<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 3983 bps / non-identical: 100 bps

Full alignment

C  AL591482.3	3983	GTCAATAGAATACAAACTTTTTTAAAAAGTGCAGTCGGGTTAAAGTGAAT	3934
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	1	GTCAATAGAATACAAACTTTTTTAAAAAGTGCAGTCGGGTTAAAGTGAAT	50

C  AL591482.3	3933	AAGCTGTTCTAAACAGATTTGGGATTGTACTATCACAAATCCCATACTCA	3884
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	51	AAGCTGTTCTAAACAGATTTGGGATTGTACTATCACAAATCCCATACTCA	100

C  AL591482.3	3883	AGCTTAAACTAATCTTTTGTCTATATAAGTAAAATAAAATGTGATAAACA	3834
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	101	AGCTTAAACTAATCTTTTGTCTATATAAGTAAAATAAAATGTGATAAACA	150

C  AL591482.3	3833	GTGCTCTATTTAGAGGCCACAGTGTATGACATAATTTCCTGTAGAATGGC	3784
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	151	GTGCTCTATTTAGAGGCCACAGTGTATGACATAATTTCCTGTAGAATGGC	200

C  AL591482.3	3783	TGACAGGAAGAAGATGCTCAGTCTAGAACTGATGTGGTGAACATCAATGG	3734
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	201	TGACAGGAAGAAGATGCTCAGTCTAGAACTGATGTGGTGAACATCAATGG	250

C  AL591482.3	3733	AAAAATTCACTTTAGCACCGATTAAATGTTTTATTAATATTAATATAGTA	3684
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	251	AAAAATTCACTTTAGCACCGATTAAATGTTTTATTAATATTAATATAGTA	300

C  AL591482.3	3683	AATATTGTACATGTATGTATTTATGTTATCTTATATGTTATTGTTTGTTT	3634
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	301	AATATTGTACATGTATGTATTTATGTTATCTTATATGTTATTGTTTGTTT	350

C  AL591482.3	3633	GTACCTGCACACGCTTTGCAAGTTTGACAATTTACCAACCACAGGACTGA	3584
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	351	GTACCTGCACACGCTTTGCAAGTTTGACAATTTACCAACCACAGGACTGA	400

C  AL591482.3	3583	CCAAGTGTTTCGTCTTCACACCTCCATCTGAATGAAAAACACACATGCCA	3534
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	401	CCAAGTGTTTCGTCTTCACACCTCCATCTGAATGAAAAACACACATGCCA	450

C  AL591482.3	3533	TGCACATTTGTCAGTGTCAAAAATAACCCTCCTATTTCCCCCTAACCTTC	3484
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	451	TGCACATTTGTCAGTGTCAAAAATAACCCTCCTATTTCCCCCTAACCTTC	500

C  AL591482.3	3483	TATCTCTTTCAGTAAAGAACATTTATATTTAAAACTTTTGAAAAAATACA	3434
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	501	TATCTCTTTCAGTAAAGAACATTTATATTTAAAACTTTTGAAAAAATACA	550

C  AL591482.3	3433	TGTAGTAATATATCAAATTTATATTTGCAATAATTGGAATACATAAATTA	3384
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	551	TGTAGTAATATATCAAATTTATATTTGCAATAATTGGAATACATAAATTA	600

C  AL591482.3	3383	ATTTATATATATATATATATATATATATATATAAAATAATCAATTGTAAT	3334
			|||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	601	ATT--TATATATATATATATATATATATATATAAAATAATCAATTGTAAT	648

C  AL591482.3	3333	CTAGATTACTCTTTTAATACAATTTCTAGCTAGAATCAAACAATTAGGCC	3284
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	649	CTAGATTACTCTTTTAATACAATTTCTAGCTAGAATCAAACAATTAGGCC	698

C  AL591482.3	3283	TTTGTATTTGCTGTGACATGCATTACCAGATGTCCTTTGTGTTTTTCAAA	3234
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	699	TTTGTATTTGCTGTGACATGCATTACCAGATGTCCTTTGTGTTTTTCAAA	748

