<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL592550.11	94482	GATCAAGGATCTGCGTGTGTCTGATTCTGCTGTGTATTACTGTGCTCTGA	94531
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	1	GATCAAGGATCTGCGTGTGTCTGATTCTGCTGTGTATTACTGTGCTCTGA	50

AL592550.11	94532	GGCCCACAGTGACAAAACACACTCAACACTCACACAAAAACCCTCATGGT	94581
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	51	GGCCCACAGTGACAAAACACACTCAACACTCACACAAAAACCCTCATGGT	100

AL592550.11	94582	GACGAGCTGCACTATATTTTGATGGTAGATGAGATTTGCTATGCAATAAC	94631
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	101	GACGAGCTGCACTATATTTTGATGGTAGATGAGATTTGCTATGCAATAAC	150

AL592550.11	94632	TAGTAACTAGCTTTAGCAGTAGTAAATAGTTTTAACTAGTTTCTAGGCTT	94681
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	151	TAGTAACTAGCTTTAGCAGTAGTAAATAGTTTTAACTAGTTTCTAGGCTT	200

AL592550.11	94682	TGGACGATAACCGTATGTTGTTTTTTACCCAGACATTTAAAATAATATAT	94731
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	201	TGGACGATAACCGTATGTTGTTTTTTACCCAGACATTTAAAATAATATAT	250

AL592550.11	94732	TTTAAAGCAGTAATCACAACACCATGAAACTGTCATATATTCAAGGTTAT	94781
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	251	TTTAAAGCAGTAATCACAACACCATGAAACTGTCATATATTCAAGGTTAT	300

AL592550.11	94782	CATACCATCAGAATCTTACACCGGCCCATGCCTAGTTTCTAGTAACTAGT	94831
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	301	CATACCATCAGAATCTTACACCGGCCCATGCCTAGTTTCTAGTAACTAGT	350

AL592550.11	94832	TTAGTAACTAGTTTTAAATATGCAAAGTTGTCCATGTTTTATACATTAAA	94881
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	351	TTAGTAACTAGTTTTAAATATGCAAAGTTGTCCATGTTTTATACATTAAA	400

AL592550.11	94882	ATATGTAATGTTCTAAGGTATTATTATTAAATACTAATTTAAGAAAATAT	94931
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	401	ATATGTAATGTTCTAAGGTATTATTATTAAATACTAATTTAAGAAAATAT	450

AL592550.11	94932	AAATGTACACATGTATAAATGTCAAATCTGTAAATTAAGTATTTATATTT	94981
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	451	AAATGTACACATGTATAAATGTCAAATCTGTAAATTAAGTATTTATATTT	500

AL592550.11	94982	ATGTAAGTTTGTAAATATAAAATATTTCATAATGCTGTAAATGATAATTT	95031
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	501	ATGTAAGTTTGTAAATATAAAATATTTCATAATGCTGTAAATGATAATTT	550

AL592550.11	95032	ACCAACTGGAATTTGAATATGTTATTAGTAGTAAAATAAAATGCAAAACA	95081
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	551	ACCAACTGGAATTTGAATATGTTATTAGTAGTAAAATAAAATGCAAAACA	600

AL592550.11	95082	ACATTTTATTCAAAACATCTATTAATCGCAAATCCAGAAAACTGAAATTG	95131
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	601	ACATTTTATTCAAAACATCTATTAATCGCAAATCCAGAAAACTGAAATTG	650

AL592550.11	95132	TCTCAATTTTTGCCAGAAGCAGATAAAAAAAAAACTAATTTAACATTTAA	95181
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	651	TCTCAATTTTTGCCAGAAGCAGATAAAAAAAAAACTAATTTAACATTTAA	700

AL592550.11	95182	ATCAGTTGTAAGGTCCTCCTTGTATTAACTCTTGCAATCCAGAAGAGGGC	95231
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	701	ATCAGTTGTAAGGTCCTCCTTGTATTAACTCTTGCAATCCAGAAGAGGGC	750

