<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL589744.18	1	GAATTCCAGGAAAGTCAGAACAACATGTGAGACACTATTTCTAAAAGCCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	194858	GAATTCCAGGAAAGTCAGAACAACATGTGAGACACTATTTCTAAAAGCCA	194907

AL589744.18	51	AAACAAATAGACAAACAAACAAACAAACAAAAATTTCAGGTGAAGTCAAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	194908	AAACAAATAGACAAACAAACAAACAAACAAAAATTTCAGGTGAAGTCAAC	194957

AL589744.18	101	CATCCATAGGTAATTAAAACTTGTCACACAAACATTTCTTCTAAAATTTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	194958	CATCCATAGGTAATTAAAACTTGTCACACAAACATTTCTTCTAAAATTTC	195007

AL589744.18	151	AGCTAGGTTTGTAGTATAAAGTAATTATATAAAGTGGTTTCTTTTTAAAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	195008	AGCTAGGTTTGTAGTATAAAGTAATTATATAAAGTGGTTTCTTTTTAAAC	195057

AL589744.18	201	ATGTGAATGTGAATTTAGACATTCGAACTAATACAGATGCTATTGGAAGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	195058	ATGTGAATGTGAATTTAGACATTCGAACTAATACAGATGCTATTGGAAGA	195107

AL589744.18	251	GTGCTGTCAGGCTAGGCTGGGCAGTGCAAACCTGTCATCCCAGCAGTTTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	195108	GTGCTGTCAGGCTAGGCTGGGCAGTGCAAACCTGTCATCCCAGCAGTTTG	195157

AL589744.18	301	GAGGCTGATACTGGAGGATTGCAAATTTGAAGCTCGTCTGGATTATACAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	195158	GAGGCTGATACTGGAGGATTGCAAATTTGAAGCTCGTCTGGATTATACAG	195207

AL589744.18	351	GGGCTTCAAGGATATAGTCTGGGCAGTTTAGGAAGATTAAGTCTTTGAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	195208	GGGCTTCAAGGATATAGTCTGGGCAGTTTAGGAAGATTAAGTCTTTGAAA	195257

AL589744.18	401	CAAAAAAATGAAAAGTGCTAGGTGCTCGCCCAAAATTCTTAAGGATCTAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	195258	CAAAAAAATGAAAAGTGCTAGGTGCTCGCCCAAAATTCTTAAGGATCTAG	195307

AL589744.18	451	GTTCGAGCCATAAAAATAGAGCTTCCTATTAAATCTTCTTTAAAGCAGAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	195308	GTTCGAGCCATAAAAATAGAGCTTCCTATTAAATCTTCTTTAAAGCAGAT	195357

AL589744.18	501	TAAACAGAAGATATCAAAGCCTGACTAACTTTTCTAAACATTCATTTCCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	195358	TAAACAGAAGATATCAAAGCCTGACTAACTTTTCTAAACATTCATTTCCC	195407

AL589744.18	551	CTTACATTTCTAAAGTTTAGTCTCAGTAACTCTCTCAGCATCAAATGCCG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	195408	CTTACATTTCTAAAGTTTAGTCTCAGTAACTCTCTCAGCATCAAATGCCG	195457

AL589744.18	601	GCCTTTTCTCATTCAAGGGATAGTCTCATGAACAGACTTCAGGTCAGCTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	195458	GCCTTTTCTCATTCAAGGGATAGTCTCATGAACAGACTTCAGGTCAGCTA	195507

AL589744.18	651	CACACAGACACACAGACACACACACACAGACACACACACACACACCCCTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	195508	CACACAGACACACAGACACACACACACAGACACACACACACACACCCCTC	195557

AL589744.18	701	TTCACTCTCAAGGTAATTGTAGAGTTAATCTCTTAGTCAAGGTATAGAGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	195558	TTCACTCTCAAGGTAATTGTAGAGTTAATCTCTTAGTCAAGGTATAGAGT	195607

AL589744.18	751	AAAGAAAGGGTCCACTATGACAATGGAAAAAGAAAATGTGATTTATATAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	195608	AAAGAAAGGGTCCACTATGACAATGGAAAAAGAAAATGTGATTTATATAC	195657

AL589744.18	801	ACTATGGCATTACTATTCAGCATTTTAAGCAAAAGAAATTCTGTCATTTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	195658	ACTATGGCATTACTATTCAGCATTTTAAGCAAAAGAAATTCTGTCATTTG	195707

AL589744.18	851	GCCCTGGAGAATACTGTTGAGTGAAATAAACCAGATTTCTACAGAAAGAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	195708	GCCCTGGAGAATACTGTTGAGTGAAATAAACCAGATTTCTACAGAAAGAT	195757

AL589744.18	901	AAATATCGCATGATCTTATATATATTACATGAGATCCATTTCCGGATGGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	195758	AAATATCGCATGATCTTATATATATTACATGAGATCCATTTCCGGATGGA	195807

AL589744.18	951	TTTCATTTTTGTGATGTTATTAGAAAGTCTAATACTGGGTAATTTATTAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	195808	TTTCATTTTTGTGATGTTATTAGAAAGTCTAATACTGGGTAATTTATTAA	195857