C  AL591482.3	3233	TCAGCAAACAATAGGTCCAGATAGGTCTTGACCAGAATACAGTTCTTTAT	3184
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	749	TCAGCAAACAATAGGTCCAGATAGGTCTTGACCAGAATACAGTTCTTTAT	798

C  AL591482.3	3183	CACTCTGCTGAATGATTTCAGTTCTATCACAATCAGAACAATTTTAAAAA	3134
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	799	CACTCTGCTGAATGATTTCAGTTCTATCACAATCAGAACAATTTTAAAAA	848

C  AL591482.3	3133	GGCTTTAGATGAGATGAAACTAGTCCTAAAAATCATACAAATGTCTTAAA	3084
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	849	GGCTTTAGATGAGATGAAACTAGTCCTAAAAATCATACAAATGTCTTAAA	898

C  AL591482.3	3083	ATGCATCTTCTGAACAACATCTTTGGGTGTGGTATAAGCAGAATAATTGA	3034
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	899	ATGCATCTTCTGAACAACATCTTTGGGTGTGGTATAAGCAGAATAATTGA	948

C  AL591482.3	3033	TTACACAGAGTGTTTTTTTTCAAAGAGGCGATGGTTATGGCAATAAATTA	2984
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	949	TTACACAGAGTGTTTTTTTTCAAAGAGGCGATGGTTATGGCAATAAATTA	998

C  AL591482.3	2983	AACCAAATAGAAGGCATGGGTGATATGGACTTGAAATTATGTCACTATTT	2934
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	999	AACCAAATAGAAGGCATGGGTGATATGGACTTGAAATTATGTCACTATTT	1048

C  AL591482.3	2933	TATGGTATTTATTGCGATAATAATAATGTAATATCGTCGATAAACCATAT	2884
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	1049	TATGGTATTTATTGCGATAATAATAATGTAATATCGTCGATAAACCATAT	1098

C  AL591482.3	2883	GTATCCACTGAGAGACAACAAAATGTCCTGTATCTTTAGAAAAAAAATAT	2834
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	1099	GTATCCACTGAGAGACAACAAAATGTCCTGTATCTTTAGAAAAAAAATAT	1148

C  AL591482.3	2833	TTATGTAGTATATCTATGTGTGTGTCTGTATGCATATATATATATATATA	2784
			|||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||
  AL591420.5	1149	TTATGTAGTATATCTATGTGTGTGTCTGTATGC----ATATATATATATA	1194

C  AL591482.3	2783	TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA	2734
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	1195	TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA	1244

C  AL591482.3	2733	TATATATATATAAACAACGTATATGTTACTTTTATTTAATCAGCAATTTT	2684
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	1245	TATATATATATAAACAACGTATATGTTACTTTTATTTAATCAGCAATTTT	1294

C  AL591482.3	2683	TTTTCCTGTACACGCCTCTCCTAAAAGACATTCAGATGATATACAAGAGG	2634
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	1295	TTTTCCTGTACACGCCTCTCCTAAAAGACATTCAGATGATATACAAGAGG	1344

C  AL591482.3	2633	AATTTTTGTGGAAAAAAGTAACTTTAAGTCAGAATTTGCCTGGGGTTTCA	2584
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	1345	AATTTTTGTGGAAAAAAGTAACTTTAAGTCAGAATTTGCCTGGGGTTTCA	1394

C  AL591482.3	2583	ATAATTTTGGGCATGTCTGTATACAGTAACTCAAATAACCACTTGTTACA	2534
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	1395	ATAATTTTGGGCATGTCTGTATACAGTAACTCAAATAACCACTTGTTACA	1444

C  AL591482.3	2533	ACTGAGGTATGCATAAGAGGATCTCTGAATGAACAACACGTCCAACCTTG	2484
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	1445	ACTGAGGTATGCATAAGAGGATCTCTGAATGAACAACACGTCCAACCTTG	1494