AL592550.11	95232	GACAAGAAGTTACTTTAGTAATTATTGTAAAGTAGTGTTGAGCTTCTCTT	95281
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	751	GACAAGAAGTTACTTTAGTAATTATTGTAAAGTAGTGTTGAGCTTCTCTT	800

AL592550.11	95282	TGATAAACAGTCACTCTCTATTTAGATGAGTGAGTAGGGCTGCACAATAT	95331
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	801	TGATAAACAGTCACTCTCTATTTAGATGAGTGAGTAGGGCTGCACAATAT	850

AL592550.11	95332	ATCGTTTCAGCATCAATTTCGCAATGTGCGCATCTACAACAGTCAAATAG	95381
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	851	ATCGTTTCAGCATCAATTTCGCAATGTGCGCATCTACAACAGTCAAATAG	900

AL592550.11	95382	CAAGATAAGCAATGTTAAGTCTGAATAACAGTTGGCCAAGAGCTACAGAA	95431
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	901	CAAGATAAGCAATGTTAAGTCTGAATAACAGTTGGCCAAGAGCTACAGAA	950

AL592550.11	95432	TTGTATTTAATGGCTGTTTTATACAGAACTTACACAATTTACTCAAAAAA	95481
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	951	TTGTATTTAATGGCTGTTTTATACAGAACTTACACAATTTACTCAAAAAA	1000

AL592550.11	95482	TAAACAAAATTCTCACTTTGAATTTTTGTCTTGTTTCTAATCCAAAAATC	95531
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	1001	TAAACAAAATTCTCACTTTGAATTTTTGTCTTGTTTCTAATCCAAAAATC	1050

AL592550.11	95532	TACATTTTAAAGAGAAAAACATAAAAAATGATGAAAAAATGATTATTTTA	95581
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	1051	TACATTTTAAAGAGAAAAACATAAAAAATGATGAAAAAATGATTATTTTA	1100

AL592550.11	95582	CTCGCCCTACAGATAGTTTTGCTTGCTTTGAGGAAAAACTCTTAATTTTG	95631
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	1101	CTCGCCCTACAGATAGTTTTGCTTGCTTTGAGGAAAAACTCTTAATTTTG	1150

AL592550.11	95632	ACTTATTTCTTCTGAAGTTGAAAACAAAAAATATTTTTACTTGATATAAC	95681
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	1151	ACTTATTTCTTCTGAAGTTGAAAACAAAAAATATTTTTACTTGATATAAC	1200

AL592550.11	95682	AATTTGCAGATATTTAAACTAGAAATAACACAAAGTAAAGTACAAAATGT	95731
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	1201	AATTTGCAGATATTTAAACTAGAAATAACACAAAGTAAAGTACAAAATGT	1250

AL592550.11	95732	AGGCTTTGCATTGTGATTAATCCACTCCCTAGAAAACCTTCAAAAAGAGC	95781
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	1251	AGGCTTTGCATTGTGATTAATCCACTCCCTAGAAAACCTTCAAAAAGAGC	1300

AL592550.11	95782	TATTCAAACTATCTTATAAAACTGTATTCATATCGCAATATTTATTGCAG	95831
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	1301	TATTCAAACTATCTTATAAAACTGTATTCATATCGCAATATTTATTGCAG	1350

AL592550.11	95832	AAAAATTCAATATTAAATTATAAATTTTTTCCCAACAGCCTTACAAGTGA	95881
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	1351	AAAAATTCAATATTAAATTATAAATTTTTTCCCAACAGCCTTACAAGTGA	1400

AL592550.11	95882	CTATTGTCATCCTCTGAATATCGATAGAGACCAAACACAGAGCACACTTG	95931
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	1401	CTATTGTCATCCTCTGAATATCGATAGAGACCAAACACAGAGCACACTTG	1450

