<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1999 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL591589.5	1	ATGTAATCATGTAGCTATAACTTTTTATCTGTTTCACAGCATACTAAATG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	94047	ATGTAATCATGTAGCTATAACTTTTTATCTGTTTCACAGCATACTAAATG	94096

AL591589.5	51	TGTTGTATATGTATGGACATATTTAGCCATACAAATTTGAATTATTAAAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	94097	TGTTGTATATGTATGGACATATTTAGCCATACAAATTTGAATTATTAAAT	94146

AL591589.5	101	TGGTAAAGCTGTACACAATCAGCACAATTTAAAGAGATTATTGACAGTTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	94147	TGGTAAAGCTGTACACAATCAGCACAATTTAAAGAGATTATTGACAGTTG	94196

AL591589.5	151	AGTAAGTTGTTATTTCCTTCTGTCTGTAATACAGGTATGATACCTACAGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	94197	AGTAAGTTGTTATTTCCTTCTGTCTGTAATACAGGTATGATACCTACAGT	94246

AL591589.5	201	ATGTATCATACAAGTTCTTTGGTGTTGCTATGTTTTGCACCACATTCATC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	94247	ATGTATCATACAAGTTCTTTGGTGTTGCTATGTTTTGCACCACATTCATC	94296

AL591589.5	251	CATACAGATAGTGCTACTGCTTCACCTGAAATTGATGTTGATACTGAATG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	94297	CATACAGATAGTGCTACTGCTTCACCTGAAATTGATGTTGATACTGAATG	94346

AL591589.5	301	TGGTCATAATGAGAATCAATTTTTGATTACTTCTAGATAAAGTTGAAAAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	94347	TGGTCATAATGAGAATCAATTTTTGATTACTTCTAGATAAAGTTGAAAAC	94396

AL591589.5	351	TTCTTGTATAAAATTGCTTTCAGTTTGAACTGCCACAAAATACCACCAGC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	94397	TTCTTGTATAAAATTGCTTTCAGTTTGAACTGCCACAAAATACCACCAGC	94446

AL591589.5	401	AAATAATCATAAAGAGGGCATGTTGTGTGAAAGTTCACACTTTGCTGTGC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	94447	AAATAATCATAAAGAGGGCATGTTGTGTGAAAGTTCACACTTTGCTGTGC	94496

AL591589.5	451	TGTATCAAAACATGGATTTACAGCCAAGTTGTAGCTGCCATCTACATCCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	94497	TGTATCAAAACATGGATTTACAGCCAAGTTGTAGCTGCCATCTACATCCT	94546

AL591589.5	501	TTTCGTTTGCTTTTCCACTTATCCGTGAACCACATACTATGGGTTCATTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	94547	TTTCGTTTGCTTTTCCACTTATCCGTGAACCACATACTATGGGTTCATTG	94596

AL591589.5	551	ATCCAGTAGTATTAATGTCCCACACCAAGCACTCTCATGTAGTAATGTAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	94597	ATCCAGTAGTATTAATGTCCCACACCAAGCACTCTCATGTAGTAATGTAG	94646

AL591589.5	601	AGTCTGGCAAAATATAAGGGCAGCATCTAGAGACAAAAATACAAACACAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	94647	AGTCTGGCAAAATATAAGGGCAGCATCTAGAGACAAAAATACAAACACAG	94696

AL591589.5	651	CATTAAACATTGCCATTTTCTTTCTTTAGCCTTAACATCACATTAACCAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	94697	CATTAAACATTGCCATTTTCTTTCTTTAGCCTTAACATCACATTAACCAA	94746

AL591589.5	701	CTACGAGTACTAGAGAAAGAGAGAATAATGTTTTCAAACTGTCAATTCTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	94747	CTACGAGTACTAGAGAAAGAGAGAATAATGTTTTCAAACTGTCAATTCTG	94796

AL591589.5	751	AATTCATCTCTTTATAAAATGATACCCTAATTTGGCTGATGGATTCATAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	94797	AATTCATCTCTTTATAAAATGATACCCTAATTTGGCTGATGGATTCATAA	94846

AL591589.5	801	GTGTTTCTTTTTTTACTCTTGCAGTCCTAAATCACGTTCTGCTTGGCTTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	94847	GTGTTTCTTTTTTTACTCTTGCAGTCCTAAATCACGTTCTGCTTGGCTTG	94896

AL591589.5	851	ACAGCAGTAGTTGTGGAATCAGTACCTCGAGGCTGTGAGATTCATGAAAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	94897	ACAGCAGTAGTTGTGGAATCAGTACCTCGAGGCTGTGAGATTCATGAAAG	94946

AL591589.5	901	CAGTAGACTAACTATTTCTGATGCAGAAACCCGAAACTCAGGCTCTCAAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	94947	CAGTAGACTAACTATTTCTGATGCAGAAACCCGAAACTCAGGCTCTCAAG	94996

AL591589.5	951	AAAAAAAAAATCTTCTGAAATGGACCATGTAGAAGTGCGTTTAAGCCTAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	94997	AAAAAAAAAATCTTCTGAAATGGACCATGTAGAAGTGCGTTTAAGCCTAT	95046

AL591589.5	1001	AAAACACTGTGTGCTTGAAGAGAGCCACTCCCATCTCAAATCACTGTCAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	95047	AAAACACTGTGTGCTTGAAGAGAGCCACTCCCATCTCAAATCACTGTCAT	95096

AL591589.5	1051	TACGGGGAAAACAAGTTGAGACTTGATTATTCCAAATAACATTCCTTAAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	95097	TACGGGGAAAACAAGTTGAGACTTGATTATTCCAAATAACATTCCTTAAG	95146