C  AL591482.3	2483	AGGCAGATGGGCTACAGCAGCAGAAGACCACACCGGGTGCCACTCCTTTC	2434
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	1495	AGGCAGATGGGCTACAGCAGCAGAAGACCACACCGGGTGCCACTCCTTTC	1544

C  AL591482.3	2433	AGCTAAGAACAGGAAACTGAGGCTACAATTCACACAGGCTCACCAAAACT	2384
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	1545	AGCTAAGAACAGGAAACTGAGGCTACAATTCACACAGGCTCACCAAAACT	1594

C  AL591482.3	2383	GGACAATAGAAGATTGAAAACACATAGCCTGGTCTGATGAGTCTTGATTT	2334
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	1595	GGACAATAGAAGATTGAAAACACATAGCCTGGTCTGATGAGTCTTGATTT	1644

C  AL591482.3	2333	CTGCTGTGACATCCGAAGGGTGGGGTCAGAATTTGGCATCAACAACATGA	2284
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	1645	CTGCTGTGACATCCGAAGGGTGGGGTCAGAATTTGGCATCAACAACATGA	1694

C  AL591482.3	2283	AAACATGGATCCATCCTGCCTTGTATCAACAGTTCAGGCTGGTGGTGGTG	2234
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	1695	AAACATGGATCCATCCTGCCTTGTATCAACAGTTCAGGCTGGTGGTGGTG	1744

C  AL591482.3	2233	GTGTAATGGTGTGGGGGATATTTTCTTGGCGCACTTTGTGCCCATTAGTA	2184
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	1745	GTGTAATGGTGTGGGGGATATTTTCTTGGCGCACTTTGTGCCCATTAGTA	1794

C  AL591482.3	2183	CCAATTGAGCACCGTGTCAATGCCACAGCCTACCTGAGTATTGTTTTTAA	2134
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	1795	CCAATTGAGCACCGTGTCAATGCCACAGCCTACCTGAGTATTGTTTTTAA	1844

C  AL591482.3	2133	CTATGTCCATCTCTTTTTGACCACAGTGTACCCATCTTCTGATGGCTACT	2084
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	1845	CTATGTCCATCTCTTTTTGACCACAGTGTACCCATCTTCTGATGGCTACT	1894

C  AL591482.3	2083	TCCAGCAGGATAACGCGACGTCATAATGCGCAAATCTTCTCAGACAGGTT	2034
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	1895	TCCAGCAGGATAACGCGACGTCATAATGCGCAAATCTTCTCAGACAGGTT	1944

C  AL591482.3	2033	TCTTGACCATGACAATGAGTTCACTGTACTCAAATGACCTTCACATTCAG	1984
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	1945	TCTTGACCATGACAATGAGTTCACTGTACTCAAATGACCTTCACATTCAG	1994

C  AL591482.3	1983	CAGATCTCAACCCAATAGAGCACCTTTGGGATGTGGTGGAACGGGAGATT	1934
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	1995	CAGATCTCAACCCAATAGAGCACCTTTGGGATGTGGTGGAACGGGAGATT	2044

C  AL591482.3	1933	CACATCATGGATGAGTAGCTGATAAATCTGCAGCAACTGCATGATGCTAT	1884
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	2045	CACATCATGGATGAGTAGCTGATAAATCTGCAGCAACTGCATGATGCTAT	2094

C  AL591482.3	1883	CATGTCAATATGGAACAAAATCTCTGAGGAATATTTCAAGTACCTTGTTG	1834
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	2095	CATGTCAATATGGAACAAAATCTCTGAGGAATATTTCAAGTACCTTGTTG	2144

C  AL591482.3	1833	AATCTATGCCGCAAAGGATTAAAGCAGTTCTGAAGGCAAAAGGGGGTCCA	1784
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	2145	AATCTATGCCGCAAAGGATTAAAGCAGTTCTGAAGGCAAAAGGGGGTCCA	2194

