TACATTCAATCTGTCAAGCAATCCTGTTGGTTCTTCATCAAAATACACCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	81115	TACATTCAATCTGTCAAGCAATCCTGTTGGTTCTTCATCAAAATACACCC	81164

AL662889.5	51	AAGGTCTCATTATCATCACTACCTCCATTGCTACTACCCTAGTACAAGCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	81165	AAGGTCTCATTATCATCACTACCTCCATTGCTACTACCCTAGTACAAGCC	81214

AL662889.5	101	ACTATCATCAATTATCTAGATTACTGCTGCAATTAGCAAACTATCTGCTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	81215	ACTATCATCAATTATCTAGATTACTGCTGCAATTAGCAAACTATCTGCTT	81264

AL662889.5	151	CCAATCCACAGTCTATTGTCAACACTGCAGCCAAAGTGATACTGAAAACT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	81265	CCAATCCACAGTCTATTGTCAACACTGCAGCCAAAGTGATACTGAAAACT	81314

AL662889.5	201	AGACTGTGTAACTACACGGCATAAAAATTTCCAAAGGCTTCCCACTTCAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	81315	AGACTGTGTAACTACACGGCATAAAAATTTCCAAAGGCTTCCCACTTCAT	81364

AL662889.5	251	TCACAGTAAAAGCCAATATCCTTACAAACATCCTACACCATTCTTGTTCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	81365	TCACAGTAAAAGCCAATATCCTTACAAACATCCTACACCATTCTTGTTCC	81414

AL662889.5	301	ACACCATGCTAGACTCCTAGCTATTCAAAGAATGTGTTAGAATGTGCTAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	81415	ACACCATGCTAGACTCCTAGCTATTCAAAGAATGTGTTAGAATGTGCTAA	81464

AL662889.5	351	GTAAGCTCCCTCCTCAGGGCCTTCTCAATTGCTATTTCCCCTTGCTGGAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	81465	GTAAGCTCCCTCCTCAGGGCCTTCTCAATTGCTATTTCCCCTTGCTGGAA	81514

AL662889.5	401	CATTCTTCCTTCAAAATATCTAAAGGACTTGCTTCCTGATCTCCTTCAAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	81515	CATTCTTCCTTCAAAATATCTAAAGGACTTGCTTCCTGATCTCCTTCAAA	81564

AL662889.5	451	TGCTTGCTGAAATTTCACCTTTCAGTGAGGCCTTCCATAGTCATGCTATT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	81565	TGCTTGCTGAAATTTCACCTTTCAGTGAGGCCTTCCATAGTCATGCTATT	81614

AL662889.5	501	TAAAACTGCATTAAGTCCCCAAAATCGCTACCATCATTATTCCTTATTTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	81615	TAAAACTGCATTAAGTCCCCAAAATCGCTACCATCATTATTCCTTATTTC	81664

AL662889.5	551	CCTACTCCACTTTTCTCTGTAAGTATGGATTAGTTTATTACATACTCTAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	81665	CCTACTCCACTTTTCTCTGTAAGTATGGATTAGTTTATTACATACTCTAT	81714

AL662889.5	601	GGTTTATTTATTATGTGTATTATTTATTCTCTAATTGCTGACTTGAATAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	81715	GGTTTATTTATTATGTGTATTATTTATTCTCTAATTGCTGACTTGAATAA	81764

AL662889.5	651	AATTTCCCAAAGGAGAGGAGTTTGTCAGTTTTATTCGTTCAAATGGTCCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	81765	AATTTCCCAAAGGAGAGGAGTTTGTCAGTTTTATTCGTTCAAATGGTCCC	81814

AL662889.5	701	AGTGCCTAGAGCAGTACCTAGCAAATAATTAGGTGTTCGACATATATTTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	81815	AGTGCCTAGAGCAGTACCTAGCAAATAATTAGGTGTTCGACATATATTTA	81864

AL662889.5	751	TTGAAATAATGAGTGAATGAACTAGTAAATAACGAATAACCTTGGTGCAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	81865	TTGAAATAATGAGTGAATGAACTAGTAAATAACGAATAACCTTGGTGCAT	81914

AL662889.5	801	GCTGCTGAAGAATAGAAGCTACACGAACTACATGAAATAACTCTAGAACA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	81915	GCTGCTGAAGAATAGAAGCTACACGAACTACATGAAATAACTCTAGAACA	81964

AL662889.5	851	TAAATCACTGAAATCATACTCCCAATAGAACAATGACAGTTGATGAAGGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	81965	TAAATCACTGAAATCATACTCCCAATAGAACAATGACAGTTGATGAAGGT	82014

AL662889.5	901	ATAGCAGATCAAACCATTATCTGCTTCCTACAATAAACCACAATCGTTGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	82015	ATAGCAGATCAAACCATTATCTGCTTCCTACAATAAACCACAATCGTTGA	82064

AL662889.5	951	TGCAATGTTTAATACAGAGGTTCAAAAGAATATGAAAGAAGAGAACAAAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	82065	TGCAATGTTTAATACAGAGGTTCAAAAGAATATGAAAGAAGAGAACAAAG	82114

AL662889.5	1001	TAACTGGCTGATCACGTTAAGAGATTTCAGTTAAGATCCACCAGTAAGAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	82115	TAACTGGCTGATCACGTTAAGAGATTTCAGTTAAGATCCACCAGTAAGAA	82164

