<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL606488.15	1	GGAAACAGTGGTTCCAAAAGCAAGAAGAGGGTTGGACTATCGACAGACAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	177283	GGAAACAGTGGTTCCAAAAGCAAGAAGAGGGTTGGACTATCGACAGACAG	177332

AL606488.15	51	ACAGACATCAGCTGTTCATATGCACCCTGAGATGTCAGCTCATAAGCCAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	177333	ACAGACATCAGCTGTTCATATGCACCCTGAGATGTCAGCTCATAAGCCAG	177382

AL606488.15	101	GGACCTTGTCATACTCACTGTCCAGTCCCTGGTGCCAGCACATGAAGTAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	177383	GGACCTTGTCATACTCACTGTCCAGTCCCTGGTGCCAGCACATGAAGTAC	177432

AL606488.15	151	ACTGCCTGTACCCTTTTTCAAAGTTCCAGAACTATTTGGATGGCTTTTGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	177433	ACTGCCTGTACCCTTTTTCAAAGTTCCAGAACTATTTGGATGGCTTTTGT	177482

AL606488.15	201	CTGTATCTGAATCACACTAACTATTCAAGTTGCATCCATGACTAATGTGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	177483	CTGTATCTGAATCACACTAACTATTCAAGTTGCATCCATGACTAATGTGT	177532

AL606488.15	251	GCCACACTGAAAAAAAGGAACGTAACACTCCTCGTGGTATTTGTACCAGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	177533	GCCACACTGAAAAAAAGGAACGTAACACTCCTCGTGGTATTTGTACCAGA	177582

AL606488.15	301	TGAGAAAAAGAAATAGATTAACTGACTGTTAATAAAAGCCACTTAAGTCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	177583	TGAGAAAAAGAAATAGATTAACTGACTGTTAATAAAAGCCACTTAAGTCA	177632

AL606488.15	351	TAATCATGTTTTTAGTGAAAACCTGATGCCGTTTAAAAGTTCCAGTTTCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	177633	TAATCATGTTTTTAGTGAAAACCTGATGCCGTTTAAAAGTTCCAGTTTCA	177682

AL606488.15	401	AAATTGAAGTGTATTTTTTTTTTAATTCACTGGAACATAGAAAGCAGCTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	177683	AAATTGAAGTGTATTTTTTTTTTAATTCACTGGAACATAGAAAGCAGCTG	177732

AL606488.15	451	AAGAAGGACAAATTGCTATTACCAGGTTGTCGTAGTGACAGCGCCTGAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	177733	AAGAAGGACAAATTGCTATTACCAGGTTGTCGTAGTGACAGCGCCTGAAA	177782

AL606488.15	501	TGTCATTTGAGTGAAAGTGAAGTGAGTTTCCTCCAACTGCACTGAAGATC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	177783	TGTCATTTGAGTGAAAGTGAAGTGAGTTTCCTCCAACTGCACTGAAGATC	177832

AL606488.15	551	AAAATTCTGAGGACATTAATCCAATATACTACTATCAAAAATCTATGTGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	177833	AAAATTCTGAGGACATTAATCCAATATACTACTATCAAAAATCTATGTGT	177882

AL606488.15	601	ATGCACATATGAGAGAGAGGGGGGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGATGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	177883	ATGCACATATGAGAGAGAGGGGGGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGATGG	177932

AL606488.15	651	AGAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGGGGGAGAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	177933	AGAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGGGGGAGAG	177982

AL606488.15	701	AGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	177983	AGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	178032

AL606488.15	751	AGAGAGAATCGTAGCCTGAATGTGGGGAGTGAGACAATGAGAATCCGTTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	178033	AGAGAGAATCGTAGCCTGAATGTGGGGAGTGAGACAATGAGAATCCGTTC	178082

AL606488.15	801	TCTCCTGCCTACAGAAGTGGAGCCTGCTGCACTTGTTGTGATCAGGGCAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	178083	TCTCCTGCCTACAGAAGTGGAGCCTGCTGCACTTGTTGTGATCAGGGCAG	178132

AL606488.15	851	AGAAGGCAAGCCTAGCTCTCGAGTGACCTGAAGTTTCCAAAGTTCTGATC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	178133	AGAAGGCAAGCCTAGCTCTCGAGTGACCTGAAGTTTCCAAAGTTCTGATC	178182

AL606488.15	901	ACATGCACTGTATGCTACCACTTTTTTTTTTTACTAGTACTGCCCAAAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	178183	ACATGCACTGTATGCTACCACTTTTTTTTTTTACTAGTACTGCCCAAAAA	178232

AL606488.15	951	GTGTTTGCCTCCTTGATGAGCTGAAGTCACTGCGTGAGAGAATTGATTAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	178233	GTGTTTGCCTCCTTGATGAGCTGAAGTCACTGCGTGAGAGAATTGATTAT	178282

AL606488.15	1001	CTCTTCAGAATGGCTTATACTGTGGGAATATAAAAAATTGCAGGTGGTCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	178283	CTCTTCAGAATGGCTTATACTGTGGGAATATAAAAAATTGCAGGTGGTCC	178332