C  AL591482.3	1783	ACCCAGTACTAGTAATGTGTACCTAATAAAGTGGCAGTTGAGAGTATCTG	1734
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	2195	ACCCAGTACTAGTAATGTGTACCTAATAAAGTGGCAGTTGAGAGTATCTG	2244

C  AL591482.3	1733	TTCATGTTAAGCCTACTGGCCTATTAGAAGTGTTATTGGAGTGCTTAATG	1684
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	2245	TTCATGTTAAGCCTACTGGCCTATTAGAAGTGTTATTGGAGTGCTTAATG	2294

C  AL591482.3	1683	CATGTTAAACCCTTCACACCTTTCACACATTCACTAGCGCCTCGAGTTCA	1634
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	2295	CATGTTAAACCCTTCACACCTTTCACACATTCACTAGCGCCTCGAGTTCA	2344

C  AL591482.3	1633	CCTCTTGCTTACTTTAAATAATTTTGAACAATGTTGTCAGCTGTAAAGTT	1584
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	2345	CCTCTTGCTTACTTTAAATAATTTTGAACAATGTTGTCAGCTGTAAAGTT	2394

C  AL591482.3	1583	TAGCCACAAAATAATTAAAAAACTCATAAATTATTCTAATTTCAGTTTGC	1534
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	2395	TAGCCACAAAATAATTAAAAAACTCATAAATTATTCTAATTTCAGTTTGC	2444

C  AL591482.3	1533	ATGTTAACTTTATTACTATGCAGGTTCAATTGTCTGTGAAGAGATTCTTC	1484
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	2445	ATGTTAACTTTATTACTATGCAGGTTCAATTGTCTGTGAAGAGATTCTTC	2494

C  AL591482.3	1483	TAAAGGAAGTCCGCTCTGCCCTTTTTGTTTTTTACGTTTCCGTGTCTGAT	1434
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	2495	TAAAGGAAGTCCGCTCTGCCCTTTTTGTTTTTTACGTTTCCGTGTCTGAT	2544

C  AL591482.3	1433	CTTTGACCACTGCTGTGCTTTGAAGAGGAAGCAGTCTGAAATTAGATACT	1384
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	2545	CTTTGACCACTGCTGTGCTTTGAAGAGGAAGCAGTCTGAAATTAGATACT	2594

C  AL591482.3	1383	ACCAAACCAAGGTTGTACTGTAAGTAGACCAGTGAAACTGTTTATTTTAT	1334
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	2595	ACCAAACCAAGGTTGTACTGTAAGTAGACCAGTGAAACTGTTTATTTTAT	2644

C  AL591482.3	1333	TTTATCAAATTAATACATGTGATGAAGTACTTCCGTTCATATTTTAGAAA	1284
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	2645	TTTATCAAATTAATACATGTGATGAAGTACTTCCGTTCATATTTTAGAAA	2694

C  AL591482.3	1283	TATAAAATGTGTAAATTAGAATATTTCATTATTTTCATGTTCCAGGTTTC	1234
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	2695	TATAAAATGTGTAAATTAGAATATTTCATTATTTTCATGTTCCAGGTTTC	2744

C  AL591482.3	1233	TTGACATGCTTATTTTTTTTCTCAGGTGCTGAAAAATGAGCTTGCAAGAT	1184
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	2745	TTGACATGCTTATTTTTTTTCTCAGGTGCTGAAAAATGAGCTTGCAAGAT	2794

C  AL591482.3	1183	TGTTTTACCTTCTTTCTCCTCACATTTGCATGTAAGTTTAAACTGTTGGG	1134
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	2795	TGTTTTACCTTCTTTCTCCTCACATTTGCATGTAAGTTTAAACTGTTGGG	2844

C  AL591482.3	1133	TGATAATGACAAAAAAATACCACAAATACATTTATATCTGTCAATATTGA	1084
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	2845	TGATAATGACAAAAAAATACCACAAATACATTTATATCTGTCAATATTGA	2894

