<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  AL837512.2	2000	GAATTCAAACACATAAGCCTATGGAAGCCCTGTACATTTAAACCATATCA	1951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	1	GAATTCAAACACATAAGCCTATGGAAGCCCTGTACATTTAAACCATATCA	50

C  AL837512.2	1950	CTCACATAATCCCTGCTTGTGATATTACACTGTAATTTTGTACAACATAA	1901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	51	CTCACATAATCCCTGCTTGTGATATTACACTGTAATTTTGTACAACATAA	100

C  AL837512.2	1900	ACTTGGAAGTTGGTAAAGGTGATATACATTGCTTGGCAACTGCACTTTCC	1851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	101	ACTTGGAAGTTGGTAAAGGTGATATACATTGCTTGGCAACTGCACTTTCC	150

C  AL837512.2	1850	TACAAATGTATAATTATCACTGCATGAAAAGTAAAATAAAACAGAGCACA	1801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	151	TACAAATGTATAATTATCACTGCATGAAAAGTAAAATAAAACAGAGCACA	200

C  AL837512.2	1800	AACCCTGGTCTCTGCAGAGCTTAGCACACACGCTGATGTATTTTCCAAGA	1751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	201	AACCCTGGTCTCTGCAGAGCTTAGCACACACGCTGATGTATTTTCCAAGA	250

C  AL837512.2	1750	TGATGTGAGCTCAGAGATAAAACTGAAAATTAGCATTTCTGCTCTAAGCT	1701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	251	TGATGTGAGCTCAGAGATAAAACTGAAAATTAGCATTTCTGCTCTAAGCT	300

C  AL837512.2	1700	TGCTAAGAGCCATTATAAAAACAAATACTACAACTGTATTAATGAATTAA	1651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	301	TGCTAAGAGCCATTATAAAAACAAATACTACAACTGTATTAATGAATTAA	350

C  AL837512.2	1650	AACTCTAAGTCAGAGACGCAAAATACAAAGGATAGGACTTTTGGTGGACC	1601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	351	AACTCTAAGTCAGAGACGCAAAATACAAAGGATAGGACTTTTGGTGGACC	400

C  AL837512.2	1600	CCTAGGTAGGTTTCTTAAAGGTACATTGCCCTGCTTTTAGTAAAAGCTGT	1551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	401	CCTAGGTAGGTTTCTTAAAGGTACATTGCCCTGCTTTTAGTAAAAGCTGT	450

C  AL837512.2	1550	TCCTGTATTCATCACAAATAAAATAGCAAGGGTGCAACAATATGCCATTG	1501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	451	TCCTGTATTCATCACAAATAAAATAGCAAGGGTGCAACAATATGCCATTG	500

C  AL837512.2	1500	ATTATAAACAAGCCCACAATGTTTTTTTTTTTTTAAGTATATAGGGTACA	1451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	501	ATTATAAACAAGCCCACAATGTTTTTTTTTTTTTAAGTATATAGGGTACA	550

C  AL837512.2	1450	ATGGAACACAGAAATTGTCTGAATTTCAAGAGTAGTTCTTGCTTACTAAA	1401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	551	ATGGAACACAGAAATTGTCTGAATTTCAAGAGTAGTTCTTGCTTACTAAA	600

C  AL837512.2	1400	TACCATTTTTGTTTTCGAACCTGAGAAAAAGGCCTAGCATGAAGAAGTCA	1351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	601	TACCATTTTTGTTTTCGAACCTGAGAAAAAGGCCTAGCATGAAGAAGTCA	650

C  AL837512.2	1350	AGAGTCACCCCCATAGTCAGTTCCCTGTGGCTCTAACCTCCTCTGGTTGA	1301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	651	AGAGTCACCCCCATAGTCAGTTCCCTGTGGCTCTAACCTCCTCTGGTTGA	700

C  AL837512.2	1300	CAGAACTGGGAATGAGGTTACTAAAAATCCTGTTTTTCAGCTCTACACAC	1251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	701	CAGAACTGGGAATGAGGTTACTAAAAATCCTGTTTTTCAGCTCTACACAC	750

C  AL837512.2	1250	AAAGGACTACCAGTGAACATGTTACCATTGAAATTTCTCATGATAGAAAA	1201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	751	AAAGGACTACCAGTGAACATGTTACCATTGAAATTTCTCATGATAGAAAA	800

C  AL837512.2	1200	GATTTAGTTTGCTTACACTGCACAGTTAACTAAACTGAGCTCACATGAGA	1151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	801	GATTTAGTTTGCTTACACTGCACAGTTAACTAAACTGAGCTCACATGAGA	850

C  AL837512.2	1150	AAAACTGCATGAGATTTGAATCTGCCAAAATACTATATATTACACTTTCT	1101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	851	AAAACTGCATGAGATTTGAATCTGCCAAAATACTATATATTACACTTTCT	900

C  AL837512.2	1100	ATGTGTTTTATAGAAAGGTGTGTTTTCCAATCTTTACAGCATTTTTCACA	1051
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	901	ATGTGTTTTATAGAAAGGTGTGTTTTCCAATCTTTACAGCATTTTTCACA	950

C  AL837512.2	1050	GAATGGTGTGGACATCTTCAGAAGCTCATAATTGAAAGGAATGTTATAGT	1001
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	951	GAATGGTGTGGACATCTTCAGAAGCTCATAATTGAAAGGAATGTTATAGT	1000

