<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  AL607105.15	2000	GAATTCTTTGGTTTCTCCATCTATGGTTATTGATAGTTTGGCTGGGTATA	1951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	1	GAATTCTTTGGTTTCTCCATCTATGGTTATTGATAGTTTGGCTGGGTATA	50

C  AL607105.15	1950	GTAGCCTGGGCTGGAATTTGTGTTCTCTTAGTGTCTGTATAACATCTGTC	1901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	51	GTAGCCTGGGCTGGAATTTGTGTTCTCTTAGTGTCTGTATAACATCTGTC	100

C  AL607105.15	1900	CAGGCTCTTCTGGCTTTCATAGTCGCTGGTGAAAAGTCTGGTGTAATTCT	1851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	101	CAGGCTCTTCTGGCTTTCATAGTCGCTGGTGAAAAGTCTGGTGTAATTCT	150

C  AL607105.15	1850	GATAGGCCTGCCTTTATATTTTACTTGACCTTTTTCCCTTACTGCTTTTA	1801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	151	GATAGGCCTGCCTTTATATTTTACTTGACCTTTTTCCCTTACTGCTTTTA	200

C  AL607105.15	1800	ATAATGTCTCTTTATTTAGTGCATTTGTTGTTCTGATTATTATGTGTAGG	1751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	201	ATAATGTCTCTTTATTTAGTGCATTTGTTGTTCTGATTATTATGTGTAGG	250

C  AL607105.15	1750	GAGGAATTTCTTTTCTGGTCCAGGTTATTATGAGTTCTGTAGGTTTCTTG	1701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	251	GAGGAATTTCTTTTCTGGTCCAGGTTATTATGAGTTCTGTAGGTTTCTTG	300

C  AL607105.15	1700	TATGTTCAAGGGCATCTCTTTCTTTAGGTTTGGGAAGTTTTCTTCTATTA	1651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	301	TATGTTCAAGGGCATCTCTTTCTTTAGGTTTGGGAAGTTTTCTTCTATTA	350

C  AL607105.15	1650	TTTTGTTGAAGATATTTGCTGACCCTTTAAGTTGAAAATCTTGATTCTCA	1601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	351	TTTTGTTGAAGATATTTGCTGACCCTTTAAGTTGAAAATCTTGATTCTCA	400

C  AL607105.15	1600	TCTACTCTTATTATCTGTAGGTTTGGTCTTTTCCTTGTGTCCTGTATTTC	1551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	401	TCTACTCTTATTATCTGTAGGTTTGGTCTTTTCCTTGTGTCCTGTATTTC	450

C  AL607105.15	1550	CTGGATGTTTTGAGTTAGGATCTTTTTGCATTTTGTATTATCTTTGATTG	1501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	451	CTGGATGTTTTGAGTTAGGATCTTTTTGCATTTTGTATTATCTTTGATTG	500

C  AL607105.15	1500	TTGTGCCGATGTTCTCTATGGAATCTTCTGCACCTGAGATTCTCTCTTCC	1451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	501	TTGTGCCGATGTTCTCTATGGAATCTTCTGCACCTGAGATTCTCTCTTCC	550

C  AL607105.15	1450	ATCTCTTGTATTCTGTTGCTGATGCTCGCATCTATGGTTCCAGATTTCTT	1401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	551	ATCTCTTGTATTCTGTTGCTGATGCTCGCATCTATGGTTCCAGATTTCTT	600

C  AL607105.15	1400	TCCTAGGGTTTCTATCTCCAGCGTTGCCTCACTTTGGTTTTTCTTTATTG	1351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	601	TCCTAGGGTTTCTATCTCCAGCGTTGCCTCACTTTGGTTTTTCTTTATTG	650

C  AL607105.15	1350	TGTCTACTTCCCTTTTTAGGTCTTGGATGGTTTTATTCAATTCCATTACC	1301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	651	TGTCTACTTCCCTTTTTAGGTCTTGGATGGTTTTATTCAATTCCATTACC	700

C  AL607105.15	1300	TGTTTGGTGGTGTTTTCTTGCAATTCTTTAAGGGATTTTTGTGCTTCCTC	1251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	701	TGTTTGGTGGTGTTTTCTTGCAATTCTTTAAGGGATTTTTGTGCTTCCTC	750

C  AL607105.15	1250	TTTAAGGTCTTCTACCTGTTTAGCAGTGTTTTCCTGTATTTCTTTAAGTG	1201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	751	TTTAAGGTCTTCTACCTGTTTAGCAGTGTTTTCCTGTATTTCTTTAAGTG	800

C  AL607105.15	1200	AGTTATTAAAGTCCTTCTTGATCCTCTACCATCATCATGAGATATGCTTT	1151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	801	AGTTATTAAAGTCCTTCTTGATCCTCTACCATCATCATGAGATATGCTTT	850

C  AL607105.15	1150	CAAATCAGGGACTATCTTTTTGGGTGTGTTGGCGTGCTCAGGACTGAGTG	1101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	851	CAAATCAGGGACTATCTTTTTGGGTGTGTTGGCGTGCTCAGGACTGAGTG	900

C  AL607105.15	1100	CGGTGGGAGTGCTGCGTTCTGATGATGATGAGTGGTCTTGGTTTCTGTTA	1051
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	901	CGGTGGGAGTGCTGCGTTCTGATGATGATGAGTGGTCTTGGTTTCTGTTA	950

C  AL607105.15	1050	GCAAGATTCTTATGTTTGCCTTTTGCCGTGTGTTAATATCTGGAGTTAGT	1001
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	951	GCAAGATTCTTATGTTTGCCTTTTGCCGTGTGTTAATATCTGGAGTTAGT	1000

