<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645683.7	1	CCAGGGTATCCAATGCCTCCACATCACCTCCATGAGCATCAAGCACACAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	208846	CCAGGGTATCCAATGCCTCCACATCACCTCCATGAGCATCAAGCACACAC	208895

AL645683.7	51	AGTACACTTATATATATGCAGACAAAACACACAGAAGATAAAATGAATCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	208896	AGTACACTTATATATATGCAGACAAAACACACAGAAGATAAAATGAATCT	208945

AL645683.7	101	GTCTAATAAAAATAAATGTTTAACATTAAACAAACAAACAAACAAGTTAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	208946	GTCTAATAAAAATAAATGTTTAACATTAAACAAACAAACAAACAAGTTAA	208995

AL645683.7	151	AAAAAAACAAACAAACATAGAAAGCCCAGAAACACGTAGAGTAAAGGATA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	208996	AAAAAAACAAACAAACATAGAAAGCCCAGAAACACGTAGAGTAAAGGATA	209045

AL645683.7	201	CTCAAGGACCAAAGTCAGTGGCTGGTCTTATGTTATGGTATCCAGGGCAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	209046	CTCAAGGACCAAAGTCAGTGGCTGGTCTTATGTTATGGTATCCAGGGCAG	209095

AL645683.7	251	AGCAGCAGTGGGGATTTTTAGAGGTTGTGTCTGCTTCTTGCTCTGGGTGC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	209096	AGCAGCAGTGGGGATTTTTAGAGGTTGTGTCTGCTTCTTGCTCTGGGTGC	209145

AL645683.7	301	AGACTTTATGCAGAGGAGTCAACTCCTCTCCTGCCTGAGTTCTTCATTTC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	209146	AGACTTTATGCAGAGGAGTCAACTCCTCTCCTGCCTGAGTTCTTCATTTC	209195

AL645683.7	351	TCCTCTTGTTTGTAGCTAGCTCTTTTTGATAAGTTAACTGTCAAATGGTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	209196	TCCTCTTGTTTGTAGCTAGCTCTTTTTGATAAGTTAACTGTCAAATGGTT	209245

AL645683.7	401	CTATCTCTTGATCAGATTGTCCAGTTATTGCCAAGGTCAGTTAGAGCAGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	209246	CTATCTCTTGATCAGATTGTCCAGTTATTGCCAAGGTCAGTTAGAGCAGG	209295

AL645683.7	451	GATATATGTTGCTGTATGCCAACCCGAGGCTTACAAGGACTAGGTACACC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	209296	GATATATGTTGCTGTATGCCAACCCGAGGCTTACAAGGACTAGGTACACC	209345

AL645683.7	501	TGGGAGGCAGGCTGGAGCTGAAAAGAGAGAAACTAGATGGTTGAGAGAAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	209346	TGGGAGGCAGGCTGGAGCTGAAAAGAGAGAAACTAGATGGTTGAGAGAAA	209395

AL645683.7	551	TAATGGAGGCCCGTGAGTTTATTAAGAGACCGTGCTTATAAGGGGGAAGG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	209396	TAATGGAGGCCCGTGAGTTTATTAAGAGACCGTGCTTATAAGGGGGAAGG	209445

AL645683.7	601	CCTGTTCCCTCCCCCCCCCCATGCCAGGCTTCTTGATGTATTGTTGCCAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	209446	CCTGTTCCCTCCCCCCCCCCATGCCAGGCTTCTTGATGTATTGTTGCCAA	209495

AL645683.7	651	GTTTTTAGCACTAGTTTGCCAGTTCCACACTTGATGTCTGGAGCCATTTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	209496	GTTTTTAGCACTAGTTTGCCAGTTCCACACTTGATGTCTGGAGCCATTTT	209545

AL645683.7	701	GTCAGCACTAGGTAACCAGGCTGGTCACTTATTCAGGAATCTCTCAGGAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	209546	GTCAGCACTAGGTAACCAGGCTGGTCACTTATTCAGGAATCTCTCAGGAA	209595

AL645683.7	751	AATAGGTTTAGCCTCTCGGCAGGTGGCAGAATCTCAGGGCAGATGTCACT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	209596	AATAGGTTTAGCCTCTCGGCAGGTGGCAGAATCTCAGGGCAGATGTCACT	209645

AL645683.7	801	TCCAAAGAAGCCAGTTAGAAGAAGCCAGCCAAGTCAGAAAGCTGCACTGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	209646	TCCAAAGAAGCCAGTTAGAAGAAGCCAGCCAAGTCAGAAAGCTGCACTGC	209695

AL645683.7	851	AGGTGGCCCTACCTCAGTGGCCACCTGGTCAATACCAGCCCACTTCAGGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	209696	AGGTGGCCCTACCTCAGTGGCCACCTGGTCAATACCAGCCCACTTCAGGC	209745

AL645683.7	901	TGGGGGAGCCTACAATTCCTCCCTGGTTATATAATGAAAATAGCCAGACT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	209746	TGGGGGAGCCTACAATTCCTCCCTGGTTATATAATGAAAATAGCCAGACT	209795

AL645683.7	951	GAGGCATAAAATTTATTTATGCTCCATAGTCCTGCCTGGGAGTTATGGTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	209796	GAGGCATAAAATTTATTTATGCTCCATAGTCCTGCCTGGGAGTTATGGTG	209845