C  AL591482.3	1083	TGATTATCATAATGTCAAATCTCAGTTTATTTCAAGTTTAAAGGCATTTT	1034
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	2895	TGATTATCATAATGTCAAATCTCAGTTTATTTCAAGTTTAAAGGCATTTT	2944

C  AL591482.3	1033	TTTTGCTGAGTAAAACTTGTAGAAACCAGAAATGAAATATGCCTTGAAGC	984
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	2945	TTTTGCTGAGTAAAACTTGTAGAAACCAGAAATGAAATATGCCTTGAAGC	2994

C  AL591482.3	983	CTAAAAATTTATAAAATGTGTTTTTGTTTTATCCATATACATATAGTTTT	934
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	2995	CTAAAAATTTATAAAATGTGTTTTTGTTTTATCCATATACATATAGTTTT	3044

C  AL591482.3	933	ATTGTGATAATTTTTGTTTGACCATCCCTAATTTTTAATAAGCTTTATGT	884
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	3045	ATTGTGATAATTTTTGTTTGACCATCCCTAATTTTTAATAAGCTTTATGT	3094

C  AL591482.3	883	TTAACTTTTTTTTTTTTTTGTTTCTTACTGCTTAATTGTTTGTTTTTGTT	834
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	3095	TTAACTTTTTTTTTTTTTTGTTTCTTACTGCTTAATTGTTTGTTTTTGTT	3144

C  AL591482.3	833	GTCTTAGATGGGACCTGTGAAGAAGATTTTATTCACCAGCAGCCACTGGT	784
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	3145	GTCTTAGATGGGACCTGTGAAGAAGATTTTATTCACCAGCAGCCACTGGT	3194

C  AL591482.3	783	AGTTGCTGAACTTGGAAGCAGTGTGACTTTACCCTGTTTTCACTCTGATG	734
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	3195	AGTTGCTGAACTTGGAAGCAGTGTGACTTTACCCTGTTTTCACTCTGATG	3244

C  AL591482.3	733	ACTTTATAACCACTATTTCATGGTATAAACATTCAGCTGGCAAGAAACCT	684
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	3245	ACTTTATAACCACTATTTCATGGTATAAACATTCAGCTGGCAAGAAACCT	3294

C  AL591482.3	683	CTTCTTATAGCACATTCAGCTCCCAACTCGGGAAGTGTTACATATCAATA	634
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	3295	CTTCTTATAGCACATTCAGCTCCCAACTCGGGAAGTGTTACATATCAATA	3344

C  AL591482.3	633	TGCCTTTAACAACACTAATCGATTCTTTATAACAATTGCAAGTGGCTCTT	584
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	3345	TGCCTTTAACAACACTAATCGATTCTTTATAACAATTGCAAGTGGCTCTT	3394

C  AL591482.3	583	ATAATTTAAGTATCCTTCACTTGGAGAAAGAGGATTTTGCAAATTACTAT	534
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	3395	ATAATTTAAGTATCCTTCACTTGGAGAAAGAGGATTTTGCAAATTACTAT	3444

C  AL591482.3	533	TGTGCTAAGTTTTTCCTGAACATCATGATGTTTGGAGAAGGGACGATTCT	484
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	3445	TGTGCTAAGTTTTTCCTGAACATCATGATGTTTGGAGAAGGGACGATTCT	3494

C  AL591482.3	483	GCTACATAATGGTGAGTTAATGACAGATTTTGAATTCAGAAATTTACATA	434
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	3495	GCTACATAATGGTGAGTTAATGACAGATTTTGAATTCAGAAATTTACATA	3544

C  AL591482.3	433	AAGTTTGTATATCTGTGTTTACTGCAGTGGTTCAAGCTGTAGTATTGTCA	384
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	3545	AAGTTTGTATATCTGTGTTTACTGCAGTGGTTCAAGCTGTAGTATTGTCA	3594

