<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645783.13	1	ACAGACTTCCTAATACATCAATACAAGATGAACTTTTACTGATCCAAAAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	163746	ACAGACTTCCTAATACATCAATACAAGATGAACTTTTACTGATCCAAAAG	163795

AL645783.13	51	CAAACATCCAATGTGTTGGTGGGAGAATGAGCAAAGGAAGGGATAGCGCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	163796	CAAACATCCAATGTGTTGGTGGGAGAATGAGCAAAGGAAGGGATAGCGCA	163845

AL645783.13	101	CAGAAAGTGTGCAGTGTCATTCAGAAGAAATGCGTGTTATGCTGCCACAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	163846	CAGAAAGTGTGCAGTGTCATTCAGAAGAAATGCGTGTTATGCTGCCACAC	163895

AL645783.13	151	CACAGGAGCTACAATTCTCACTAATCAGATTGAAAAAAATATATCCCAAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	163896	CACAGGAGCTACAATTCTCACTAATCAGATTGAAAAAAATATATCCCAAA	163945

AL645783.13	201	CCGTGTCAACACAAAGCTGACAAGACTGTGGAGTCTCAGACAGTCTTACA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	163946	CCGTGTCAACACAAAGCTGACAAGACTGTGGAGTCTCAGACAGTCTTACA	163995

AL645783.13	251	TTGTTATTAAACCTGATGGAATGCCAGAGTGGTAACTCTGATCATCACCA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	163996	TTGTTATTAAACCTGATGGAATGCCAGAGTGGTAACTCTGATCATCACCA	164045

AL645783.13	301	TACAGTGGGATCTTACAACTGTCACAATCAGTGCATTTACCCTTTGACCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	164046	TACAGTGGGATCTTACAACTGTCACAATCAGTGCATTTACCCTTTGACCC	164095

AL645783.13	351	AATCGTCTTGTTTCTGGGCATTTCTCCTGTGTTTAATGGCACATGTGCAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	164096	AATCGTCTTGTTTCTGGGCATTTCTCCTGTGTTTAATGGCACATGTGCAG	164145

AL645783.13	401	CATGGTCTGCTCTGGTAGTCTGAATGAGAACGGCCCCCACGGGCTCAGAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	164146	CATGGTCTGCTCTGGTAGTCTGAATGAGAACGGCCCCCACGGGCTCAGAT	164195

AL645783.13	451	GTTTGAGTACTTTTAAGTCGCTGGAACCGTGGGGGAAGGATTAGGGGGCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	164196	GTTTGAGTACTTTTAAGTCGCTGGAACCGTGGGGGAAGGATTAGGGGGCA	164245

AL645783.13	501	GAACCTTGTTGGAGAAGATATGTCACTGGGAGTGGAATTTGAGGTTTCAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	164246	GAACCTTGTTGGAGAAGATATGTCACTGGGAGTGGAATTTGAGGTTTCAA	164295

AL645783.13	551	AAGCCTGTGATCTTCCCAGTTATCTCTCTCTGCTTCATGCTGTGGATCAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	164296	AAGCCTGTGATCTTCCCAGTTATCTCTCTCTGCTTCATGCTGTGGATCAA	164345

AL645783.13	601	ATGTAAGTGCTTCCCAAGTGCCCTTCCTACCTGCTTGCTGTCAGGCTCCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	164346	ATGTAAGTGCTTCCCAAGTGCCCTTCCTACCTGCTTGCTGTCAGGCTCCA	164395

AL645783.13	651	CACACCATGGTGGTCCTGTCCTCTAACCCCTGAAAGCATAAGCCTCAATT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	164396	CACACCATGGTGGTCCTGTCCTCTAACCCCTGAAAGCATAAGCCTCAATT	164445

AL645783.13	701	AAGCCATTTCTTCCATGTGTTGCCTCACCTTGATCATGGTGTCATATCAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	164446	AAGCCATTTCTTCCATGTGTTGCCTCACCTTGATCATGGTGTCATATCAC	164495

AL645783.13	751	AGTAAGAGAAAGTAACTAAGATATCTATTGAGATAACAGAAAAAGAGGCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	164496	AGTAAGAGAAAGTAACTAAGATATCTATTGAGATAACAGAAAAAGAGGCC	164545

AL645783.13	801	ACCATGAAAGAATCGGTCTATTGCAGCAGTTCGCAACCTTAAGGTCCCCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	164546	ACCATGAAAGAATCGGTCTATTGCAGCAGTTCGCAACCTTAAGGTCCCCA	164595

AL645783.13	851	TCTCCCAGGGTCACATTTCAGATATGTACATTATGATTGGCTACAGTAAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	164596	TCTCCCAGGGTCACATTTCAGATATGTACATTATGATTGGCTACAGTAAC	164645

AL645783.13	901	AAAATTAGAGTTACTAAGTAGCAACGAAATAATTTTATGGTTGGGGGTCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	164646	AAAATTAGAGTTACTAAGTAGCAACGAAATAATTTTATGGTTGGGGGTCA	164695