C  AL837512.2	1000	CATGTAATCATATACAGTATTAGGATATATTTTTGAGTTGTTGAATTAAA	951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	1001	CATGTAATCATATACAGTATTAGGATATATTTTTGAGTTGTTGAATTAAA	1050

C  AL837512.2	950	AAATTACAGCACAGTTTTACTAACTTTTCCAAGTGCTTTAGCGGCCCTTT	901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	1051	AAATTACAGCACAGTTTTACTAACTTTTCCAAGTGCTTTAGCGGCCCTTT	1100

C  AL837512.2	900	GGATTGATAAGCAGCTCCGGATTGAGATGGTGAGCACATCCAGGCGTACT	851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	1101	GGATTGATAAGCAGCTCCGGATTGAGATGGTGAGCACATCCAGGCGTACT	1150

C  AL837512.2	850	GTGCTGGCAAGGAATCAGGTGTCATTTTACTCTTGGTTTCTGATTTTGAA	801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	1151	GTGCTGGCAAGGAATCAGGTGTCATTTTACTCTTGGTTTCTGATTTTGAA	1200

C  AL837512.2	800	AAAGATAAAGATAACATGACCAACAGCTGGATTGCCAGCACATGGGATTC	751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	1201	AAAGATAAAGATAACATGACCAACAGCTGGATTGCCAGCACATGGGATTC	1250

C  AL837512.2	750	CTGATAAATTACTAAGCAGTGTGTATTTTTAAGAAGTGGCATTAAACTGG	701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	1251	CTGATAAATTACTAAGCAGTGTGTATTTTTAAGAAGTGGCATTAAACTGG	1300

C  AL837512.2	700	AGGGGTTCCAAAATGTAGCATTCATAATAAAAATAACATTAAAAACATGA	651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	1301	AGGGGTTCCAAAATGTAGCATTCATAATAAAAATAACATTAAAAACATGA	1350

C  AL837512.2	650	TAAATTTATCTCAAGCACAGAGAAGAAGTCCTGTAGATTTAAAGTACCTA	601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	1351	TAAATTTATCTCAAGCACAGAGAAGAAGTCCTGTAGATTTAAAGTACCTA	1400

C  AL837512.2	600	TGCAATCAGTGGCTCTGACTGGCACCGTTCTCCTAAACTCTACACCTATA	551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	1401	TGCAATCAGTGGCTCTGACTGGCACCGTTCTCCTAAACTCTACACCTATA	1450

C  AL837512.2	550	AATACAATGTCCATGTGGTGTGTTCACTTGGACTTTTATTCTTTTCTATC	501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	1451	AATACAATGTCCATGTGGTGTGTTCACTTGGACTTTTATTCTTTTCTATC	1500

C  AL837512.2	500	TCTCCTTTTTTCTTTCTTCCTTCTTTCCTTCCTTTCTTCCATCCTTCTTT	451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	1501	TCTCCTTTTTTCTTTCTTCCTTCTTTCCTTCCTTTCTTCCATCCTTCTTT	1550

C  AL837512.2	450	CTTTTTTTCTTTATTGTTTGAACTTTTAACAGAAACAATGTGTCCTTGTA	401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	1551	CTTTTTTTCTTTATTGTTTGAACTTTTAACAGAAACAATGTGTCCTTGTA	1600

C  AL837512.2	400	GGCCAGGCTAGCCTCAAACTCATTATGCATCTGAGGATGACTTTAAATTC	351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	1601	GGCCAGGCTAGCCTCAAACTCATTATGCATCTGAGGATGACTTTAAATTC	1650

C  AL837512.2	350	CTGGTCATCCTGCCACCAGAGCTCAAGTATTGTGATTTCAGGAGTGTGAT	301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	1651	CTGGTCATCCTGCCACCAGAGCTCAAGTATTGTGATTTCAGGAGTGTGAT	1700

C  AL837512.2	300	GTACATTTGTTTTGCAGAAGATCTTCCAGTGGTTTTCCCAGTGCCTATCT	251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	1701	GTACATTTGTTTTGCAGAAGATCTTCCAGTGGTTTTCCCAGTGCCTATCT	1750

C  AL837512.2	250	GAGATGATCCAGTTGTTCACCAGTAGCTTTAACCAATCTTGATTTTTTTA	201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	1751	GAGATGATCCAGTTGTTCACCAGTAGCTTTAACCAATCTTGATTTTTTTA	1800

C  AL837512.2	200	AATAAGTTTTAAATTGAAATAGAATCATACCGATTTCCCTCCTATTTTTT	151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	1801	AATAAGTTTTAAATTGAAATAGAATCATACCGATTTCCCTCCTATTTTTT	1850

C  AL837512.2	150	TGTCCTTCGATCTTCTCCCAGGAAGATCCTCTCTAGGAATCCTTTCATGC	101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	1851	TGTCCTTCGATCTTCTCCCAGGAAGATCCTCTCTAGGAATCCTTTCATGC	1900

C  AL837512.2	100	AGTATTATCAAGTTGATGGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATA	51
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	1901	AGTATTATCAAGTTGATGGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATA	1950

C  AL837512.2	50	TATATATATATGTATATATATATATATATATATATATACACATATATATA	1
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590870.14	1951	TATATATATATGTATATATATATATATATATATATATACACATATATATA	2000

Overview

Query
AL837512.2 - 99030 bps
Hit
AL590870.14 - 214308 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link