AL591589.5	1101	GAAAAATGGAAAACCTTTGACTGAAATCAGTAAATATCTGGCAGTCAGTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	95147	GAAAAATGGAAAACCTTTGACTGAAATCAGTAAATATCTGGCAGTCAGTG	95196

AL591589.5	1151	TAGCGTTATTCAGTACAGAAAGAAGATATAAAAATTAGTTATACCTACAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	95197	TAGCGTTATTCAGTACAGAAAGAAGATATAAAAATTAGTTATACCTACAA	95246

AL591589.5	1201	TTCTTGAGAAATTGTGATGTTAAAAGGCTCTAATCAAGCTCTTAAAACAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	95247	TTCTTGAGAAATTGTGATGTTAAAAGGCTCTAATCAAGCTCTTAAAACAC	95296

AL591589.5	1251	CTCCTATAATCCTGCTACATTCCTAGTAGTGTGATTGTTATGTGATGGTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	95297	CTCCTATAATCCTGCTACATTCCTAGTAGTGTGATTGTTATGTGATGGTG	95346

AL591589.5	1301	GTGATTGGTTATTTTTGAGCAAGAGGCAGTGGTGTGTAAAGGTATTTTCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	95347	GTGATTGGTTATTTTTGAGCAAGAGGCAGTGGTGTGTAAAGGTATTTTCA	95396

AL591589.5	1351	GTCCTGTGTCTCCGCTGTAGGGCCTTACATCAAGCCCGAGGGGTGGTACA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	95397	GTCCTGTGTCTCCGCTGTAGGGCCTTACATCAAGCCCGAGGGGTGGTACA	95446

AL591589.5	1401	TCTATAGCAATTCGCAGCGCAAAGGCATGACTGCACTCGCAGCAGTTCAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	95447	TCTATAGCAATTCGCAGCGCAAAGGCATGACTGCACTCGCAGCAGTTCAT	95496

AL591589.5	1451	CCTACTGTGGAATGAAGCATGCCTGCATCAACATGCCTCTATCTCGGTGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	95497	CCTACTGTGGAATGAAGCATGCCTGCATCAACATGCCTCTATCTCGGTGC	95546

AL591589.5	1501	AGTTCAGTGGAAGCACAGGAAGAAAGAGACTGTGGACACACGATAGTGAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	95547	AGTTCAGTGGAAGCACAGGAAGAAAGAGACTGTGGACACACGATAGTGAA	95596

AL591589.5	1551	GACCCTCAATGTTTCAGTAGTGTGCCAGACCAGAGCCAGGGCTGTGAGCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	95597	GACCCTCAATGTTTCAGTAGTGTGCCAGACCAGAGCCAGGGCTGTGAGCT	95646

AL591589.5	1601	GGAGCTTTCCATCAGGGTTCCTCAGGGTGAGATGGTTAAAGTGATGTCGT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	95647	GGAGCTTTCCATCAGGGTTCCTCAGGGTGAGATGGTTAAAGTGATGTCGT	95696

AL591589.5	1651	TGGGCGCTGATTGCATCATTTTCCTTTACTTTTTGGAGTTTCGATGTTGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	95697	TGGGCGCTGATTGCATCATTTTCCTTTACTTTTTGGAGTTTCGATGTTGA	95746

AL591589.5	1701	TTGTGACTGTTTCTTACATGCTCAAATGTATGGTGGCTATTATACAGCTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	95747	TTGTGACTGTTTCTTACATGCTCAAATGTATGGTGGCTATTATACAGCTA	95796

AL591589.5	1751	AACAAGTTTAGCATAGTCATAGTTTTCGTTTTACATCAGTTTGCTTCGCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	95797	AACAAGTTTAGCATAGTCATAGTTTTCGTTTTACATCAGTTTGCTTCGCT	95846

AL591589.5	1801	GAATTGTATGCATAAGACATGTACAGTATATAAATGTTATTTCTCAGACT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	95847	GAATTGTATGCATAAGACATGTACAGTATATAAATGTTATTTCTCAGACT	95896

AL591589.5	1851	AGCTTCTAGGAATTCGCTTGCAGTAACTGCTCTGATCTTTATTCTGCCCG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	95897	AGCTTCTAGGAATTCGCTTGCAGTAACTGCTCTGATCTTTATTCTGCCCG	95946

AL591589.5	1901	TGTATTTTGCTCTATAGGGAAGTAGAAACTGGCTCAAGGGTGTTAGTCTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	95947	TGTATTTTGCTCTATAGGGAAGTAGAAACTGGCTCAAGGGTGTTAGTCTA	95996

AL591589.5	1951	AGATCATGTAAGACTTGTGCAATAGTTAGACAGAATGGTTTTACTGATC	1999
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591674.3	95997	AGATCATGTAAGACTTGTGCAATAGTTAGACAGAATGGTTTTACTGATC	96045

Overview

Query
AL591589.5 - 42701 bps
Hit
AL591674.3 - 96045 bps
Total alignments
23
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1999 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001956199911999194047960451
293.1838883992540012-120690207771
394.7434761143911514120691207661
486.811923811834918729125195255731
510044592288122939-127632276901
688.411512522940529656-147953482111
790.4313920356385840-148070482781
895.7437941140111494-149221493141
998.8640883992740014149222493091
1010035712283122901-160231603011
1110035713983539905-160231603011
1210035712283222902160231603011
1310035713983439904160231603011
1490.7598657265811160427605121
1593.02801293985939987-165475656031
1698.3943623987939940166748668091
1787.26217415990410318-167354677691
1888.592093801835018729-167368677441
1986.27631523398534136167614677661
2087.7110518356585840169629698071
2184.881352852937229656169629699191
2294.3871891084910937169630697181
2384.09831751095311127-173260734351
Short-link