AL645783.13	951	CCACAACACAAGGAACTGTATCACAGGGTTGCAGCATTACAAAGGGCGGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	164696	CCACAACACAAGGAACTGTATCACAGGGTTGCAGCATTACAAAGGGCGGG	164745

AL645783.13	1001	CACCATTGGTTTAAAGGGAACTCTTTAAATAAGCCTTGGCGTTTCCATCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	164746	CACCATTGGTTTAAAGGGAACTCTTTAAATAAGCCTTGGCGTTTCCATCC	164795

AL645783.13	1051	CGTGGAATCCTGGCAGCTTTAAAAGTGGGGTTCCTTATGTACAAAGAGGA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	164796	CGTGGAATCCTGGCAGCTTTAAAAGTGGGGTTCCTTATGTACAAAGAGGA	164845

AL645783.13	1101	CAGCAACAGGTTTCAATTTTAAATGAAAAACCAAGGCTGGTTGAATCAAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	164846	CAGCAACAGGTTTCAATTTTAAATGAAAAACCAAGGCTGGTTGAATCAAT	164895

AL645783.13	1151	TGTGAAAAGAAGGAATTTCAGAATTTTTATTATTTACTTTTAATGATTTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	164896	TGTGAAAAGAAGGAATTTCAGAATTTTTATTATTTACTTTTAATGATTTC	164945

AL645783.13	1201	ATTCATTCTCTGAGGCATTCATATCTGTATACAAAAAAATGAAAGATCTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	164946	ATTCATTCTCTGAGGCATTCATATCTGTATACAAAAAAATGAAAGATCTT	164995

AL645783.13	1251	TAGTGTTTATTTCTGTAATGGAAGCATGGCTTCACTACTGATCAAACTCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	164996	TAGTGTTTATTTCTGTAATGGAAGCATGGCTTCACTACTGATCAAACTCT	165045

AL645783.13	1301	TTTACTAAGGGTGGGGTTGGACTTTGGTAAAGTCATCTTATTATCTACCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	165046	TTTACTAAGGGTGGGGTTGGACTTTGGTAAAGTCATCTTATTATCTACCT	165095

AL645783.13	1351	TATTTTCTCTTTTTCCTATTTAAATCATGTGGTTTACCTCTTTAGATAAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	165096	TATTTTCTCTTTTTCCTATTTAAATCATGTGGTTTACCTCTTTAGATAAG	165145

AL645783.13	1401	AAAATATAATTTTAAAAAGTCCTTAAGAGTGTTTTCTGACTTTTAAATAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	165146	AAAATATAATTTTAAAAAGTCCTTAAGAGTGTTTTCTGACTTTTAAATAA	165195

AL645783.13	1451	AGAAGGAATTATTACCACCACCACCACTACTACTACCACTACCACTACCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	165196	AGAAGGAATTATTACCACCACCACCACTACTACTACCACTACCACTACCA	165245

AL645783.13	1501	CTACCACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	165246	CTACCACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACC	165295

AL645783.13	1551	ACTACCACCACTACTACTACTACCACTACTACTACTACTATCACCACTAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	165296	ACTACCACCACTACTACTACTACCACTACTACTACTACTATCACCACTAC	165345

AL645783.13	1601	TACTACTGCAACTACTACCACCACCACCACCACTACTACTACTACTACTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	165346	TACTACTGCAACTACTACCACCACCACCACCACTACTACTACTACTACTA	165395

AL645783.13	1651	CCACTACCACCACTACCAGTACCACTACCACTACTACTACTACTACAGTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	165396	CCACTACCACCACTACCAGTACCACTACCACTACTACTACTACTACAGTT	165445

AL645783.13	1701	TTGAATTTTTTGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTAGATATTCTGGAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	165446	TTGAATTTTTTGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTAGATATTCTGGAA	165495

AL645783.13	1751	CTCTCTCTGTAGATAAGACTGGCTTTGAGCTCACAGAGATCCACCTATCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	165496	CTCTCTCTGTAGATAAGACTGGCTTTGAGCTCACAGAGATCCACCTATCC	165545

AL645783.13	1801	CTGCCTCCCAGGCTTTGGGACCAAAGGTGTGTGCTACCACTGCCTGGTAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	165546	CTGCCTCCCAGGCTTTGGGACCAAAGGTGTGTGCTACCACTGCCTGGTAG	165595

AL645783.13	1851	GATTTATTAAATGTTAATGATGCTTACCTTGGAGGTTATTTTATTGGTTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	165596	GATTTATTAAATGTTAATGATGCTTACCTTGGAGGTTATTTTATTGGTTG	165645

AL645783.13	1901	TGTGAGCAAAAGTTGATTTTCCACCATCCTATAAGCCATCCTTTCAATTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	165646	TGTGAGCAAAAGTTGATTTTCCACCATCCTATAAGCCATCCTTTCAATTT	165695

AL645783.13	1951	TGCATGACAGTGAGCCACCTGGTCCAGGGGAAGAGGTGTGCTCAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590625.16	165696	TGCATGACAGTGAGCCACCTGGTCCAGGGGAAGAGGTGTGCTCAGAATTC	165745

Overview

Query
AL645783.13 - 98685 bps
Hit
AL590625.16 - 165745 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link