C  AL607105.15	1000	TGTTATAGTTGTCTCTGGTTAGAGCTTGTTCCTCAGGTGATTATGTTAGC	951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	1001	TGTTATAGTTGTCTCTGGTTAGAGCTTGTTCCTCAGGTGATTATGTTAGC	1050

C  AL607105.15	950	CTCTATCAGCAGACCTGGGAGACTAGCTCTCTCCTGAGTTCCAATGCTCA	901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	1051	CTCTATCAGCAGACCTGGGAGACTAGCTCTCTCCTGAGTTCCAATGCTCA	1100

C  AL607105.15	900	GAGTACTCTCTGTAGGCAAGCTCTTCTCTTGCAGGGAAGTTGTCCAGATA	851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	1101	GAGTACTCTCTGTAGGCAAGCTCTTCTCTTGCAGGGAAGTTGTCCAGATA	1150

C  AL607105.15	850	TCTGGTGTTCGAACCTGCCTCCAGGCAGAAGTTGTGATCCACTCACCAGA	801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	1151	TCTGGTGTTCGAACCTGCCTCCAGGCAGAAGTTGTGATCCACTCACCAGA	1200

C  AL607105.15	800	GGTCCTCAGATCCCATGGAGAGTCCTGTGGGTACCTTGGGGTGTCCACAG	751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	1201	GGTCCTCAGATCCCATGGAGAGTCCTGTGGGTACCTTGGGGTGTCCACAG	1250

C  AL607105.15	750	ACTCTGCACCCAAGATGCCCTGGTGCTGGCATGGACCAGAAGGGACTTGT	701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	1251	ACTCTGCACCCAAGATGCCCTGGTGCTGGCATGGACCAGAAGGGACTTGT	1300

C  AL607105.15	700	GACCCTGGTCAGGTCGGGTTTTCTGCTTTCCTAATTAATGCAGTCTCAGG	651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	1301	GACCCTGGTCAGGTCGGGTTTTCTGCTTTCCTAATTAATGCAGTCTCAGG	1350

C  AL607105.15	650	TCCCGTGCAATTGGATTGGAGCAGAAGTTGTGTTCCACTCACCAGAGGTC	601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	1351	TCCCGTGCAATTGGATTGGAGCAGAAGTTGTGTTCCACTCACCAGAGGTC	1400

C  AL607105.15	600	TTAATATCCTGTGGAGGGTCCTGTGGGGCCTTGGAGGTGTCCGCAGACTC	551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	1401	TTAATATCCTGTGGAGGGTCCTGTGGGGCCTTGGAGGTGTCCGCAGACTC	1450

C  AL607105.15	550	TGCACCCAAGGTGCCCTGGTGCTGTCATGGACCGGAAGGTGATCTATTAG	501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	1451	TGCACCCAAGGTGCCCTGGTGCTGTCATGGACCGGAAGGTGATCTATTAG	1500

C  AL607105.15	500	TTTTTAAAGAAAATTTTTTAGAAGAACAATTCAATGTCTTTCTTGTATAA	451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	1501	TTTTTAAAGAAAATTTTTTAGAAGAACAATTCAATGTCTTTCTTGTATAA	1550

C  AL607105.15	450	GTCCAATAGAAATAAGTATATTAAGACACAACAATAATTTCCACTTAGAG	401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	1551	GTCCAATAGAAATAAGTATATTAAGACACAACAATAATTTCCACTTAGAG	1600

C  AL607105.15	400	TCTTTTATTCATGTATTGTGCTAGGTACTATAGGTAAGTTTAACTTAGCA	351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	1601	TCTTTTATTCATGTATTGTGCTAGGTACTATAGGTAAGTTTAACTTAGCA	1650

C  AL607105.15	350	TAAATTATATTATATTCATGTTGGGGAAACTGATACTTAAAAAATTAATT	301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	1651	TAAATTATATTATATTCATGTTGGGGAAACTGATACTTAAAAAATTAATT	1700

C  AL607105.15	300	TTCTGAGGTCCAGACAAATTGATTATTTGAAAAAGTGTTAGTTAAGGCAT	251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	1701	TTCTGAGGTCCAGACAAATTGATTATTTGAAAAAGTGTTAGTTAAGGCAT	1750

C  AL607105.15	250	GGTTTTGTTCCAACCAATAGAAAATTCACATTACATTAATTAACCATTTC	201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	1751	GGTTTTGTTCCAACCAATAGAAAATTCACATTACATTAATTAACCATTTC	1800

C  AL607105.15	200	CATATGCACATCAGCCACACTTAGCATATTTATTGTTTTTCAAGTTTCAA	151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	1801	CATATGCACATCAGCCACACTTAGCATATTTATTGTTTTTCAAGTTTCAA	1850

C  AL607105.15	150	AATACTTTTGTGCCCTCACCCCAAACCCTCCATATTTATTAAGTTTAAGT	101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	1851	AATACTTTTGTGCCCTCACCCCAAACCCTCCATATTTATTAAGTTTAAGT	1900

C  AL607105.15	100	GCCCCATTTCAATGCTCCTCTGGCAGTTGGATTTGCTTCTGTGTTTATGG	51
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	1901	GCCCCATTTCAATGCTCCTCTGGCAGTTGGATTTGCTTCTGTGTTTATGG	1950

C  AL607105.15	50	TTTTAGGCATTCTGAAAATTGATATATGTGAAATTGTTTAACATGTGACT	1
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL590616.23	1951	TTTTAGGCATTCTGAAAATTGATATATGTGAAATTGTTTAACATGTGACT	2000

Overview

Query
AL607105.15 - 54630 bps
Hit
AL590616.23 - 202629 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link