AL662889.5	1051	CTTAAGAGTCCAAGGAAAAAGAGATGCCAGTAATCAAGCAAACGCATTGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	82165	CTTAAGAGTCCAAGGAAAAAGAGATGCCAGTAATCAAGCAAACGCATTGG	82214

AL662889.5	1101	GTTATTTTAATGGACTTACGTGCAGAAAAAGGGTAACACATCAGGCCTGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	82215	GTTATTTTAATGGACTTACGTGCAGAAAAAGGGTAACACATCAGGCCTGG	82264

AL662889.5	1151	GTTGCCCAAACTCTACACATTCCCAAAAAAGTCAGTCTTCAGAACTGGCG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	82265	GTTGCCCAAACTCTACACATTCCCAAAAAAGTCAGTCTTCAGAACTGGCG	82314

AL662889.5	1201	CCGTTGGCCAACTCCTGGGAAATGAATTCTGAGCCTCTGAAATATTCTGC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	82315	CCGTTGGCCAACTCCTGGGAAATGAATTCTGAGCCTCTGAAATATTCTGC	82364

AL662889.5	1251	CTGGTCAGAGTATTTTTGTATGCTGGAGATCTTGGGCCACATGGTACCAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	82365	CTGGTCAGAGTATTTTTGTATGCTGGAGATCTTGGGCCACATGGTACCAG	82414

AL662889.5	1301	TTTGACTAGATAGTTTATGCAAACAACAGGATGCATGATTAATACTTCGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	82415	TTTGACTAGATAGTTTATGCAAACAACAGGATGCATGATTAATACTTCGT	82464

AL662889.5	1351	GCCTGATTTTGCTCTGAGAGGTTGGAATCTGAGCATCTCAGGGCAGTCAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	82465	GCCTGATTTTGCTCTGAGAGGTTGGAATCTGAGCATCTCAGGGCAGTCAT	82514

AL662889.5	1401	GAAGGTACTGCTTGCCTATGTGACTGACTTCCAATAAAAACCCTGGACAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	82515	GAAGGTACTGCTTGCCTATGTGACTGACTTCCAATAAAAACCCTGGACAC	82564

AL662889.5	1451	CAAGGCTCAGGTAAGCTTCTTTAGTTGACAACACTTCACTACTGGGAGAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	82565	CAAGGCTCAGGTAAGCTTCTTTAGTTGACAACACTTCACTACTGGGAGAA	82614

AL662889.5	1501	TTAAAATTAACCATCACAGATGCACTTATGTGTCAACTTGACTGGATTAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	82615	TTAAAATTAACCATCACAGATGCACTTATGTGTCAACTTGACTGGATTAA	82664

AL662889.5	1551	GGAATACCTAGAGAACTGGTAAAGCATTACTAATAGCTGTTTCTGTGTTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	82665	GGAATACCTAGAGAACTGGTAAAGCATTACTAATAGCTGTTTCTGTGTTT	82714

AL662889.5	1601	CCAGAGGAGACTGGAATGTGAATTGATGGACTGAGTGAGAAATATTCACC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	82715	CCAGAGGAGACTGGAATGTGAATTGATGGACTGAGTGAGAAATATTCACC	82764

AL662889.5	1651	CACAATGTGAGCAGACACCATCCAATCAACTAAGAGCCCAAATAGGACCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	82765	CACAATGTGAGCAGACACCATCCAATCAACTAAGAGCCCAAATAGGACCC	82814

AL662889.5	1701	AAAAAAGCAAAGAAAAGGCACTCTCCTGGAATGGGGACACTCCTCTTCTC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	82815	AAAAAAGCAAAGAAAAGGCACTCTCCTGGAATGGGGACACTCCTCTTCTC	82864

AL662889.5	1751	CTGTCCTTGGACATCAGAACTCTAGGCTCTCTGACATTTGGACTCCAGGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	82865	CTGTCCTTGGACATCAGAACTCTAGGCTCTCTGACATTTGGACTCCAGGC	82914

AL662889.5	1801	TTTATACCAGCAACTCCCTAGTTTCCCACCAAAACCCAGGTTCCTGGCCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	82915	TTTATACCAGCAACTCCCTAGTTTCCCACCAAAACCCAGGTTCCTGGCCC	82964

AL662889.5	1851	TTAGCCTCAGACTAAGAATTACACCATCAGCTTCCCAGGGAACTTGGACG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	82965	TTAGCCTCAGACTAAGAATTACACCATCAGCTTCCCAGGGAACTTGGACG	83014

AL662889.5	1901	GAGATACGTTACCAGCATCCCAAGGTCTCCAGCTTCCAGATGGCCTGTCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	83015	GAGATACGTTACCAGCATCCCAAGGTCTCCAGCTTCCAGATGGCCTGTCT	83064

AL662889.5	1951	TGGGAATTTTCAACCTCCATAATCACATGAGCCAATTTCCCAGTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591721.7	83065	TGGGAATTTTCAACCTCCATAATCACATGAGCCAATTTCCCAGTGAATTC	83114

Overview

Query
AL662889.5 - 127036 bps
Hit
AL591721.7 - 83114 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link