AL606488.15	1051	TGGTTACAAGGGAGCTATCTGTCATCCTCAACTATTGACAAATTTTTATG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	178333	TGGTTACAAGGGAGCTATCTGTCATCCTCAACTATTGACAAATTTTTATG	178382

AL606488.15	1101	TAGTACAGTCCCAAATTGCCTGCTAAGTTTAGTTATTCATCCATGAAATC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	178383	TAGTACAGTCCCAAATTGCCTGCTAAGTTTAGTTATTCATCCATGAAATC	178432

AL606488.15	1151	TAAAATTTGGAGTCTACTTAAGGGAAAGGGGAGGATTTAGACTAACACCC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	178433	TAAAATTTGGAGTCTACTTAAGGGAAAGGGGAGGATTTAGACTAACACCC	178482

AL606488.15	1201	TGGTCCCCAGTCCCCTATCAACATCACATTTCAAAGCTAGATGGAAGGGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	178483	TGGTCCCCAGTCCCCTATCAACATCACATTTCAAAGCTAGATGGAAGGGA	178532

AL606488.15	1251	CAAGCTAAACTCCCTTAAGCCCCACCATCTTAGGGAACGGCTGGTGTCCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	178533	CAAGCTAAACTCCCTTAAGCCCCACCATCTTAGGGAACGGCTGGTGTCCA	178582

AL606488.15	1301	CCTTCATTCAACTGATAACCGAAAGAGCCATAAATCCCAGAAATTGGGAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	178583	CCTTCATTCAACTGATAACCGAAAGAGCCATAAATCCCAGAAATTGGGAA	178632

AL606488.15	1351	AAGCTACTTAAGCTGTTCCATAGCTTTAATTTATGACTGGCCAAGAACTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	178633	AAGCTACTTAAGCTGTTCCATAGCTTTAATTTATGACTGGCCAAGAACTA	178682

AL606488.15	1401	ATAAATAGAATAGTAAATATTTATTTTTCCTCAACAGTGTGCTTGTCACC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	178683	ATAAATAGAATAGTAAATATTTATTTTTCCTCAACAGTGTGCTTGTCACC	178732

AL606488.15	1451	AAGTTGCAGATAGAATCAATTCCATCCTGGTCCCCGGAGCTTAAAAAATT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	178733	AAGTTGCAGATAGAATCAATTCCATCCTGGTCCCCGGAGCTTAAAAAATT	178782

AL606488.15	1501	AAGCACATGTTAACACTGCTGCATTAGCAGAGATAGGCAAATGACACACA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	178783	AAGCACATGTTAACACTGCTGCATTAGCAGAGATAGGCAAATGACACACA	178832

AL606488.15	1551	GTGACCAGAGTGCAAATCTCCCTCCAAAAGCTGATAGAAGTGGCACCCTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	178833	GTGACCAGAGTGCAAATCTCCCTCCAAAAGCTGATAGAAGTGGCACCCTG	178882

AL606488.15	1601	GGGTCTATGACTTCTCCACTACACAATGAGTCTCTGGGGAAGGCTGCCTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	178883	GGGTCTATGACTTCTCCACTACACAATGAGTCTCTGGGGAAGGCTGCCTA	178932

AL606488.15	1651	CTGGCTAATGACCACATAGACATTATTTGTGAGTGCATGGTGTTCGATTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	178933	CTGGCTAATGACCACATAGACATTATTTGTGAGTGCATGGTGTTCGATTC	178982

AL606488.15	1701	TAGGTGAGGCAGCAAACTCTTTTTACTGTCCTTTCTTTCCTCATATAAAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	178983	TAGGTGAGGCAGCAAACTCTTTTTACTGTCCTTTCTTTCCTCATATAAAG	179032

AL606488.15	1751	CATCTCAATCTACAACTAAATGAATAAACTTTGCTGCCCCTCTGTTCCAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	179033	CATCTCAATCTACAACTAAATGAATAAACTTTGCTGCCCCTCTGTTCCAC	179082

AL606488.15	1801	AGCACCACTTCTAAATCCCAGGTTGGTTGCAATCCAGCTTTTCTGGTCTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	179083	AGCACCACTTCTAAATCCCAGGTTGGTTGCAATCCAGCTTTTCTGGTCTG	179132

AL606488.15	1851	CTTTCCCAAGGGAACTGTCACTGCTAGGGCCTCTCTAACACTCCCCCCTA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	179133	CTTTCCCAAGGGAACTGTCACTGCTAGGGCCTCTCTAACACTCCCCCCTA	179182

AL606488.15	1901	CGAAGTAGCTGAGTCCCTCCATAAAGGGATTCCTCTCTTTCCTCCCCTTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	179183	CGAAGTAGCTGAGTCCCTCCATAAAGGGATTCCTCTCTTTCCTCCCCTTC	179232

AL606488.15	1951	CATTGTCTAGGTTTTGGGGGGCGGGGAGGCAGGTGGGTGTTCTAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590626.9	179233	CATTGTCTAGGTTTTGGGGGGCGGGGAGGCAGGTGGGTGTTCTAGAATTC	179282

Overview

Query
AL606488.15 - 188423 bps
Hit
AL590626.9 - 179282 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link