C  AL591482.3	383	AATGATTAAAGAGATGTTATCAGCATGATGGTGTAAAAGTTTCAGCCACC	334
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	3595	AATGATTAAAGAGATGTTATCAGCATGATGGTGTAAAAGTTTCAGCCACC	3644

C  AL591482.3	333	TACTGCAATCATATACCAATAATGGAAATAAGTGCAGTTAAAATTGTGTG	284
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	3645	TACTGCAATCATATACCAATAATGGAAATAAGTGCAGTTAAAATTGTGTG	3694

C  AL591482.3	283	ACTATTGCAATATGGAGCAGTAATTTACAGAATGCTTGTGAATTAAATAA	234
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	3695	ACTATTGCAATATGGAGCAGTAATTTACAGAATGCTTGTGAATTAAATAA	3744

C  AL591482.3	233	ATAAATTTTTTGCTTTGGTTACAATGAAATTAGTCACAGAATATATGATT	184
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	3745	ATAAATTTTTTGCTTTGGTTACAATGAAATTAGTCACAGAATATATGATT	3794

C  AL591482.3	183	GAGATGATAAAACATATGAAATGAAGAAACATATATAATATTGTTCCTTT	134
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	3795	GAGATGATAAAACATATGAAATGAAGAAACATATATAATATTGTTCCTTT	3844

C  AL591482.3	133	CCATTTCTAAAAACCCCAAAACTGTACATTTCAATTTCAGCTACTCTTTG	84
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	3845	CCATTTCTAAAAACCCCAAAACTGTACATTTCAATTTCAGCTACTCTTTG	3894

C  AL591482.3	83	TAATCTTACACCAACATTGAAAATAAGTGCAGTTAAAAATAACAAAATAT	34
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	3895	TAATCTTACACCAACATTGAAAATAAGTGCAGTTAAAAATAACAAAATAT	3944

C  AL591482.3	33	GGGGGAGATTGTTGCTAAATAGCAAAATAGATC	1
			|||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	3945	GGGGGAGATTGTTGCTAAATAGCAAAATAGATC	3977

Compact alignment

skip 600 bps 100% identity alignment

C  AL591482.3	3383	ATTTATATATATATATATATATATATATATATAAAATAATCAATTGTAAT	3334
			|||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL591420.5	601	ATT--TATATATATATATATATATATATATATAAAATAATCAATTGTAAT	648

skip 500 bps 100% identity alignment

C  AL591482.3	2833	TTATGTAGTATATCTATGTGTGTGTCTGTATGCATATATATATATATATA	2784
			|||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||
  AL591420.5	1149	TTATGTAGTATATCTATGTGTGTGTCTGTATGC----ATATATATATATA	1194

skip 2783 bps 100% identity alignment

Overview

Query
AL591482.3 - 95364 bps
Hit
AL591420.5 - 51019 bps
Total alignments
30
Best alignment
alignment #1 (HSP: 3983 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
199.853787398313983-1139771
282.73781971636916565-1782681
391.594910657483575881115012561
493.18428815373154601116712541
5100396631125311901117812431
610038643112931192-1118012431
71003675272327971118212561
898.7339795750757585-1118212601
992.933895231122911751-1311036321
1094.52587113741444-1792279941
1183.253729173491265-1821291181
1289.923445261122611751-1859991241
1397.563641251291-1920992491
1486.9426650577508254-112111126081
1593.2246593606636124-113388134461
1683.2940110083671374-117705187031
1789.643255021125011751-118202187031
18100367427202793123994240671
1997.4438789238992466123999240761
2096.4344565918359238-127587276421
2175.29603413290533245-130820311631
2298.5941711539015460141470415401
2310038653112631190141471415351
24100478227222803-141471415521
2510038643112931192-141472415351
2610039815753057610141474415541
2710039805751057589-141474415531
28100387927222800141475415531
2910038729238792458-141484415551
3087.72183666908869453-142605429701
Short-link