AL592550.11	95932	CATTTGCAATTATCCTCAGTTTAATCATTAAGAGTCACATTGAACCATCA	95981
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	1451	CATTTGCAATTATCCTCAGTTTAATCATTAAGAGTCACATTGAACCATCA	1500

AL592550.11	95982	TGTGCTCACTGGGGTCTACATGTGTATATGCTAGAACTAGAGCAGTCAAT	96031
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	1501	TGTGCTCACTGGGGTCTACATGTGTATATGCTAGAACTAGAGCAGTCAAT	1550

AL592550.11	96032	CAGTCAGTAAGAAAGAAAAACAAAACTTTAAGAAAGATTTTTAAAAACAC	96081
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	1551	CAGTCAGTAAGAAAGAAAAACAAAACTTTAAGAAAGATTTTTAAAAACAC	1600

AL592550.11	96082	ATCTGAGTTATAAAATTAAGAAGTGACCAAAACACAAGCAATCCTCACTT	96131
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	1601	ATCTGAGTTATAAAATTAAGAAGTGACCAAAACACAAGCAATCCTCACTT	1650

AL592550.11	96132	GACATGCAAAAAGATTGGAAAAATAACCGGCTTCAAAGCTTACTGTGGTT	96181
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	1651	GACATGCAAAAAGATTGGAAAAATAACCGGCTTCAAAGCTTACTGTGGTT	1700

AL592550.11	96182	TGGAAAAGTCACAGTTTTAAAACTGCAATAAAAATGTATACCTTTCTTGC	96231
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	1701	TGGAAAAGTCACAGTTTTAAAACTGCAATAAAAATGTATACCTTTCTTGC	1750

AL592550.11	96232	AGTATATGTACATTTTTTCAAAAATTTTTTGTGTAGTCGAAGACTTTTTC	96281
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	1751	AGTATATGTACATTTTTTCAAAAATTTTTTGTGTAGTCGAAGACTTTTTC	1800

AL592550.11	96282	AATGATTTATTTTAATTAGCCTGACATGTGTCACAGAAGGACCGTGACAC	96331
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	1801	AATGATTTATTTTAATTAGCCTGACATGTGTCACAGAAGGACCGTGACAC	1850

AL592550.11	96332	AGAGGGTGGGTAGATCTAAATAGTTTATTTCAGGATGGCAGTAACAAAAC	96381
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	1851	AGAGGGTGGGTAGATCTAAATAGTTTATTTCAGGATGGCAGTAACAAAAC	1900

AL592550.11	96382	AGAGATAAATGTGAATGATGAATTCGGTGATCAGATGTAGATGCCACAGA	96431
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	1901	AGAGATAAATGTGAATGATGAATTCGGTGATCAGATGTAGATGCCACAGA	1950

AL592550.11	96432	AATGGCAGGGAGAAACGGGAACCAGACACGAAGACCACAAGATGACGAGA	96481
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591511.2	1951	AATGGCAGGGAGAAACGGGAACCAGACACGAAGACCACAAGATGACGAGA	2000

Overview

Query
AL592550.11 - 96481 bps
Hit
AL591511.2 - 74508 bps
Total alignments
24
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001890200094482964811120001
295.56779137346312911
379.04912951424914543113849141391
481.531172948035680649113849141351
579.09942948462584918113849141351
696.7784936111261204116576166681
795.1841023299833099116583166841
892.23791035396154063116585166871
995.15881037879278894116585166871
1083.341312946224962542116843171241
1191.9532744659346379-127087275331
1288.359916457335896-127171273331
1396.97157917544554547298139336410821
1486.96851537655176703147492476521
1578.761113558029780651155354557111
1679.321203558456684920155354557111
1778.881073528945589806155355557091
1876.2903538728387635155357557091
1982.8413229468947187155413557091
2077.451013591418514543157416577741
2180.571273538029780649157421577701
2276.78903568945589810157422577741
2380.951172948462584918157477577701
2490.088813170617191157644577741
Short-link