AL645683.7	1001	GCTGGCAGCCATGCCTGTCTTAGGAATTCTCAGATTTTCCTGAATCATTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	209846	GCTGGCAGCCATGCCTGTCTTAGGAATTCTCAGATTTTCCTGAATCATTC	209895

AL645683.7	1051	AGATCCATCAAGGAGCATACATGCAGCTTGTTTGTGTTTATTTTACACAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	209896	AGATCCATCAAGGAGCATACATGCAGCTTGTTTGTGTTTATTTTACACAA	209945

AL645683.7	1101	TACATGGAGCTGTGGTGTATTATTAATAAACTACGGCCTCTTGGCATGTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	209946	TACATGGAGCTGTGGTGTATTATTAATAAACTACGGCCTCTTGGCATGTA	209995

AL645683.7	1151	CCTCTGTCTTAGATTGATATGGTTCCGAAATCTGGTTGCCCATCATTGGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	209996	CCTCTGTCTTAGATTGATATGGTTCCGAAATCTGGTTGCCCATCATTGGC	210045

AL645683.7	1201	TAACCGGCCCTCATAGCACACCTTATTCCCAAATCAGACCAAAGCCACAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	210046	TAACCGGCCCTCATAGCACACCTTATTCCCAAATCAGACCAAAGCCACAA	210095

AL645683.7	1251	TATATACTCAATATGCTTCTTCATATTGAATAATTTCTGCCACCCACACT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	210096	TATATACTCAATATGCTTCTTCATATTGAATAATTTCTGCCACCCACACT	210145

AL645683.7	1301	TGCTAGGAGGCTAGGCTGCACACTTGCTGAAATCAGACTTTGAGGCTTGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	210146	TGCTAGGAGGCTAGGCTGCACACTTGCTGAAATCAGACTTTGAGGCTTGA	210195

AL645683.7	1351	CTTTGAGTTGACTGATCTACTTGAAAAACAAAGTCAAGACAGTGAAAAGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	210196	CTTTGAGTTGACTGATCTACTTGAAAAACAAAGTCAAGACAGTGAAAAGC	210245

AL645683.7	1401	AACAGGATAAAAGCTTCTTTGTGGAAGCCCAGGTACTTTATTCAGTTGCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	210246	AACAGGATAAAAGCTTCTTTGTGGAAGCCCAGGTACTTTATTCAGTTGCA	210295

AL645683.7	1451	AATTAGCAACGATCAAGCTCAGACTCTGACCTCCCAGTGTTGGGGAGCTA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	210296	AATTAGCAACGATCAAGCTCAGACTCTGACCTCCCAGTGTTGGGGAGCTA	210345

AL645683.7	1501	GCTTTGAGAATCAGCAGAAAGGCTAGAGATTCTCTGGAAGTGGAGGCTGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	210346	GCTTTGAGAATCAGCAGAAAGGCTAGAGATTCTCTGGAAGTGGAGGCTGT	210395

AL645683.7	1551	GCTCCAAACTAACTTTTTCGGCTAAAAAGGATTTTTAGCCATCAAGGAGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	210396	GCTCCAAACTAACTTTTTCGGCTAAAAAGGATTTTTAGCCATCAAGGAGG	210445

AL645683.7	1601	TTAGAGTCATACTTACTAGAAGATTCAGGATCTGTGTCCACTTGACGAAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	210446	TTAGAGTCATACTTACTAGAAGATTCAGGATCTGTGTCCACTTGACGAAC	210495

AL645683.7	1651	CAGTCTTTCAGGCAGCCATCGTGCTCTGTCTTCTTTTTGTGAAAAAACAC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	210496	CAGTCTTTCAGGCAGCCATCGTGCTCTGTCTTCTTTTTGTGAAAAAACAC	210545

AL645683.7	1701	AGACAGAACCTCTTCCCCAGATAAAAACGGGGTCTGGACCATTCCACGTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	210546	AGACAGAACCTCTTCCCCAGATAAAAACGGGGTCTGGACCATTCCACGTA	210595

AL645683.7	1751	TTAGTTAATGAGTCCTGCTATTTAACCATGGCATAAGAACTGGAAGTAAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	210596	TTAGTTAATGAGTCCTGCTATTTAACCATGGCATAAGAACTGGAAGTAAC	210645

AL645683.7	1801	TGGATGCCAGTGGCGATCTGCTGCAGACTGACCTTTAACATCAGTTTGCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	210646	TGGATGCCAGTGGCGATCTGCTGCAGACTGACCTTTAACATCAGTTTGCA	210695

AL645683.7	1851	AGAAATTTAAACCGAACAAGACAAAAGCAAGATGTGCTTTTGGTGACCTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	210696	AGAAATTTAAACCGAACAAGACAAAAGCAAGATGTGCTTTTGGTGACCTT	210745

AL645683.7	1901	GTGGGGTAAAGCTGCCCCTGTTTCATTTTTAAAAGCCAGTTTTTCAGAGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	210746	GTGGGGTAAAGCTGCCCCTGTTTCATTTTTAAAAGCCAGTTTTTCAGAGT	210795

AL645683.7	1951	GTGATAAGCACGTTCGACAATTCCTTGTCCCATGGGGCCATAAGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590614.8	210796	GTGATAAGCACGTTCGACAATTCCTTGTCCCATGGGGCCATAAGGAATTC	210845

Overview

Query
AL645683.7 - 77611 bps
Hit
AL590614.8 - 210845 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link