AL589744.18	1001	TAAAAAACCCAGAATTTCATTTCTATAGTTCCAGAAATAGGATCAAACTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	195858	TAAAAAACCCAGAATTTCATTTCTATAGTTCCAGAAATAGGATCAAACTG	195907

AL589744.18	1051	CTGTCTGGTCAGAGCCAAGTCTCTGCTTGCAAGGTGATACCTTGTTGCTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	195908	CTGTCTGGTCAGAGCCAAGTCTCTGCTTGCAAGGTGATACCTTGTTGCTG	195957

AL589744.18	1101	AAACCTATGGGTCTCCCATCATCATCATCACCACCACCAACACCACCACC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	195958	AAACCTATGGGTCTCCCATCATCATCATCACCACCACCAACACCACCACC	196007

AL589744.18	1151	ACCACCACCACCACCACCATCACCACCACCATCACCACCACCACCATCAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	196008	ACCACCACCACCACCACCATCACCACCACCATCACCACCACCACCATCAC	196057

AL589744.18	1201	CACCACCACCATCACCATCACCACCTCCACCACCTCCACCATCATAATCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	196058	CACCACCACCATCACCATCACCACCTCCACCACCTCCACCATCATAATCC	196107

AL589744.18	1251	ATTACAGAGACTCTATAATGTAAACACATGTCAAGCCTGCATGTTGGACA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	196108	ATTACAGAGACTCTATAATGTAAACACATGTCAAGCCTGCATGTTGGACA	196157

AL589744.18	1301	CTCTGAATATATACAACTATATTTGTTGATTTAAAAAGGAAAGTTTTGGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	196158	CTCTGAATATATACAACTATATTTGTTGATTTAAAAAGGAAAGTTTTGGG	196207

AL589744.18	1351	CTGGTGAGATGGCTCAGTGGGTAAGAGCACTGGCTGCTCTTCCAAAGGTC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	196208	CTGGTGAGATGGCTCAGTGGGTAAGAGCACTGGCTGCTCTTCCAAAGGTC	196257

AL589744.18	1401	CTGAGTTCAAATCCCAGCAACCACGTGGTGGCTCACAACCATTTGTAATG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	196258	CTGAGTTCAAATCCCAGCAACCACGTGGTGGCTCACAACCATTTGTAATG	196307

AL589744.18	1451	AGATCTGACACCTTTTGGTGTGTCTAAAGATAGCAACAGTGTACTTACAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	196308	AGATCTGACACCTTTTGGTGTGTCTAAAGATAGCAACAGTGTACTTACAC	196357

AL589744.18	1501	ATAGTAATAAATAAATCTTTGAGCCAAAGTGAGCAGAGGTCCTGAGTTCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	196358	ATAGTAATAAATAAATCTTTGAGCCAAAGTGAGCAGAGGTCCTGAGTTCA	196407

AL589744.18	1551	ATTCTCAGTAGCCACATGATGACTCACAACCATTTGTAGTTATAGTGTAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	196408	ATTCTCAGTAGCCACATGATGACTCACAACCATTTGTAGTTATAGTGTAC	196457

AL589744.18	1601	TCATACACATAAAATAAATAAATAAATCTTTTTTTTTTTTTTAAGGAAAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	196458	TCATACACATAAAATAAATAAATAAATCTTTTTTTTTTTTTTAAGGAAAG	196507

AL589744.18	1651	TGTCTTAGTCACGGTTTCTATTCCTGCACAAACATGATGACCAAGAAGCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	196508	TGTCTTAGTCACGGTTTCTATTCCTGCACAAACATGATGACCAAGAAGCA	196557

AL589744.18	1701	AGTTGGGGAGGAAAGGGTTTTACATTTCTATACTGCTGTTCATCACTAAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	196558	AGTTGGGGAGGAAAGGGTTTTACATTTCTATACTGCTGTTCATCACTAAG	196607

AL589744.18	1751	GAAGTCAGGACTGGAACTCAAGCAGGTCAGGAAGCAGGAGCTGATGCAGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	196608	GAAGTCAGGACTGGAACTCAAGCAGGTCAGGAAGCAGGAGCTGATGCAGA	196657

AL589744.18	1801	GGCCATGGAGGGATGTTCCTTACTGGCTTGCTTCCCCTGGCTTGCTCAGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	196658	GGCCATGGAGGGATGTTCCTTACTGGCTTGCTTCCCCTGGCTTGCTCAGC	196707

AL589744.18	1851	CAGCTCTCTTATAAAACCAAGATTACCAGCCCAGAGATGCTCCCACCCAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	196708	CAGCTCTCTTATAAAACCAAGATTACCAGCCCAGAGATGCTCCCACCCAC	196757

AL589744.18	1901	AAGGAGCCTTTCCCCCTTGATCACTAATTGAGAAAATGCCTTACAGTTGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	196758	AAGGAGCCTTTCCCCCTTGATCACTAATTGAGAAAATGCCTTACAGTTGT	196807

AL589744.18	1951	AGCTCATGGAGGCATTTCCTCAACTGAAGCTCCCTTTTCTGTGATAACTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590864.12	196808	AGCTCATGGAGGCATTTCCTCAACTGAAGCTCCCTTTTCTGTGATAACTC	196857

Overview

Query
AL589744.18 - 216800 bps
Hit
AL590864.12 - 196857 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link